MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2538 genome

Total Repeats: 39455

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30003	NC_022351	CTT	2	6	1259193	1259198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946704
30004	NC_022351	CCA	2	6	1259227	1259232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543946704
30005	NC_022351	T	6	6	1259278	1259283	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30006	NC_022351	CT	3	6	1259325	1259330	0 %	50 %	0 %	50 %	543946705
30007	NC_022351	T	7	7	1259356	1259362	0 %	100 %	0 %	0 %	543946705
30008	NC_022351	TCT	2	6	1259368	1259373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946705
30009	NC_022351	T	6	6	1259382	1259387	0 %	100 %	0 %	0 %	543946705
30010	NC_022351	T	7	7	1259468	1259474	0 %	100 %	0 %	0 %	543946705
30011	NC_022351	T	6	6	1259538	1259543	0 %	100 %	0 %	0 %	543946705
30012	NC_022351	T	6	6	1259558	1259563	0 %	100 %	0 %	0 %	543946705
30013	NC_022351	ATT	2	6	1259598	1259603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543946705
30014	NC_022351	TA	3	6	1259715	1259720	50 %	50 %	0 %	0 %	543946705
30015	NC_022351	TTC	2	6	1259793	1259798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946705
30016	NC_022351	T	6	6	1259860	1259865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30017	NC_022351	AGA	2	6	1259916	1259921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30018	NC_022351	T	6	6	1259924	1259929	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30019	NC_022351	T	6	6	1259931	1259936	0 %	100 %	0 %	0 %	543946706
30020	NC_022351	AAT	2	6	1259997	1260002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543946706
30021	NC_022351	AGT	2	6	1260019	1260024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543946706
30022	NC_022351	T	6	6	1260028	1260033	0 %	100 %	0 %	0 %	543946706
30023	NC_022351	TAT	2	6	1260075	1260080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543946706
30024	NC_022351	ATC	2	6	1260097	1260102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946706
30025	NC_022351	ATA	2	6	1260103	1260108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543946706
30026	NC_022351	T	8	8	1260118	1260125	0 %	100 %	0 %	0 %	543946706
30027	NC_022351	TAC	2	6	1260169	1260174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946706
30028	NC_022351	CATT	2	8	1260188	1260195	25 %	50 %	0 %	25 %	543946706
30029	NC_022351	TA	3	6	1260217	1260222	50 %	50 %	0 %	0 %	543946706
30030	NC_022351	T	7	7	1260262	1260268	0 %	100 %	0 %	0 %	543946706
30031	NC_022351	TTA	2	6	1260318	1260323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543946706
30032	NC_022351	TCT	2	6	1260362	1260367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946706
30033	NC_022351	A	7	7	1260388	1260394	100 %	0 %	0 %	0 %	543946706
30034	NC_022351	CCA	2	6	1260400	1260405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543946706
30035	NC_022351	T	6	6	1260415	1260420	0 %	100 %	0 %	0 %	543946706
30036	NC_022351	ATA	2	6	1260421	1260426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543946706
30037	NC_022351	TTTG	2	8	1260557	1260564	0 %	75 %	25 %	0 %	543946706
30038	NC_022351	TCA	3	9	1260575	1260583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946706
30039	NC_022351	A	7	7	1260583	1260589	100 %	0 %	0 %	0 %	543946706
30040	NC_022351	TTC	2	6	1260643	1260648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946706
30041	NC_022351	TCA	2	6	1260659	1260664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946706
30042	NC_022351	CAAA	2	8	1260677	1260684	75 %	0 %	0 %	25 %	543946706
30043	NC_022351	ATT	2	6	1260706	1260711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543946706
30044	NC_022351	ACTT	2	8	1260718	1260725	25 %	50 %	0 %	25 %	543946706
30045	NC_022351	T	6	6	1260751	1260756	0 %	100 %	0 %	0 %	543946706
30046	NC_022351	TCT	2	6	1260804	1260809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946706
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30049	NC_022351	TTC	2	6	1260931	1260936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946707
30050	NC_022351	TTA	2	6	1260953	1260958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543946707
30051	NC_022351	T	6	6	1260984	1260989	0 %	100 %	0 %	0 %	543946707
30052	NC_022351	T	6	6	1261028	1261033	0 %	100 %	0 %	0 %	543946707
30053	NC_022351	TC	3	6	1261062	1261067	0 %	50 %	0 %	50 %	543946707
30054	NC_022351	T	7	7	1261122	1261128	0 %	100 %	0 %	0 %	543946707
30055	NC_022351	ATT	2	6	1261147	1261152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543946707
30056	NC_022351	ATT	2	6	1261177	1261182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543946707
30057	NC_022351	GTT	2	6	1261220	1261225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543946707
30058	NC_022351	AG	3	6	1261232	1261237	50 %	0 %	50 %	0 %	543946707
30059	NC_022351	TTC	2	6	1261291	1261296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946707
30060	NC_022351	T	6	6	1261426	1261431	0 %	100 %	0 %	0 %	543946707
30061	NC_022351	TCT	2	6	1261436	1261441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946707
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30063	NC_022351	TTTCA	2	10	1261498	1261507	20 %	60 %	0 %	20 %	543946707
30064	NC_022351	TGAT	2	8	1261706	1261713	25 %	50 %	25 %	0 %	543946707
30065	NC_022351	ATTTA	2	10	1261762	1261771	40 %	60 %	0 %	0 %	543946707
30066	NC_022351	TAT	2	6	1261782	1261787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543946707
30067	NC_022351	CTT	2	6	1261812	1261817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946707
30068	NC_022351	TAA	2	6	1261845	1261850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543946707
30069	NC_022351	GTTT	2	8	1261869	1261876	0 %	75 %	25 %	0 %	543946707
30070	NC_022351	TTGT	2	8	1261906	1261913	0 %	75 %	25 %	0 %	543946707
30071	NC_022351	ATC	2	6	1262074	1262079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946707
30072	NC_022351	GAT	2	6	1262118	1262123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543946707
30073	NC_022351	TAC	2	6	1262136	1262141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946707
30074	NC_022351	TGAT	2	8	1262171	1262178	25 %	50 %	25 %	0 %	543946707
30075	NC_022351	T	6	6	1262196	1262201	0 %	100 %	0 %	0 %	543946707
30076	NC_022351	TTG	2	6	1262263	1262268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543946707
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30087	NC_022351	T	7	7	1262781	1262787	0 %	100 %	0 %	0 %	543946707
30088	NC_022351	ATT	2	6	1262797	1262802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543946707
30089	NC_022351	T	7	7	1262817	1262823	0 %	100 %	0 %	0 %	543946707
30090	NC_022351	CTTT	2	8	1262835	1262842	0 %	75 %	0 %	25 %	543946707
30091	NC_022351	A	7	7	1262878	1262884	100 %	0 %	0 %	0 %	543946707
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30093	NC_022351	TAC	2	6	1263009	1263014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946707
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30098	NC_022351	CCA	2	6	1263155	1263160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543946707
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30100	NC_022351	AAG	2	6	1263210	1263215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543946707
30101	NC_022351	A	6	6	1263245	1263250	100 %	0 %	0 %	0 %	543946707
30102	NC_022351	ATTGA	2	10	1263302	1263311	40 %	40 %	20 %	0 %	543946707
30103	NC_022351	CTAT	2	8	1263359	1263366	25 %	50 %	0 %	25 %	543946707
30104	NC_022351	TAG	2	6	1263390	1263395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543946707
30105	NC_022351	GAACTT	2	12	1263407	1263418	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	543946707
30106	NC_022351	A	6	6	1263419	1263424	100 %	0 %	0 %	0 %	543946707
30107	NC_022351	ACT	2	6	1263484	1263489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946707
30108	NC_022351	TATC	2	8	1263531	1263538	25 %	50 %	0 %	25 %	543946707
30109	NC_022351	ATA	2	6	1263581	1263586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543946707
30110	NC_022351	ATT	2	6	1263595	1263600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543946707
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30112	NC_022351	ATTTAA	2	12	1263688	1263699	50 %	50 %	0 %	0 %	543946707
30113	NC_022351	CAA	2	6	1263720	1263725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543946707
30114	NC_022351	TTTG	2	8	1263740	1263747	0 %	75 %	25 %	0 %	543946707
30115	NC_022351	TGA	2	6	1263835	1263840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543946707
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30117	NC_022351	A	6	6	1263931	1263936	100 %	0 %	0 %	0 %	543946707
30118	NC_022351	T	6	6	1263951	1263956	0 %	100 %	0 %	0 %	543946707
30119	NC_022351	T	7	7	1263983	1263989	0 %	100 %	0 %	0 %	543946707
30120	NC_022351	T	6	6	1264006	1264011	0 %	100 %	0 %	0 %	543946707
30121	NC_022351	ATC	2	6	1264055	1264060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946707
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30151	NC_022351	T	6	6	1265283	1265288	0 %	100 %	0 %	0 %	543946707
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30225	NC_022351	T	7	7	1268322	1268328	0 %	100 %	0 %	0 %	543946711
30226	NC_022351	TTC	2	6	1268344	1268349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946711
30227	NC_022351	CTT	2	6	1268442	1268447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946711
30228	NC_022351	TAAAAC	2	12	1268473	1268484	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	543946711
30229	NC_022351	ATT	2	6	1268516	1268521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543946711
30230	NC_022351	TA	3	6	1268546	1268551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30231	NC_022351	TATTT	2	10	1268633	1268642	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30232	NC_022351	T	6	6	1268648	1268653	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30233	NC_022351	A	7	7	1268666	1268672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30234	NC_022351	T	6	6	1268726	1268731	0 %	100 %	0 %	0 %	543946712
30235	NC_022351	AAAG	2	8	1268742	1268749	75 %	0 %	25 %	0 %	543946712
30236	NC_022351	AGA	2	6	1268762	1268767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543946712
30237	NC_022351	ATT	2	6	1268769	1268774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543946712
30238	NC_022351	AGA	2	6	1268798	1268803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543946712
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30485	NC_022351	TCA	2	6	1278506	1278511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946725
30486	NC_022351	CAT	3	9	1278534	1278542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946725
30487	NC_022351	T	6	6	1278556	1278561	0 %	100 %	0 %	0 %	543946725
30488	NC_022351	AGC	2	6	1278574	1278579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543946725
30489	NC_022351	ATTTT	2	10	1278594	1278603	20 %	80 %	0 %	0 %	543946725
30490	NC_022351	T	7	7	1278600	1278606	0 %	100 %	0 %	0 %	543946725
30491	NC_022351	A	6	6	1278623	1278628	100 %	0 %	0 %	0 %	543946725
30492	NC_022351	T	7	7	1278691	1278697	0 %	100 %	0 %	0 %	543946725
30493	NC_022351	TTC	2	6	1278742	1278747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946725
30494	NC_022351	ATC	2	6	1278788	1278793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946725
30495	NC_022351	T	6	6	1278849	1278854	0 %	100 %	0 %	0 %	543946725
30496	NC_022351	T	7	7	1278862	1278868	0 %	100 %	0 %	0 %	543946725
30497	NC_022351	T	6	6	1278876	1278881	0 %	100 %	0 %	0 %	543946725
30498	NC_022351	AATTTC	2	12	1278895	1278906	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	543946725
30499	NC_022351	A	6	6	1278941	1278946	100 %	0 %	0 %	0 %	543946725
30500	NC_022351	GAT	2	6	1279032	1279037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543946725

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