MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Campylobacter coli CVM N29710 plasmid pN29710-2

Total Repeats: 78

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022348	A	6	6	5	10	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022348	T	6	6	23	28	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022348	A	6	6	62	67	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022348	TATT	2	8	87	94	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022348	TAA	3	9	254	262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022348	AT	3	6	272	277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022348	T	6	6	518	523	0 %	100 %	0 %	0 %	543939818
8	NC_022348	AG	3	6	552	557	50 %	0 %	50 %	0 %	543939818
9	NC_022348	AGT	2	6	560	565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543939818
10	NC_022348	A	6	6	673	678	100 %	0 %	0 %	0 %	543939818
11	NC_022348	TTA	2	6	714	719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543939818
12	NC_022348	ACA	2	6	743	748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543939818
13	NC_022348	AGTA	2	8	774	781	50 %	25 %	25 %	0 %	543939818
14	NC_022348	AT	3	6	859	864	50 %	50 %	0 %	0 %	543939818
15	NC_022348	TGA	2	6	926	931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543939818
16	NC_022348	A	6	6	981	986	100 %	0 %	0 %	0 %	543939818
17	NC_022348	A	6	6	1033	1038	100 %	0 %	0 %	0 %	543939818
18	NC_022348	GAT	2	6	1044	1049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543939818
19	NC_022348	AG	3	6	1056	1061	50 %	0 %	50 %	0 %	543939818
20	NC_022348	ACA	2	6	1075	1080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543939818
21	NC_022348	TAT	2	6	1113	1118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543939818
22	NC_022348	T	6	6	1194	1199	0 %	100 %	0 %	0 %	543939818
23	NC_022348	CAAA	2	8	1249	1256	75 %	0 %	0 %	25 %	543939818
24	NC_022348	GAT	2	6	1257	1262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543939818
25	NC_022348	T	6	6	1262	1267	0 %	100 %	0 %	0 %	543939818
26	NC_022348	TA	3	6	1288	1293	50 %	50 %	0 %	0 %	543939818
27	NC_022348	A	6	6	1323	1328	100 %	0 %	0 %	0 %	543939818
28	NC_022348	CAATG	2	10	1342	1351	40 %	20 %	20 %	20 %	543939818
29	NC_022348	GA	3	6	1403	1408	50 %	0 %	50 %	0 %	543939818
30	NC_022348	AT	3	6	1444	1449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022348	TAAAAT	2	12	1457	1468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022348	ATTAAG	2	12	1493	1504	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022348	T	6	6	1506	1511	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022348	AGG	2	6	1530	1535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022348	A	6	6	1604	1609	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022348	T	6	6	1630	1635	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022348	T	6	6	1638	1643	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022348	ACA	2	6	1669	1674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543939819
39	NC_022348	AGA	2	6	1704	1709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543939819
40	NC_022348	A	6	6	1726	1731	100 %	0 %	0 %	0 %	543939819
41	NC_022348	GAT	2	6	1738	1743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543939819
42	NC_022348	AGA	2	6	1797	1802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543939819
43	NC_022348	TGAA	2	8	1811	1818	50 %	25 %	25 %	0 %	543939819
44	NC_022348	ATT	2	6	1825	1830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543939819
45	NC_022348	ATC	2	6	1873	1878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543939819
46	NC_022348	A	6	6	1888	1893	100 %	0 %	0 %	0 %	543939819
47	NC_022348	A	6	6	1940	1945	100 %	0 %	0 %	0 %	543939820
48	NC_022348	A	6	6	2072	2077	100 %	0 %	0 %	0 %	543939820
49	NC_022348	A	7	7	2161	2167	100 %	0 %	0 %	0 %	543939820
50	NC_022348	TA	3	6	2188	2193	50 %	50 %	0 %	0 %	543939820
51	NC_022348	TAC	2	6	2209	2214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543939820
52	NC_022348	A	6	6	2241	2246	100 %	0 %	0 %	0 %	543939820
53	NC_022348	AAC	2	6	2322	2327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543939820
54	NC_022348	T	6	6	2354	2359	0 %	100 %	0 %	0 %	543939820
55	NC_022348	TAAA	2	8	2406	2413	75 %	25 %	0 %	0 %	543939820
56	NC_022348	ATAC	2	8	2506	2513	50 %	25 %	0 %	25 %	543939820
57	NC_022348	AAGAAA	2	12	2547	2558	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	543939820
58	NC_022348	A	8	8	2616	2623	100 %	0 %	0 %	0 %	543939820
59	NC_022348	ACAAG	2	10	2635	2644	60 %	0 %	20 %	20 %	543939820
60	NC_022348	AGA	2	6	2665	2670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543939820
61	NC_022348	AGA	2	6	2827	2832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543939820
62	NC_022348	T	6	6	2854	2859	0 %	100 %	0 %	0 %	543939820
63	NC_022348	TAA	2	6	2890	2895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543939820
64	NC_022348	GAT	2	6	2936	2941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543939820
65	NC_022348	CA	3	6	2970	2975	50 %	0 %	0 %	50 %	543939820
66	NC_022348	A	6	6	2980	2985	100 %	0 %	0 %	0 %	543939820
67	NC_022348	A	6	6	3081	3086	100 %	0 %	0 %	0 %	543939820
68	NC_022348	ATA	2	6	3153	3158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543939820
69	NC_022348	GGGTTT	2	12	3161	3172	0 %	50 %	50 %	0 %	543939820
70	NC_022348	T	7	7	3188	3194	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022348	AACG	2	8	3274	3281	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_022348	AAT	2	6	3332	3337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022348	A	6	6	3417	3422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022348	GCTATT	2	12	3441	3452	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_022348	T	7	7	3504	3510	0 %	100 %	0 %	0 %	543939821
76	NC_022348	CAA	2	6	3561	3566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543939821
77	NC_022348	CCAA	2	8	3604	3611	50 %	0 %	0 %	50 %	543939821
78	NC_022348	CTT	2	6	3669	3674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543939821

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.