MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis D/UW-3/CX chromosome

Total Repeats: 20291

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_000117	TTC	2	6	507481	507486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605164
10002	NC_000117	TGT	4	12	507509	507520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15605164
10003	NC_000117	CTT	2	6	507815	507820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605165
10004	NC_000117	CAC	2	6	507858	507863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15605165
10005	NC_000117	CTT	2	6	507912	507917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605165
10006	NC_000117	CTT	2	6	508000	508005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605165
10007	NC_000117	TAA	2	6	508026	508031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15605165
10008	NC_000117	CTT	2	6	508078	508083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605165
10009	NC_000117	GTC	2	6	508095	508100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605165
10010	NC_000117	T	6	6	508203	508208	0 %	100 %	0 %	0 %	15605611
10011	NC_000117	GCA	2	6	508212	508217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605611
10012	NC_000117	AGTTTT	2	12	508406	508417	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	15605611
10013	NC_000117	AGAC	2	8	508425	508432	50 %	0 %	25 %	25 %	15605611
10014	NC_000117	GAG	2	6	508444	508449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15605611
10015	NC_000117	TTTC	2	8	508469	508476	0 %	75 %	0 %	25 %	15605611
10016	NC_000117	CTT	2	6	508496	508501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605611
10017	NC_000117	TCG	2	6	508519	508524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605611
10018	NC_000117	GTT	2	6	508794	508799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15605166
10019	NC_000117	CGC	2	6	508843	508848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15605166
10020	NC_000117	T	6	6	508866	508871	0 %	100 %	0 %	0 %	15605166
10021	NC_000117	TAT	2	6	508931	508936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15605166
10022	NC_000117	T	6	6	508977	508982	0 %	100 %	0 %	0 %	15605166
10023	NC_000117	TCTT	2	8	509020	509027	0 %	75 %	0 %	25 %	15605166
10024	NC_000117	GAA	2	6	509048	509053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605166
10025	NC_000117	ATG	2	6	509284	509289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605167
10026	NC_000117	TCGC	2	8	509294	509301	0 %	25 %	25 %	50 %	15605167
10027	NC_000117	CAG	2	6	509345	509350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605167
10028	NC_000117	CGA	2	6	509359	509364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605167
10029	NC_000117	CAT	2	6	509401	509406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605167
10030	NC_000117	TC	3	6	509423	509428	0 %	50 %	0 %	50 %	15605167
10031	NC_000117	TC	4	8	509436	509443	0 %	50 %	0 %	50 %	15605167
10032	NC_000117	GTTC	2	8	509461	509468	0 %	50 %	25 %	25 %	15605167
10033	NC_000117	TCT	2	6	509507	509512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605167
10034	NC_000117	AGA	2	6	509526	509531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605167
10035	NC_000117	AAG	2	6	509561	509566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605167
10036	NC_000117	TCT	2	6	509575	509580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605167
10037	NC_000117	CAA	2	6	509605	509610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605167
10038	NC_000117	A	6	6	509698	509703	100 %	0 %	0 %	0 %	15605167
10039	NC_000117	CTT	2	6	509717	509722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605167
10040	NC_000117	GAA	2	6	509728	509733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605167
10041	NC_000117	TCT	3	9	509754	509762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605167
10042	NC_000117	ATCT	2	8	509772	509779	25 %	50 %	0 %	25 %	15605167
10043	NC_000117	AGA	2	6	509784	509789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605167
10044	NC_000117	GCA	2	6	509791	509796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605167
10045	NC_000117	A	6	6	509796	509801	100 %	0 %	0 %	0 %	15605167
10046	NC_000117	TAT	2	6	509940	509945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15605167
10047	NC_000117	GAA	2	6	509995	510000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605167
10048	NC_000117	TG	3	6	510035	510040	0 %	50 %	50 %	0 %	15605167
10049	NC_000117	AGA	2	6	510060	510065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605167
10050	NC_000117	AAG	2	6	510086	510091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605167
10051	NC_000117	CTG	2	6	510107	510112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605167
10052	NC_000117	ATT	2	6	510142	510147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15605167
10053	NC_000117	TCC	2	6	510223	510228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605167
10054	NC_000117	AAT	2	6	510253	510258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15605167
10055	NC_000117	CGT	2	6	510277	510282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605167
10056	NC_000117	A	6	6	510284	510289	100 %	0 %	0 %	0 %	15605167
10057	NC_000117	GTC	2	6	510302	510307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605167
10058	NC_000117	A	7	7	510437	510443	100 %	0 %	0 %	0 %	15605167
10059	NC_000117	GA	3	6	510470	510475	50 %	0 %	50 %	0 %	15605167
10060	NC_000117	GGA	2	6	510481	510486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15605167
10061	NC_000117	GGTTGT	2	12	510534	510545	0 %	50 %	50 %	0 %	15605167
10062	NC_000117	ATG	2	6	510605	510610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605167
10063	NC_000117	GCA	2	6	510649	510654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605167
10064	NC_000117	TTG	2	6	510659	510664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15605167
10065	NC_000117	CAA	2	6	510709	510714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605167
10066	NC_000117	AAG	2	6	510767	510772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605167
10067	NC_000117	CA	3	6	510822	510827	50 %	0 %	0 %	50 %	15605167
10068	NC_000117	AGA	2	6	510873	510878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605167
10069	NC_000117	GA	3	6	511029	511034	50 %	0 %	50 %	0 %	15605167
10070	NC_000117	A	7	7	511076	511082	100 %	0 %	0 %	0 %	15605167
10071	NC_000117	A	7	7	511114	511120	100 %	0 %	0 %	0 %	15605167
10072	NC_000117	CAAA	2	8	511121	511128	75 %	0 %	0 %	25 %	15605167
10073	NC_000117	GATC	2	8	511132	511139	25 %	25 %	25 %	25 %	15605167
10074	NC_000117	GAA	2	6	511165	511170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605167
10075	NC_000117	CCA	2	6	511354	511359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15605168
10076	NC_000117	TCT	2	6	511367	511372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605168
10077	NC_000117	TCA	2	6	511413	511418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605168
10078	NC_000117	GTT	2	6	511436	511441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15605168
10079	NC_000117	CAT	2	6	511450	511455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605168
10080	NC_000117	GAT	2	6	511457	511462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605168
10081	NC_000117	TCT	2	6	511464	511469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605168
10082	NC_000117	CTT	2	6	511484	511489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605168
10083	NC_000117	TC	3	6	511502	511507	0 %	50 %	0 %	50 %	15605168
10084	NC_000117	CTA	2	6	511579	511584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605168
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10086	NC_000117	CAC	2	6	511658	511663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15605168
10087	NC_000117	AGA	2	6	511692	511697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605168
10088	NC_000117	AAC	2	6	511772	511777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605168
10089	NC_000117	TG	3	6	511979	511984	0 %	50 %	50 %	0 %	15605169
10090	NC_000117	GAA	2	6	512023	512028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605169
10091	NC_000117	CGAAT	2	10	512118	512127	40 %	20 %	20 %	20 %	15605169
10092	NC_000117	ACT	2	6	512128	512133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605169
10093	NC_000117	TCT	2	6	512224	512229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605169
10094	NC_000117	CTA	2	6	512300	512305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605169
10095	NC_000117	AGC	2	6	512319	512324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605169
10096	NC_000117	AAG	2	6	512357	512362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605169
10097	NC_000117	AGC	2	6	512381	512386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605169
10098	NC_000117	CAA	2	6	512393	512398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605169
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10100	NC_000117	ACT	2	6	512488	512493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605169
10101	NC_000117	TTA	2	6	512494	512499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15605169
10102	NC_000117	ACG	2	6	512560	512565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605169
10103	NC_000117	TACT	2	8	512654	512661	25 %	50 %	0 %	25 %	15605169
10104	NC_000117	GTT	2	6	512686	512691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15605169
10105	NC_000117	TCC	2	6	512712	512717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605169
10106	NC_000117	AGA	2	6	512841	512846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605169
10107	NC_000117	CAA	3	9	512876	512884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605169
10108	NC_000117	GCTGTT	2	12	512893	512904	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	15605169
10109	NC_000117	ACT	2	6	512932	512937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605169
10110	NC_000117	CTT	2	6	512966	512971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605169
10111	NC_000117	AGC	2	6	513050	513055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605169
10112	NC_000117	CTT	2	6	513059	513064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605169
10113	NC_000117	CAG	2	6	513143	513148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605169
10114	NC_000117	ATAGG	2	10	513253	513262	40 %	20 %	40 %	0 %	15605169
10115	NC_000117	TG	3	6	513295	513300	0 %	50 %	50 %	0 %	15605169
10116	NC_000117	ATC	2	6	513315	513320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605169
10117	NC_000117	T	6	6	513436	513441	0 %	100 %	0 %	0 %	15605169
10118	NC_000117	T	6	6	513447	513452	0 %	100 %	0 %	0 %	15605169
10119	NC_000117	AGCTA	2	10	513489	513498	40 %	20 %	20 %	20 %	15605169
10120	NC_000117	AG	4	8	513510	513517	50 %	0 %	50 %	0 %	15605169
10121	NC_000117	TGA	2	6	513599	513604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605169
10122	NC_000117	ACC	2	6	513899	513904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15605170
10123	NC_000117	TCTT	2	8	513912	513919	0 %	75 %	0 %	25 %	15605170
10124	NC_000117	ACA	2	6	513986	513991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605170
10125	NC_000117	ACT	2	6	513992	513997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605170
10126	NC_000117	ACA	2	6	514005	514010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605170
10127	NC_000117	AGC	2	6	514019	514024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605170
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10130	NC_000117	CTG	2	6	514413	514418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605171
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10139	NC_000117	ATG	2	6	514822	514827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15605172
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10147	NC_000117	CT	3	6	515117	515122	0 %	50 %	0 %	50 %	15605172
10148	NC_000117	CTT	2	6	515301	515306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605172
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10151	NC_000117	TTCT	2	8	515348	515355	0 %	75 %	0 %	25 %	15605172
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10154	NC_000117	AGA	2	6	515438	515443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605172
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10161	NC_000117	CTC	2	6	515886	515891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605172
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10165	NC_000117	CTTC	2	8	516490	516497	0 %	50 %	0 %	50 %	15605173
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10244	NC_000117	CAACA	2	10	520690	520699	60 %	0 %	0 %	40 %	15605175
10245	NC_000117	GA	3	6	520700	520705	50 %	0 %	50 %	0 %	15605175
10246	NC_000117	CTT	2	6	520749	520754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605175
10247	NC_000117	CTCC	2	8	520928	520935	0 %	25 %	0 %	75 %	15605175
10248	NC_000117	T	6	6	520949	520954	0 %	100 %	0 %	0 %	15605175
10249	NC_000117	CTT	2	6	520968	520973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15605175
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10252	NC_000117	AAG	2	6	521211	521216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605175
10253	NC_000117	CT	3	6	521257	521262	0 %	50 %	0 %	50 %	15605175
10254	NC_000117	GAG	2	6	521349	521354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15605175
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10314	NC_000117	TTCT	2	8	525722	525729	0 %	75 %	0 %	25 %	15605178
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10342	NC_000117	AAGC	2	8	527044	527051	50 %	0 %	25 %	25 %	15605180
10343	NC_000117	TAT	2	6	527072	527077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15605180
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10345	NC_000117	AGCT	2	8	527146	527153	25 %	25 %	25 %	25 %	15605180
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10347	NC_000117	TGC	2	6	527237	527242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605180
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10350	NC_000117	TCA	2	6	527287	527292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605180
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10353	NC_000117	A	6	6	527520	527525	100 %	0 %	0 %	0 %	15605180
10354	NC_000117	CAA	2	6	527589	527594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605180
10355	NC_000117	ACA	2	6	527636	527641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15605181
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10358	NC_000117	CTA	2	6	527730	527735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605181
10359	NC_000117	ATCG	2	8	527818	527825	25 %	25 %	25 %	25 %	15605181
10360	NC_000117	TCC	2	6	527836	527841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15605181
10361	NC_000117	CTAG	2	8	527909	527916	25 %	25 %	25 %	25 %	15605181
10362	NC_000117	TGC	2	6	527959	527964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605181
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10366	NC_000117	TCA	2	6	528178	528183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605181
10367	NC_000117	AGA	2	6	528187	528192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605181
10368	NC_000117	TA	3	6	528204	528209	50 %	50 %	0 %	0 %	15605181
10369	NC_000117	CG	3	6	528220	528225	0 %	0 %	50 %	50 %	15605181
10370	NC_000117	AGA	2	6	528232	528237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605181
10371	NC_000117	A	6	6	528248	528253	100 %	0 %	0 %	0 %	15605181
10372	NC_000117	GCG	2	6	528387	528392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15605181
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10383	NC_000117	AAG	2	6	529044	529049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605181
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10474	NC_000117	TCTCC	2	10	533093	533102	0 %	40 %	0 %	60 %	15605183
10475	NC_000117	CGTA	2	8	533172	533179	25 %	25 %	25 %	25 %	15605183
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10483	NC_000117	ACC	2	6	533431	533436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15605183
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10487	NC_000117	TGG	2	6	533484	533489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15605183
10488	NC_000117	GGA	2	6	533491	533496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15605183
10489	NC_000117	GGA	3	9	533506	533514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15605183
10490	NC_000117	GCT	2	6	533526	533531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15605183
10491	NC_000117	AGC	2	6	533742	533747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605183
10492	NC_000117	ATC	2	6	533817	533822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605183
10493	NC_000117	GAC	2	6	533833	533838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605183
10494	NC_000117	AGC	3	9	533871	533879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15605183
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10496	NC_000117	TGAT	2	8	533906	533913	25 %	50 %	25 %	0 %	15605183
10497	NC_000117	TCA	2	6	534062	534067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15605184
10498	NC_000117	CT	3	6	534101	534106	0 %	50 %	0 %	50 %	15605184
10499	NC_000117	TAA	2	6	534130	534135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15605184
10500	NC_000117	AAG	2	6	534179	534184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15605184

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