MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis D/UW-3/CX chromosome

Total Repeats: 20291

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_000117	GAT	2	6	660678	660683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605315
13002	NC_000117	GAG	2	6	660742	660747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15605315
13003	NC_000117	TAG	2	6	660769	660774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605315
13004	NC_000117	GAA	2	6	660825	660830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605315
13005	NC_000117	TCG	2	6	660833	660838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605315
13006	NC_000117	ATC	2	6	660909	660914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605315
13007	NC_000117	GAT	2	6	660984	660989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605315
13008	NC_000117	AGA	2	6	660995	661000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605315
13009	NC_000117	A	6	6	661030	661035	100 %	0 %	0 %	0 %	15605315
13010	NC_000117	A	7	7	661055	661061	100 %	0 %	0 %	0 %	15605315
13011	NC_000117	TGC	2	6	661103	661108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605315
13012	NC_000117	CAG	2	6	661135	661140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605315
13013	NC_000117	ATTG	2	8	661187	661194	25 %	50 %	25 %	0 %	15605315
13014	NC_000117	TCT	2	6	661202	661207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605315
13015	NC_000117	AAG	2	6	661264	661269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605315
13016	NC_000117	GTA	2	6	661279	661284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605315
13017	NC_000117	CT	3	6	661289	661294	0 %	50 %	0 %	50 %	15605315
13018	NC_000117	ACG	2	6	661397	661402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605315
13019	NC_000117	CAA	2	6	661428	661433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605315
13020	NC_000117	TAT	2	6	661454	661459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15605315
13021	NC_000117	AAG	2	6	661489	661494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605315
13022	NC_000117	AAG	2	6	661501	661506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605315
13023	NC_000117	AGC	2	6	661580	661585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605315
13024	NC_000117	TGA	2	6	661627	661632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605315
13025	NC_000117	GCA	2	6	661635	661640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605315
13026	NC_000117	A	7	7	661640	661646	100 %	0 %	0 %	0 %	15605315
13027	NC_000117	CTC	2	6	661650	661655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605315
13028	NC_000117	GAA	3	9	661668	661676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605315
13029	NC_000117	GTC	2	6	661859	661864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605316
13030	NC_000117	GA	3	6	661882	661887	50 %	0 %	50 %	0 %	15605316
13031	NC_000117	TCA	2	6	661929	661934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605316
13032	NC_000117	GCGT	2	8	661958	661965	0 %	25 %	50 %	25 %	15605316
13033	NC_000117	TGAT	2	8	662136	662143	25 %	50 %	25 %	0 %	15605316
13034	NC_000117	GCT	2	6	662216	662221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605316
13035	NC_000117	TGG	2	6	662257	662262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15605316
13036	NC_000117	ATG	2	6	662291	662296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605316
13037	NC_000117	ATGC	2	8	662315	662322	25 %	25 %	25 %	25 %	15605316
13038	NC_000117	A	8	8	662422	662429	100 %	0 %	0 %	0 %	15605316
13039	NC_000117	TGA	2	6	662464	662469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605316
13040	NC_000117	AGA	2	6	662557	662562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605316
13041	NC_000117	GCT	2	6	662585	662590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605316
13042	NC_000117	TCT	2	6	662591	662596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605316
13043	NC_000117	ATG	2	6	662622	662627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605316
13044	NC_000117	GAA	2	6	662711	662716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605316
13045	NC_000117	GAC	2	6	662777	662782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605316
13046	NC_000117	ATTG	2	8	662803	662810	25 %	50 %	25 %	0 %	15605316
13047	NC_000117	TCA	2	6	662847	662852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605316
13048	NC_000117	AACCA	2	10	662853	662862	60 %	0 %	0 %	40 %	15605316
13049	NC_000117	GCTAC	2	10	662916	662925	20 %	20 %	20 %	40 %	15605316
13050	NC_000117	AGA	2	6	662953	662958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605316
13051	NC_000117	TAC	2	6	662959	662964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605316
13052	NC_000117	GAA	2	6	663065	663070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605316
13053	NC_000117	AATA	2	8	663272	663279	75 %	25 %	0 %	0 %	15605317
13054	NC_000117	CACG	2	8	663297	663304	25 %	0 %	25 %	50 %	15605317
13055	NC_000117	TG	3	6	663329	663334	0 %	50 %	50 %	0 %	15605317
13056	NC_000117	TAT	2	6	663340	663345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15605317
13057	NC_000117	CTC	2	6	663403	663408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605317
13058	NC_000117	TTTA	2	8	663436	663443	25 %	75 %	0 %	0 %	15605317
13059	NC_000117	ACA	2	6	663457	663462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605317
13060	NC_000117	CT	3	6	663492	663497	0 %	50 %	0 %	50 %	15605317
13061	NC_000117	CTG	2	6	663531	663536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605317
13062	NC_000117	A	7	7	663607	663613	100 %	0 %	0 %	0 %	15605317
13063	NC_000117	AAC	2	6	663657	663662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605317
13064	NC_000117	AAG	2	6	663792	663797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605317
13065	NC_000117	TATT	2	8	663833	663840	25 %	75 %	0 %	0 %	15605317
13066	NC_000117	CT	3	6	663867	663872	0 %	50 %	0 %	50 %	15605317
13067	NC_000117	TC	3	6	663889	663894	0 %	50 %	0 %	50 %	15605317
13068	NC_000117	CAT	2	6	663904	663909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605317
13069	NC_000117	GAT	2	6	663995	664000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605317
13070	NC_000117	C	6	6	664006	664011	0 %	0 %	0 %	100 %	15605317
13071	NC_000117	TAC	2	6	664020	664025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605317
13072	NC_000117	C	6	6	664027	664032	0 %	0 %	0 %	100 %	15605317
13073	NC_000117	AT	3	6	664105	664110	50 %	50 %	0 %	0 %	15605317
13074	NC_000117	CT	3	6	664114	664119	0 %	50 %	0 %	50 %	15605317
13075	NC_000117	GAA	2	6	664151	664156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605317
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13078	NC_000117	TTG	2	6	664213	664218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15605317
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13080	NC_000117	ATG	2	6	664295	664300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605317
13081	NC_000117	TCG	2	6	664306	664311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605317
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13088	NC_000117	TGCG	2	8	664654	664661	0 %	25 %	50 %	25 %	15605317
13089	NC_000117	TGAG	2	8	664701	664708	25 %	25 %	50 %	0 %	15605317
13090	NC_000117	CTC	2	6	664711	664716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605317
13091	NC_000117	AAG	2	6	664722	664727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605317
13092	NC_000117	CAA	2	6	664733	664738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605317
13093	NC_000117	GCT	2	6	664742	664747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605317
13094	NC_000117	CT	3	6	664746	664751	0 %	50 %	0 %	50 %	15605317
13095	NC_000117	ACAG	2	8	664759	664766	50 %	0 %	25 %	25 %	15605317
13096	NC_000117	TCC	2	6	664933	664938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605317
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13098	NC_000117	GA	3	6	665025	665030	50 %	0 %	50 %	0 %	15605317
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13103	NC_000117	CTC	2	6	665383	665388	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605318
13104	NC_000117	CTTT	3	12	665409	665420	0 %	75 %	0 %	25 %	15605318
13105	NC_000117	AAC	2	6	665438	665443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605318
13106	NC_000117	GAAAA	2	10	665493	665502	80 %	0 %	20 %	0 %	15605318
13107	NC_000117	T	6	6	665576	665581	0 %	100 %	0 %	0 %	15605318
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13110	NC_000117	TA	3	6	665697	665702	50 %	50 %	0 %	0 %	15605318
13111	NC_000117	AACA	2	8	665901	665908	75 %	0 %	0 %	25 %	15605318
13112	NC_000117	TCT	2	6	665921	665926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605318
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13115	NC_000117	CTT	2	6	666037	666042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605318
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13118	NC_000117	CT	3	6	666264	666269	0 %	50 %	0 %	50 %	15605318
13119	NC_000117	TACTT	2	10	666410	666419	20 %	60 %	0 %	20 %	15605318
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13238	NC_000117	AAGA	2	8	673493	673500	75 %	0 %	25 %	0 %	15605323
13239	NC_000117	CA	3	6	673530	673535	50 %	0 %	0 %	50 %	15605323
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13496	NC_000117	TTTG	2	8	685976	685983	0 %	75 %	25 %	0 %	15605336
13497	NC_000117	AG	3	6	686120	686125	50 %	0 %	50 %	0 %	15605336
13498	NC_000117	CT	3	6	686137	686142	0 %	50 %	0 %	50 %	15605337
13499	NC_000117	TCTGC	2	10	686177	686186	0 %	40 %	20 %	40 %	15605337
13500	NC_000117	ATC	2	6	686349	686354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605338

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