MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis D/UW-3/CX chromosome

Total Repeats: 20291

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_000117	CTA	2	6	256966	256971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604951
5002	NC_000117	TC	3	6	256985	256990	0 %	50 %	0 %	50 %	15604951
5003	NC_000117	TTC	2	6	257093	257098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604951
5004	NC_000117	CTT	2	6	257101	257106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604951
5005	NC_000117	TC	3	6	257123	257128	0 %	50 %	0 %	50 %	15604951
5006	NC_000117	TCT	2	6	257185	257190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604951
5007	NC_000117	CAA	2	6	257246	257251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15604951
5008	NC_000117	GTTTT	2	10	257258	257267	0 %	80 %	20 %	0 %	15604951
5009	NC_000117	TTA	2	6	257282	257287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604951
5010	NC_000117	CATT	2	8	257306	257313	25 %	50 %	0 %	25 %	15604951
5011	NC_000117	CAC	2	6	257316	257321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15604951
5012	NC_000117	GCT	2	6	257401	257406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604951
5013	NC_000117	TCA	2	6	257449	257454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604951
5014	NC_000117	TCT	2	6	257484	257489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604951
5015	NC_000117	TTC	2	6	257498	257503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604951
5016	NC_000117	TGC	2	6	257557	257562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604951
5017	NC_000117	GTT	2	6	257563	257568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604951
5018	NC_000117	TAAT	2	8	257573	257580	50 %	50 %	0 %	0 %	15604951
5019	NC_000117	A	6	6	257581	257586	100 %	0 %	0 %	0 %	15604951
5020	NC_000117	AGA	2	6	257598	257603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604951
5021	NC_000117	A	8	8	257824	257831	100 %	0 %	0 %	0 %	15604952
5022	NC_000117	TCA	2	6	257842	257847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604952
5023	NC_000117	GAT	2	6	257868	257873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604952
5024	NC_000117	GGC	2	6	257932	257937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15604952
5025	NC_000117	TTC	2	6	257948	257953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604952
5026	NC_000117	ATT	2	6	257971	257976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604952
5027	NC_000117	CT	3	6	258004	258009	0 %	50 %	0 %	50 %	15604952
5028	NC_000117	AGG	2	6	258081	258086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15604952
5029	NC_000117	TAC	2	6	258121	258126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604952
5030	NC_000117	CTT	2	6	258156	258161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604952
5031	NC_000117	TAA	2	6	258318	258323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604952
5032	NC_000117	CTT	3	9	258505	258513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604952
5033	NC_000117	AAAC	2	8	258535	258542	75 %	0 %	0 %	25 %	15604952
5034	NC_000117	AAT	2	6	258580	258585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604952
5035	NC_000117	TTTCT	2	10	258590	258599	0 %	80 %	0 %	20 %	15604952
5036	NC_000117	TTTA	2	8	258697	258704	25 %	75 %	0 %	0 %	15604952
5037	NC_000117	TC	3	6	258744	258749	0 %	50 %	0 %	50 %	15604952
5038	NC_000117	T	6	6	258754	258759	0 %	100 %	0 %	0 %	15604952
5039	NC_000117	TCT	3	9	258767	258775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604952
5040	NC_000117	GGC	2	6	258789	258794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15604952
5041	NC_000117	GAT	2	6	258804	258809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604952
5042	NC_000117	TCT	2	6	258822	258827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604952
5043	NC_000117	A	6	6	258856	258861	100 %	0 %	0 %	0 %	15604952
5044	NC_000117	TCT	2	6	258874	258879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604952
5045	NC_000117	TGC	2	6	258888	258893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604952
5046	NC_000117	T	6	6	258931	258936	0 %	100 %	0 %	0 %	15604952
5047	NC_000117	TATT	2	8	258990	258997	25 %	75 %	0 %	0 %	15604952
5048	NC_000117	ACTT	2	8	259072	259079	25 %	50 %	0 %	25 %	15604952
5049	NC_000117	TGG	2	6	259171	259176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15604952
5050	NC_000117	TCTT	2	8	259241	259248	0 %	75 %	0 %	25 %	15604952
5051	NC_000117	AAC	2	6	259282	259287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15604952
5052	NC_000117	A	6	6	259476	259481	100 %	0 %	0 %	0 %	15604953
5053	NC_000117	GCA	2	6	259524	259529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604953
5054	NC_000117	TCT	2	6	259571	259576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604953
5055	NC_000117	TGC	2	6	259577	259582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604953
5056	NC_000117	TTA	2	6	259647	259652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604953
5057	NC_000117	CTT	2	6	259653	259658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604953
5058	NC_000117	CAA	2	6	259723	259728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15604953
5059	NC_000117	CA	3	6	259844	259849	50 %	0 %	0 %	50 %	15604954
5060	NC_000117	CTT	2	6	259974	259979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604954
5061	NC_000117	CAA	2	6	259999	260004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15604954
5062	NC_000117	TGCAA	2	10	260010	260019	40 %	20 %	20 %	20 %	15604954
5063	NC_000117	AAC	2	6	260020	260025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15604954
5064	NC_000117	A	6	6	260062	260067	100 %	0 %	0 %	0 %	15604954
5065	NC_000117	TGC	2	6	260136	260141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604954
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5068	NC_000117	CTGG	2	8	260218	260225	0 %	25 %	50 %	25 %	15604954
5069	NC_000117	TTG	2	6	260277	260282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604954
5070	NC_000117	TCT	2	6	260300	260305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604954
5071	NC_000117	CTT	2	6	260416	260421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604955
5072	NC_000117	T	6	6	260457	260462	0 %	100 %	0 %	0 %	15604955
5073	NC_000117	TAT	2	6	260498	260503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604955
5074	NC_000117	TTC	2	6	260504	260509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604955
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5078	NC_000117	TC	3	6	260678	260683	0 %	50 %	0 %	50 %	15604955
5079	NC_000117	CT	3	6	260690	260695	0 %	50 %	0 %	50 %	15604955
5080	NC_000117	ACCTTT	2	12	260729	260740	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15604955
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5082	NC_000117	T	6	6	260857	260862	0 %	100 %	0 %	0 %	15604955
5083	NC_000117	T	6	6	260922	260927	0 %	100 %	0 %	0 %	15604955
5084	NC_000117	AGA	2	6	261054	261059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604955
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5091	NC_000117	TGT	2	6	261391	261396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604955
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5094	NC_000117	GAT	2	6	261469	261474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604955
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5096	NC_000117	TTA	2	6	261487	261492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604955
5097	NC_000117	TAA	2	6	261507	261512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604955
5098	NC_000117	TTG	2	6	261548	261553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604955
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5100	NC_000117	TAT	2	6	261618	261623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604955
5101	NC_000117	CCG	2	6	261629	261634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15604955
5102	NC_000117	CACT	2	8	261663	261670	25 %	25 %	0 %	50 %	15604955
5103	NC_000117	TC	4	8	261693	261700	0 %	50 %	0 %	50 %	15604955
5104	NC_000117	ATGA	2	8	261748	261755	50 %	25 %	25 %	0 %	15604955
5105	NC_000117	A	6	6	261798	261803	100 %	0 %	0 %	0 %	15604955
5106	NC_000117	TTG	2	6	261841	261846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604955
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5108	NC_000117	CTT	2	6	261880	261885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604955
5109	NC_000117	A	6	6	261936	261941	100 %	0 %	0 %	0 %	15604955
5110	NC_000117	ACT	2	6	261975	261980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604955
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5112	NC_000117	AGC	3	9	262017	262025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604955
5113	NC_000117	TGA	2	6	262077	262082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604955
5114	NC_000117	TC	3	6	262179	262184	0 %	50 %	0 %	50 %	15604955
5115	NC_000117	TAA	2	6	262214	262219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604955
5116	NC_000117	AAG	2	6	262248	262253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604955
5117	NC_000117	TAT	2	6	262269	262274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604955
5118	NC_000117	CTT	2	6	262281	262286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604955
5119	NC_000117	AC	3	6	262403	262408	50 %	0 %	0 %	50 %	15604955
5120	NC_000117	GTTC	2	8	262470	262477	0 %	50 %	25 %	25 %	15604955
5121	NC_000117	CT	3	6	262533	262538	0 %	50 %	0 %	50 %	15604955
5122	NC_000117	GCA	2	6	262612	262617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604955
5123	NC_000117	ATAG	2	8	262633	262640	50 %	25 %	25 %	0 %	15604955
5124	NC_000117	GCT	2	6	262684	262689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604955
5125	NC_000117	TCG	2	6	262823	262828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604955
5126	NC_000117	TCA	2	6	262831	262836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604955
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5129	NC_000117	GAA	2	6	263026	263031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604955
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5239	NC_000117	TCTA	2	8	269984	269991	25 %	50 %	0 %	25 %	15604962
5240	NC_000117	TTA	2	6	269996	270001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604962
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5252	NC_000117	AAT	2	6	270407	270412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604962
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5255	NC_000117	GAG	2	6	270453	270458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15604962
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5383	NC_000117	TGT	2	6	275853	275858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604968
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5499	NC_000117	AAC	2	6	281487	281492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15604972
5500	NC_000117	CAT	2	6	281495	281500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604972

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