MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/31-98

Total Repeats: 23001

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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9002	NC_022121	TTC	3	9	409096	409104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431507
9003	NC_022121	T	6	6	409114	409119	0 %	100 %	0 %	0 %	532431507
9004	NC_022121	CT	3	6	409183	409188	0 %	50 %	0 %	50 %	532431507
9005	NC_022121	AAAG	2	8	409285	409292	75 %	0 %	25 %	0 %	532431507
9006	NC_022121	TTC	2	6	409408	409413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431507
9007	NC_022121	ACAA	2	8	409429	409436	75 %	0 %	0 %	25 %	532431507
9008	NC_022121	CAC	2	6	409499	409504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532431507
9009	NC_022121	AGTG	2	8	409509	409516	25 %	25 %	50 %	0 %	532431507
9010	NC_022121	A	7	7	409529	409535	100 %	0 %	0 %	0 %	532431507
9011	NC_022121	AGA	2	6	409613	409618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431507
9012	NC_022121	TAA	2	6	409638	409643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431507
9013	NC_022121	GTC	2	6	409667	409672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431507
9014	NC_022121	A	6	6	409678	409683	100 %	0 %	0 %	0 %	532431507
9015	NC_022121	A	8	8	409685	409692	100 %	0 %	0 %	0 %	532431507
9016	NC_022121	TTTTAA	2	12	409705	409716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431507
9017	NC_022121	TAA	2	6	409760	409765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9018	NC_022121	A	6	6	409764	409769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9019	NC_022121	AAC	2	6	409778	409783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9020	NC_022121	TAA	2	6	409810	409815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9021	NC_022121	TAA	2	6	409845	409850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9022	NC_022121	TATCT	2	10	409988	409997	20 %	60 %	0 %	20 %	532432046
9023	NC_022121	TTA	2	6	410012	410017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532432046
9024	NC_022121	T	6	6	410034	410039	0 %	100 %	0 %	0 %	532432046
9025	NC_022121	GGA	2	6	410058	410063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532432046
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9028	NC_022121	T	6	6	410106	410111	0 %	100 %	0 %	0 %	532432046
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9034	NC_022121	CTTG	2	8	410295	410302	0 %	50 %	25 %	25 %	532432047
9035	NC_022121	TAG	2	6	410330	410335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532432047
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9040	NC_022121	TCA	2	6	410525	410530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431508
9041	NC_022121	TCT	2	6	410534	410539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431508
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9043	NC_022121	TAT	2	6	410662	410667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431508
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9049	NC_022121	TC	3	6	410949	410954	0 %	50 %	0 %	50 %	532431508
9050	NC_022121	TA	3	6	410969	410974	50 %	50 %	0 %	0 %	532431508
9051	NC_022121	ATC	2	6	410976	410981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431508
9052	NC_022121	CT	3	6	411069	411074	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9053	NC_022121	ATAA	2	8	411095	411102	75 %	25 %	0 %	0 %	532431509
9054	NC_022121	AG	3	6	411200	411205	50 %	0 %	50 %	0 %	532431509
9055	NC_022121	ATC	2	6	411287	411292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431509
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9058	NC_022121	GAA	2	6	411439	411444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431509
9059	NC_022121	ACT	2	6	411467	411472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431509
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9063	NC_022121	ATGC	2	8	411899	411906	25 %	25 %	25 %	25 %	532432048
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9065	NC_022121	AT	3	6	411958	411963	50 %	50 %	0 %	0 %	532432048
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9070	NC_022121	A	6	6	412072	412077	100 %	0 %	0 %	0 %	532431510
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9073	NC_022121	CT	3	6	412168	412173	0 %	50 %	0 %	50 %	532431510
9074	NC_022121	A	6	6	412252	412257	100 %	0 %	0 %	0 %	532431510
9075	NC_022121	T	8	8	412283	412290	0 %	100 %	0 %	0 %	532431510
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9082	NC_022121	TTA	2	6	412598	412603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9083	NC_022121	TAA	2	6	412620	412625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9084	NC_022121	AGA	2	6	412648	412653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9085	NC_022121	TTA	2	6	412687	412692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9086	NC_022121	TGA	2	6	412698	412703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9093	NC_022121	AAAC	2	8	413395	413402	75 %	0 %	0 %	25 %	532431511
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9096	NC_022121	CGAA	2	8	413492	413499	50 %	0 %	25 %	25 %	532431511
9097	NC_022121	CT	3	6	413505	413510	0 %	50 %	0 %	50 %	532431511
9098	NC_022121	AGC	2	6	413513	413518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431511
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9101	NC_022121	AATTA	2	10	413645	413654	60 %	40 %	0 %	0 %	532431512
9102	NC_022121	AGCT	2	8	413732	413739	25 %	25 %	25 %	25 %	532431512
9103	NC_022121	CTT	2	6	414043	414048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431512
9104	NC_022121	CT	3	6	414251	414256	0 %	50 %	0 %	50 %	532431512
9105	NC_022121	AG	3	6	414279	414284	50 %	0 %	50 %	0 %	532431512
9106	NC_022121	C	6	6	414299	414304	0 %	0 %	0 %	100 %	532431512
9107	NC_022121	TCT	2	6	414372	414377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431512
9108	NC_022121	CCGC	2	8	414427	414434	0 %	0 %	25 %	75 %	532431512
9109	NC_022121	CAG	2	6	414501	414506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431512
9110	NC_022121	AGAA	2	8	414569	414576	75 %	0 %	25 %	0 %	532431512
9111	NC_022121	CT	3	6	414694	414699	0 %	50 %	0 %	50 %	532431512
9112	NC_022121	AAC	3	9	414758	414766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431512
9113	NC_022121	TCTT	2	8	414776	414783	0 %	75 %	0 %	25 %	532431512
9114	NC_022121	TCG	2	6	414803	414808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431512
9115	NC_022121	AC	3	6	414848	414853	50 %	0 %	0 %	50 %	532431512
9116	NC_022121	CT	3	6	414889	414894	0 %	50 %	0 %	50 %	532431513
9117	NC_022121	TGA	2	6	414895	414900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431513
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9121	NC_022121	ATC	2	6	415044	415049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431513
9122	NC_022121	AAG	2	6	415127	415132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431513
9123	NC_022121	TCT	2	6	415138	415143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431513
9124	NC_022121	TC	3	6	415271	415276	0 %	50 %	0 %	50 %	532431513
9125	NC_022121	TCT	2	6	415283	415288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431513
9126	NC_022121	ACATGC	2	12	415384	415395	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	532431513
9127	NC_022121	ACA	2	6	415406	415411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431513
9128	NC_022121	ACA	2	6	415446	415451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431513
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9130	NC_022121	A	6	6	415477	415482	100 %	0 %	0 %	0 %	532431513
9131	NC_022121	TTC	2	6	415488	415493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431513
9132	NC_022121	AGT	2	6	415602	415607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431513
9133	NC_022121	CTG	2	6	415610	415615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431513
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9135	NC_022121	ACA	2	6	415645	415650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431513
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9139	NC_022121	AAAC	2	8	415908	415915	75 %	0 %	0 %	25 %	532431514
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9163	NC_022121	AGCAA	2	10	416745	416754	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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9165	NC_022121	AGAA	2	8	416790	416797	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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9210	NC_022121	A	7	7	418616	418622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9232	NC_022121	CTTCT	2	10	419535	419544	0 %	60 %	0 %	40 %	532431516
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9239	NC_022121	A	6	6	419770	419775	100 %	0 %	0 %	0 %	532431516
9240	NC_022121	GGT	2	6	419778	419783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532431516
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9244	NC_022121	ATAA	2	8	419940	419947	75 %	25 %	0 %	0 %	532431516
9245	NC_022121	CTTC	2	8	420028	420035	0 %	50 %	0 %	50 %	532431516
9246	NC_022121	T	7	7	420087	420093	0 %	100 %	0 %	0 %	532432049
9247	NC_022121	CTT	2	6	420106	420111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532432049
9248	NC_022121	GAA	2	6	420163	420168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532432049
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9251	NC_022121	TAT	2	6	420249	420254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532432049
9252	NC_022121	CT	3	6	420293	420298	0 %	50 %	0 %	50 %	532432049
9253	NC_022121	ACA	2	6	420342	420347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532432049
9254	NC_022121	CAT	2	6	420380	420385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532432049
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9256	NC_022121	TGA	2	6	420476	420481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532432049
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9259	NC_022121	AG	3	6	420522	420527	50 %	0 %	50 %	0 %	532432049
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9264	NC_022121	TTC	2	6	420651	420656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431517
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9271	NC_022121	GGA	3	9	420890	420898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431517
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9277	NC_022121	TCCT	2	8	421083	421090	0 %	50 %	0 %	50 %	532431517
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9320	NC_022121	GATA	2	8	422905	422912	50 %	25 %	25 %	0 %	532431519
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9361	NC_022121	CAAAA	2	10	424528	424537	80 %	0 %	0 %	20 %	532431520
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9365	NC_022121	A	7	7	424811	424817	100 %	0 %	0 %	0 %	532431520
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9371	NC_022121	T	6	6	425010	425015	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9372	NC_022121	GTT	2	6	425047	425052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431521
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9500	NC_022121	CAT	2	6	430633	430638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431525

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