MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2538 genome

Total Repeats: 39455

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30502	NC_022351	GCT	3	9	1279126	1279134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543946726
30503	NC_022351	TACT	2	8	1279142	1279149	25 %	50 %	0 %	25 %	543946726
30504	NC_022351	TCA	2	6	1279165	1279170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946726
30505	NC_022351	T	6	6	1279227	1279232	0 %	100 %	0 %	0 %	543946726
30506	NC_022351	AGC	2	6	1279278	1279283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543946726
30507	NC_022351	GCAC	2	8	1279315	1279322	25 %	0 %	25 %	50 %	543946726
30508	NC_022351	ATT	2	6	1279362	1279367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543946726
30509	NC_022351	GATTT	2	10	1279368	1279377	20 %	60 %	20 %	0 %	543946726
30510	NC_022351	CTT	2	6	1279387	1279392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946726
30511	NC_022351	TCA	3	9	1279507	1279515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946726
30512	NC_022351	CTT	2	6	1279565	1279570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946726
30513	NC_022351	GAG	2	6	1279613	1279618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	543946726
30514	NC_022351	CTA	2	6	1279658	1279663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946726
30515	NC_022351	ATA	2	6	1279666	1279671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543946726
30516	NC_022351	ACC	2	6	1279738	1279743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543946726
30517	NC_022351	T	6	6	1279758	1279763	0 %	100 %	0 %	0 %	543946726
30518	NC_022351	ATA	2	6	1279804	1279809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543946726
30519	NC_022351	ATC	2	6	1279824	1279829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946726
30520	NC_022351	AGC	2	6	1279887	1279892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543946726
30521	NC_022351	TCT	2	6	1279897	1279902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946726
30522	NC_022351	TCT	2	6	1279954	1279959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946726
30523	NC_022351	T	6	6	1280007	1280012	0 %	100 %	0 %	0 %	543946726
30524	NC_022351	AAAC	2	8	1280013	1280020	75 %	0 %	0 %	25 %	543946726
30525	NC_022351	CAG	2	6	1280081	1280086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543946726
30526	NC_022351	GTATAA	2	12	1280125	1280136	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	543946726
30527	NC_022351	CAAGG	2	10	1280162	1280171	40 %	0 %	40 %	20 %	543946726
30528	NC_022351	AGAT	2	8	1280199	1280206	50 %	25 %	25 %	0 %	543946726
30529	NC_022351	CTT	3	9	1280273	1280281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946726
30530	NC_022351	ATTTT	2	10	1280290	1280299	20 %	80 %	0 %	0 %	543946726
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30532	NC_022351	T	7	7	1280328	1280334	0 %	100 %	0 %	0 %	543946727
30533	NC_022351	TCA	2	6	1280339	1280344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946727
30534	NC_022351	CTT	2	6	1280439	1280444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946727
30535	NC_022351	T	8	8	1280443	1280450	0 %	100 %	0 %	0 %	543946727
30536	NC_022351	A	6	6	1280453	1280458	100 %	0 %	0 %	0 %	543946727
30537	NC_022351	T	6	6	1280490	1280495	0 %	100 %	0 %	0 %	543946727
30538	NC_022351	ATT	2	6	1280536	1280541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543946727
30539	NC_022351	TCA	2	6	1280570	1280575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946727
30540	NC_022351	ATA	2	6	1280615	1280620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543946727
30541	NC_022351	CT	3	6	1280641	1280646	0 %	50 %	0 %	50 %	543946727
30542	NC_022351	TAA	2	6	1280647	1280652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543946727
30543	NC_022351	TGATA	2	10	1280802	1280811	40 %	40 %	20 %	0 %	543946727
30544	NC_022351	T	6	6	1280824	1280829	0 %	100 %	0 %	0 %	543946727
30545	NC_022351	TCT	2	6	1280834	1280839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946727
30546	NC_022351	A	6	6	1280844	1280849	100 %	0 %	0 %	0 %	543946727
30547	NC_022351	TCT	2	6	1280975	1280980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946727
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30549	NC_022351	GAT	2	6	1281066	1281071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543946727
30550	NC_022351	AAC	2	6	1281118	1281123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543946727
30551	NC_022351	CTT	2	6	1281152	1281157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946727
30552	NC_022351	ATC	2	6	1281169	1281174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946727
30553	NC_022351	TCT	2	6	1281182	1281187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946727
30554	NC_022351	CAT	2	6	1281312	1281317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946727
30555	NC_022351	GGC	2	6	1281334	1281339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	543946727
30556	NC_022351	CTTG	2	8	1281342	1281349	0 %	50 %	25 %	25 %	543946727
30557	NC_022351	TTC	2	6	1281358	1281363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946727
30558	NC_022351	TTC	2	6	1281367	1281372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946727
30559	NC_022351	AAT	2	6	1281387	1281392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543946727
30560	NC_022351	CAT	2	6	1281471	1281476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946727
30561	NC_022351	TAG	2	6	1281516	1281521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543946727
30562	NC_022351	CTT	2	6	1281522	1281527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946727
30563	NC_022351	A	6	6	1281566	1281571	100 %	0 %	0 %	0 %	543946727
30564	NC_022351	CCA	2	6	1281575	1281580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543946727
30565	NC_022351	T	6	6	1281581	1281586	0 %	100 %	0 %	0 %	543946727
30566	NC_022351	AAT	2	6	1281597	1281602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543946727
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30568	NC_022351	TAAA	2	8	1281733	1281740	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30569	NC_022351	TGAAA	2	10	1281745	1281754	60 %	20 %	20 %	0 %	543946728
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30573	NC_022351	TCA	2	6	1281912	1281917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946728
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30575	NC_022351	AAC	2	6	1281945	1281950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543946728
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30578	NC_022351	TGCT	2	8	1281999	1282006	0 %	50 %	25 %	25 %	543946728
30579	NC_022351	CAAAA	2	10	1282007	1282016	80 %	0 %	0 %	20 %	543946728
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30583	NC_022351	TGA	2	6	1282153	1282158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543946728
30584	NC_022351	A	7	7	1282165	1282171	100 %	0 %	0 %	0 %	543946728
30585	NC_022351	TATC	2	8	1282229	1282236	25 %	50 %	0 %	25 %	543946728
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30587	NC_022351	A	6	6	1282390	1282395	100 %	0 %	0 %	0 %	543946728
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30590	NC_022351	CAT	2	6	1282659	1282664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946729
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30592	NC_022351	TCT	2	6	1282753	1282758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946729
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30597	NC_022351	T	6	6	1283180	1283185	0 %	100 %	0 %	0 %	543946729
30598	NC_022351	TTC	2	6	1283208	1283213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946729
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30600	NC_022351	TTTTCA	2	12	1283407	1283418	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	543946729
30601	NC_022351	ACC	4	12	1283436	1283447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543946729
30602	NC_022351	GCT	2	6	1283452	1283457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543946729
30603	NC_022351	T	6	6	1283493	1283498	0 %	100 %	0 %	0 %	543946729
30604	NC_022351	GCT	2	6	1283500	1283505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543946729
30605	NC_022351	ATGTT	2	10	1283632	1283641	20 %	60 %	20 %	0 %	543946729
30606	NC_022351	CAA	2	6	1283654	1283659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543946729
30607	NC_022351	GAT	2	6	1283730	1283735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543946729
30608	NC_022351	CTT	2	6	1283764	1283769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946729
30609	NC_022351	AC	3	6	1283837	1283842	50 %	0 %	0 %	50 %	543946729
30610	NC_022351	T	6	6	1283850	1283855	0 %	100 %	0 %	0 %	543946729
30611	NC_022351	TCAT	2	8	1284035	1284042	25 %	50 %	0 %	25 %	543946730
30612	NC_022351	ATA	2	6	1284059	1284064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543946730
30613	NC_022351	T	6	6	1284079	1284084	0 %	100 %	0 %	0 %	543946730
30614	NC_022351	TAC	2	6	1284090	1284095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946730
30615	NC_022351	TGC	2	6	1284112	1284117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543946730
30616	NC_022351	GTTT	2	8	1284171	1284178	0 %	75 %	25 %	0 %	543946730
30617	NC_022351	GGA	2	6	1284248	1284253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	543946730
30618	NC_022351	GCA	2	6	1284274	1284279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543946730
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