MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Campylobacter coli 15-537360 plasmid pCC42yr

Total Repeats: 625

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022656	TTTGTA	2	12	36	47	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022656	TTA	2	6	68	73	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022656	TTA	2	6	127	132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022656	TTC	2	6	228	233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561978
5	NC_022656	ATA	2	6	262	267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561978
6	NC_022656	AGCAA	2	10	302	311	60 %	0 %	20 %	20 %	556561978
7	NC_022656	AT	3	6	319	324	50 %	50 %	0 %	0 %	556561978
8	NC_022656	TAA	2	6	344	349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561978
9	NC_022656	A	6	6	384	389	100 %	0 %	0 %	0 %	556561978
10	NC_022656	AATC	2	8	408	415	50 %	25 %	0 %	25 %	556561978
11	NC_022656	A	7	7	467	473	100 %	0 %	0 %	0 %	556561978
12	NC_022656	TAT	2	6	517	522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561978
13	NC_022656	AGCC	2	8	566	573	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_022656	AAAAAT	2	12	581	592	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022656	A	6	6	605	610	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022656	TTTA	2	8	687	694	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022656	TAT	2	6	706	711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022656	CTT	2	6	766	771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_022656	TA	3	6	779	784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022656	TTG	2	6	880	885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022656	AAG	2	6	887	892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022656	A	6	6	951	956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022656	T	6	6	957	962	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022656	AAG	2	6	980	985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022656	A	8	8	996	1003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022656	CCA	2	6	1053	1058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_022656	CCA	2	6	1074	1079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_022656	GTG	2	6	1098	1103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556561979
29	NC_022656	ATT	2	6	1109	1114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561979
30	NC_022656	A	6	6	1120	1125	100 %	0 %	0 %	0 %	556561979
31	NC_022656	AAAT	2	8	1136	1143	75 %	25 %	0 %	0 %	556561979
32	NC_022656	A	6	6	1148	1153	100 %	0 %	0 %	0 %	556561979
33	NC_022656	T	7	7	1158	1164	0 %	100 %	0 %	0 %	556561979
34	NC_022656	T	6	6	1181	1186	0 %	100 %	0 %	0 %	556561979
35	NC_022656	A	6	6	1190	1195	100 %	0 %	0 %	0 %	556561979
36	NC_022656	ATA	2	6	1200	1205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561979
37	NC_022656	A	6	6	1220	1225	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022656	GAAA	2	8	1237	1244	75 %	0 %	25 %	0 %	556561980
39	NC_022656	TAG	2	6	1245	1250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561980
40	NC_022656	TA	3	6	1278	1283	50 %	50 %	0 %	0 %	556561980
41	NC_022656	ATA	2	6	1305	1310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561980
42	NC_022656	TAC	2	6	1324	1329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561980
43	NC_022656	A	6	6	1356	1361	100 %	0 %	0 %	0 %	556561980
44	NC_022656	GAT	2	6	1367	1372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561980
45	NC_022656	TTA	2	6	1374	1379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561980
46	NC_022656	ATTA	2	8	1397	1404	50 %	50 %	0 %	0 %	556561980
47	NC_022656	AGT	2	6	1438	1443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561980
48	NC_022656	ATG	2	6	1448	1453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561980
49	NC_022656	A	7	7	1520	1526	100 %	0 %	0 %	0 %	556561980
50	NC_022656	AAC	2	6	1602	1607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556561980
51	NC_022656	AAG	2	6	1608	1613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561980
52	NC_022656	AT	3	6	1639	1644	50 %	50 %	0 %	0 %	556561980
53	NC_022656	ACAA	2	8	1699	1706	75 %	0 %	0 %	25 %	556561980
54	NC_022656	AGTAGA	2	12	1750	1761	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	556561980
55	NC_022656	ATT	2	6	1806	1811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561980
56	NC_022656	ATT	2	6	1862	1867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561980
57	NC_022656	A	6	6	1874	1879	100 %	0 %	0 %	0 %	556561980
58	NC_022656	CTT	2	6	1926	1931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561980
59	NC_022656	AAG	2	6	1956	1961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561980
60	NC_022656	TGG	2	6	1984	1989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556561980
61	NC_022656	AAG	2	6	2064	2069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561980
62	NC_022656	T	7	7	2087	2093	0 %	100 %	0 %	0 %	556561981
63	NC_022656	GAA	2	6	2122	2127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561981
64	NC_022656	CAA	2	6	2143	2148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556561981
65	NC_022656	ATTT	2	8	2161	2168	25 %	75 %	0 %	0 %	556561981
66	NC_022656	T	6	6	2166	2171	0 %	100 %	0 %	0 %	556561981
67	NC_022656	T	6	6	2195	2200	0 %	100 %	0 %	0 %	556561981
68	NC_022656	A	6	6	2236	2241	100 %	0 %	0 %	0 %	556561981
69	NC_022656	ATT	2	6	2342	2347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561981
70	NC_022656	TGT	2	6	2410	2415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556561981
71	NC_022656	A	6	6	2434	2439	100 %	0 %	0 %	0 %	556561981
72	NC_022656	A	7	7	2574	2580	100 %	0 %	0 %	0 %	556561982
73	NC_022656	A	6	6	2626	2631	100 %	0 %	0 %	0 %	556561982
74	NC_022656	A	8	8	2656	2663	100 %	0 %	0 %	0 %	556561982
75	NC_022656	T	6	6	2671	2676	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022656	A	6	6	2679	2684	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022656	TCT	2	6	2693	2698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_022656	A	6	6	2700	2705	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022656	A	6	6	2752	2757	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022656	AATTA	2	10	2765	2774	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022656	ATA	2	6	2778	2783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022656	TAA	2	6	2784	2789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022656	T	6	6	2817	2822	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022656	A	6	6	2826	2831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022656	AG	10	20	2857	2876	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022656	AAT	2	6	2880	2885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022656	A	8	8	2934	2941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022656	CAAG	2	8	3007	3014	50 %	0 %	25 %	25 %	556561983
89	NC_022656	A	6	6	3023	3028	100 %	0 %	0 %	0 %	556561983
90	NC_022656	ATTTT	2	10	3049	3058	20 %	80 %	0 %	0 %	556561983
91	NC_022656	GATAT	2	10	3133	3142	40 %	40 %	20 %	0 %	556561983
92	NC_022656	CTT	2	6	3199	3204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561983
93	NC_022656	A	7	7	3318	3324	100 %	0 %	0 %	0 %	556561983
94	NC_022656	TGA	2	6	3345	3350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561983
95	NC_022656	CAAAA	2	10	3377	3386	80 %	0 %	0 %	20 %	556561983
96	NC_022656	GTT	2	6	3430	3435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556561983
97	NC_022656	ATT	2	6	3475	3480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561983
98	NC_022656	AAG	2	6	3665	3670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561983
99	NC_022656	GGA	2	6	3709	3714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556561983
100	NC_022656	GGA	2	6	3745	3750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556561983
101	NC_022656	CAA	2	6	3782	3787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556561983
102	NC_022656	AATT	2	8	3803	3810	50 %	50 %	0 %	0 %	556561983
103	NC_022656	AGG	2	6	3851	3856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556561983
104	NC_022656	A	6	6	3940	3945	100 %	0 %	0 %	0 %	556561984
105	NC_022656	ATTTT	2	10	3952	3961	20 %	80 %	0 %	0 %	556561984
106	NC_022656	CAA	2	6	3992	3997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556561984
107	NC_022656	TAT	2	6	4068	4073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561984
108	NC_022656	TGGAGC	2	12	4092	4103	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	556561984
109	NC_022656	TTA	2	6	4136	4141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561984
110	NC_022656	TAG	2	6	4178	4183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561984
111	NC_022656	T	6	6	4205	4210	0 %	100 %	0 %	0 %	556561984
112	NC_022656	CAA	2	6	4211	4216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556561984
113	NC_022656	GAA	2	6	4236	4241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561985
114	NC_022656	CAA	2	6	4271	4276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556561985
115	NC_022656	T	8	8	4392	4399	0 %	100 %	0 %	0 %	556561985
116	NC_022656	A	6	6	4476	4481	100 %	0 %	0 %	0 %	556561985
117	NC_022656	TAT	2	6	4485	4490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561985
118	NC_022656	AAGCA	2	10	4547	4556	60 %	0 %	20 %	20 %	556561986
119	NC_022656	CAA	2	6	4613	4618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556561986
120	NC_022656	TAT	2	6	4644	4649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561986
121	NC_022656	GAAA	2	8	4683	4690	75 %	0 %	25 %	0 %	556561986
122	NC_022656	ATTG	2	8	4752	4759	25 %	50 %	25 %	0 %	556561986
123	NC_022656	GAAA	2	8	4836	4843	75 %	0 %	25 %	0 %	556561986
124	NC_022656	ATT	2	6	4846	4851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561986
125	NC_022656	ATAA	2	8	4920	4927	75 %	25 %	0 %	0 %	556561986
126	NC_022656	TGA	2	6	4939	4944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561986
127	NC_022656	A	6	6	4958	4963	100 %	0 %	0 %	0 %	556561986
128	NC_022656	AGA	2	6	5018	5023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561986
129	NC_022656	TA	3	6	5037	5042	50 %	50 %	0 %	0 %	556561986
130	NC_022656	ATA	2	6	5083	5088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561986
131	NC_022656	GAT	2	6	5103	5108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561986
132	NC_022656	AT	3	6	5117	5122	50 %	50 %	0 %	0 %	556561986
133	NC_022656	GA	3	6	5142	5147	50 %	0 %	50 %	0 %	556561986
134	NC_022656	A	6	6	5149	5154	100 %	0 %	0 %	0 %	556561986
135	NC_022656	TAC	2	6	5158	5163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561986
136	NC_022656	AT	3	6	5243	5248	50 %	50 %	0 %	0 %	556561986
137	NC_022656	ATT	2	6	5253	5258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561986
138	NC_022656	GAC	2	6	5358	5363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556561986
139	NC_022656	TAA	2	6	5384	5389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561986
140	NC_022656	A	6	6	5397	5402	100 %	0 %	0 %	0 %	556561986
141	NC_022656	CAA	2	6	5406	5411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556561986
142	NC_022656	A	6	6	5410	5415	100 %	0 %	0 %	0 %	556561986
143	NC_022656	GAT	2	6	5463	5468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561986
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149	NC_022656	TCC	2	6	5906	5911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556561986
150	NC_022656	CTTG	2	8	5949	5956	0 %	50 %	25 %	25 %	556561986
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153	NC_022656	CAAAA	2	10	6172	6181	80 %	0 %	0 %	20 %	556561986
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173	NC_022656	ATTA	2	8	7042	7049	50 %	50 %	0 %	0 %	556561987
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