MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis D/UW-3/CX chromosome

Total Repeats: 20291

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_000117	AAG	2	6	761365	761370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605397
15002	NC_000117	AAG	2	6	761395	761400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605397
15003	NC_000117	A	7	7	761425	761431	100 %	0 %	0 %	0 %	15605397
15004	NC_000117	AAC	2	6	761461	761466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605397
15005	NC_000117	AAAC	2	8	761469	761476	75 %	0 %	0 %	25 %	15605397
15006	NC_000117	GTG	2	6	761491	761496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15605397
15007	NC_000117	AACC	2	8	761497	761504	50 %	0 %	0 %	50 %	15605397
15008	NC_000117	GAA	2	6	761526	761531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605397
15009	NC_000117	CAG	2	6	761556	761561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605397
15010	NC_000117	TCT	2	6	761571	761576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605397
15011	NC_000117	CAA	2	6	761616	761621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605397
15012	NC_000117	GAA	2	6	761688	761693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605397
15013	NC_000117	AGA	2	6	761729	761734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605397
15014	NC_000117	GAA	3	9	761754	761762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605397
15015	NC_000117	GAA	2	6	761772	761777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605397
15016	NC_000117	CTG	2	6	761782	761787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605397
15017	NC_000117	GCA	2	6	761793	761798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605397
15018	NC_000117	AAG	3	9	761827	761835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605397
15019	NC_000117	AGA	2	6	761836	761841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605397
15020	NC_000117	CTG	2	6	761917	761922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605397
15021	NC_000117	AGA	2	6	761927	761932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605397
15022	NC_000117	TTG	2	6	761982	761987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15605397
15023	NC_000117	TTGA	2	8	762147	762154	25 %	50 %	25 %	0 %	15605397
15024	NC_000117	GTA	2	6	762163	762168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605397
15025	NC_000117	TTG	2	6	762181	762186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15605397
15026	NC_000117	CT	3	6	762216	762221	0 %	50 %	0 %	50 %	15605397
15027	NC_000117	GTT	2	6	762231	762236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15605397
15028	NC_000117	AAC	2	6	762245	762250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605397
15029	NC_000117	TGC	2	6	762272	762277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605397
15030	NC_000117	CGA	2	6	762298	762303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605397
15031	NC_000117	TCT	2	6	762306	762311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605397
15032	NC_000117	GTC	2	6	762331	762336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605397
15033	NC_000117	TGC	2	6	762356	762361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605397
15034	NC_000117	GGAAGA	2	12	762371	762382	50 %	0 %	50 %	0 %	15605397
15035	NC_000117	AGAGA	2	10	762383	762392	60 %	0 %	40 %	0 %	15605397
15036	NC_000117	GCTCT	2	10	762450	762459	0 %	40 %	20 %	40 %	15605397
15037	NC_000117	CTT	2	6	762475	762480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605397
15038	NC_000117	GAAG	2	8	762491	762498	50 %	0 %	50 %	0 %	15605397
15039	NC_000117	CAG	2	6	762549	762554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605397
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15041	NC_000117	GTT	2	6	762596	762601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15605397
15042	NC_000117	CT	3	6	762661	762666	0 %	50 %	0 %	50 %	15605397
15043	NC_000117	GAT	2	6	762684	762689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605397
15044	NC_000117	AGA	2	6	762818	762823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605397
15045	NC_000117	AGC	2	6	762827	762832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605397
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15047	NC_000117	AT	3	6	762998	763003	50 %	50 %	0 %	0 %	15605397
15048	NC_000117	AAT	2	6	763005	763010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15605397
15049	NC_000117	GAA	2	6	763076	763081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605397
15050	NC_000117	TGC	2	6	763093	763098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605397
15051	NC_000117	AGA	2	6	763103	763108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605397
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15053	NC_000117	AATA	2	8	763311	763318	75 %	25 %	0 %	0 %	15605397
15054	NC_000117	GCT	2	6	763402	763407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605398
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15059	NC_000117	ACA	2	6	763715	763720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605399
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15061	NC_000117	TAA	2	6	763890	763895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15605399
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15063	NC_000117	TTG	2	6	763947	763952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15605400
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15065	NC_000117	TTG	2	6	764067	764072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15605400
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15071	NC_000117	GCT	2	6	764236	764241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605400
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15074	NC_000117	TGC	2	6	764514	764519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605401
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15088	NC_000117	GAGT	2	8	765291	765298	25 %	25 %	50 %	0 %	15605402
15089	NC_000117	CTT	2	6	765300	765305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605402
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15092	NC_000117	TGC	2	6	765766	765771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605402
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15099	NC_000117	AG	3	6	766190	766195	50 %	0 %	50 %	0 %	15605402
15100	NC_000117	TCG	2	6	766246	766251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605402
15101	NC_000117	GGATC	2	10	766253	766262	20 %	20 %	40 %	20 %	15605402
15102	NC_000117	TAAAT	2	10	766294	766303	60 %	40 %	0 %	0 %	15605402
15103	NC_000117	A	6	6	766329	766334	100 %	0 %	0 %	0 %	15605402
15104	NC_000117	GCT	2	6	766349	766354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605402
15105	NC_000117	TG	3	6	766401	766406	0 %	50 %	50 %	0 %	15605403
15106	NC_000117	AAG	2	6	766440	766445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605403
15107	NC_000117	CAGAG	2	10	766457	766466	40 %	0 %	40 %	20 %	15605403
15108	NC_000117	GTT	2	6	766470	766475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15605403
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15110	NC_000117	GCGAT	2	10	766609	766618	20 %	20 %	40 %	20 %	15605403
15111	NC_000117	AGT	2	6	766643	766648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605403
15112	NC_000117	GAA	4	12	766665	766676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605403
15113	NC_000117	AGAA	2	8	766690	766697	75 %	0 %	25 %	0 %	15605403
15114	NC_000117	GCA	2	6	766707	766712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605403
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15117	NC_000117	A	6	6	766768	766773	100 %	0 %	0 %	0 %	15605403
15118	NC_000117	AGA	2	6	766787	766792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605403
15119	NC_000117	AAG	2	6	766801	766806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605403
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15490	NC_000117	TTG	2	6	786552	786557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15605417
15491	NC_000117	GA	3	6	786567	786572	50 %	0 %	50 %	0 %	15605417
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