MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia pecorum P787

Total Repeats: 23620

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16235	NC_022441	TCA	2	6	756756	756761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545633231
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16241	NC_022441	TGC	2	6	757370	757375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545633231
16242	NC_022441	AAC	3	9	757376	757384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545633231
16243	NC_022441	TCC	2	6	757416	757421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545633231
16244	NC_022441	ACG	3	9	757425	757433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545633231
16245	NC_022441	TCA	2	6	757554	757559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545633231
16246	NC_022441	AAG	2	6	757566	757571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545633231
16247	NC_022441	GATA	2	8	757589	757596	50 %	25 %	25 %	0 %	545633231
16248	NC_022441	GCT	2	6	757600	757605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545633231
16249	NC_022441	CTC	2	6	757739	757744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545633231
16250	NC_022441	AT	3	6	757761	757766	50 %	50 %	0 %	0 %	545633231
16251	NC_022441	CACG	2	8	757792	757799	25 %	0 %	25 %	50 %	545633231
16252	NC_022441	ATACG	2	10	757800	757809	40 %	20 %	20 %	20 %	545633231
16253	NC_022441	AGA	2	6	757856	757861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545633231
16254	NC_022441	CT	3	6	757955	757960	0 %	50 %	0 %	50 %	545633231
16255	NC_022441	ACG	2	6	757991	757996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545633231
16256	NC_022441	AAC	2	6	758099	758104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545633231
16257	NC_022441	AGA	2	6	758126	758131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545633231
16258	NC_022441	ATTC	2	8	758144	758151	25 %	50 %	0 %	25 %	545633231
16259	NC_022441	TC	4	8	758150	758157	0 %	50 %	0 %	50 %	545633231
16260	NC_022441	GAAC	2	8	758220	758227	50 %	0 %	25 %	25 %	545633231
16261	NC_022441	ATC	2	6	758252	758257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545633231
16262	NC_022441	TCA	2	6	758271	758276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545633231
16263	NC_022441	TCT	2	6	758319	758324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545633231
16264	NC_022441	GA	3	6	758341	758346	50 %	0 %	50 %	0 %	545633231
16265	NC_022441	TCA	2	6	758352	758357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545633231
16266	NC_022441	A	6	6	758429	758434	100 %	0 %	0 %	0 %	545633231
16267	NC_022441	TGA	2	6	758554	758559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545633231
16268	NC_022441	AAGAG	2	10	758669	758678	60 %	0 %	40 %	0 %	545633231
16269	NC_022441	TCA	2	6	758682	758687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545633231
16270	NC_022441	CAA	2	6	758713	758718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545633231
16271	NC_022441	CTT	2	6	758739	758744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545633231
16272	NC_022441	TTC	2	6	758771	758776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545633231
16273	NC_022441	AGA	2	6	758792	758797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545633231
16274	NC_022441	TCTT	2	8	758833	758840	0 %	75 %	0 %	25 %	545633231
16275	NC_022441	AAT	2	6	758921	758926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545633231
16276	NC_022441	TAA	3	9	759028	759036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545633231
16277	NC_022441	CTT	3	9	759082	759090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545633231
16278	NC_022441	TTC	2	6	759164	759169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545633231
16279	NC_022441	CTT	2	6	759262	759267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545633231
16280	NC_022441	TC	3	6	759280	759285	0 %	50 %	0 %	50 %	545633231
16281	NC_022441	TCT	2	6	759288	759293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545633231
16282	NC_022441	GAA	2	6	759310	759315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545633231
16283	NC_022441	CTTC	2	8	759370	759377	0 %	50 %	0 %	50 %	545633231
16284	NC_022441	CA	3	6	759453	759458	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16285	NC_022441	CA	3	6	759466	759471	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16286	NC_022441	AAG	2	6	759561	759566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545633232
16287	NC_022441	TTC	2	6	759590	759595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545633232
16288	NC_022441	TTC	2	6	759601	759606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545633232
16289	NC_022441	T	6	6	759624	759629	0 %	100 %	0 %	0 %	545633232
16290	NC_022441	CTT	2	6	759669	759674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545633232
16291	NC_022441	AAGCC	2	10	759678	759687	40 %	0 %	20 %	40 %	545633232
16292	NC_022441	AAC	2	6	759700	759705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545633232
16293	NC_022441	AC	3	6	759711	759716	50 %	0 %	0 %	50 %	545633232
16294	NC_022441	T	7	7	759720	759726	0 %	100 %	0 %	0 %	545633232
16295	NC_022441	TCT	2	6	759740	759745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545633232
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16300	NC_022441	TGT	2	6	759934	759939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545633232
16301	NC_022441	T	6	6	759986	759991	0 %	100 %	0 %	0 %	545633233
16302	NC_022441	AG	3	6	760011	760016	50 %	0 %	50 %	0 %	545633233
16303	NC_022441	C	6	6	760033	760038	0 %	0 %	0 %	100 %	545633233
16304	NC_022441	CAA	2	6	760046	760051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545633233
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16306	NC_022441	TTG	2	6	760086	760091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545633233
16307	NC_022441	AGAA	2	8	760143	760150	75 %	0 %	25 %	0 %	545633233
16308	NC_022441	TTC	2	6	760163	760168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545633233
16309	NC_022441	GA	3	6	760171	760176	50 %	0 %	50 %	0 %	545633233
16310	NC_022441	TTA	2	6	760201	760206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545633233
16311	NC_022441	GCA	2	6	760225	760230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545633233
16312	NC_022441	A	6	6	760250	760255	100 %	0 %	0 %	0 %	545633233
16313	NC_022441	T	6	6	760333	760338	0 %	100 %	0 %	0 %	545633233
16314	NC_022441	AG	4	8	760367	760374	50 %	0 %	50 %	0 %	545633233
16315	NC_022441	T	6	6	760448	760453	0 %	100 %	0 %	0 %	545633233
16316	NC_022441	T	7	7	760477	760483	0 %	100 %	0 %	0 %	545633233
16317	NC_022441	CTT	2	6	760484	760489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545633233
16318	NC_022441	TAG	2	6	760556	760561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545633234
16319	NC_022441	TTAA	2	8	760615	760622	50 %	50 %	0 %	0 %	545633234
16320	NC_022441	AAAG	2	8	760669	760676	75 %	0 %	25 %	0 %	545633234
16321	NC_022441	AAC	2	6	760758	760763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545633234
16322	NC_022441	CAT	2	6	760845	760850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545633234
16323	NC_022441	GCAACA	2	12	760861	760872	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	545633234
16324	NC_022441	CCAT	2	8	760884	760891	25 %	25 %	0 %	50 %	545633234
16325	NC_022441	AAT	2	6	760905	760910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545633234
16326	NC_022441	TCA	2	6	760912	760917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545633234
16327	NC_022441	CTTC	2	8	760949	760956	0 %	50 %	0 %	50 %	545633234
16328	NC_022441	TC	3	6	760961	760966	0 %	50 %	0 %	50 %	545633234
16329	NC_022441	GGAA	2	8	761011	761018	50 %	0 %	50 %	0 %	545633234
16330	NC_022441	CAC	2	6	761024	761029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545633234
16331	NC_022441	TTG	2	6	761034	761039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545633234
16332	NC_022441	AACTCT	2	12	761216	761227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16333	NC_022441	GAA	2	6	761297	761302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545633235
16334	NC_022441	GCA	2	6	761338	761343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545633235
16335	NC_022441	T	6	6	761415	761420	0 %	100 %	0 %	0 %	545633235
16336	NC_022441	AGA	2	6	761427	761432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545633235
16337	NC_022441	GAA	2	6	761495	761500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545633235
16338	NC_022441	GCA	2	6	761524	761529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545633235
16339	NC_022441	ATA	2	6	761551	761556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545633235
16340	NC_022441	GCA	2	6	761566	761571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545633235
16341	NC_022441	TCC	2	6	761610	761615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545633235
16342	NC_022441	ATT	2	6	761632	761637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545633235
16343	NC_022441	CTC	2	6	761684	761689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16344	NC_022441	A	7	7	761702	761708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16345	NC_022441	AAG	2	6	761726	761731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16346	NC_022441	TGT	2	6	761757	761762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16347	NC_022441	ATC	2	6	761816	761821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545633236
16348	NC_022441	CTTT	2	8	761977	761984	0 %	75 %	0 %	25 %	545633236
16349	NC_022441	TC	3	6	762006	762011	0 %	50 %	0 %	50 %	545633236
16350	NC_022441	TCT	2	6	762018	762023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545633236
16351	NC_022441	CCA	2	6	762045	762050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545633236
16352	NC_022441	ACA	2	6	762060	762065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545633236
16353	NC_022441	TACA	2	8	762080	762087	50 %	25 %	0 %	25 %	545633236
16354	NC_022441	CAA	2	6	762148	762153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545633236
16355	NC_022441	AAT	2	6	762200	762205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545633236
16356	NC_022441	T	6	6	762257	762262	0 %	100 %	0 %	0 %	545633236
16357	NC_022441	T	8	8	762266	762273	0 %	100 %	0 %	0 %	545633236
16358	NC_022441	GAC	2	6	762293	762298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545633236
16359	NC_022441	CAAA	2	8	762322	762329	75 %	0 %	0 %	25 %	545633237
16360	NC_022441	TAC	2	6	762340	762345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545633237
16361	NC_022441	CA	3	6	762380	762385	50 %	0 %	0 %	50 %	545633237
16362	NC_022441	AAACCA	2	12	762396	762407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545633237
16363	NC_022441	T	6	6	762437	762442	0 %	100 %	0 %	0 %	545633237
16364	NC_022441	T	8	8	762469	762476	0 %	100 %	0 %	0 %	545633237
16365	NC_022441	GCTT	2	8	762507	762514	0 %	50 %	25 %	25 %	545633237
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16489	NC_022441	GCT	2	6	768189	768194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545633243
16490	NC_022441	GCT	2	6	768212	768217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545633243
16491	NC_022441	AG	3	6	768233	768238	50 %	0 %	50 %	0 %	545633243
16492	NC_022441	TAC	2	6	768240	768245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545633243
16493	NC_022441	AG	3	6	768320	768325	50 %	0 %	50 %	0 %	545633243
16494	NC_022441	TCA	2	6	768332	768337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545633243
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