MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/31-98

Total Repeats: 23001

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9501	NC_022121	TCC	2	6	430775	430780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431525
9502	NC_022121	CT	3	6	430822	430827	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9503	NC_022121	AACT	2	8	430869	430876	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9504	NC_022121	GAT	2	6	430901	430906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9505	NC_022121	A	8	8	430949	430956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9506	NC_022121	A	6	6	431018	431023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9507	NC_022121	TTG	2	6	431070	431075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9508	NC_022121	AGC	2	6	431085	431090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9509	NC_022121	A	6	6	431110	431115	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9510	NC_022121	A	7	7	431154	431160	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9511	NC_022121	AG	3	6	431169	431174	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9512	NC_022121	TAAAA	2	10	431201	431210	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9513	NC_022121	CAAA	2	8	431217	431224	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9514	NC_022121	A	7	7	431222	431228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9515	NC_022121	ATG	2	6	431329	431334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431526
9516	NC_022121	CTT	2	6	431375	431380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431526
9517	NC_022121	GAG	2	6	431462	431467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431526
9518	NC_022121	GAA	2	6	431491	431496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431526
9519	NC_022121	AGCTAA	2	12	431547	431558	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532431526
9520	NC_022121	CAA	2	6	431567	431572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431526
9521	NC_022121	GAT	2	6	431593	431598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431526
9522	NC_022121	ATA	2	6	431609	431614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431526
9523	NC_022121	TGA	2	6	431680	431685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431526
9524	NC_022121	A	6	6	431695	431700	100 %	0 %	0 %	0 %	532431526
9525	NC_022121	AAT	2	6	431733	431738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431526
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9527	NC_022121	TC	3	6	431770	431775	0 %	50 %	0 %	50 %	532431526
9528	NC_022121	ATTCC	2	10	431795	431804	20 %	40 %	0 %	40 %	532431526
9529	NC_022121	TGT	2	6	431809	431814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431526
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9532	NC_022121	TC	4	8	431927	431934	0 %	50 %	0 %	50 %	532431526
9533	NC_022121	AGC	2	6	431964	431969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431526
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9539	NC_022121	ATCT	2	8	432261	432268	25 %	50 %	0 %	25 %	532431526
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9541	NC_022121	A	6	6	432312	432317	100 %	0 %	0 %	0 %	532431526
9542	NC_022121	TA	3	6	432429	432434	50 %	50 %	0 %	0 %	532431526
9543	NC_022121	TCC	2	6	432460	432465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431526
9544	NC_022121	GCA	2	6	432484	432489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431526
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9547	NC_022121	TTG	2	6	432594	432599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431526
9548	NC_022121	CT	3	6	432628	432633	0 %	50 %	0 %	50 %	532431526
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9552	NC_022121	A	6	6	432817	432822	100 %	0 %	0 %	0 %	532431526
9553	NC_022121	CAT	2	6	432831	432836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431526
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9555	NC_022121	CTT	2	6	432871	432876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9556	NC_022121	ATA	2	6	433027	433032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431527
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9558	NC_022121	CTC	2	6	433117	433122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431527
9559	NC_022121	TCC	2	6	433133	433138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431527
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9563	NC_022121	CTG	2	6	433545	433550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431527
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9596	NC_022121	GGA	2	6	434980	434985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9597	NC_022121	GAC	2	6	434991	434996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9616	NC_022121	A	6	6	435870	435875	100 %	0 %	0 %	0 %	532431528
9617	NC_022121	T	8	8	435886	435893	0 %	100 %	0 %	0 %	532431528
9618	NC_022121	ACTC	2	8	435908	435915	25 %	25 %	0 %	50 %	532431528
9619	NC_022121	A	8	8	435961	435968	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10000	NC_022121	TCA	2	6	453112	453117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431543

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