MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2538 genome

Total Repeats: 39455

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31002	NC_022351	TTA	2	6	1300382	1300387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543946750
31003	NC_022351	AAT	2	6	1300408	1300413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543946750
31004	NC_022351	TTA	2	6	1300430	1300435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543946750
31005	NC_022351	T	6	6	1300460	1300465	0 %	100 %	0 %	0 %	543946750
31006	NC_022351	ATC	2	6	1300489	1300494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946750
31007	NC_022351	A	6	6	1300560	1300565	100 %	0 %	0 %	0 %	543946750
31008	NC_022351	ACA	2	6	1300577	1300582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543946750
31009	NC_022351	AT	3	6	1300598	1300603	50 %	50 %	0 %	0 %	543946750
31010	NC_022351	A	6	6	1300619	1300624	100 %	0 %	0 %	0 %	543946750
31011	NC_022351	ACC	2	6	1300648	1300653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543946750
31012	NC_022351	TCA	3	9	1300685	1300693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946750
31013	NC_022351	CAT	2	6	1300743	1300748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946750
31014	NC_022351	GGTTT	2	10	1300768	1300777	0 %	60 %	40 %	0 %	543946750
31015	NC_022351	TAAAA	2	10	1300834	1300843	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31016	NC_022351	GTG	2	6	1300892	1300897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543946751
31017	NC_022351	A	6	6	1300917	1300922	100 %	0 %	0 %	0 %	543946751
31018	NC_022351	TGA	2	6	1300992	1300997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543946751
31019	NC_022351	GTG	2	6	1300999	1301004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543946751
31020	NC_022351	GAT	2	6	1301014	1301019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543946751
31021	NC_022351	GAA	2	6	1301020	1301025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543946751
31022	NC_022351	GAT	2	6	1301089	1301094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543946751
31023	NC_022351	CTG	2	6	1301108	1301113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543946751
31024	NC_022351	CTG	2	6	1301169	1301174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543946751
31025	NC_022351	TAAA	2	8	1301198	1301205	75 %	25 %	0 %	0 %	543946751
31026	NC_022351	TGC	2	6	1301262	1301267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543946751
31027	NC_022351	TGA	2	6	1301334	1301339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543946751
31028	NC_022351	ATG	2	6	1301384	1301389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543946751
31029	NC_022351	GCTTG	2	10	1301419	1301428	0 %	40 %	40 %	20 %	543946751
31030	NC_022351	TGCT	2	8	1301644	1301651	0 %	50 %	25 %	25 %	543946752
31031	NC_022351	TAG	2	6	1301704	1301709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543946752
31032	NC_022351	TCA	2	6	1301736	1301741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946752
31033	NC_022351	AAG	2	6	1301742	1301747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543946752
31034	NC_022351	CTT	2	6	1301759	1301764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946752
31035	NC_022351	GAT	2	6	1301792	1301797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543946752
31036	NC_022351	TGA	3	9	1301842	1301850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543946752
31037	NC_022351	TCA	2	6	1301860	1301865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946752
31038	NC_022351	TCAATG	2	12	1301880	1301891	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	543946752
31039	NC_022351	GAA	2	6	1301975	1301980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543946752
31040	NC_022351	A	8	8	1302009	1302016	100 %	0 %	0 %	0 %	543946752
31041	NC_022351	T	6	6	1302022	1302027	0 %	100 %	0 %	0 %	543946752
31042	NC_022351	A	6	6	1302052	1302057	100 %	0 %	0 %	0 %	543946752
31043	NC_022351	CTTT	2	8	1302059	1302066	0 %	75 %	0 %	25 %	543946752
31044	NC_022351	ATC	2	6	1302098	1302103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946752
31045	NC_022351	CTAATC	2	12	1302123	1302134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946752
31046	NC_022351	A	6	6	1302137	1302142	100 %	0 %	0 %	0 %	543946752
31047	NC_022351	ATT	2	6	1302178	1302183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543946752
31048	NC_022351	TGA	2	6	1302210	1302215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543946752
31049	NC_022351	TCA	2	6	1302231	1302236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946752
31050	NC_022351	TGTTA	2	10	1302296	1302305	20 %	60 %	20 %	0 %	543946752
31051	NC_022351	A	6	6	1302338	1302343	100 %	0 %	0 %	0 %	543946752
31052	NC_022351	AAAAC	2	10	1302460	1302469	80 %	0 %	0 %	20 %	543946753
31053	NC_022351	GAA	2	6	1302481	1302486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543946753
31054	NC_022351	TAA	2	6	1302522	1302527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543946753
31055	NC_022351	A	6	6	1302526	1302531	100 %	0 %	0 %	0 %	543946753
31056	NC_022351	T	6	6	1302534	1302539	0 %	100 %	0 %	0 %	543946753
31057	NC_022351	AATG	2	8	1302654	1302661	50 %	25 %	25 %	0 %	543946753
31058	NC_022351	A	6	6	1302667	1302672	100 %	0 %	0 %	0 %	543946753
31059	NC_022351	CAA	2	6	1302751	1302756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543946753
31060	NC_022351	ATG	2	6	1302773	1302778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543946753
31061	NC_022351	CTA	2	6	1302792	1302797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946753
31062	NC_022351	TTC	2	6	1302841	1302846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946754
31063	NC_022351	TCC	2	6	1302952	1302957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	543946754
31064	NC_022351	ATA	2	6	1302962	1302967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543946754
31065	NC_022351	AAG	2	6	1303054	1303059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543946754
31066	NC_022351	T	8	8	1303072	1303079	0 %	100 %	0 %	0 %	543946754
31067	NC_022351	T	6	6	1303107	1303112	0 %	100 %	0 %	0 %	543946754
31068	NC_022351	CTTTT	2	10	1303152	1303161	0 %	80 %	0 %	20 %	543946754
31069	NC_022351	TCT	2	6	1303229	1303234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946754
31070	NC_022351	TCT	2	6	1303352	1303357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946754
31071	NC_022351	ATA	2	6	1303406	1303411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543946754
31072	NC_022351	TCA	2	6	1303415	1303420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946754
31073	NC_022351	TTG	2	6	1303446	1303451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543946754
31074	NC_022351	T	6	6	1303511	1303516	0 %	100 %	0 %	0 %	543946754
31075	NC_022351	AC	3	6	1303521	1303526	50 %	0 %	0 %	50 %	543946754
31076	NC_022351	T	6	6	1303599	1303604	0 %	100 %	0 %	0 %	543946755
31077	NC_022351	CAA	2	6	1303650	1303655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543946755
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31079	NC_022351	TTTAAA	2	12	1303811	1303822	50 %	50 %	0 %	0 %	543946755
31080	NC_022351	ACT	2	6	1303838	1303843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946755
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31082	NC_022351	T	8	8	1303936	1303943	0 %	100 %	0 %	0 %	543946755
31083	NC_022351	CTT	2	6	1304004	1304009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946755
31084	NC_022351	A	6	6	1304011	1304016	100 %	0 %	0 %	0 %	543946755
31085	NC_022351	T	6	6	1304094	1304099	0 %	100 %	0 %	0 %	543946755
31086	NC_022351	AC	3	6	1304164	1304169	50 %	0 %	0 %	50 %	543946756
31087	NC_022351	CAT	2	6	1304192	1304197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946756
31088	NC_022351	TCA	2	6	1304221	1304226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946756
31089	NC_022351	T	7	7	1304237	1304243	0 %	100 %	0 %	0 %	543946756
31090	NC_022351	CTA	2	6	1304258	1304263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946756
31091	NC_022351	T	6	6	1304264	1304269	0 %	100 %	0 %	0 %	543946756
31092	NC_022351	TTC	2	6	1304274	1304279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946756
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31094	NC_022351	CTT	2	6	1304363	1304368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946756
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31097	NC_022351	GAT	2	6	1304513	1304518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543946756
31098	NC_022351	A	6	6	1304527	1304532	100 %	0 %	0 %	0 %	543946756
31099	NC_022351	T	6	6	1304538	1304543	0 %	100 %	0 %	0 %	543946756
31100	NC_022351	T	7	7	1304558	1304564	0 %	100 %	0 %	0 %	543946756
31101	NC_022351	ATA	2	6	1304580	1304585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543946756
31102	NC_022351	TTC	2	6	1304622	1304627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946756
31103	NC_022351	TA	3	6	1304642	1304647	50 %	50 %	0 %	0 %	543946756
31104	NC_022351	TTC	2	6	1304721	1304726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946756
31105	NC_022351	CT	3	6	1304733	1304738	0 %	50 %	0 %	50 %	543946756
31106	NC_022351	ATTTTT	2	12	1304748	1304759	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	543946756
31107	NC_022351	ACT	2	6	1304760	1304765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946756
31108	NC_022351	GAT	2	6	1304805	1304810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543946756
31109	NC_022351	GAT	2	6	1304966	1304971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543946756
31110	NC_022351	AC	5	10	1305024	1305033	50 %	0 %	0 %	50 %	543946756
31111	NC_022351	T	6	6	1305126	1305131	0 %	100 %	0 %	0 %	543946756
31112	NC_022351	T	7	7	1305135	1305141	0 %	100 %	0 %	0 %	543946756
31113	NC_022351	A	6	6	1305150	1305155	100 %	0 %	0 %	0 %	543946756
31114	NC_022351	TCTT	2	8	1305165	1305172	0 %	75 %	0 %	25 %	543946756
31115	NC_022351	CTT	2	6	1305197	1305202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946756
31116	NC_022351	CTT	2	6	1305227	1305232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946756
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