MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/31-98

Total Repeats: 23001

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_022121	AG	4	8	764902	764909	50 %	0 %	50 %	0 %	532431809
17002	NC_022121	GCT	2	6	764918	764923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431809
17003	NC_022121	ATG	2	6	765002	765007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431809
17004	NC_022121	GTG	2	6	765023	765028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532431809
17005	NC_022121	TGC	2	6	765112	765117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431810
17006	NC_022121	GGT	2	6	765185	765190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532431810
17007	NC_022121	ATG	2	6	765245	765250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431810
17008	NC_022121	GATC	2	8	765271	765278	25 %	25 %	25 %	25 %	532431810
17009	NC_022121	GGA	2	6	765286	765291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431810
17010	NC_022121	ATGCAA	2	12	765365	765376	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532431810
17011	NC_022121	TTG	2	6	765423	765428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431810
17012	NC_022121	ACA	2	6	765469	765474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431810
17013	NC_022121	GAA	2	6	765500	765505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431810
17014	NC_022121	GAA	2	6	765548	765553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431810
17015	NC_022121	TGT	2	6	765570	765575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431810
17016	NC_022121	GAGAAA	2	12	765594	765605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431810
17017	NC_022121	AGT	2	6	765695	765700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431810
17018	NC_022121	TAT	2	6	765812	765817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431811
17019	NC_022121	TGT	2	6	765845	765850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431811
17020	NC_022121	GGT	2	6	765917	765922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532431811
17021	NC_022121	GAGT	2	8	765973	765980	25 %	25 %	50 %	0 %	532431811
17022	NC_022121	CTT	2	6	765982	765987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431811
17023	NC_022121	GTC	2	6	766427	766432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431811
17024	NC_022121	TGC	2	6	766448	766453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431811
17025	NC_022121	TGA	2	6	766510	766515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431811
17026	NC_022121	CCT	2	6	766575	766580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431811
17027	NC_022121	GAT	2	6	766695	766700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431811
17028	NC_022121	TTCT	2	8	766753	766760	0 %	75 %	0 %	25 %	532431811
17029	NC_022121	AAC	2	6	766846	766851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431811
17030	NC_022121	ATT	2	6	766857	766862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431811
17031	NC_022121	AG	3	6	766872	766877	50 %	0 %	50 %	0 %	532431811
17032	NC_022121	TCG	2	6	766928	766933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431811
17033	NC_022121	GGATC	2	10	766935	766944	20 %	20 %	40 %	20 %	532431811
17034	NC_022121	TAAAT	2	10	766976	766985	60 %	40 %	0 %	0 %	532431811
17035	NC_022121	A	6	6	767011	767016	100 %	0 %	0 %	0 %	532431811
17036	NC_022121	GCT	2	6	767031	767036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431811
17037	NC_022121	TAG	2	6	767074	767079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17038	NC_022121	TG	3	6	767083	767088	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17039	NC_022121	AAG	2	6	767122	767127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431812
17040	NC_022121	CAGAG	2	10	767139	767148	40 %	0 %	40 %	20 %	532431812
17041	NC_022121	GTT	2	6	767152	767157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431812
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17043	NC_022121	GCGAT	2	10	767291	767300	20 %	20 %	40 %	20 %	532431812
17044	NC_022121	AGT	2	6	767325	767330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431812
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17046	NC_022121	AGAA	2	8	767372	767379	75 %	0 %	25 %	0 %	532431812
17047	NC_022121	GCA	3	9	767389	767397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431812
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17050	NC_022121	A	6	6	767450	767455	100 %	0 %	0 %	0 %	532431812
17051	NC_022121	AGA	2	6	767469	767474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431812
17052	NC_022121	AAG	2	6	767483	767488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431812
17053	NC_022121	AGA	2	6	767496	767501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431812
17054	NC_022121	GAA	2	6	767512	767517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431812
17055	NC_022121	AGATG	2	10	767526	767535	40 %	20 %	40 %	0 %	532431812
17056	NC_022121	TCA	2	6	767547	767552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431812
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17058	NC_022121	TAAA	2	8	767603	767610	75 %	25 %	0 %	0 %	532431813
17059	NC_022121	ATC	2	6	767648	767653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431813
17060	NC_022121	GAAG	2	8	767710	767717	50 %	0 %	50 %	0 %	532431813
17061	NC_022121	GAA	2	6	767756	767761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431813
17062	NC_022121	CGTCA	2	10	767765	767774	20 %	20 %	20 %	40 %	532431813
17063	NC_022121	TCT	2	6	767779	767784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431813
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17065	NC_022121	TCT	2	6	767830	767835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431813
17066	NC_022121	AGA	4	12	767838	767849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431813
17067	NC_022121	TTC	2	6	767866	767871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431813
17068	NC_022121	TGG	2	6	767874	767879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532431813
17069	NC_022121	ATG	2	6	767938	767943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431813
17070	NC_022121	TAG	2	6	768050	768055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431813
17071	NC_022121	ATA	2	6	768068	768073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431813
17072	NC_022121	GAA	2	6	768130	768135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431813
17073	NC_022121	CAG	2	6	768199	768204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431813
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17089	NC_022121	GAAG	2	8	768531	768538	50 %	0 %	50 %	0 %	532431814
17090	NC_022121	TTTTC	2	10	768544	768553	0 %	80 %	0 %	20 %	532431814
17091	NC_022121	GAA	2	6	768607	768612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431814
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17100	NC_022121	GGAG	2	8	768942	768949	25 %	0 %	75 %	0 %	532431814
17101	NC_022121	AGA	2	6	769050	769055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431814
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17105	NC_022121	AGA	2	6	769323	769328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431814
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17111	NC_022121	TTGC	2	8	769625	769632	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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17117	NC_022121	AT	3	6	770222	770227	50 %	50 %	0 %	0 %	532431815
17118	NC_022121	GAGCA	2	10	770235	770244	40 %	0 %	40 %	20 %	532431815
17119	NC_022121	TTG	2	6	770289	770294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431815
17120	NC_022121	GCA	2	6	770400	770405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431815
17121	NC_022121	AAGA	2	8	770481	770488	75 %	0 %	25 %	0 %	532431815
17122	NC_022121	TGT	2	6	770492	770497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431815
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17128	NC_022121	TTG	2	6	770819	770824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431815
17129	NC_022121	AGA	2	6	770843	770848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431815
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17131	NC_022121	G	6	6	770902	770907	0 %	0 %	100 %	0 %	532431815
17132	NC_022121	GGA	2	6	770942	770947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431815
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17147	NC_022121	CTG	2	6	771645	771650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431816
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17150	NC_022121	TCG	2	6	771736	771741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431816
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17155	NC_022121	TAAA	2	8	771930	771937	75 %	25 %	0 %	0 %	532431816
17156	NC_022121	AAG	2	6	771963	771968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431816
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17223	NC_022121	TGA	2	6	775913	775918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17224	NC_022121	AGAA	2	8	775937	775944	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17225	NC_022121	T	7	7	776139	776145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17226	NC_022121	ATTT	2	8	776172	776179	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17227	NC_022121	CTT	2	6	776232	776237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431819
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17232	NC_022121	TTC	2	6	776437	776442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431819
17233	NC_022121	CAT	2	6	776547	776552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431819
17234	NC_022121	CGATG	2	10	776593	776602	20 %	20 %	40 %	20 %	532431819
17235	NC_022121	A	6	6	776701	776706	100 %	0 %	0 %	0 %	532431819
17236	NC_022121	TCC	2	6	776757	776762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431820
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17238	NC_022121	CCT	2	6	776804	776809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431820
17239	NC_022121	GATC	2	8	776882	776889	25 %	25 %	25 %	25 %	532431820
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17241	NC_022121	GTT	2	6	777055	777060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431820
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17368	NC_022121	CTT	2	6	783598	783603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431824
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