MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia pecorum P787

Total Repeats: 23620

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13123	NC_022441	TAAA	2	8	612553	612560	75 %	25 %	0 %	0 %	545633131
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13235	NC_022441	AGTG	2	8	616325	616332	25 %	25 %	50 %	0 %	545633133
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13239	NC_022441	A	7	7	616415	616421	100 %	0 %	0 %	0 %	545633133
13240	NC_022441	A	7	7	616435	616441	100 %	0 %	0 %	0 %	545633133
13241	NC_022441	GAAGCT	2	12	616451	616462	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	545633133
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13243	NC_022441	AAAGA	2	10	616539	616548	80 %	0 %	20 %	0 %	545633133
13244	NC_022441	A	6	6	616636	616641	100 %	0 %	0 %	0 %	545633133
13245	NC_022441	AGA	2	6	616664	616669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545633133
13246	NC_022441	A	7	7	616669	616675	100 %	0 %	0 %	0 %	545633133
13247	NC_022441	AGA	3	9	616682	616690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545633133
13248	NC_022441	GAA	2	6	616737	616742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545633133
13249	NC_022441	AGA	2	6	616760	616765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545633133
13250	NC_022441	TTC	2	6	616768	616773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545633133
13251	NC_022441	AGA	2	6	616816	616821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545633133
13252	NC_022441	TTC	3	9	616911	616919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545633133
13253	NC_022441	TGC	2	6	616940	616945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545633133
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13320	NC_022441	A	6	6	619119	619124	100 %	0 %	0 %	0 %	545633133
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13353	NC_022441	A	7	7	620129	620135	100 %	0 %	0 %	0 %	545633133
13354	NC_022441	TA	3	6	620194	620199	50 %	50 %	0 %	0 %	545633133
13355	NC_022441	GC	3	6	620207	620212	0 %	0 %	50 %	50 %	545633133
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13368	NC_022441	AAC	2	6	621260	621265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545633133
13369	NC_022441	ATT	2	6	621275	621280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545633133
13370	NC_022441	AGG	2	6	621299	621304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545633133
13371	NC_022441	TGA	2	6	621398	621403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545633133
13372	NC_022441	GCAACA	2	12	621405	621416	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	545633133
13373	NC_022441	ATC	2	6	621465	621470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545633133
13374	NC_022441	CTT	2	6	621508	621513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545633133
13375	NC_022441	A	6	6	621549	621554	100 %	0 %	0 %	0 %	545633133
13376	NC_022441	A	6	6	621586	621591	100 %	0 %	0 %	0 %	545633133
13377	NC_022441	AGA	2	6	621647	621652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545633133
13378	NC_022441	A	6	6	621679	621684	100 %	0 %	0 %	0 %	545633133
13379	NC_022441	A	6	6	621695	621700	100 %	0 %	0 %	0 %	545633133
13380	NC_022441	A	6	6	621712	621717	100 %	0 %	0 %	0 %	545633133
13381	NC_022441	TAG	2	6	621862	621867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545633133
13382	NC_022441	AGG	2	6	622055	622060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545633133
13383	NC_022441	AGA	2	6	622154	622159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545633133
13384	NC_022441	AGCG	2	8	622182	622189	25 %	0 %	50 %	25 %	545633133
13385	NC_022441	TCT	2	6	622245	622250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545633133
13386	NC_022441	GTT	2	6	622251	622256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545633133
13387	NC_022441	CTC	2	6	622258	622263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545633133
13388	NC_022441	GCT	2	6	622290	622295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545633133
13389	NC_022441	A	6	6	622322	622327	100 %	0 %	0 %	0 %	545633133
13390	NC_022441	GAA	2	6	622341	622346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545633133
13391	NC_022441	CAG	2	6	622387	622392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545633133
13392	NC_022441	CA	3	6	622417	622422	50 %	0 %	0 %	50 %	545633133
13393	NC_022441	TCC	2	6	622487	622492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545633133
13394	NC_022441	GACA	2	8	622553	622560	50 %	0 %	25 %	25 %	545633133
13395	NC_022441	TCTA	2	8	622687	622694	25 %	50 %	0 %	25 %	545633133
13396	NC_022441	TAA	2	6	622742	622747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545633133
13397	NC_022441	CCT	2	6	622797	622802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545633133
13398	NC_022441	CTC	2	6	622846	622851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545633133
13399	NC_022441	CTA	2	6	622872	622877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545633133
13400	NC_022441	TTG	2	6	622939	622944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545633133
13401	NC_022441	GAG	2	6	622954	622959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545633133
13402	NC_022441	A	6	6	623015	623020	100 %	0 %	0 %	0 %	545633133
13403	NC_022441	ATC	2	6	623160	623165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545633133
13404	NC_022441	AGG	2	6	623177	623182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545633133
13405	NC_022441	GGA	3	9	623232	623240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545633133
13406	NC_022441	GAA	2	6	623261	623266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545633133
13407	NC_022441	AAGG	2	8	623290	623297	50 %	0 %	50 %	0 %	545633133
13408	NC_022441	CAT	2	6	623303	623308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545633133
13409	NC_022441	CCT	2	6	623458	623463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545633133
13410	NC_022441	A	6	6	623623	623628	100 %	0 %	0 %	0 %	545633133
13411	NC_022441	GAA	2	6	623637	623642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545633133
13412	NC_022441	GTG	2	6	623687	623692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545633133
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13414	NC_022441	ACTC	2	8	623894	623901	25 %	25 %	0 %	50 %	545633133
13415	NC_022441	AGA	2	6	623906	623911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545633133
13416	NC_022441	A	6	6	623987	623992	100 %	0 %	0 %	0 %	545633133
13417	NC_022441	ATCTC	2	10	624015	624024	20 %	40 %	0 %	40 %	545633133
13418	NC_022441	CAT	2	6	624063	624068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545633133
13419	NC_022441	TCT	2	6	624094	624099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545633133
13420	NC_022441	ATA	2	6	624223	624228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545633133
13421	NC_022441	TGA	2	6	624238	624243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545633133
13422	NC_022441	GAA	2	6	624256	624261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545633133
13423	NC_022441	GAG	2	6	624292	624297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545633133
13424	NC_022441	TC	3	6	624376	624381	0 %	50 %	0 %	50 %	545633133
13425	NC_022441	CTG	2	6	624384	624389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545633133
13426	NC_022441	GATAC	2	10	624462	624471	40 %	20 %	20 %	20 %	545633133
13427	NC_022441	ACA	2	6	624604	624609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545633133
13428	NC_022441	TTC	2	6	624696	624701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545633133
13429	NC_022441	CTT	2	6	624752	624757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545633133
13430	NC_022441	GAT	2	6	624762	624767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545633133
13431	NC_022441	GAAC	2	8	624783	624790	50 %	0 %	25 %	25 %	545633133
13432	NC_022441	TAG	2	6	624817	624822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545633133
13433	NC_022441	TC	3	6	624832	624837	0 %	50 %	0 %	50 %	545633133
13434	NC_022441	AG	3	6	624855	624860	50 %	0 %	50 %	0 %	545633133
13435	NC_022441	ACA	2	6	624927	624932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545633133
13436	NC_022441	AACTA	2	10	624943	624952	60 %	20 %	0 %	20 %	545633133
13437	NC_022441	TGT	2	6	625022	625027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545633133
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13439	NC_022441	CAA	2	6	625108	625113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545633133
13440	NC_022441	CTA	3	9	625124	625132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545633133
13441	NC_022441	TTC	2	6	625225	625230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545633133
13442	NC_022441	G	6	6	625377	625382	0 %	0 %	100 %	0 %	545633133
13443	NC_022441	CA	3	6	625466	625471	50 %	0 %	0 %	50 %	545633133
13444	NC_022441	CTA	2	6	625643	625648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545633133
13445	NC_022441	AGG	2	6	625775	625780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545633133
13446	NC_022441	TCT	2	6	625789	625794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545633133
13447	NC_022441	A	6	6	625887	625892	100 %	0 %	0 %	0 %	545633133
13448	NC_022441	TGA	2	6	625895	625900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545633133
13449	NC_022441	GAA	3	9	625950	625958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545633133
13450	NC_022441	CA	3	6	626045	626050	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13451	NC_022441	TAT	2	6	626054	626059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545633134
13452	NC_022441	CTG	2	6	626082	626087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545633134
13453	NC_022441	AGC	2	6	626151	626156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545633134
13454	NC_022441	TTC	2	6	626158	626163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545633134
13455	NC_022441	GAAG	2	8	626189	626196	50 %	0 %	50 %	0 %	545633134
13456	NC_022441	GAG	2	6	626204	626209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545633134
13457	NC_022441	CTT	2	6	626281	626286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545633134
13458	NC_022441	TGC	2	6	626302	626307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545633134
13459	NC_022441	TCAAA	2	10	626343	626352	60 %	20 %	0 %	20 %	545633134
13460	NC_022441	TCA	2	6	626396	626401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545633134
13461	NC_022441	T	6	6	626473	626478	0 %	100 %	0 %	0 %	545633134
13462	NC_022441	ATT	2	6	626485	626490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545633134
13463	NC_022441	AAT	2	6	626500	626505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545633134
13464	NC_022441	T	6	6	626524	626529	0 %	100 %	0 %	0 %	545633134
13465	NC_022441	A	6	6	626545	626550	100 %	0 %	0 %	0 %	545633134
13466	NC_022441	T	6	6	626553	626558	0 %	100 %	0 %	0 %	545633134
13467	NC_022441	A	6	6	626565	626570	100 %	0 %	0 %	0 %	545633134
13468	NC_022441	TTG	2	6	626602	626607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545633134
13469	NC_022441	AAT	2	6	626608	626613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545633134
13470	NC_022441	T	6	6	626645	626650	0 %	100 %	0 %	0 %	545633134
13471	NC_022441	TCT	2	6	626675	626680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545633134
13472	NC_022441	AAG	2	6	626800	626805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545633134
13473	NC_022441	TCT	2	6	626832	626837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545633134
13474	NC_022441	CCT	2	6	626852	626857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545633134
13475	NC_022441	CAA	2	6	626880	626885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545633134
13476	NC_022441	CCA	3	9	627089	627097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545633134
13477	NC_022441	CCACTA	2	12	627104	627115	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	545633134
13478	NC_022441	TAC	2	6	627150	627155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545633134
13479	NC_022441	CT	3	6	627160	627165	0 %	50 %	0 %	50 %	545633134
13480	NC_022441	AGG	2	6	627172	627177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545633134
13481	NC_022441	TAGGGA	2	12	627178	627189	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	545633134
13482	NC_022441	GTT	2	6	627237	627242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545633134
13483	NC_022441	CAG	2	6	627246	627251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545633134
13484	NC_022441	GGTG	2	8	627266	627273	0 %	25 %	75 %	0 %	545633134
13485	NC_022441	ACG	3	9	627277	627285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545633134
13486	NC_022441	C	12	12	627307	627318	0 %	0 %	0 %	100 %	545633134
13487	NC_022441	GAG	2	6	627339	627344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545633134
13488	NC_022441	GAT	2	6	627351	627356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545633134
13489	NC_022441	ATA	3	9	627383	627391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545633134
13490	NC_022441	TAT	3	9	627418	627426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13491	NC_022441	CTC	3	9	627438	627446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13492	NC_022441	TC	3	6	627445	627450	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13493	NC_022441	ATT	2	6	627451	627456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13494	NC_022441	GAA	2	6	627535	627540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13500	NC_022441	TCCT	2	8	627721	627728	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

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