MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis D/UW-3/CX chromosome

Total Repeats: 20291

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12502	NC_000117	TGG	2	6	635277	635282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15605292
12503	NC_000117	AGC	2	6	635293	635298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605292
12504	NC_000117	TTG	2	6	635340	635345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15605292
12505	NC_000117	GGCT	2	8	635375	635382	0 %	25 %	50 %	25 %	15605292
12506	NC_000117	TGC	2	6	635404	635409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605292
12507	NC_000117	GGCTC	2	10	635478	635487	0 %	20 %	40 %	40 %	15605293
12508	NC_000117	TA	3	6	635501	635506	50 %	50 %	0 %	0 %	15605293
12509	NC_000117	AGCC	2	8	635514	635521	25 %	0 %	25 %	50 %	15605293
12510	NC_000117	TCTT	2	8	635538	635545	0 %	75 %	0 %	25 %	15605293
12511	NC_000117	ATC	2	6	635579	635584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605293
12512	NC_000117	CT	3	6	635636	635641	0 %	50 %	0 %	50 %	15605293
12513	NC_000117	TGC	2	6	635652	635657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605293
12514	NC_000117	CTT	2	6	635720	635725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605293
12515	NC_000117	TGC	2	6	635782	635787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605293
12516	NC_000117	ACCA	2	8	635810	635817	50 %	0 %	0 %	50 %	15605293
12517	NC_000117	CT	3	6	635848	635853	0 %	50 %	0 %	50 %	15605293
12518	NC_000117	ATT	2	6	635895	635900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15605293
12519	NC_000117	AGG	2	6	635926	635931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15605293
12520	NC_000117	ATC	2	6	635972	635977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605293
12521	NC_000117	ATG	2	6	636005	636010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605293
12522	NC_000117	CAG	2	6	636090	636095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605293
12523	NC_000117	ATC	2	6	636131	636136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605293
12524	NC_000117	CTC	2	6	636147	636152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605293
12525	NC_000117	CTAC	2	8	636166	636173	25 %	25 %	0 %	50 %	15605293
12526	NC_000117	TGG	2	6	636221	636226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15605293
12527	NC_000117	ATT	2	6	636246	636251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15605293
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12529	NC_000117	TCC	2	6	636301	636306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605293
12530	NC_000117	TGC	2	6	636425	636430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605294
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12532	NC_000117	CAA	2	6	636624	636629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605294
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12534	NC_000117	C	6	6	636730	636735	0 %	0 %	0 %	100 %	15605294
12535	NC_000117	TG	3	6	636748	636753	0 %	50 %	50 %	0 %	15605294
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12542	NC_000117	GCA	2	6	637142	637147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605295
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12544	NC_000117	CG	3	6	637184	637189	0 %	0 %	50 %	50 %	15605295
12545	NC_000117	GAA	2	6	637257	637262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605295
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12555	NC_000117	TCGTT	2	10	637747	637756	0 %	60 %	20 %	20 %	15605295
12556	NC_000117	TTG	2	6	637789	637794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15605295
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12561	NC_000117	TGG	2	6	637965	637970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15605296
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12563	NC_000117	TCCAT	2	10	638048	638057	20 %	40 %	0 %	40 %	15605296
12564	NC_000117	AGAA	2	8	638058	638065	75 %	0 %	25 %	0 %	15605296
12565	NC_000117	CCT	2	6	638099	638104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605296
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12569	NC_000117	A	6	6	638216	638221	100 %	0 %	0 %	0 %	15605296
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12582	NC_000117	ACGA	2	8	638752	638759	50 %	0 %	25 %	25 %	15605297
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12593	NC_000117	CAC	2	6	638998	639003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15605298
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12618	NC_000117	CAGC	2	8	640170	640177	25 %	0 %	25 %	50 %	15605299
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12624	NC_000117	CGT	2	6	640394	640399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605299
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12990	NC_000117	CT	3	6	660210	660215	0 %	50 %	0 %	50 %	15605315
12991	NC_000117	CCT	2	6	660244	660249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605315
12992	NC_000117	TCT	2	6	660298	660303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605315
12993	NC_000117	ACC	2	6	660402	660407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15605315
12994	NC_000117	CT	3	6	660418	660423	0 %	50 %	0 %	50 %	15605315
12995	NC_000117	GAA	2	6	660486	660491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605315
12996	NC_000117	T	8	8	660508	660515	0 %	100 %	0 %	0 %	15605315
12997	NC_000117	ATT	2	6	660610	660615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15605315
12998	NC_000117	GCT	2	6	660633	660638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605315
12999	NC_000117	GCC	2	6	660647	660652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15605315
13000	NC_000117	CCT	2	6	660659	660664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605315

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