MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Carnobacterium sp. WN1359 plasmid pWNCR9

Total Repeats: 277

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022608	A	6	6	20	25	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022608	GCT	2	6	31	36	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_022608	TGTT	2	8	45	52	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022608	T	8	8	65	72	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022608	A	6	6	79	84	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022608	GAA	2	6	103	108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022608	T	6	6	119	124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022608	T	6	6	151	156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022608	TAA	2	6	159	164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022608	A	6	6	163	168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022608	TTTC	2	8	179	186	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_022608	ACT	2	6	205	210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_022608	GCA	2	6	214	219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_022608	T	7	7	369	375	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022608	TCA	2	6	384	389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_022608	A	6	6	501	506	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022608	A	7	7	561	567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022608	AGG	2	6	575	580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022608	T	6	6	630	635	0 %	100 %	0 %	0 %	554651120
20	NC_022608	AGC	2	6	645	650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	554651120
21	NC_022608	A	7	7	653	659	100 %	0 %	0 %	0 %	554651120
22	NC_022608	TAA	2	6	669	674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554651120
23	NC_022608	AGA	2	6	840	845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554651120
24	NC_022608	A	6	6	848	853	100 %	0 %	0 %	0 %	554651120
25	NC_022608	TTAAA	2	10	864	873	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022608	A	7	7	871	877	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022608	AGGT	2	8	883	890	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022608	A	6	6	915	920	100 %	0 %	0 %	0 %	554651121
29	NC_022608	ATGA	2	8	949	956	50 %	25 %	25 %	0 %	554651121
30	NC_022608	TAAA	2	8	959	966	75 %	25 %	0 %	0 %	554651121
31	NC_022608	GAA	2	6	973	978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554651121
32	NC_022608	AAT	2	6	997	1002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554651121
33	NC_022608	TTA	2	6	1012	1017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554651121
34	NC_022608	AAAAC	2	10	1034	1043	80 %	0 %	0 %	20 %	554651121
35	NC_022608	A	7	7	1061	1067	100 %	0 %	0 %	0 %	554651121
36	NC_022608	A	6	6	1084	1089	100 %	0 %	0 %	0 %	554651121
37	NC_022608	A	6	6	1105	1110	100 %	0 %	0 %	0 %	554651121
38	NC_022608	TACTT	2	10	1119	1128	20 %	60 %	0 %	20 %	554651121
39	NC_022608	CTTT	2	8	1152	1159	0 %	75 %	0 %	25 %	554651121
40	NC_022608	GA	3	6	1212	1217	50 %	0 %	50 %	0 %	554651121
41	NC_022608	GAAA	2	8	1237	1244	75 %	0 %	25 %	0 %	554651121
42	NC_022608	A	7	7	1251	1257	100 %	0 %	0 %	0 %	554651121
43	NC_022608	AAT	2	6	1283	1288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022608	T	7	7	1298	1304	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022608	TGAAC	2	10	1325	1334	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_022608	A	7	7	1366	1372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022608	GTTT	2	8	1414	1421	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022608	GTC	2	6	1430	1435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_022608	A	7	7	1445	1451	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022608	AAT	2	6	1500	1505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022608	A	6	6	1532	1537	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022608	ATTT	2	8	1558	1565	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022608	TAA	2	6	1615	1620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022608	A	7	7	1640	1646	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022608	TCA	2	6	1650	1655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_022608	T	6	6	1712	1717	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022608	TA	3	6	1723	1728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022608	A	6	6	1731	1736	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022608	GAAAC	2	10	1737	1746	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_022608	TTA	2	6	1761	1766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022608	TA	3	6	1768	1773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022608	A	7	7	1782	1788	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022608	CTT	2	6	1816	1821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_022608	AGGC	2	8	1822	1829	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_022608	CGC	2	6	1912	1917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_022608	TGT	2	6	1966	1971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022608	GGT	2	6	2006	2011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022608	ACA	2	6	2088	2093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_022608	ATT	2	6	2202	2207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022608	CAG	2	6	2262	2267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_022608	A	6	6	2309	2314	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022608	A	6	6	2425	2430	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022608	AT	3	6	2519	2524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022608	CAT	2	6	2650	2655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554651122
75	NC_022608	ACA	2	6	2775	2780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554651122
76	NC_022608	AAAAGA	2	12	2809	2820	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	554651122
77	NC_022608	AATT	2	8	2865	2872	50 %	50 %	0 %	0 %	554651122
78	NC_022608	CAG	2	6	2879	2884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	554651122
79	NC_022608	A	6	6	2907	2912	100 %	0 %	0 %	0 %	554651122
80	NC_022608	A	7	7	2975	2981	100 %	0 %	0 %	0 %	554651122
81	NC_022608	ATAG	2	8	3012	3019	50 %	25 %	25 %	0 %	554651122
82	NC_022608	GAA	2	6	3052	3057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554651113
83	NC_022608	TAA	2	6	3064	3069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554651113
84	NC_022608	ATT	2	6	3070	3075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554651113
85	NC_022608	ATT	2	6	3120	3125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554651113
86	NC_022608	AAGT	2	8	3150	3157	50 %	25 %	25 %	0 %	554651113
87	NC_022608	TTTA	2	8	3172	3179	25 %	75 %	0 %	0 %	554651113
88	NC_022608	CA	3	6	3196	3201	50 %	0 %	0 %	50 %	554651113
89	NC_022608	CTATT	2	10	3214	3223	20 %	60 %	0 %	20 %	554651113
90	NC_022608	AAT	2	6	3259	3264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554651113
91	NC_022608	TTA	3	9	3266	3274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554651113
92	NC_022608	TGG	2	6	3292	3297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	554651113
93	NC_022608	ATT	2	6	3358	3363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554651113
94	NC_022608	A	7	7	3389	3395	100 %	0 %	0 %	0 %	554651113
95	NC_022608	TCA	2	6	3462	3467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_022608	A	7	7	3504	3510	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022608	AGG	2	6	3577	3582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022608	T	6	6	3583	3588	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022608	ATT	2	6	3608	3613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022608	T	7	7	3612	3618	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022608	TTA	2	6	3630	3635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022608	A	8	8	3644	3651	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022608	AG	3	6	3714	3719	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022608	G	6	6	3750	3755	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022608	AT	4	8	3768	3775	50 %	50 %	0 %	0 %	554651123
106	NC_022608	T	6	6	3876	3881	0 %	100 %	0 %	0 %	554651123
107	NC_022608	AAC	2	6	3889	3894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554651123
108	NC_022608	TCT	2	6	3940	3945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554651123
109	NC_022608	A	8	8	3996	4003	100 %	0 %	0 %	0 %	554651123
110	NC_022608	A	6	6	4018	4023	100 %	0 %	0 %	0 %	554651123
111	NC_022608	AT	3	6	4044	4049	50 %	50 %	0 %	0 %	554651123
112	NC_022608	A	6	6	4050	4055	100 %	0 %	0 %	0 %	554651123
113	NC_022608	ATT	2	6	4092	4097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554651123
114	NC_022608	ACA	2	6	4128	4133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554651123
115	NC_022608	ATT	2	6	4136	4141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554651123
116	NC_022608	TAT	2	6	4175	4180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554651123
117	NC_022608	GAA	2	6	4183	4188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554651123
118	NC_022608	A	7	7	4206	4212	100 %	0 %	0 %	0 %	554651123
119	NC_022608	T	7	7	4227	4233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022608	ATG	2	6	4262	4267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554651124
121	NC_022608	TTG	2	6	4282	4287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	554651124
122	NC_022608	AATGCC	2	12	4291	4302	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	554651124
123	NC_022608	T	6	6	4386	4391	0 %	100 %	0 %	0 %	554651124
124	NC_022608	CTG	3	9	4444	4452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	554651124
125	NC_022608	AC	3	6	4459	4464	50 %	0 %	0 %	50 %	554651124
126	NC_022608	TTG	2	6	4495	4500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	554651124
127	NC_022608	T	8	8	4512	4519	0 %	100 %	0 %	0 %	554651124
128	NC_022608	TAT	2	6	4525	4530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554651124
129	NC_022608	ATT	2	6	4533	4538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554651124
130	NC_022608	TA	3	6	4603	4608	50 %	50 %	0 %	0 %	554651124
131	NC_022608	TCATAT	2	12	4686	4697	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	554651124
132	NC_022608	TCT	2	6	4731	4736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554651124
133	NC_022608	TCT	2	6	4755	4760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554651124
134	NC_022608	TCT	2	6	4776	4781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554651124
135	NC_022608	AGTA	2	8	4901	4908	50 %	25 %	25 %	0 %	554651124
136	NC_022608	TTC	2	6	4916	4921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554651124
137	NC_022608	TTC	2	6	4967	4972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554651124
138	NC_022608	TTC	2	6	4979	4984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554651124
139	NC_022608	CTT	2	6	4993	4998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554651124
140	NC_022608	A	6	6	5062	5067	100 %	0 %	0 %	0 %	554651124
141	NC_022608	TAA	2	6	5083	5088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554651124
142	NC_022608	T	7	7	5089	5095	0 %	100 %	0 %	0 %	554651124
143	NC_022608	T	6	6	5115	5120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022608	AT	3	6	5131	5136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022608	TAA	2	6	5148	5153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_022608	A	6	6	5171	5176	100 %	0 %	0 %	0 %	554651125
147	NC_022608	TTAT	2	8	5177	5184	25 %	75 %	0 %	0 %	554651125
148	NC_022608	AAG	2	6	5214	5219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554651125
149	NC_022608	GCA	2	6	5378	5383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	554651125
150	NC_022608	TAT	2	6	5394	5399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554651125
151	NC_022608	ATC	2	6	5431	5436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554651125
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153	NC_022608	T	7	7	5485	5491	0 %	100 %	0 %	0 %	554651125
154	NC_022608	AT	3	6	5526	5531	50 %	50 %	0 %	0 %	554651125
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170	NC_022608	T	6	6	5865	5870	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_022608	TA	3	6	5877	5882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_022608	AT	3	6	5883	5888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_022608	T	6	6	5926	5931	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_022608	AAT	2	6	5960	5965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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177	NC_022608	TA	3	6	6035	6040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_022608	TTG	2	6	6049	6054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_022608	A	8	8	6179	6186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_022608	TAAA	2	8	6191	6198	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_022608	ATA	2	6	6234	6239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554651114
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268	NC_022608	ATT	2	6	9338	9343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
269	NC_022608	T	6	6	9342	9347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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271	NC_022608	CTTA	2	8	9405	9412	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
272	NC_022608	CAAAT	2	10	9451	9460	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
273	NC_022608	AC	3	6	9475	9480	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
274	NC_022608	A	6	6	9484	9489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
275	NC_022608	TG	3	6	9512	9517	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
276	NC_022608	T	7	7	9574	9580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
277	NC_022608	GAT	2	6	9582	9587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.