MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia pecorum P787

Total Repeats: 23620

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_022441	ATA	2	6	279867	279872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545632860
6003	NC_022441	CTT	2	6	279923	279928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545632860
6004	NC_022441	TGT	2	6	279948	279953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545632860
6005	NC_022441	CTC	2	6	279987	279992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545632860
6006	NC_022441	AGT	2	6	280040	280045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545632860
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6009	NC_022441	GAA	3	9	280196	280204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632860
6010	NC_022441	TGCT	2	8	280365	280372	0 %	50 %	25 %	25 %	545632860
6011	NC_022441	TAG	2	6	280510	280515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545632860
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6013	NC_022441	AGA	2	6	280564	280569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632860
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6015	NC_022441	GGCGTA	2	12	280727	280738	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	545632860
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6020	NC_022441	TGGA	2	8	280965	280972	25 %	25 %	50 %	0 %	545632860
6021	NC_022441	CTC	2	6	280987	280992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545632860
6022	NC_022441	TTC	2	6	281039	281044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6023	NC_022441	TTTGT	2	10	281045	281054	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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6025	NC_022441	T	7	7	281088	281094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_022441	TGT	2	6	281114	281119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_022441	ATT	2	6	281128	281133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_022441	A	8	8	281140	281147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_022441	T	6	6	281150	281155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_022441	TGG	2	6	281166	281171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_022441	G	7	7	281200	281206	0 %	0 %	100 %	0 %	545632861
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6107	NC_022441	TTC	2	6	284030	284035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545632862
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6110	NC_022441	T	6	6	284074	284079	0 %	100 %	0 %	0 %	545632862
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6123	NC_022441	GCG	2	6	284793	284798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545632862
6124	NC_022441	TGCT	2	8	284803	284810	0 %	50 %	25 %	25 %	545632862
6125	NC_022441	A	6	6	284821	284826	100 %	0 %	0 %	0 %	545632862
6126	NC_022441	TCA	2	6	284874	284879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545632862
6127	NC_022441	TTA	2	6	284911	284916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545632862
6128	NC_022441	TCT	2	6	284931	284936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545632862
6129	NC_022441	AAG	2	6	285044	285049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632863
6130	NC_022441	TGT	2	6	285127	285132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545632863
6131	NC_022441	TCC	2	6	285139	285144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545632863
6132	NC_022441	GTG	2	6	285158	285163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545632863
6133	NC_022441	TGCG	2	8	285239	285246	0 %	25 %	50 %	25 %	545632863
6134	NC_022441	GTAA	2	8	285414	285421	50 %	25 %	25 %	0 %	545632863
6135	NC_022441	GCA	2	6	285581	285586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545632863
6136	NC_022441	TTC	2	6	285620	285625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545632863
6137	NC_022441	TTG	2	6	285687	285692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545632863
6138	NC_022441	GCA	2	6	285890	285895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545632863
6139	NC_022441	TGA	2	6	285973	285978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545632863
6140	NC_022441	TGT	3	9	285985	285993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545632863
6141	NC_022441	TTC	2	6	286000	286005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545632863
6142	NC_022441	GAAA	2	8	286065	286072	75 %	0 %	25 %	0 %	545632863
6143	NC_022441	AGA	2	6	286115	286120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632863
6144	NC_022441	T	8	8	286125	286132	0 %	100 %	0 %	0 %	545632863
6145	NC_022441	TCG	3	9	286175	286183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545632863
6146	NC_022441	GA	3	6	286186	286191	50 %	0 %	50 %	0 %	545632863
6147	NC_022441	AGT	2	6	286237	286242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545632863
6148	NC_022441	TAC	2	6	286257	286262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545632863
6149	NC_022441	TAGA	2	8	286299	286306	50 %	25 %	25 %	0 %	545632863
6150	NC_022441	GTAATT	2	12	286334	286345	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	545632863
6151	NC_022441	TGT	2	6	286368	286373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545632863
6152	NC_022441	CTC	2	6	286389	286394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545632863
6153	NC_022441	TCC	2	6	286408	286413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545632863
6154	NC_022441	AC	3	6	286464	286469	50 %	0 %	0 %	50 %	545632863
6155	NC_022441	A	6	6	286551	286556	100 %	0 %	0 %	0 %	545632863
6156	NC_022441	TGTT	2	8	286602	286609	0 %	75 %	25 %	0 %	545632863
6157	NC_022441	A	7	7	286633	286639	100 %	0 %	0 %	0 %	545632863
6158	NC_022441	TTC	2	6	286647	286652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545632863
6159	NC_022441	AGA	2	6	286675	286680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632863
6160	NC_022441	AT	3	6	286693	286698	50 %	50 %	0 %	0 %	545632863
6161	NC_022441	TTA	2	6	286742	286747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545632863
6162	NC_022441	CCA	2	6	286889	286894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545632863
6163	NC_022441	GTT	2	6	286909	286914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545632863
6164	NC_022441	AAC	2	6	286921	286926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545632863
6165	NC_022441	ATT	2	6	286936	286941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545632863
6166	NC_022441	CCA	2	6	286982	286987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545632863
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6172	NC_022441	CTC	2	6	287169	287174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545632863
6173	NC_022441	TAT	2	6	287211	287216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545632863
6174	NC_022441	ATA	2	6	287223	287228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545632863
6175	NC_022441	AGC	2	6	287272	287277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545632863
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6178	NC_022441	T	6	6	287327	287332	0 %	100 %	0 %	0 %	545632863
6179	NC_022441	GAA	2	6	287429	287434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632863
6180	NC_022441	AG	3	6	287446	287451	50 %	0 %	50 %	0 %	545632863
6181	NC_022441	GTA	2	6	287486	287491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545632863
6182	NC_022441	GA	3	6	287499	287504	50 %	0 %	50 %	0 %	545632863
6183	NC_022441	TCC	2	6	287557	287562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545632863
6184	NC_022441	CTTTT	2	10	287572	287581	0 %	80 %	0 %	20 %	545632863
6185	NC_022441	TTA	2	6	287597	287602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545632863
6186	NC_022441	ATT	2	6	287605	287610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545632863
6187	NC_022441	AAAT	2	8	287666	287673	75 %	25 %	0 %	0 %	545632863
6188	NC_022441	A	6	6	287704	287709	100 %	0 %	0 %	0 %	545632863
6189	NC_022441	AGC	2	6	287737	287742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545632863
6190	NC_022441	TTG	2	6	287858	287863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6191	NC_022441	CCA	2	6	287882	287887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545632864
6192	NC_022441	AGA	3	9	287911	287919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632864
6193	NC_022441	TGGA	2	8	287936	287943	25 %	25 %	50 %	0 %	545632864
6194	NC_022441	AG	3	6	288081	288086	50 %	0 %	50 %	0 %	545632864
6195	NC_022441	AAGC	2	8	288096	288103	50 %	0 %	25 %	25 %	545632864
6196	NC_022441	CTT	2	6	288219	288224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545632864
6197	NC_022441	GTAGC	2	10	288258	288267	20 %	20 %	40 %	20 %	545632864
6198	NC_022441	GTT	2	6	288275	288280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545632864
6199	NC_022441	GA	3	6	288306	288311	50 %	0 %	50 %	0 %	545632864
6200	NC_022441	GTATGC	2	12	288394	288405	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	545632864
6201	NC_022441	GAAA	2	8	288410	288417	75 %	0 %	25 %	0 %	545632864
6202	NC_022441	GAA	2	6	288436	288441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632864
6203	NC_022441	AGT	2	6	288468	288473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545632864
6204	NC_022441	GAG	2	6	288479	288484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545632864
6205	NC_022441	TTTGGG	2	12	288492	288503	0 %	50 %	50 %	0 %	545632864
6206	NC_022441	TGAA	2	8	288638	288645	50 %	25 %	25 %	0 %	545632864
6207	NC_022441	A	6	6	288672	288677	100 %	0 %	0 %	0 %	545632864
6208	NC_022441	GGA	2	6	288679	288684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545632864
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6210	NC_022441	TGT	2	6	288862	288867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545632864
6211	NC_022441	TAT	2	6	288972	288977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545632864
6212	NC_022441	AG	4	8	289075	289082	50 %	0 %	50 %	0 %	545632864
6213	NC_022441	TAG	2	6	289086	289091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545632864
6214	NC_022441	ATT	2	6	289093	289098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545632864
6215	NC_022441	TCT	2	6	289100	289105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545632864
6216	NC_022441	TAC	2	6	289122	289127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545632864
6217	NC_022441	TGT	2	6	289273	289278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545632864
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6219	NC_022441	TTG	2	6	289315	289320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545632864
6220	NC_022441	GAA	2	6	289321	289326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545632864
6221	NC_022441	TGA	2	6	289328	289333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545632864
6222	NC_022441	GCA	2	6	289343	289348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545632864
6223	NC_022441	GA	3	6	289401	289406	50 %	0 %	50 %	0 %	545632864
6224	NC_022441	A	6	6	289406	289411	100 %	0 %	0 %	0 %	545632864
6225	NC_022441	TGT	2	6	289509	289514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545632864
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6227	NC_022441	GGAT	2	8	289648	289655	25 %	25 %	50 %	0 %	545632864
6228	NC_022441	CGG	2	6	289695	289700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545632864
6229	NC_022441	CTC	2	6	289737	289742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545632864
6230	NC_022441	A	6	6	289763	289768	100 %	0 %	0 %	0 %	545632864
6231	NC_022441	AAT	2	6	289873	289878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545632864
6232	NC_022441	CCG	2	6	289904	289909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545632864
6233	NC_022441	GTT	2	6	289939	289944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545632864
6234	NC_022441	ATT	2	6	289984	289989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545632864
6235	NC_022441	ATT	2	6	290023	290028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545632864
6236	NC_022441	CTC	2	6	290085	290090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545632864
6237	NC_022441	TAT	2	6	290139	290144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545632864
6238	NC_022441	GGA	2	6	290164	290169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545632864
6239	NC_022441	CTC	2	6	290175	290180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545632864
6240	NC_022441	A	6	6	290204	290209	100 %	0 %	0 %	0 %	545632864
6241	NC_022441	ATT	2	6	290224	290229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545632864
6242	NC_022441	TTG	2	6	290244	290249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545632864
6243	NC_022441	CTC	2	6	290259	290264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545632864
6244	NC_022441	TTGATT	2	12	290266	290277	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	545632864
6245	NC_022441	TTG	2	6	290327	290332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545632864
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6247	NC_022441	ATT	2	6	290416	290421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545632864
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6373	NC_022441	A	6	6	297018	297023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6374	NC_022441	A	6	6	297028	297033	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6497	NC_022441	A	7	7	301442	301448	100 %	0 %	0 %	0 %	545632869
6498	NC_022441	TGA	2	6	301674	301679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545632869
6499	NC_022441	CCA	2	6	301692	301697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545632869
6500	NC_022441	GCT	2	6	301724	301729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545632869

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