MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Liberibacter americanus str. Sao Paulo

Total Repeats: 32433

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022793	ATA	2	6	41	46	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022793	A	6	6	95	100	100 %	0 %	0 %	0 %	557822171
3	NC_022793	ACA	2	6	184	189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557822171
4	NC_022793	AGA	2	6	225	230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557822171
5	NC_022793	CA	3	6	290	295	50 %	0 %	0 %	50 %	557822171
6	NC_022793	TATC	2	8	304	311	25 %	50 %	0 %	25 %	557822171
7	NC_022793	ATT	2	6	412	417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557822171
8	NC_022793	TCT	2	6	457	462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557822171
9	NC_022793	TAC	2	6	474	479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557822171
10	NC_022793	ACC	2	6	486	491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557822171
11	NC_022793	TAA	2	6	494	499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557822171
12	NC_022793	T	6	6	578	583	0 %	100 %	0 %	0 %	557822171
13	NC_022793	AGC	2	6	621	626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557822171
14	NC_022793	AGA	2	6	642	647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557822171
15	NC_022793	TGC	2	6	741	746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557822171
16	NC_022793	AAT	2	6	760	765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557822171
17	NC_022793	AGT	2	6	771	776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557822171
18	NC_022793	CTG	2	6	785	790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557822171
19	NC_022793	TGA	2	6	882	887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557822171
20	NC_022793	TTA	2	6	934	939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557822171
21	NC_022793	GCA	2	6	973	978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557822171
22	NC_022793	CCT	2	6	988	993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557822171
23	NC_022793	AGG	2	6	1038	1043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557822171
24	NC_022793	A	7	7	1116	1122	100 %	0 %	0 %	0 %	557822171
25	NC_022793	TA	4	8	1136	1143	50 %	50 %	0 %	0 %	557822171
26	NC_022793	AGA	2	6	1146	1151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557822171
27	NC_022793	AAC	2	6	1179	1184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557822171
28	NC_022793	ATTC	2	8	1232	1239	25 %	50 %	0 %	25 %	557822171
29	NC_022793	A	8	8	1305	1312	100 %	0 %	0 %	0 %	557822171
30	NC_022793	GTAC	2	8	1390	1397	25 %	25 %	25 %	25 %	557822171
31	NC_022793	TATC	2	8	1426	1433	25 %	50 %	0 %	25 %	557822171
32	NC_022793	TAA	2	6	1550	1555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557822171
33	NC_022793	A	7	7	1554	1560	100 %	0 %	0 %	0 %	557822171
34	NC_022793	ATTAT	2	10	1623	1632	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022793	ATC	2	6	1638	1643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_022793	ATT	2	6	1700	1705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022793	AAT	2	6	1736	1741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022793	TAAA	2	8	1769	1776	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022793	ATATT	2	10	1778	1787	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022793	TAA	2	6	1792	1797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022793	ATT	2	6	1801	1806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022793	AGA	2	6	1823	1828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022793	TAA	2	6	1839	1844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022793	TGA	2	6	1870	1875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022793	TCA	2	6	1895	1900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_022793	TTA	2	6	1901	1906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022793	GTT	2	6	1932	1937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022793	TCTCA	2	10	2052	2061	20 %	40 %	0 %	40 %	557822172
49	NC_022793	CAT	2	6	2136	2141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557822172
50	NC_022793	TCA	2	6	2149	2154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557822172
51	NC_022793	TTG	2	6	2157	2162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557822172
52	NC_022793	ATA	2	6	2188	2193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557822172
53	NC_022793	T	7	7	2203	2209	0 %	100 %	0 %	0 %	557822172
54	NC_022793	ATC	2	6	2212	2217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557822172
55	NC_022793	TGCGA	2	10	2253	2262	20 %	20 %	40 %	20 %	557822172
56	NC_022793	CAC	2	6	2315	2320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557822172
57	NC_022793	AAT	2	6	2327	2332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557822172
58	NC_022793	GAT	2	6	2437	2442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557822172
59	NC_022793	TCA	2	6	2449	2454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557822172
60	NC_022793	GAA	2	6	2456	2461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557822172
61	NC_022793	AT	3	6	2528	2533	50 %	50 %	0 %	0 %	557822172
62	NC_022793	ATCC	2	8	2535	2542	25 %	25 %	0 %	50 %	557822172
63	NC_022793	TA	3	6	2605	2610	50 %	50 %	0 %	0 %	557822172
64	NC_022793	A	6	6	2767	2772	100 %	0 %	0 %	0 %	557822172
65	NC_022793	A	8	8	2907	2914	100 %	0 %	0 %	0 %	557822172
66	NC_022793	AATT	2	8	2937	2944	50 %	50 %	0 %	0 %	557822172
67	NC_022793	CT	3	6	2986	2991	0 %	50 %	0 %	50 %	557822172
68	NC_022793	TGAT	2	8	2992	2999	25 %	50 %	25 %	0 %	557822172
69	NC_022793	CGA	2	6	3007	3012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557822172
70	NC_022793	T	9	9	3095	3103	0 %	100 %	0 %	0 %	557822172
71	NC_022793	GAA	2	6	3135	3140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022793	ACA	2	6	3149	3154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557822173
73	NC_022793	CAT	2	6	3208	3213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557822173
74	NC_022793	TCC	2	6	3239	3244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557822173
75	NC_022793	TTCTT	2	10	3252	3261	0 %	80 %	0 %	20 %	557822173
76	NC_022793	A	7	7	3374	3380	100 %	0 %	0 %	0 %	557822173
77	NC_022793	TAG	2	6	3451	3456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557822173
78	NC_022793	CAA	2	6	3466	3471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557822173
79	NC_022793	CAA	2	6	3574	3579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557822173
80	NC_022793	TCT	2	6	3675	3680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557822173
81	NC_022793	AGA	2	6	3704	3709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557822173
82	NC_022793	ATA	2	6	3732	3737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557822173
83	NC_022793	CTTAT	2	10	3753	3762	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_022793	ATC	2	6	3857	3862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557822174
85	NC_022793	CAT	2	6	3884	3889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557822174
86	NC_022793	CTG	2	6	3925	3930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557822174
87	NC_022793	CAA	2	6	3943	3948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557822174
88	NC_022793	CATCAA	2	12	3979	3990	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	557822174
89	NC_022793	TCA	2	6	4002	4007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557822174
90	NC_022793	AGA	2	6	4034	4039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557822174
91	NC_022793	ATT	2	6	4074	4079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557822174
92	NC_022793	TAC	3	9	4096	4104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557822174
93	NC_022793	TGC	2	6	4157	4162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557822174
94	NC_022793	TCC	2	6	4172	4177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557822174
95	NC_022793	AAC	2	6	4238	4243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557822174
96	NC_022793	CCT	2	6	4290	4295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557822174
97	NC_022793	AAT	2	6	4304	4309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557822174
98	NC_022793	ATCC	2	8	4368	4375	25 %	25 %	0 %	50 %	557822174
99	NC_022793	GTT	2	6	4425	4430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557822174
100	NC_022793	TAA	2	6	4480	4485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557822174
101	NC_022793	CTC	2	6	4486	4491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557822174
102	NC_022793	TAT	2	6	4544	4549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557822174
103	NC_022793	TCC	2	6	4551	4556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557822174
104	NC_022793	ATT	2	6	4557	4562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557822174
105	NC_022793	TAAT	2	8	4580	4587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022793	AATGA	2	10	4600	4609	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022793	A	6	6	4665	4670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022793	AAAT	2	8	4697	4704	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022793	A	6	6	4727	4732	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022793	TGA	2	6	4777	4782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022793	T	7	7	4786	4792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022793	ATGT	2	8	4794	4801	25 %	50 %	25 %	0 %	557822175
113	NC_022793	AT	3	6	4815	4820	50 %	50 %	0 %	0 %	557822175
114	NC_022793	CAG	2	6	4899	4904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557822175
115	NC_022793	ATC	2	6	4945	4950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557822175
116	NC_022793	CCAA	2	8	4957	4964	50 %	0 %	0 %	50 %	557822175
117	NC_022793	CAT	2	6	5077	5082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557822175
118	NC_022793	AGTTTC	2	12	5086	5097	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	557822175
119	NC_022793	TCC	2	6	5098	5103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557822175
120	NC_022793	ATA	2	6	5135	5140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557822175
121	NC_022793	CCA	2	6	5178	5183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557822175
122	NC_022793	CAA	2	6	5214	5219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557822175
123	NC_022793	ACC	2	6	5239	5244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557822175
124	NC_022793	TATAA	2	10	5296	5305	60 %	40 %	0 %	0 %	557822175
125	NC_022793	CAT	2	6	5322	5327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557822175
126	NC_022793	GAAG	2	8	5417	5424	50 %	0 %	50 %	0 %	557822175
127	NC_022793	AAT	2	6	5458	5463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557822175
128	NC_022793	AGTATC	2	12	5464	5475	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	557822175
129	NC_022793	ACT	2	6	5522	5527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557822175
130	NC_022793	A	8	8	5637	5644	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022793	TA	3	6	5654	5659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022793	TAC	2	6	5661	5666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_022793	ATG	2	6	5688	5693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022793	ATT	2	6	5704	5709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022793	AT	3	6	5713	5718	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022793	CAG	2	6	5760	5765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557822176
137	NC_022793	TACT	2	8	5775	5782	25 %	50 %	0 %	25 %	557822176
138	NC_022793	AAT	2	6	5789	5794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557822176
139	NC_022793	TAA	2	6	5875	5880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557822176
140	NC_022793	TA	3	6	5921	5926	50 %	50 %	0 %	0 %	557822176
141	NC_022793	GAT	3	9	5930	5938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557822176
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143	NC_022793	GAA	2	6	5993	5998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557822176
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171	NC_022793	AATA	2	8	7256	7263	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_022793	AAT	2	6	7304	7309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557822177
173	NC_022793	AT	3	6	7313	7318	50 %	50 %	0 %	0 %	557822177
174	NC_022793	TTTA	2	8	7319	7326	25 %	75 %	0 %	0 %	557822177
175	NC_022793	T	7	7	7331	7337	0 %	100 %	0 %	0 %	557822177
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257	NC_022793	ATC	2	6	10144	10149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
258	NC_022793	ATA	2	6	10171	10176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
259	NC_022793	GTTT	2	8	10194	10201	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
260	NC_022793	ATAG	2	8	10225	10232	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
261	NC_022793	A	6	6	10233	10238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
262	NC_022793	A	6	6	10240	10245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
263	NC_022793	ATT	2	6	10282	10287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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266	NC_022793	AAT	2	6	10358	10363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
267	NC_022793	A	7	7	10388	10394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
268	NC_022793	TTA	2	6	10417	10422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
269	NC_022793	CTT	2	6	10479	10484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
270	NC_022793	TAT	2	6	10512	10517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
271	NC_022793	TAT	2	6	10551	10556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
272	NC_022793	AAGG	2	8	10569	10576	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
273	NC_022793	ATGG	2	8	10675	10682	25 %	25 %	50 %	0 %	557822179
274	NC_022793	A	6	6	10683	10688	100 %	0 %	0 %	0 %	557822179
275	NC_022793	TAC	2	6	10722	10727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557822179
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