MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium tetani 12124569 main chromosome

Total Repeats: 78751

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022777	T	6	6	25	30	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022777	A	6	6	31	36	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022777	TGT	2	6	71	76	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022777	CAA	2	6	84	89	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_022777	AATTT	2	10	108	117	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022777	TAT	2	6	149	154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022777	TATT	3	12	159	170	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022777	TC	3	6	182	187	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_022777	GTT	2	6	218	223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022777	TAATA	2	10	224	233	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022777	TAT	2	6	258	263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022777	AAT	2	6	280	285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557604011
13	NC_022777	TA	5	10	297	306	50 %	50 %	0 %	0 %	557604011
14	NC_022777	AT	4	8	315	322	50 %	50 %	0 %	0 %	557604011
15	NC_022777	TAA	2	6	324	329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557604011
16	NC_022777	TTCC	2	8	338	345	0 %	50 %	0 %	50 %	557604011
17	NC_022777	CTT	2	6	406	411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604011
18	NC_022777	CT	3	6	414	419	0 %	50 %	0 %	50 %	557604011
19	NC_022777	CTT	2	6	467	472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604011
20	NC_022777	T	7	7	493	499	0 %	100 %	0 %	0 %	557604011
21	NC_022777	TCT	2	6	508	513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604011
22	NC_022777	TCA	2	6	520	525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557604011
23	NC_022777	ATA	2	6	529	534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557604011
24	NC_022777	CTT	2	6	554	559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604011
25	NC_022777	TCTAT	2	10	589	598	20 %	60 %	0 %	20 %	557604011
26	NC_022777	CTTT	2	8	688	695	0 %	75 %	0 %	25 %	557604011
27	NC_022777	ATT	3	9	721	729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557604011
28	NC_022777	A	8	8	741	748	100 %	0 %	0 %	0 %	557604011
29	NC_022777	TCT	2	6	781	786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604011
30	NC_022777	TCT	2	6	864	869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604011
31	NC_022777	T	6	6	872	877	0 %	100 %	0 %	0 %	557604011
32	NC_022777	TCA	2	6	895	900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557604011
33	NC_022777	AT	3	6	955	960	50 %	50 %	0 %	0 %	557604011
34	NC_022777	TTA	2	6	977	982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557604011
35	NC_022777	AAT	2	6	1000	1005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557604011
36	NC_022777	T	7	7	1079	1085	0 %	100 %	0 %	0 %	557604011
37	NC_022777	TCT	2	6	1107	1112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604011
38	NC_022777	TAA	2	6	1185	1190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557604011
39	NC_022777	CTT	2	6	1199	1204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604011
40	NC_022777	ATC	2	6	1260	1265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557604011
41	NC_022777	TCT	2	6	1289	1294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604011
42	NC_022777	TTC	2	6	1299	1304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604011
43	NC_022777	GCT	2	6	1345	1350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557604011
44	NC_022777	ATTTT	2	10	1384	1393	20 %	80 %	0 %	0 %	557604011
45	NC_022777	CTT	2	6	1409	1414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604011
46	NC_022777	CTA	2	6	1430	1435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557604011
47	NC_022777	TA	3	6	1515	1520	50 %	50 %	0 %	0 %	557604011
48	NC_022777	CCT	2	6	1541	1546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557604011
49	NC_022777	TAT	2	6	1601	1606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557604011
50	NC_022777	CTC	2	6	1638	1643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557604011
51	NC_022777	TCT	2	6	1662	1667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604011
52	NC_022777	TA	3	6	1689	1694	50 %	50 %	0 %	0 %	557604011
53	NC_022777	TTC	2	6	1704	1709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604011
54	NC_022777	CTC	2	6	1739	1744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557604011
55	NC_022777	AT	3	6	1763	1768	50 %	50 %	0 %	0 %	557604011
56	NC_022777	GCA	2	6	1771	1776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557604011
57	NC_022777	CTC	2	6	1784	1789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557604011
58	NC_022777	CTA	2	6	1868	1873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557604011
59	NC_022777	TAA	2	6	1938	1943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557604011
60	NC_022777	AT	3	6	1944	1949	50 %	50 %	0 %	0 %	557604011
61	NC_022777	T	7	7	1978	1984	0 %	100 %	0 %	0 %	557604011
62	NC_022777	TAT	2	6	1986	1991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557604011
63	NC_022777	ATT	2	6	2055	2060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557604011
64	NC_022777	TCT	2	6	2067	2072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604011
65	NC_022777	CT	3	6	2092	2097	0 %	50 %	0 %	50 %	557604011
66	NC_022777	CTAC	2	8	2110	2117	25 %	25 %	0 %	50 %	557604011
67	NC_022777	ACA	2	6	2119	2124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557604011
68	NC_022777	T	7	7	2129	2135	0 %	100 %	0 %	0 %	557604011
69	NC_022777	TTTC	2	8	2245	2252	0 %	75 %	0 %	25 %	557604011
70	NC_022777	TTATCT	2	12	2275	2286	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	557604011
71	NC_022777	ATC	2	6	2292	2297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557604011
72	NC_022777	ATTC	2	8	2313	2320	25 %	50 %	0 %	25 %	557604011
73	NC_022777	ATT	2	6	2328	2333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557604011
74	NC_022777	AAAT	2	8	2346	2353	75 %	25 %	0 %	0 %	557604011
75	NC_022777	TAA	2	6	2388	2393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557604011
76	NC_022777	TCT	2	6	2425	2430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604011
77	NC_022777	ATT	2	6	2452	2457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557604011
78	NC_022777	TAG	2	6	2549	2554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557604011
79	NC_022777	TAAT	2	8	2612	2619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022777	TTA	2	6	2636	2641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022777	TTA	2	6	2669	2674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022777	AATATA	2	12	2719	2730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022777	T	6	6	2744	2749	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022777	AGG	2	6	2759	2764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022777	TTC	2	6	2805	2810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604012
86	NC_022777	TAA	2	6	2824	2829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557604012
87	NC_022777	AGAA	2	8	2849	2856	75 %	0 %	25 %	0 %	557604012
88	NC_022777	A	6	6	2866	2871	100 %	0 %	0 %	0 %	557604012
89	NC_022777	TAA	3	9	2887	2895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557604012
90	NC_022777	ACC	2	6	2903	2908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557604012
91	NC_022777	T	7	7	2917	2923	0 %	100 %	0 %	0 %	557604012
92	NC_022777	TAAAT	2	10	2957	2966	60 %	40 %	0 %	0 %	557604012
93	NC_022777	GAT	2	6	3021	3026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557604012
94	NC_022777	AAT	2	6	3087	3092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557604012
95	NC_022777	CAT	2	6	3162	3167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557604012
96	NC_022777	A	6	6	3191	3196	100 %	0 %	0 %	0 %	557604012
97	NC_022777	ATA	2	6	3201	3206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557604012
98	NC_022777	A	6	6	3218	3223	100 %	0 %	0 %	0 %	557604012
99	NC_022777	ATTT	2	8	3263	3270	25 %	75 %	0 %	0 %	557604012
100	NC_022777	ATGAT	2	10	3313	3322	40 %	40 %	20 %	0 %	557604012
101	NC_022777	AAAT	2	8	3379	3386	75 %	25 %	0 %	0 %	557604012
102	NC_022777	A	7	7	3581	3587	100 %	0 %	0 %	0 %	557604012
103	NC_022777	AAT	2	6	3591	3596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557604012
104	NC_022777	TAA	2	6	3607	3612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557604012
105	NC_022777	TCAT	2	8	3623	3630	25 %	50 %	0 %	25 %	557604012
106	NC_022777	AATC	2	8	3645	3652	50 %	25 %	0 %	25 %	557604012
107	NC_022777	A	6	6	3657	3662	100 %	0 %	0 %	0 %	557604012
108	NC_022777	AGCT	2	8	3670	3677	25 %	25 %	25 %	25 %	557604012
109	NC_022777	TCA	2	6	3702	3707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557604012
110	NC_022777	AT	4	8	3732	3739	50 %	50 %	0 %	0 %	557604012
111	NC_022777	AT	5	10	3751	3760	50 %	50 %	0 %	0 %	557604012
112	NC_022777	TAT	2	6	3791	3796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557604012
113	NC_022777	ATT	2	6	3966	3971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557604012
114	NC_022777	CTA	2	6	3991	3996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557604012
115	NC_022777	AAAT	2	8	4042	4049	75 %	25 %	0 %	0 %	557604012
116	NC_022777	AT	3	6	4056	4061	50 %	50 %	0 %	0 %	557604012
117	NC_022777	GAA	2	6	4065	4070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557604012
118	NC_022777	AGA	2	6	4085	4090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557604012
119	NC_022777	T	6	6	4095	4100	0 %	100 %	0 %	0 %	557604012
120	NC_022777	AACAG	2	10	4127	4136	60 %	0 %	20 %	20 %	557604012
121	NC_022777	GTT	2	6	4187	4192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557604012
122	NC_022777	TTC	2	6	4193	4198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604012
123	NC_022777	AGG	2	6	4218	4223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022777	TATT	2	8	4226	4233	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022777	AGA	3	9	4251	4259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022777	A	8	8	4263	4270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022777	GAT	2	6	4288	4293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022777	TTTA	2	8	4341	4348	25 %	75 %	0 %	0 %	557604013
129	NC_022777	AGA	2	6	4377	4382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557604013
130	NC_022777	AGC	2	6	4401	4406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557604013
131	NC_022777	TAAAA	2	10	4494	4503	80 %	20 %	0 %	0 %	557604013
132	NC_022777	GAA	2	6	4517	4522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557604013
133	NC_022777	CCT	2	6	4540	4545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557604013
134	NC_022777	AAAT	2	8	4556	4563	75 %	25 %	0 %	0 %	557604013
135	NC_022777	A	7	7	4581	4587	100 %	0 %	0 %	0 %	557604013
136	NC_022777	ATT	2	6	4612	4617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557604013
137	NC_022777	CTA	2	6	4664	4669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557604013
138	NC_022777	AT	3	6	4718	4723	50 %	50 %	0 %	0 %	557604013
139	NC_022777	ATC	2	6	4733	4738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557604013
140	NC_022777	AT	3	6	4750	4755	50 %	50 %	0 %	0 %	557604013
141	NC_022777	AGA	2	6	4788	4793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557604013
142	NC_022777	AT	3	6	4811	4816	50 %	50 %	0 %	0 %	557604013
143	NC_022777	TAAA	2	8	4827	4834	75 %	25 %	0 %	0 %	557604013
144	NC_022777	ATTA	2	8	4841	4848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022777	TTTA	2	8	4857	4864	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_022777	ATT	2	6	4868	4873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557604014
147	NC_022777	TTA	2	6	4874	4879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557604014
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162	NC_022777	TA	3	6	5228	5233	50 %	50 %	0 %	0 %	557604014
163	NC_022777	TTC	2	6	5235	5240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557604014
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172	NC_022777	AATT	2	8	5513	5520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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174	NC_022777	AAT	2	6	5810	5815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_022777	AAT	2	6	5838	5843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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280	NC_022777	A	6	6	11603	11608	100 %	0 %	0 %	0 %	557604015
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284	NC_022777	A	6	6	11737	11742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_022777	ATC	2	6	11765	11770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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287	NC_022777	AAATT	2	10	11824	11833	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_022777	AATTT	2	10	11863	11872	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_022777	ATCAA	2	10	11935	11944	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
290	NC_022777	TGT	2	6	11982	11987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
291	NC_022777	TAT	2	6	11994	11999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_022777	AT	3	6	12003	12008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_022777	ATT	2	6	12025	12030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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309	NC_022777	TA	3	6	12529	12534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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