MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/31-98

Total Repeats: 23001

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12502	NC_022121	AGA	2	6	565145	565150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431632
12503	NC_022121	AAT	2	6	565162	565167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431632
12504	NC_022121	A	6	6	565212	565217	100 %	0 %	0 %	0 %	532431632
12505	NC_022121	CTT	2	6	565234	565239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431632
12506	NC_022121	ATC	2	6	565283	565288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431632
12507	NC_022121	TC	3	6	565302	565307	0 %	50 %	0 %	50 %	532431632
12508	NC_022121	T	6	6	565321	565326	0 %	100 %	0 %	0 %	532431632
12509	NC_022121	CCCA	2	8	565335	565342	25 %	0 %	0 %	75 %	532431632
12510	NC_022121	CTTG	2	8	565428	565435	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12511	NC_022121	AGA	2	6	565438	565443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12512	NC_022121	GAAAA	2	10	565490	565499	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
12513	NC_022121	CT	3	6	565505	565510	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12514	NC_022121	GAT	2	6	565551	565556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431633
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12521	NC_022121	GAT	2	6	565883	565888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431633
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12539	NC_022121	A	6	6	566851	566856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12540	NC_022121	A	6	6	566864	566869	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12541	NC_022121	ATT	2	6	566873	566878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12542	NC_022121	A	6	6	566879	566884	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12544	NC_022121	ATT	2	6	566905	566910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12545	NC_022121	AAT	2	6	566916	566921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12546	NC_022121	ATTTT	2	10	566928	566937	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12547	NC_022121	AAAAAT	2	12	566948	566959	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12609	NC_022121	A	7	7	570621	570627	100 %	0 %	0 %	0 %	532431637
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12616	NC_022121	AAGCA	2	10	570823	570832	60 %	0 %	20 %	20 %	532431637
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12621	NC_022121	TGC	2	6	571064	571069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431637
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12623	NC_022121	GTC	2	6	571130	571135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431637
12624	NC_022121	TCT	2	6	571202	571207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431637
12625	NC_022121	AACT	2	8	571249	571256	50 %	25 %	0 %	25 %	532431637
12626	NC_022121	GAA	2	6	571334	571339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431637
12627	NC_022121	GCT	2	6	571453	571458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431637
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12629	NC_022121	T	6	6	571522	571527	0 %	100 %	0 %	0 %	532431637
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12634	NC_022121	T	6	6	571873	571878	0 %	100 %	0 %	0 %	532431637
12635	NC_022121	TTG	2	6	571922	571927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431638
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12644	NC_022121	AAC	2	6	572201	572206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431638
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12663	NC_022121	CAA	2	6	572933	572938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12665	NC_022121	ATACT	2	10	573000	573009	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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12734	NC_022121	CAA	2	6	575501	575506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12735	NC_022121	A	6	6	575505	575510	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12736	NC_022121	CAAA	3	12	575515	575526	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12737	NC_022121	AG	3	6	575559	575564	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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12739	NC_022121	T	10	10	575693	575702	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12740	NC_022121	A	6	6	575735	575740	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12741	NC_022121	TCCCC	2	10	575793	575802	0 %	20 %	0 %	80 %	532431641
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12743	NC_022121	GA	3	6	575844	575849	50 %	0 %	50 %	0 %	532431641
12744	NC_022121	ACCA	2	8	575859	575866	50 %	0 %	0 %	50 %	532431641
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12746	NC_022121	A	7	7	575900	575906	100 %	0 %	0 %	0 %	532431641
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12748	NC_022121	TC	3	6	575926	575931	0 %	50 %	0 %	50 %	532431642
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12757	NC_022121	GAA	2	6	576210	576215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431642
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12850	NC_022121	A	10	10	580120	580129	100 %	0 %	0 %	0 %	532431644
12851	NC_022121	C	6	6	580132	580137	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12852	NC_022121	G	6	6	580153	580158	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12853	NC_022121	TCGAA	2	10	580299	580308	40 %	20 %	20 %	20 %	532431645
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12868	NC_022121	CTT	2	6	580895	580900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431646
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12993	NC_022121	CAG	2	6	586608	586613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431653
12994	NC_022121	CAG	2	6	586635	586640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431653
12995	NC_022121	TAT	2	6	586662	586667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431653
12996	NC_022121	T	6	6	586706	586711	0 %	100 %	0 %	0 %	532431653
12997	NC_022121	T	8	8	586732	586739	0 %	100 %	0 %	0 %	532431653
12998	NC_022121	CT	3	6	586763	586768	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12999	NC_022121	ATT	3	9	586776	586784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431654
13000	NC_022121	TCT	2	6	586785	586790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431654

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