MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/31-98

Total Repeats: 23001

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15003	NC_022121	TCT	2	6	676573	676578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431735
15004	NC_022121	ACT	2	6	676594	676599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431735
15005	NC_022121	CAT	2	6	676607	676612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431735
15006	NC_022121	CTG	2	6	676784	676789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431735
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15008	NC_022121	GAA	2	6	676945	676950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431735
15009	NC_022121	ACC	2	6	677047	677052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532431735
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15011	NC_022121	TCC	2	6	677122	677127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431735
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15013	NC_022121	TCT	2	6	677317	677322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431735
15014	NC_022121	AGCA	2	8	677350	677357	50 %	0 %	25 %	25 %	532431735
15015	NC_022121	A	6	6	677361	677366	100 %	0 %	0 %	0 %	532431735
15016	NC_022121	ACA	2	6	677392	677397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15017	NC_022121	CT	3	6	677398	677403	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15018	NC_022121	ATC	2	6	677416	677421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15019	NC_022121	ACA	2	6	677424	677429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15020	NC_022121	GTT	2	6	677435	677440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15021	NC_022121	CAT	2	6	677563	677568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431736
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15030	NC_022121	TAAA	2	8	677928	677935	75 %	25 %	0 %	0 %	532431736
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15033	NC_022121	TTG	2	6	678105	678110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431736
15034	NC_022121	TAG	2	6	678123	678128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431736
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15036	NC_022121	CTTTT	2	10	678186	678195	0 %	80 %	0 %	20 %	532431736
15037	NC_022121	AGA	3	9	678261	678269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431737
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15041	NC_022121	ACCAT	2	10	678443	678452	40 %	20 %	0 %	40 %	532431737
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15043	NC_022121	GCT	2	6	678537	678542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431737
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15053	NC_022121	CAAA	2	8	678925	678932	75 %	0 %	0 %	25 %	532431738
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15071	NC_022121	CT	3	6	679688	679693	0 %	50 %	0 %	50 %	532431739
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15093	NC_022121	GA	3	6	680586	680591	50 %	0 %	50 %	0 %	532431739
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15105	NC_022121	TCG	2	6	681177	681182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431740
15106	NC_022121	TAA	2	6	681222	681227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431741
15107	NC_022121	CCT	2	6	681309	681314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431741
15108	NC_022121	TCA	2	6	681328	681333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431741
15109	NC_022121	ACCT	2	8	681414	681421	25 %	25 %	0 %	50 %	532431741
15110	NC_022121	TCT	2	6	681506	681511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431741
15111	NC_022121	AAAT	2	8	681517	681524	75 %	25 %	0 %	0 %	532431741
15112	NC_022121	CAA	2	6	681536	681541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431741
15113	NC_022121	A	8	8	681546	681553	100 %	0 %	0 %	0 %	532431741
15114	NC_022121	CATATT	2	12	681656	681667	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	532431741
15115	NC_022121	GA	3	6	681678	681683	50 %	0 %	50 %	0 %	532431741
15116	NC_022121	CGT	2	6	681718	681723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431741
15117	NC_022121	A	7	7	681730	681736	100 %	0 %	0 %	0 %	532431741
15118	NC_022121	TAA	2	6	681739	681744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431741
15119	NC_022121	GCT	2	6	681802	681807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431741
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15121	NC_022121	CTG	2	6	681831	681836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15122	NC_022121	AACT	2	8	681855	681862	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15123	NC_022121	AAC	2	6	681960	681965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431742
15124	NC_022121	TAT	2	6	682016	682021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431742
15125	NC_022121	GAA	2	6	682056	682061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431742
15126	NC_022121	CTT	2	6	682064	682069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431742
15127	NC_022121	ACTA	2	8	682118	682125	50 %	25 %	0 %	25 %	532431742
15128	NC_022121	ATC	2	6	682128	682133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431742
15129	NC_022121	ATT	2	6	682167	682172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431742
15130	NC_022121	CT	3	6	682186	682191	0 %	50 %	0 %	50 %	532431742
15131	NC_022121	CTT	2	6	682209	682214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431742
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15136	NC_022121	TCC	2	6	682574	682579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431743
15137	NC_022121	GTC	2	6	682622	682627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431743
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15141	NC_022121	TTTC	2	8	682777	682784	0 %	75 %	0 %	25 %	532431743
15142	NC_022121	TCT	2	6	682785	682790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431743
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15145	NC_022121	CTC	2	6	682854	682859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15146	NC_022121	AGAA	2	8	682862	682869	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15147	NC_022121	ACC	2	6	682900	682905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15148	NC_022121	A	6	6	682949	682954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15149	NC_022121	AGG	2	6	682964	682969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15150	NC_022121	A	6	6	683016	683021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15151	NC_022121	TTC	2	6	683061	683066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431744
15152	NC_022121	CT	3	6	683076	683081	0 %	50 %	0 %	50 %	532431744
15153	NC_022121	AAC	2	6	683122	683127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431744
15154	NC_022121	GTC	2	6	683134	683139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431744
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15156	NC_022121	CCT	3	9	683276	683284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431744
15157	NC_022121	CTG	2	6	683293	683298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431744
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15159	NC_022121	CACC	2	8	683419	683426	25 %	0 %	0 %	75 %	532431744
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15162	NC_022121	GCA	2	6	683515	683520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431744
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15183	NC_022121	ATAC	2	8	684224	684231	50 %	25 %	0 %	25 %	532431744
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15185	NC_022121	TTTTC	2	10	684287	684296	0 %	80 %	0 %	20 %	532431744
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15189	NC_022121	AAC	2	6	684717	684722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15190	NC_022121	GAAG	2	8	684756	684763	50 %	0 %	50 %	0 %	532431745
15191	NC_022121	CA	3	6	684801	684806	50 %	0 %	0 %	50 %	532431745
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15196	NC_022121	CATA	2	8	685071	685078	50 %	25 %	0 %	25 %	532431745
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15199	NC_022121	CATC	2	8	685140	685147	25 %	25 %	0 %	50 %	532431745
15200	NC_022121	GATA	2	8	685201	685208	50 %	25 %	25 %	0 %	532431745
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15204	NC_022121	AATT	2	8	685498	685505	50 %	50 %	0 %	0 %	532431745
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15214	NC_022121	T	7	7	686019	686025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15215	NC_022121	TAAAA	2	10	686055	686064	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15217	NC_022121	GAAA	2	8	686074	686081	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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15221	NC_022121	T	8	8	686136	686143	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15222	NC_022121	A	7	7	686222	686228	100 %	0 %	0 %	0 %	532431746
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15232	NC_022121	CTT	2	6	686469	686474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431746
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15234	NC_022121	TTTG	2	8	686636	686643	0 %	75 %	25 %	0 %	532431746
15235	NC_022121	AG	3	6	686780	686785	50 %	0 %	50 %	0 %	532431746
15236	NC_022121	CT	3	6	686797	686802	0 %	50 %	0 %	50 %	532431747
15237	NC_022121	TCTGC	2	10	686837	686846	0 %	40 %	20 %	40 %	532431747
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15240	NC_022121	TAAT	2	8	687039	687046	50 %	50 %	0 %	0 %	532431748
15241	NC_022121	GCAA	2	8	687107	687114	50 %	0 %	25 %	25 %	532431748
15242	NC_022121	GCA	2	6	687165	687170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431748
15243	NC_022121	AATT	2	8	687209	687216	50 %	50 %	0 %	0 %	532431748
15244	NC_022121	GA	3	6	687262	687267	50 %	0 %	50 %	0 %	532431748
15245	NC_022121	AGA	2	6	687306	687311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431748
15246	NC_022121	TGCC	2	8	687410	687417	0 %	25 %	25 %	50 %	532431748
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15371	NC_022121	ATG	2	6	692833	692838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431753
15372	NC_022121	GAT	2	6	692840	692845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431753
15373	NC_022121	A	7	7	692862	692868	100 %	0 %	0 %	0 %	532431753
15374	NC_022121	CTC	2	6	692918	692923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431753
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15384	NC_022121	GATA	2	8	693512	693519	50 %	25 %	25 %	0 %	532431754
15385	NC_022121	TTG	2	6	693530	693535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431754
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15388	NC_022121	CCGCT	2	10	693548	693557	0 %	20 %	20 %	60 %	532431754
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15463	NC_022121	A	7	7	696583	696589	100 %	0 %	0 %	0 %	532431757
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15488	NC_022121	A	6	6	697676	697681	100 %	0 %	0 %	0 %	532431757
15489	NC_022121	T	6	6	697758	697763	0 %	100 %	0 %	0 %	532431757
15490	NC_022121	A	6	6	697805	697810	100 %	0 %	0 %	0 %	532431757
15491	NC_022121	T	7	7	697912	697918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15492	NC_022121	CTA	2	6	697948	697953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15493	NC_022121	ACT	2	6	697965	697970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15494	NC_022121	C	6	6	697998	698003	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15495	NC_022121	TTTAT	2	10	698007	698016	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15496	NC_022121	TTTC	2	8	698027	698034	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15497	NC_022121	ACA	2	6	698184	698189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15498	NC_022121	TCATG	2	10	698202	698211	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
15499	NC_022121	CAG	2	6	698222	698227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15500	NC_022121	GA	3	6	698292	698297	50 %	0 %	50 %	0 %	532431758

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