MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis D/UW-3/CX chromosome

Total Repeats: 20291

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_000117	AGA	2	6	583225	583230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605234
11502	NC_000117	CTT	2	6	583239	583244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605234
11503	NC_000117	GTA	2	6	583249	583254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605234
11504	NC_000117	ATA	2	6	583256	583261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15605234
11505	NC_000117	TTC	2	6	583262	583267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605234
11506	NC_000117	TGC	2	6	583279	583284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605234
11507	NC_000117	CGT	2	6	583315	583320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605234
11508	NC_000117	CTA	2	6	583347	583352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605234
11509	NC_000117	AGC	2	6	583435	583440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605234
11510	NC_000117	ATA	2	6	583457	583462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15605234
11511	NC_000117	CTC	2	6	583473	583478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605234
11512	NC_000117	CCT	2	6	583481	583486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605234
11513	NC_000117	TGT	2	6	583546	583551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15605234
11514	NC_000117	CTT	2	6	583560	583565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605234
11515	NC_000117	TGG	2	6	583614	583619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15605234
11516	NC_000117	ATG	2	6	583637	583642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605234
11517	NC_000117	CTG	2	6	583660	583665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605234
11518	NC_000117	CT	3	6	583725	583730	0 %	50 %	0 %	50 %	15605234
11519	NC_000117	CAT	2	6	583758	583763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605234
11520	NC_000117	ACAA	2	8	583772	583779	75 %	0 %	0 %	25 %	15605234
11521	NC_000117	CGA	3	9	583791	583799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605234
11522	NC_000117	CTTT	2	8	583861	583868	0 %	75 %	0 %	25 %	15605234
11523	NC_000117	CATC	2	8	583883	583890	25 %	25 %	0 %	50 %	15605234
11524	NC_000117	GAG	2	6	583905	583910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15605234
11525	NC_000117	GT	3	6	583921	583926	0 %	50 %	50 %	0 %	15605234
11526	NC_000117	TAAA	2	8	583938	583945	75 %	25 %	0 %	0 %	15605234
11527	NC_000117	GAA	2	6	584202	584207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605235
11528	NC_000117	TAT	2	6	584314	584319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15605235
11529	NC_000117	TCT	2	6	584348	584353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605235
11530	NC_000117	ATC	2	6	584385	584390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605235
11531	NC_000117	T	7	7	584519	584525	0 %	100 %	0 %	0 %	15605235
11532	NC_000117	T	6	6	584598	584603	0 %	100 %	0 %	0 %	15605236
11533	NC_000117	ATTTC	2	10	584658	584667	20 %	60 %	0 %	20 %	15605236
11534	NC_000117	AG	3	6	584691	584696	50 %	0 %	50 %	0 %	15605236
11535	NC_000117	CTT	2	6	584698	584703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605236
11536	NC_000117	GAA	2	6	584841	584846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605236
11537	NC_000117	TTTC	2	8	584859	584866	0 %	75 %	0 %	25 %	15605236
11538	NC_000117	TTCTC	2	10	584895	584904	0 %	60 %	0 %	40 %	15605236
11539	NC_000117	T	6	6	584910	584915	0 %	100 %	0 %	0 %	15605236
11540	NC_000117	CTT	2	6	584964	584969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605236
11541	NC_000117	CAA	2	6	585048	585053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605236
11542	NC_000117	AAC	2	6	585067	585072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605236
11543	NC_000117	GA	3	6	585075	585080	50 %	0 %	50 %	0 %	15605236
11544	NC_000117	TCAT	2	8	585101	585108	25 %	50 %	0 %	25 %	15605236
11545	NC_000117	TTC	2	6	585115	585120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605236
11546	NC_000117	CTT	2	6	585243	585248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605236
11547	NC_000117	CTTC	2	8	585270	585277	0 %	50 %	0 %	50 %	15605236
11548	NC_000117	CCA	2	6	585281	585286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15605236
11549	NC_000117	TTCAAA	2	12	585392	585403	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15605236
11550	NC_000117	AT	3	6	585443	585448	50 %	50 %	0 %	0 %	15605236
11551	NC_000117	CAA	2	6	585567	585572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605236
11552	NC_000117	GCC	2	6	585592	585597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15605236
11553	NC_000117	TG	3	6	585663	585668	0 %	50 %	50 %	0 %	15605236
11554	NC_000117	TCG	2	6	585711	585716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605237
11555	NC_000117	AGA	2	6	585783	585788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605237
11556	NC_000117	CAG	2	6	585803	585808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605237
11557	NC_000117	CTT	2	6	585848	585853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605237
11558	NC_000117	AGC	2	6	585870	585875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605237
11559	NC_000117	AGC	2	6	585879	585884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605237
11560	NC_000117	GCA	2	6	585904	585909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605237
11561	NC_000117	CAG	2	6	585950	585955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605237
11562	NC_000117	CAG	2	6	585977	585982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605237
11563	NC_000117	TAT	2	6	586004	586009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15605237
11564	NC_000117	T	6	6	586048	586053	0 %	100 %	0 %	0 %	15605237
11565	NC_000117	T	8	8	586074	586081	0 %	100 %	0 %	0 %	15605237
11566	NC_000117	ATT	3	9	586118	586126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15605238
11567	NC_000117	TCT	2	6	586127	586132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605238
11568	NC_000117	TTTGTT	2	12	586174	586185	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	15605238
11569	NC_000117	AAAG	2	8	586204	586211	75 %	0 %	25 %	0 %	15605238
11570	NC_000117	ACG	2	6	586272	586277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605238
11571	NC_000117	CAA	2	6	586292	586297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605238
11572	NC_000117	AT	3	6	586426	586431	50 %	50 %	0 %	0 %	15605238
11573	NC_000117	ATG	2	6	586477	586482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605238
11574	NC_000117	TCTT	2	8	586568	586575	0 %	75 %	0 %	25 %	15605239
11575	NC_000117	ACA	2	6	586736	586741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605239
11576	NC_000117	GGTT	2	8	586801	586808	0 %	50 %	50 %	0 %	15605239
11577	NC_000117	TTC	2	6	586844	586849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605239
11578	NC_000117	ATA	2	6	586910	586915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15605239
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11580	NC_000117	AAG	2	6	586983	586988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605239
11581	NC_000117	GAAA	2	8	586997	587004	75 %	0 %	25 %	0 %	15605239
11582	NC_000117	CCT	2	6	587099	587104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605239
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11584	NC_000117	AAT	2	6	587122	587127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15605239
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11586	NC_000117	GGAA	2	8	587293	587300	50 %	0 %	50 %	0 %	15605239
11587	NC_000117	AAATA	2	10	587423	587432	80 %	20 %	0 %	0 %	15605239
11588	NC_000117	ACA	2	6	587460	587465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605239
11589	NC_000117	AAC	2	6	587488	587493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605239
11590	NC_000117	ATTC	2	8	587497	587504	25 %	50 %	0 %	25 %	15605239
11591	NC_000117	GAC	2	6	587638	587643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605239
11592	NC_000117	AAG	2	6	587644	587649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605239
11593	NC_000117	AAC	2	6	587680	587685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605239
11594	NC_000117	A	6	6	587727	587732	100 %	0 %	0 %	0 %	15605239
11595	NC_000117	GCAA	2	8	587846	587853	50 %	0 %	25 %	25 %	15605239
11596	NC_000117	T	6	6	587871	587876	0 %	100 %	0 %	0 %	15605239
11597	NC_000117	GCA	2	6	587988	587993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605240
11598	NC_000117	TC	3	6	588052	588057	0 %	50 %	0 %	50 %	15605240
11599	NC_000117	TCTT	2	8	588071	588078	0 %	75 %	0 %	25 %	15605240
11600	NC_000117	GTTGT	2	10	588130	588139	0 %	60 %	40 %	0 %	15605240
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11603	NC_000117	TTC	2	6	588328	588333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605240
11604	NC_000117	ATA	2	6	588397	588402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15605241
11605	NC_000117	AG	3	6	588414	588419	50 %	0 %	50 %	0 %	15605241
11606	NC_000117	AGG	2	6	588424	588429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15605241
11607	NC_000117	ATT	2	6	588462	588467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15605241
11608	NC_000117	CAT	2	6	588587	588592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605241
11609	NC_000117	TCC	2	6	588621	588626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605241
11610	NC_000117	T	6	6	588652	588657	0 %	100 %	0 %	0 %	15605241
11611	NC_000117	AGC	2	6	588660	588665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605241
11612	NC_000117	AAACT	2	10	588763	588772	60 %	20 %	0 %	20 %	15605241
11613	NC_000117	CCT	2	6	588778	588783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605241
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11615	NC_000117	ACA	2	6	588795	588800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605241
11616	NC_000117	GAC	2	6	588807	588812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605241
11617	NC_000117	CT	3	6	588899	588904	0 %	50 %	0 %	50 %	15605242
11618	NC_000117	CTA	2	6	588925	588930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605242
11619	NC_000117	CTC	2	6	588949	588954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605242
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11621	NC_000117	T	6	6	589035	589040	0 %	100 %	0 %	0 %	15605242
11622	NC_000117	CAT	2	6	589108	589113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605242
11623	NC_000117	TA	3	6	589234	589239	50 %	50 %	0 %	0 %	15605242
11624	NC_000117	T	6	6	589277	589282	0 %	100 %	0 %	0 %	15605243
11625	NC_000117	GCT	2	6	589293	589298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605243
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11628	NC_000117	TCTA	2	8	589643	589650	25 %	50 %	0 %	25 %	15605243
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11648	NC_000117	TA	3	6	590790	590795	50 %	50 %	0 %	0 %	15605245
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11993	NC_000117	TTC	2	6	609081	609086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605271
11994	NC_000117	TCA	2	6	609103	609108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605271
11995	NC_000117	ACA	2	6	609140	609145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605271
11996	NC_000117	GAA	2	6	609154	609159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605271
11997	NC_000117	CA	3	6	609234	609239	50 %	0 %	0 %	50 %	15605271
11998	NC_000117	TGA	2	6	609274	609279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605271
11999	NC_000117	AC	3	6	609303	609308	50 %	0 %	0 %	50 %	15605271
12000	NC_000117	AAC	2	6	609348	609353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605271

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