MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2538 genome

Total Repeats: 39455

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
38501	NC_022351	T	6	6	1619389	1619394	0 %	100 %	0 %	0 %	543947072
38502	NC_022351	CAC	2	6	1619415	1619420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543947072
38503	NC_022351	ACATC	2	10	1619490	1619499	40 %	20 %	0 %	40 %	543947072
38504	NC_022351	GGA	2	6	1619519	1619524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	543947072
38505	NC_022351	ACT	2	6	1619540	1619545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947072
38506	NC_022351	TTC	2	6	1619572	1619577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947072
38507	NC_022351	GTTTT	2	10	1619578	1619587	0 %	80 %	20 %	0 %	543947072
38508	NC_022351	TGT	2	6	1619650	1619655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543947072
38509	NC_022351	CTTG	2	8	1619777	1619784	0 %	50 %	25 %	25 %	543947072
38510	NC_022351	TGC	2	6	1619839	1619844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543947072
38511	NC_022351	CTA	2	6	1619853	1619858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947072
38512	NC_022351	CTT	2	6	1619879	1619884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947072
38513	NC_022351	ATC	2	6	1619944	1619949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947072
38514	NC_022351	ATA	2	6	1620044	1620049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543947072
38515	NC_022351	TTC	2	6	1620102	1620107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947072
38516	NC_022351	CTT	2	6	1620183	1620188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947072
38517	NC_022351	TAT	2	6	1620267	1620272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543947072
38518	NC_022351	TTAG	2	8	1620305	1620312	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38519	NC_022351	AAAAT	2	10	1620322	1620331	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38520	NC_022351	ATTT	2	8	1620341	1620348	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38521	NC_022351	A	7	7	1620388	1620394	100 %	0 %	0 %	0 %	543947073
38522	NC_022351	CTGATG	2	12	1620413	1620424	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	543947073
38523	NC_022351	CAG	2	6	1620602	1620607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543947073
38524	NC_022351	TCA	2	6	1620638	1620643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947073
38525	NC_022351	A	6	6	1620646	1620651	100 %	0 %	0 %	0 %	543947073
38526	NC_022351	ACC	2	6	1620700	1620705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543947073
38527	NC_022351	ATT	2	6	1620745	1620750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543947073
38528	NC_022351	T	6	6	1620759	1620764	0 %	100 %	0 %	0 %	543947073
38529	NC_022351	AT	3	6	1620872	1620877	50 %	50 %	0 %	0 %	543947073
38530	NC_022351	TTTGCC	2	12	1620900	1620911	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	543947073
38531	NC_022351	CGT	2	6	1620931	1620936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543947073
38532	NC_022351	GAAA	2	8	1621036	1621043	75 %	0 %	25 %	0 %	543947073
38533	NC_022351	TGA	2	6	1621056	1621061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543947073
38534	NC_022351	GAA	2	6	1621225	1621230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543947073
38535	NC_022351	CTTT	2	8	1621401	1621408	0 %	75 %	0 %	25 %	543947074
38536	NC_022351	ATC	2	6	1621419	1621424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947074
38537	NC_022351	TGAT	2	8	1621474	1621481	25 %	50 %	25 %	0 %	543947074
38538	NC_022351	A	6	6	1621538	1621543	100 %	0 %	0 %	0 %	543947075
38539	NC_022351	AGTTTT	2	12	1621576	1621587	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	543947075
38540	NC_022351	T	6	6	1621612	1621617	0 %	100 %	0 %	0 %	543947075
38541	NC_022351	GGT	2	6	1621622	1621627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543947075
38542	NC_022351	AAC	2	6	1621631	1621636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543947075
38543	NC_022351	TAGT	2	8	1621641	1621648	25 %	50 %	25 %	0 %	543947075
38544	NC_022351	CAAAA	2	10	1621744	1621753	80 %	0 %	0 %	20 %	543947075
38545	NC_022351	AATG	2	8	1621846	1621853	50 %	25 %	25 %	0 %	543947075
38546	NC_022351	T	8	8	1621969	1621976	0 %	100 %	0 %	0 %	543947075
38547	NC_022351	TAAAC	2	10	1621987	1621996	60 %	20 %	0 %	20 %	543947075
38548	NC_022351	A	6	6	1622029	1622034	100 %	0 %	0 %	0 %	543947075
38549	NC_022351	AAG	2	6	1622038	1622043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543947075
38550	NC_022351	CAAC	2	8	1622044	1622051	50 %	0 %	0 %	50 %	543947075
38551	NC_022351	T	6	6	1622179	1622184	0 %	100 %	0 %	0 %	543947075
38552	NC_022351	TAA	2	6	1622188	1622193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543947075
38553	NC_022351	A	8	8	1622192	1622199	100 %	0 %	0 %	0 %	543947075
38554	NC_022351	T	6	6	1622219	1622224	0 %	100 %	0 %	0 %	543947075
38555	NC_022351	A	7	7	1622242	1622248	100 %	0 %	0 %	0 %	543947075
38556	NC_022351	GAA	2	6	1622255	1622260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543947075
38557	NC_022351	AC	3	6	1622300	1622305	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38558	NC_022351	A	6	6	1622322	1622327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38559	NC_022351	TAAA	2	8	1622347	1622354	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38560	NC_022351	TAA	3	9	1622381	1622389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38561	NC_022351	TAA	2	6	1622395	1622400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38562	NC_022351	TAT	2	6	1622436	1622441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38563	NC_022351	A	6	6	1622446	1622451	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38564	NC_022351	AT	3	6	1622456	1622461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38565	NC_022351	GGA	2	6	1622478	1622483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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38568	NC_022351	TGCTAA	2	12	1622601	1622612	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	543947076
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38582	NC_022351	TAA	2	6	1623242	1623247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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38586	NC_022351	TAT	2	6	1623442	1623447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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38588	NC_022351	AGT	2	6	1623495	1623500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38589	NC_022351	AAT	2	6	1623501	1623506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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38591	NC_022351	ATT	2	6	1623735	1623740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38592	NC_022351	GGAT	2	8	1623742	1623749	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
38593	NC_022351	TATT	2	8	1623760	1623767	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38594	NC_022351	TAT	2	6	1623775	1623780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38595	NC_022351	ATA	2	6	1623825	1623830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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38601	NC_022351	T	6	6	1624027	1624032	0 %	100 %	0 %	0 %	543947077
38602	NC_022351	TGCT	2	8	1624063	1624070	0 %	50 %	25 %	25 %	543947077
38603	NC_022351	TGA	2	6	1624097	1624102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543947077
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38606	NC_022351	TTTA	2	8	1624176	1624183	25 %	75 %	0 %	0 %	543947077
38607	NC_022351	TAA	2	6	1624193	1624198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543947077
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38609	NC_022351	TAATCT	2	12	1624250	1624261	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	543947077
38610	NC_022351	ATTT	2	8	1624281	1624288	25 %	75 %	0 %	0 %	543947077
38611	NC_022351	TGAT	2	8	1624351	1624358	25 %	50 %	25 %	0 %	543947077
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38617	NC_022351	A	6	6	1624653	1624658	100 %	0 %	0 %	0 %	543947077
38618	NC_022351	ATTTG	2	10	1624691	1624700	20 %	60 %	20 %	0 %	543947077
38619	NC_022351	GAT	2	6	1624728	1624733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543947077
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