MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2538 genome

Total Repeats: 39455

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24001	NC_022351	GCC	2	6	1012566	1012571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	543946454
24002	NC_022351	TTGA	2	8	1012719	1012726	25 %	50 %	25 %	0 %	543946454
24003	NC_022351	ATG	2	6	1012808	1012813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543946454
24004	NC_022351	A	6	6	1012896	1012901	100 %	0 %	0 %	0 %	543946454
24005	NC_022351	TCA	2	6	1012914	1012919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946454
24006	NC_022351	CTTT	2	8	1012941	1012948	0 %	75 %	0 %	25 %	543946454
24007	NC_022351	CAT	2	6	1013002	1013007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946454
24008	NC_022351	AAG	2	6	1013014	1013019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543946454
24009	NC_022351	CTGCAA	2	12	1013056	1013067	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	543946454
24010	NC_022351	TCT	2	6	1013079	1013084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946454
24011	NC_022351	TCT	2	6	1013160	1013165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946454
24012	NC_022351	AGC	2	6	1013171	1013176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543946454
24013	NC_022351	AATA	2	8	1013179	1013186	75 %	25 %	0 %	0 %	543946454
24014	NC_022351	ATG	2	6	1013216	1013221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543946454
24015	NC_022351	CTT	2	6	1013242	1013247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946454
24016	NC_022351	CT	3	6	1013271	1013276	0 %	50 %	0 %	50 %	543946454
24017	NC_022351	CAT	2	6	1013375	1013380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946454
24018	NC_022351	T	6	6	1013417	1013422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24019	NC_022351	CT	3	6	1013489	1013494	0 %	50 %	0 %	50 %	543946455
24020	NC_022351	ATA	2	6	1013576	1013581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543946455
24021	NC_022351	T	6	6	1013606	1013611	0 %	100 %	0 %	0 %	543946455
24022	NC_022351	TCA	2	6	1013652	1013657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946455
24023	NC_022351	TTC	2	6	1013677	1013682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946455
24024	NC_022351	ATT	2	6	1013705	1013710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543946455
24025	NC_022351	ATA	2	6	1013771	1013776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543946455
24026	NC_022351	TGC	2	6	1013888	1013893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543946455
24027	NC_022351	TAA	2	6	1013896	1013901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543946455
24028	NC_022351	GAT	2	6	1014082	1014087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543946455
24029	NC_022351	TG	3	6	1014118	1014123	0 %	50 %	50 %	0 %	543946455
24030	NC_022351	T	7	7	1014126	1014132	0 %	100 %	0 %	0 %	543946455
24031	NC_022351	AAGT	2	8	1014134	1014141	50 %	25 %	25 %	0 %	543946455
24032	NC_022351	T	6	6	1014149	1014154	0 %	100 %	0 %	0 %	543946455
24033	NC_022351	TCA	2	6	1014165	1014170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946455
24034	NC_022351	A	6	6	1014410	1014415	100 %	0 %	0 %	0 %	543946455
24035	NC_022351	A	6	6	1014471	1014476	100 %	0 %	0 %	0 %	543946455
24036	NC_022351	A	6	6	1014507	1014512	100 %	0 %	0 %	0 %	543946455
24037	NC_022351	GAT	2	6	1014583	1014588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543946455
24038	NC_022351	AAT	2	6	1014625	1014630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543946455
24039	NC_022351	GCT	2	6	1014684	1014689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543946455
24040	NC_022351	TCT	2	6	1014690	1014695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946455
24041	NC_022351	ACA	2	6	1014753	1014758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543946455
24042	NC_022351	AAT	2	6	1014775	1014780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543946455
24043	NC_022351	AAT	2	6	1014836	1014841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543946455
24044	NC_022351	AAT	2	6	1014870	1014875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543946455
24045	NC_022351	A	8	8	1014921	1014928	100 %	0 %	0 %	0 %	543946455
24046	NC_022351	ATAA	2	8	1014986	1014993	75 %	25 %	0 %	0 %	543946455
24047	NC_022351	ATC	2	6	1015016	1015021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946455
24048	NC_022351	TAA	2	6	1015068	1015073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543946455
24049	NC_022351	TA	3	6	1015121	1015126	50 %	50 %	0 %	0 %	543946455
24050	NC_022351	A	6	6	1015135	1015140	100 %	0 %	0 %	0 %	543946455
24051	NC_022351	TA	3	6	1015159	1015164	50 %	50 %	0 %	0 %	543946455
24052	NC_022351	TTA	2	6	1015173	1015178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543946455
24053	NC_022351	A	6	6	1015195	1015200	100 %	0 %	0 %	0 %	543946455
24054	NC_022351	A	6	6	1015209	1015214	100 %	0 %	0 %	0 %	543946455
24055	NC_022351	ATA	2	6	1015375	1015380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543946455
24056	NC_022351	TAAAAA	2	12	1015384	1015395	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	543946455
24057	NC_022351	CTT	2	6	1015424	1015429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946456
24058	NC_022351	TCA	2	6	1015475	1015480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946456
24059	NC_022351	T	7	7	1015482	1015488	0 %	100 %	0 %	0 %	543946456
24060	NC_022351	TAA	2	6	1015497	1015502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543946456
24061	NC_022351	TCT	2	6	1015508	1015513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946456
24062	NC_022351	TAA	2	6	1015551	1015556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543946456
24063	NC_022351	TTTTG	2	10	1015588	1015597	0 %	80 %	20 %	0 %	543946456
24064	NC_022351	A	6	6	1015634	1015639	100 %	0 %	0 %	0 %	543946456
24065	NC_022351	TTC	2	6	1015657	1015662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946456
24066	NC_022351	TTTG	2	8	1015668	1015675	0 %	75 %	25 %	0 %	543946456
24067	NC_022351	T	7	7	1015716	1015722	0 %	100 %	0 %	0 %	543946456
24068	NC_022351	A	6	6	1015740	1015745	100 %	0 %	0 %	0 %	543946456
24069	NC_022351	AAAGC	2	10	1015770	1015779	60 %	0 %	20 %	20 %	543946456
24070	NC_022351	TTG	2	6	1015832	1015837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543946456
24071	NC_022351	TTC	2	6	1015849	1015854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946456
24072	NC_022351	T	6	6	1015930	1015935	0 %	100 %	0 %	0 %	543946456
24073	NC_022351	T	6	6	1015987	1015992	0 %	100 %	0 %	0 %	543946456
24074	NC_022351	CTTT	2	8	1016009	1016016	0 %	75 %	0 %	25 %	543946456
24075	NC_022351	T	6	6	1016014	1016019	0 %	100 %	0 %	0 %	543946456
24076	NC_022351	T	6	6	1016045	1016050	0 %	100 %	0 %	0 %	543946456
24077	NC_022351	A	7	7	1016071	1016077	100 %	0 %	0 %	0 %	543946456
24078	NC_022351	ACT	2	6	1016102	1016107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946456
24079	NC_022351	ATA	2	6	1016140	1016145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543946456
24080	NC_022351	GCT	2	6	1016189	1016194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543946456
24081	NC_022351	T	6	6	1016252	1016257	0 %	100 %	0 %	0 %	543946457
24082	NC_022351	CT	3	6	1016262	1016267	0 %	50 %	0 %	50 %	543946457
24083	NC_022351	CTT	2	6	1016272	1016277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946457
24084	NC_022351	ATT	2	6	1016315	1016320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543946457
24085	NC_022351	TTC	2	6	1016357	1016362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946457
24086	NC_022351	TGA	2	6	1016372	1016377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543946458
24087	NC_022351	CAT	2	6	1016415	1016420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946458
24088	NC_022351	CTTT	2	8	1016429	1016436	0 %	75 %	0 %	25 %	543946458
24089	NC_022351	CAA	2	6	1016457	1016462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543946458
24090	NC_022351	T	6	6	1016472	1016477	0 %	100 %	0 %	0 %	543946458
24091	NC_022351	TCT	2	6	1016483	1016488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946458
24092	NC_022351	AGA	2	6	1016515	1016520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543946458
24093	NC_022351	CCT	2	6	1016528	1016533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	543946458
24094	NC_022351	CAC	2	6	1016545	1016550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543946458
24095	NC_022351	CTT	2	6	1016552	1016557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946458
24096	NC_022351	ATTT	2	8	1016847	1016854	25 %	75 %	0 %	0 %	543946458
24097	NC_022351	CTT	2	6	1016856	1016861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946458
24098	NC_022351	TCA	2	6	1016870	1016875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946458
24099	NC_022351	GTA	2	6	1016918	1016923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543946458
24100	NC_022351	TGC	2	6	1016986	1016991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543946458
24101	NC_022351	AAT	2	6	1017064	1017069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543946458
24102	NC_022351	CAA	2	6	1017102	1017107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543946458
24103	NC_022351	T	6	6	1017223	1017228	0 %	100 %	0 %	0 %	543946458
24104	NC_022351	TCA	2	6	1017269	1017274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946458
24105	NC_022351	TTG	2	6	1017296	1017301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543946458
24106	NC_022351	T	6	6	1017312	1017317	0 %	100 %	0 %	0 %	543946458
24107	NC_022351	CAT	2	6	1017321	1017326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946458
24108	NC_022351	CTA	2	6	1017456	1017461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946458
24109	NC_022351	CGCTTT	2	12	1017555	1017566	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	543946458
24110	NC_022351	T	7	7	1017564	1017570	0 %	100 %	0 %	0 %	543946458
24111	NC_022351	CAT	2	6	1017646	1017651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946458
24112	NC_022351	AGC	2	6	1017655	1017660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543946458
24113	NC_022351	T	6	6	1017719	1017724	0 %	100 %	0 %	0 %	543946458
24114	NC_022351	AAT	2	6	1017782	1017787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543946458
24115	NC_022351	TAA	2	6	1017874	1017879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543946459
24116	NC_022351	TCA	2	6	1017887	1017892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946459
24117	NC_022351	AT	3	6	1017918	1017923	50 %	50 %	0 %	0 %	543946459
24118	NC_022351	CTT	2	6	1017930	1017935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946459
24119	NC_022351	TCT	2	6	1018001	1018006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946459
24120	NC_022351	T	6	6	1018026	1018031	0 %	100 %	0 %	0 %	543946459
24121	NC_022351	TTC	2	6	1018099	1018104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946459
24122	NC_022351	TAA	2	6	1018116	1018121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543946459
24123	NC_022351	TAATA	2	10	1018143	1018152	60 %	40 %	0 %	0 %	543946459
24124	NC_022351	CAT	2	6	1018155	1018160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946459
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24126	NC_022351	CTT	2	6	1018209	1018214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946459
24127	NC_022351	TACA	2	8	1018240	1018247	50 %	25 %	0 %	25 %	543946459
24128	NC_022351	CAT	2	6	1018296	1018301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946459
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24131	NC_022351	TA	3	6	1018383	1018388	50 %	50 %	0 %	0 %	543946459
24132	NC_022351	T	6	6	1018439	1018444	0 %	100 %	0 %	0 %	543946459
24133	NC_022351	CAT	2	6	1018458	1018463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946459
24134	NC_022351	T	6	6	1018495	1018500	0 %	100 %	0 %	0 %	543946459
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24143	NC_022351	CCA	2	6	1018796	1018801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543946459
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24147	NC_022351	T	9	9	1019103	1019111	0 %	100 %	0 %	0 %	543946459
24148	NC_022351	T	7	7	1019113	1019119	0 %	100 %	0 %	0 %	543946459
24149	NC_022351	T	7	7	1019137	1019143	0 %	100 %	0 %	0 %	543946459
24150	NC_022351	TTC	2	6	1019155	1019160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946459
24151	NC_022351	CTT	2	6	1019178	1019183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946459
24152	NC_022351	ATTT	2	8	1019195	1019202	25 %	75 %	0 %	0 %	543946459
24153	NC_022351	T	7	7	1019210	1019216	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24154	NC_022351	ACC	2	6	1019251	1019256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24155	NC_022351	TGA	2	6	1019267	1019272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24156	NC_022351	CTT	2	6	1019320	1019325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946460
24157	NC_022351	TTC	2	6	1019345	1019350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946460
24158	NC_022351	TTCATT	2	12	1019450	1019461	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	543946460
24159	NC_022351	TTA	2	6	1019511	1019516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543946460
24160	NC_022351	T	6	6	1019564	1019569	0 %	100 %	0 %	0 %	543946460
24161	NC_022351	A	6	6	1019588	1019593	100 %	0 %	0 %	0 %	543946460
24162	NC_022351	TC	3	6	1019596	1019601	0 %	50 %	0 %	50 %	543946460
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24205	NC_022351	TTG	2	6	1021733	1021738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543946460
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24213	NC_022351	T	6	6	1021961	1021966	0 %	100 %	0 %	0 %	543946460
24214	NC_022351	AGT	2	6	1022012	1022017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543946460
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24216	NC_022351	TAA	2	6	1022068	1022073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24217	NC_022351	A	7	7	1022133	1022139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24218	NC_022351	GAA	2	6	1022227	1022232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543946461
24219	NC_022351	TTTA	2	8	1022331	1022338	25 %	75 %	0 %	0 %	543946461
24220	NC_022351	ATG	2	6	1022387	1022392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543946461
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24224	NC_022351	TTCAAA	2	12	1022469	1022480	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	543946461
24225	NC_022351	AAAT	2	8	1022495	1022502	75 %	25 %	0 %	0 %	543946461
24226	NC_022351	TCT	2	6	1022523	1022528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946461
24227	NC_022351	AAATT	2	10	1022539	1022548	60 %	40 %	0 %	0 %	543946461
24228	NC_022351	GAT	2	6	1022575	1022580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543946461
24229	NC_022351	TAC	2	6	1022594	1022599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543946461
24230	NC_022351	TTA	2	6	1022666	1022671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543946461
24231	NC_022351	T	6	6	1022706	1022711	0 %	100 %	0 %	0 %	543946461
24232	NC_022351	A	6	6	1022721	1022726	100 %	0 %	0 %	0 %	543946461
24233	NC_022351	A	8	8	1022792	1022799	100 %	0 %	0 %	0 %	543946461
24234	NC_022351	AAT	2	6	1022956	1022961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543946461
24235	NC_022351	TTTAT	2	10	1022984	1022993	20 %	80 %	0 %	0 %	543946461
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24474	NC_022351	TCT	2	6	1032508	1032513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543946473
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