MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/31-98

Total Repeats: 23001

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_022121	AGAGA	2	10	698353	698362	60 %	0 %	40 %	0 %	532431758
15502	NC_022121	TCAAA	2	10	698403	698412	60 %	20 %	0 %	20 %	532431758
15503	NC_022121	A	6	6	698429	698434	100 %	0 %	0 %	0 %	532431758
15504	NC_022121	T	6	6	698597	698602	0 %	100 %	0 %	0 %	532431758
15505	NC_022121	TAAT	2	8	698614	698621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15506	NC_022121	TGA	2	6	698641	698646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15507	NC_022121	CCT	2	6	698749	698754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15508	NC_022121	T	8	8	698808	698815	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15509	NC_022121	GCA	2	6	698832	698837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431759
15510	NC_022121	ACT	2	6	698867	698872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431759
15511	NC_022121	CCGCAA	2	12	698878	698889	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	532431759
15512	NC_022121	GCAAC	2	10	698902	698911	40 %	0 %	20 %	40 %	532431759
15513	NC_022121	TGA	2	6	698939	698944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431759
15514	NC_022121	CAA	2	6	699015	699020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431759
15515	NC_022121	CAG	2	6	699021	699026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431759
15516	NC_022121	TTC	2	6	699123	699128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431759
15517	NC_022121	CAA	2	6	699171	699176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431759
15518	NC_022121	TAGC	2	8	699223	699230	25 %	25 %	25 %	25 %	532431759
15519	NC_022121	GCA	2	6	699481	699486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431759
15520	NC_022121	TTCT	2	8	699610	699617	0 %	75 %	0 %	25 %	532431759
15521	NC_022121	TA	3	6	699664	699669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15522	NC_022121	T	8	8	699679	699686	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15523	NC_022121	GCT	2	6	699704	699709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431760
15524	NC_022121	TTG	2	6	699802	699807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431760
15525	NC_022121	TCC	2	6	699871	699876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431760
15526	NC_022121	TGC	2	6	699904	699909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431760
15527	NC_022121	TCTT	2	8	699989	699996	0 %	75 %	0 %	25 %	532431760
15528	NC_022121	CTT	2	6	700016	700021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431760
15529	NC_022121	AG	3	6	700025	700030	50 %	0 %	50 %	0 %	532431760
15530	NC_022121	ATA	2	6	700055	700060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431760
15531	NC_022121	TGCG	2	8	700088	700095	0 %	25 %	50 %	25 %	532431760
15532	NC_022121	CTAG	2	8	700151	700158	25 %	25 %	25 %	25 %	532431760
15533	NC_022121	AT	3	6	700211	700216	50 %	50 %	0 %	0 %	532431760
15534	NC_022121	CCT	2	6	700278	700283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431760
15535	NC_022121	GAA	2	6	700301	700306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431760
15536	NC_022121	GTA	2	6	700312	700317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431760
15537	NC_022121	TTA	2	6	700337	700342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431760
15538	NC_022121	AGG	2	6	700352	700357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431760
15539	NC_022121	AGC	2	6	700372	700377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431760
15540	NC_022121	TTG	2	6	700382	700387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431760
15541	NC_022121	CTT	2	6	700395	700400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431760
15542	NC_022121	AAG	2	6	700518	700523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431760
15543	NC_022121	AAG	2	6	700548	700553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431760
15544	NC_022121	TTG	2	6	700603	700608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431760
15545	NC_022121	T	8	8	700766	700773	0 %	100 %	0 %	0 %	532431760
15546	NC_022121	TTC	3	9	700777	700785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431760
15547	NC_022121	A	7	7	700812	700818	100 %	0 %	0 %	0 %	532431760
15548	NC_022121	TTTTG	2	10	700820	700829	0 %	80 %	20 %	0 %	532431760
15549	NC_022121	ATTT	2	8	700842	700849	25 %	75 %	0 %	0 %	532431760
15550	NC_022121	TCA	2	6	700874	700879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431760
15551	NC_022121	CCA	2	6	700923	700928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532431760
15552	NC_022121	TCC	2	6	701024	701029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431760
15553	NC_022121	CT	3	6	701147	701152	0 %	50 %	0 %	50 %	532431760
15554	NC_022121	ACG	2	6	701154	701159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431760
15555	NC_022121	AAG	2	6	701171	701176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431760
15556	NC_022121	TTGC	2	8	701247	701254	0 %	50 %	25 %	25 %	532431760
15557	NC_022121	ACC	2	6	701267	701272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532431760
15558	NC_022121	TG	3	6	701345	701350	0 %	50 %	50 %	0 %	532431760
15559	NC_022121	TAC	2	6	701355	701360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431760
15560	NC_022121	TCC	2	6	701366	701371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431760
15561	NC_022121	CTT	2	6	701430	701435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431760
15562	NC_022121	ATT	2	6	701470	701475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431760
15563	NC_022121	TCCA	2	8	701483	701490	25 %	25 %	0 %	50 %	532431760
15564	NC_022121	TGCT	2	8	701607	701614	0 %	50 %	25 %	25 %	532431760
15565	NC_022121	CTTC	2	8	701631	701638	0 %	50 %	0 %	50 %	532431760
15566	NC_022121	ATA	2	6	701665	701670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431760
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15568	NC_022121	TTCT	2	8	701776	701783	0 %	75 %	0 %	25 %	532431760
15569	NC_022121	CAG	2	6	701808	701813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431760
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15571	NC_022121	GGTA	2	8	701874	701881	25 %	25 %	50 %	0 %	532431760
15572	NC_022121	CGA	2	6	701899	701904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431760
15573	NC_022121	TCT	2	6	701942	701947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431760
15574	NC_022121	TAC	2	6	702021	702026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431760
15575	NC_022121	ATA	2	6	702032	702037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431760
15576	NC_022121	CTG	2	6	702039	702044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431760
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15579	NC_022121	C	6	6	702075	702080	0 %	0 %	0 %	100 %	532431760
15580	NC_022121	TCC	2	6	702085	702090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431760
15581	NC_022121	CTC	2	6	702193	702198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431760
15582	NC_022121	TGGC	2	8	702207	702214	0 %	25 %	50 %	25 %	532431760
15583	NC_022121	TAAA	2	8	702261	702268	75 %	25 %	0 %	0 %	532431760
15584	NC_022121	AGT	2	6	702283	702288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431760
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15587	NC_022121	A	6	6	702361	702366	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15588	NC_022121	T	7	7	702368	702374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15589	NC_022121	TGTT	2	8	702378	702385	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15590	NC_022121	TAA	2	6	702453	702458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431761
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15592	NC_022121	ATT	2	6	702498	702503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431761
15593	NC_022121	A	6	6	702557	702562	100 %	0 %	0 %	0 %	532431761
15594	NC_022121	ATG	2	6	702617	702622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431761
15595	NC_022121	AGTT	2	8	702641	702648	25 %	50 %	25 %	0 %	532431761
15596	NC_022121	TCT	2	6	702658	702663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431761
15597	NC_022121	TTGG	2	8	702778	702785	0 %	50 %	50 %	0 %	532431761
15598	NC_022121	TC	3	6	702789	702794	0 %	50 %	0 %	50 %	532431761
15599	NC_022121	CAA	2	6	702838	702843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431761
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15601	NC_022121	ATTT	2	8	702878	702885	25 %	75 %	0 %	0 %	532431761
15602	NC_022121	ACT	2	6	702895	702900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431761
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15604	NC_022121	TCCT	2	8	702959	702966	0 %	50 %	0 %	50 %	532431761
15605	NC_022121	CAAT	2	8	703029	703036	50 %	25 %	0 %	25 %	532431761
15606	NC_022121	GAT	2	6	703173	703178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431761
15607	NC_022121	ATCT	2	8	703253	703260	25 %	50 %	0 %	25 %	532431761
15608	NC_022121	ATC	2	6	703267	703272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431761
15609	NC_022121	TTC	2	6	703275	703280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431761
15610	NC_022121	TC	4	8	703279	703286	0 %	50 %	0 %	50 %	532431761
15611	NC_022121	TATC	2	8	703346	703353	25 %	50 %	0 %	25 %	532431761
15612	NC_022121	TA	3	6	703387	703392	50 %	50 %	0 %	0 %	532431761
15613	NC_022121	CT	3	6	703407	703412	0 %	50 %	0 %	50 %	532431761
15614	NC_022121	TCA	2	6	703442	703447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431761
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15617	NC_022121	GC	3	6	703530	703535	0 %	0 %	50 %	50 %	532431761
15618	NC_022121	AACT	2	8	703556	703563	50 %	25 %	0 %	25 %	532431761
15619	NC_022121	TGA	2	6	703605	703610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431761
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15621	NC_022121	GAC	2	6	703689	703694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431761
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15857	NC_022121	GTT	2	6	714777	714782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15994	NC_022121	AGA	3	9	720866	720874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15995	NC_022121	TAA	2	6	720878	720883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15996	NC_022121	TCT	3	9	720897	720905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15997	NC_022121	G	6	6	720907	720912	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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