MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis D/UW-3/CX chromosome

Total Repeats: 20291

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10502	NC_000117	TCG	2	6	534194	534199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605184
10503	NC_000117	TCCTC	2	10	534209	534218	0 %	40 %	0 %	60 %	15605184
10504	NC_000117	TA	3	6	534300	534305	50 %	50 %	0 %	0 %	15605184
10505	NC_000117	CAA	2	6	534399	534404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605184
10506	NC_000117	CTC	2	6	534414	534419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605184
10507	NC_000117	CTT	2	6	534444	534449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605184
10508	NC_000117	TTC	2	6	534455	534460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605184
10509	NC_000117	AGA	2	6	534469	534474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605184
10510	NC_000117	CTTT	2	8	534477	534484	0 %	75 %	0 %	25 %	15605184
10511	NC_000117	C	7	7	534574	534580	0 %	0 %	0 %	100 %	15605184
10512	NC_000117	A	6	6	534618	534623	100 %	0 %	0 %	0 %	15605184
10513	NC_000117	CT	3	6	534886	534891	0 %	50 %	0 %	50 %	15605185
10514	NC_000117	TCT	2	6	534937	534942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605185
10515	NC_000117	CAAATC	2	12	534958	534969	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	15605185
10516	NC_000117	AGA	2	6	535065	535070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605185
10517	NC_000117	TTG	2	6	535086	535091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15605185
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10519	NC_000117	ATG	2	6	535127	535132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605185
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10527	NC_000117	CTAT	2	8	535559	535566	25 %	50 %	0 %	25 %	15605186
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10530	NC_000117	TGACA	2	10	535667	535676	40 %	20 %	20 %	20 %	15605186
10531	NC_000117	GT	3	6	535696	535701	0 %	50 %	50 %	0 %	15605186
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10540	NC_000117	GCA	3	9	536043	536051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605186
10541	NC_000117	C	6	6	536077	536082	0 %	0 %	0 %	100 %	15605186
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10543	NC_000117	TTTTC	2	10	536163	536172	0 %	80 %	0 %	20 %	15605186
10544	NC_000117	A	6	6	536175	536180	100 %	0 %	0 %	0 %	15605186
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10552	NC_000117	AAG	2	6	536928	536933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605187
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10554	NC_000117	GAT	2	6	536976	536981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605187
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10560	NC_000117	A	7	7	537335	537341	100 %	0 %	0 %	0 %	15605188
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10595	NC_000117	A	8	8	538775	538782	100 %	0 %	0 %	0 %	15605190
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10603	NC_000117	CTT	2	6	539242	539247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605190
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10605	NC_000117	CT	3	6	539287	539292	0 %	50 %	0 %	50 %	15605190
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10607	NC_000117	AGGGAA	2	12	539399	539410	50 %	0 %	50 %	0 %	15605190
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10613	NC_000117	C	6	6	539517	539522	0 %	0 %	0 %	100 %	15605190
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10623	NC_000117	A	6	6	539970	539975	100 %	0 %	0 %	0 %	15605191
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10996	NC_000117	CAG	2	6	557909	557914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605208
10997	NC_000117	GCA	2	6	557917	557922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605208
10998	NC_000117	T	6	6	557949	557954	0 %	100 %	0 %	0 %	15605208
10999	NC_000117	TG	3	6	558259	558264	0 %	50 %	50 %	0 %	15605209
11000	NC_000117	TAC	2	6	558336	558341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605209

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