MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/31-98

Total Repeats: 23001

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_022121	GGA	2	6	519923	519928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431596
11502	NC_022121	AATG	2	8	519976	519983	50 %	25 %	25 %	0 %	532431596
11503	NC_022121	GTT	2	6	520040	520045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431596
11504	NC_022121	TCT	2	6	520074	520079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431596
11505	NC_022121	CAT	2	6	520086	520091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431596
11506	NC_022121	TCT	2	6	520133	520138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431596
11507	NC_022121	AAT	2	6	520153	520158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431596
11508	NC_022121	TCA	2	6	520191	520196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431596
11509	NC_022121	TTGC	2	8	520206	520213	0 %	50 %	25 %	25 %	532431596
11510	NC_022121	AATC	2	8	520215	520222	50 %	25 %	0 %	25 %	532431596
11511	NC_022121	AGCAC	2	10	520256	520265	40 %	0 %	20 %	40 %	532431596
11512	NC_022121	TAA	2	6	520273	520278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431596
11513	NC_022121	AAT	2	6	520367	520372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431596
11514	NC_022121	AGT	2	6	520459	520464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431596
11515	NC_022121	GAA	2	6	520491	520496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431596
11516	NC_022121	GAT	2	6	520506	520511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431596
11517	NC_022121	TTCTG	2	10	520523	520532	0 %	60 %	20 %	20 %	532431596
11518	NC_022121	AT	3	6	520582	520587	50 %	50 %	0 %	0 %	532431596
11519	NC_022121	TTG	2	6	520648	520653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431596
11520	NC_022121	CA	4	8	520698	520705	50 %	0 %	0 %	50 %	532431596
11521	NC_022121	ATCC	2	8	520741	520748	25 %	25 %	0 %	50 %	532431596
11522	NC_022121	ACT	2	6	520802	520807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431596
11523	NC_022121	AAG	2	6	520841	520846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431596
11524	NC_022121	TCA	2	6	520872	520877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431596
11525	NC_022121	TC	4	8	520890	520897	0 %	50 %	0 %	50 %	532431596
11526	NC_022121	GAT	2	6	520969	520974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431596
11527	NC_022121	CAG	2	6	521017	521022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431596
11528	NC_022121	TAG	2	6	521040	521045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431596
11529	NC_022121	ATA	2	6	521189	521194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431596
11530	NC_022121	CAG	2	6	521263	521268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431596
11531	NC_022121	GTA	2	6	521302	521307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431596
11532	NC_022121	CAACA	2	10	521341	521350	60 %	0 %	0 %	40 %	532431596
11533	NC_022121	GA	3	6	521351	521356	50 %	0 %	50 %	0 %	532431596
11534	NC_022121	CTT	2	6	521400	521405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431596
11535	NC_022121	CTCC	2	8	521579	521586	0 %	25 %	0 %	75 %	532431596
11536	NC_022121	T	6	6	521600	521605	0 %	100 %	0 %	0 %	532431596
11537	NC_022121	CTT	2	6	521619	521624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431596
11538	NC_022121	TTG	2	6	521653	521658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431596
11539	NC_022121	CT	3	6	521815	521820	0 %	50 %	0 %	50 %	532431596
11540	NC_022121	AAG	2	6	521862	521867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431596
11541	NC_022121	GAG	2	6	522000	522005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431596
11542	NC_022121	CTT	2	6	522077	522082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431596
11543	NC_022121	AGA	2	6	522142	522147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431596
11544	NC_022121	CTG	2	6	522153	522158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431596
11545	NC_022121	TCA	2	6	522245	522250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431596
11546	NC_022121	TAA	2	6	522280	522285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431596
11547	NC_022121	CCT	2	6	522326	522331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431596
11548	NC_022121	TCT	2	6	522513	522518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431596
11549	NC_022121	TAC	2	6	522529	522534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431596
11550	NC_022121	TGT	2	6	522719	522724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431596
11551	NC_022121	AGC	2	6	522730	522735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431596
11552	NC_022121	TTC	2	6	522736	522741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431596
11553	NC_022121	GCC	2	6	523013	523018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532431596
11554	NC_022121	AACT	2	8	523138	523145	50 %	25 %	0 %	25 %	532431596
11555	NC_022121	AGC	2	6	523156	523161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431596
11556	NC_022121	AAC	2	6	523184	523189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431596
11557	NC_022121	GA	3	6	523227	523232	50 %	0 %	50 %	0 %	532431596
11558	NC_022121	CAA	2	6	523245	523250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431596
11559	NC_022121	AAG	2	6	523311	523316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431596
11560	NC_022121	CTC	2	6	523327	523332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431596
11561	NC_022121	CTTC	2	8	523338	523345	0 %	50 %	0 %	50 %	532431596
11562	NC_022121	TGT	2	6	523355	523360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431596
11563	NC_022121	ATAA	2	8	523559	523566	75 %	25 %	0 %	0 %	532431596
11564	NC_022121	TTG	2	6	523569	523574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431596
11565	NC_022121	AAAG	2	8	523628	523635	75 %	0 %	25 %	0 %	532431596
11566	NC_022121	AAG	2	6	523650	523655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431596
11567	NC_022121	AAC	2	6	523678	523683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431596
11568	NC_022121	TC	3	6	523686	523691	0 %	50 %	0 %	50 %	532431596
11569	NC_022121	ACA	2	6	523712	523717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431596
11570	NC_022121	AATA	2	8	523771	523778	75 %	25 %	0 %	0 %	532431596
11571	NC_022121	TCT	2	6	523787	523792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431596
11572	NC_022121	TGC	2	6	523835	523840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431596
11573	NC_022121	CAAAGC	2	12	524017	524028	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	532431596
11574	NC_022121	AAT	3	9	524038	524046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431596
11575	NC_022121	AGC	2	6	524135	524140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11576	NC_022121	GAAG	2	8	524143	524150	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11577	NC_022121	AT	3	6	524169	524174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11578	NC_022121	AAAG	2	8	524182	524189	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11579	NC_022121	T	6	6	524230	524235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11580	NC_022121	TTGGA	2	10	524253	524262	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
11581	NC_022121	T	6	6	524276	524281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11582	NC_022121	ACA	2	6	524284	524289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11583	NC_022121	AACC	2	8	524317	524324	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11584	NC_022121	A	7	7	524388	524394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11585	NC_022121	T	6	6	524410	524415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11586	NC_022121	A	7	7	524461	524467	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11587	NC_022121	AGA	2	6	524514	524519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431597
11588	NC_022121	AAAG	2	8	524527	524534	75 %	0 %	25 %	0 %	532431597
11589	NC_022121	CAA	2	6	524583	524588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431597
11590	NC_022121	GAACT	2	10	524740	524749	40 %	20 %	20 %	20 %	532431597
11591	NC_022121	TTG	2	6	524771	524776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431597
11592	NC_022121	ACTC	2	8	524808	524815	25 %	25 %	0 %	50 %	532431597
11593	NC_022121	TCA	2	6	524843	524848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11594	NC_022121	A	7	7	524853	524859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11595	NC_022121	CTAA	2	8	524874	524881	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11596	NC_022121	AAT	2	6	524898	524903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532432055
11597	NC_022121	ACTT	2	8	524908	524915	25 %	50 %	0 %	25 %	532432055
11598	NC_022121	GCT	2	6	524999	525004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532432055
11599	NC_022121	CAAAA	2	10	525018	525027	80 %	0 %	0 %	20 %	532432055
11600	NC_022121	AGA	2	6	525076	525081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532432055
11601	NC_022121	ATA	2	6	525110	525115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11602	NC_022121	CTA	2	6	525184	525189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11603	NC_022121	CTTTAG	2	12	525294	525305	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	532431598
11604	NC_022121	TCCC	2	8	525347	525354	0 %	25 %	0 %	75 %	532431598
11605	NC_022121	CAT	3	9	525367	525375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431598
11606	NC_022121	TCG	2	6	525385	525390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431598
11607	NC_022121	TTG	2	6	525471	525476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431598
11608	NC_022121	ATT	2	6	525565	525570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431598
11609	NC_022121	GCA	2	6	525594	525599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431598
11610	NC_022121	CT	3	6	525602	525607	0 %	50 %	0 %	50 %	532431598
11611	NC_022121	ACA	2	6	525678	525683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431598
11612	NC_022121	CCT	2	6	525693	525698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431598
11613	NC_022121	ATTA	2	8	525740	525747	50 %	50 %	0 %	0 %	532431598
11614	NC_022121	A	7	7	525806	525812	100 %	0 %	0 %	0 %	532431598
11615	NC_022121	CAA	2	6	526022	526027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431598
11616	NC_022121	TAAA	2	8	526045	526052	75 %	25 %	0 %	0 %	532431598
11617	NC_022121	GTC	2	6	526111	526116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431599
11618	NC_022121	TTC	2	6	526124	526129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431599
11619	NC_022121	TTC	2	6	526145	526150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431599
11620	NC_022121	CTT	2	6	526192	526197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431599
11621	NC_022121	TCC	2	6	526198	526203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431599
11622	NC_022121	TTTC	2	8	526262	526269	0 %	75 %	0 %	25 %	532431599
11623	NC_022121	TTCT	2	8	526372	526379	0 %	75 %	0 %	25 %	532431599
11624	NC_022121	CTT	2	6	526380	526385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431599
11625	NC_022121	GTT	2	6	526455	526460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431599
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11662	NC_022121	CAA	2	6	528239	528244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431601
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11695	NC_022121	GC	3	6	530172	530177	0 %	0 %	50 %	50 %	532431603
11696	NC_022121	ATGA	2	8	530222	530229	50 %	25 %	25 %	0 %	532431603
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11730	NC_022121	ATA	2	6	531496	531501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11731	NC_022121	AAC	2	6	531504	531509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11732	NC_022121	TGT	2	6	531534	531539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11733	NC_022121	TTTA	2	8	531541	531548	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11734	NC_022121	CAT	2	6	531605	531610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532432056
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11740	NC_022121	GTA	2	6	531748	531753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532432056
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11744	NC_022121	CA	3	6	531810	531815	50 %	0 %	0 %	50 %	532432056
11745	NC_022121	AGCCAC	2	12	531816	531827	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	532432056
11746	NC_022121	TCA	2	6	531907	531912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532432056
11747	NC_022121	CAA	2	6	531969	531974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532432056
11748	NC_022121	GTAG	2	8	531985	531992	25 %	25 %	50 %	0 %	532432056
11749	NC_022121	AAC	2	6	531994	531999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532432056
11750	NC_022121	TGC	3	9	532026	532034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532432056
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11755	NC_022121	CTC	2	6	532155	532160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532432056
11756	NC_022121	TGC	3	9	532179	532187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532432056
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11760	NC_022121	AGC	4	12	532278	532289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532432056
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11765	NC_022121	GCA	5	15	532429	532443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532432056
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11768	NC_022121	CTTC	2	8	532534	532541	0 %	50 %	0 %	50 %	532432056
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11772	NC_022121	AAT	2	6	532882	532887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532432056
11773	NC_022121	GGA	2	6	532987	532992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532432056
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11775	NC_022121	TAG	2	6	533049	533054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532432056
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11791	NC_022121	GAT	2	6	533701	533706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532432056
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11803	NC_022121	ACC	2	6	534088	534093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532432056
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11808	NC_022121	GGA	2	6	534148	534153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532432056
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11822	NC_022121	TCG	2	6	534851	534856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431604
11823	NC_022121	TCCTC	2	10	534866	534875	0 %	40 %	0 %	60 %	532431604
11824	NC_022121	TA	3	6	534957	534962	50 %	50 %	0 %	0 %	532431604
11825	NC_022121	CAA	2	6	535056	535061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431604
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11827	NC_022121	CTT	2	6	535101	535106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431604
11828	NC_022121	TTC	2	6	535112	535117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431604
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11830	NC_022121	CTTT	2	8	535134	535141	0 %	75 %	0 %	25 %	532431604
11831	NC_022121	C	7	7	535231	535237	0 %	0 %	0 %	100 %	532431604
11832	NC_022121	A	6	6	535275	535280	100 %	0 %	0 %	0 %	532431604
11833	NC_022121	CTA	2	6	535372	535377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11834	NC_022121	ATT	2	6	535396	535401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11835	NC_022121	AC	3	6	535420	535425	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11836	NC_022121	A	6	6	535449	535454	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11837	NC_022121	T	6	6	535463	535468	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11838	NC_022121	CT	3	6	535543	535548	0 %	50 %	0 %	50 %	532431605
11839	NC_022121	TCT	2	6	535594	535599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431605
11840	NC_022121	CAAATC	2	12	535615	535626	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	532431605
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11842	NC_022121	TTG	2	6	535743	535748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431605
11843	NC_022121	ACA	2	6	535774	535779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431605
11844	NC_022121	ATG	2	6	535784	535789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431605
11845	NC_022121	CCG	2	6	535852	535857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532431605
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11847	NC_022121	GAA	2	6	535942	535947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431605
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11849	NC_022121	CATC	2	8	536094	536101	25 %	25 %	0 %	50 %	532431606
11850	NC_022121	T	6	6	536203	536208	0 %	100 %	0 %	0 %	532431606
11851	NC_022121	T	6	6	536210	536215	0 %	100 %	0 %	0 %	532431606
11852	NC_022121	CTAT	2	8	536216	536223	25 %	50 %	0 %	25 %	532431606
11853	NC_022121	AAC	2	6	536249	536254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431606
11854	NC_022121	GC	3	6	536270	536275	0 %	0 %	50 %	50 %	532431606
11855	NC_022121	TGACA	2	10	536324	536333	40 %	20 %	20 %	20 %	532431606
11856	NC_022121	GT	3	6	536353	536358	0 %	50 %	50 %	0 %	532431606
11857	NC_022121	TGT	2	6	536390	536395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431606
11858	NC_022121	CTCCAG	2	12	536397	536408	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	532431606
11859	NC_022121	ATC	2	6	536464	536469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431606
11860	NC_022121	CT	3	6	536561	536566	0 %	50 %	0 %	50 %	532431606
11861	NC_022121	CGA	2	6	536595	536600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431606
11862	NC_022121	ATCG	2	8	536643	536650	25 %	25 %	25 %	25 %	532431606
11863	NC_022121	TCC	2	6	536661	536666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431606
11864	NC_022121	ACT	2	6	536674	536679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431606
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11979	NC_022121	A	6	6	541676	541681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11980	NC_022121	TCT	3	9	541689	541697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11981	NC_022121	TAA	2	6	541830	541835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11984	NC_022121	A	7	7	542007	542013	100 %	0 %	0 %	0 %	532431612
11985	NC_022121	A	6	6	542052	542057	100 %	0 %	0 %	0 %	532431612
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11989	NC_022121	GA	3	6	542333	542338	50 %	0 %	50 %	0 %	532431613
11990	NC_022121	T	6	6	542418	542423	0 %	100 %	0 %	0 %	532431613
11991	NC_022121	T	7	7	542433	542439	0 %	100 %	0 %	0 %	532431613
11992	NC_022121	AAG	2	6	542453	542458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431613
11993	NC_022121	AAG	2	6	542468	542473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431613
11994	NC_022121	CCT	2	6	542476	542481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431613
11995	NC_022121	TC	3	6	542552	542557	0 %	50 %	0 %	50 %	532431613
11996	NC_022121	CTTCCT	2	12	542562	542573	0 %	50 %	0 %	50 %	532431613
11997	NC_022121	GCA	2	6	542630	542635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431613
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11999	NC_022121	CT	3	6	542731	542736	0 %	50 %	0 %	50 %	532431613
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