MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/31-98

Total Repeats: 23001

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_022121	CAA	2	6	340160	340165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431453
7502	NC_022121	TGG	2	6	340258	340263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532431453
7503	NC_022121	ACT	2	6	340294	340299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431453
7504	NC_022121	TGT	2	6	340413	340418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7505	NC_022121	CAAG	2	8	340510	340517	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7506	NC_022121	TCCA	2	8	340562	340569	25 %	25 %	0 %	50 %	532431454
7507	NC_022121	TA	3	6	340671	340676	50 %	50 %	0 %	0 %	532431454
7508	NC_022121	CAT	2	6	340701	340706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431454
7509	NC_022121	GAA	2	6	340752	340757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431454
7510	NC_022121	GA	3	6	340765	340770	50 %	0 %	50 %	0 %	532431454
7511	NC_022121	GCT	2	6	340809	340814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431454
7512	NC_022121	TCC	2	6	340921	340926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431454
7513	NC_022121	CAGAG	2	10	340933	340942	40 %	0 %	40 %	20 %	532431454
7514	NC_022121	CGC	2	6	340945	340950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532431454
7515	NC_022121	CAC	2	6	340955	340960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532431454
7516	NC_022121	CAA	2	6	341008	341013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431454
7517	NC_022121	AT	3	6	341039	341044	50 %	50 %	0 %	0 %	532431454
7518	NC_022121	CA	3	6	341078	341083	50 %	0 %	0 %	50 %	532432042
7519	NC_022121	ACTG	2	8	341150	341157	25 %	25 %	25 %	25 %	532432042
7520	NC_022121	CAT	2	6	341182	341187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532432042
7521	NC_022121	CAG	2	6	341189	341194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532432042
7522	NC_022121	TGA	2	6	341225	341230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532432042
7523	NC_022121	CAGA	2	8	341239	341246	50 %	0 %	25 %	25 %	532432042
7524	NC_022121	AAT	2	6	341249	341254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532432042
7525	NC_022121	ACT	2	6	341367	341372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532432042
7526	NC_022121	AT	3	6	341385	341390	50 %	50 %	0 %	0 %	532432042
7527	NC_022121	T	7	7	341414	341420	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7528	NC_022121	A	7	7	341422	341428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7529	NC_022121	T	6	6	341479	341484	0 %	100 %	0 %	0 %	532431455
7530	NC_022121	CCA	3	9	341504	341512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532431455
7531	NC_022121	ATA	2	6	341609	341614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431455
7532	NC_022121	ATA	2	6	341824	341829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431455
7533	NC_022121	CCT	2	6	341840	341845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431455
7534	NC_022121	ATAG	2	8	341896	341903	50 %	25 %	25 %	0 %	532431455
7535	NC_022121	AT	3	6	341912	341917	50 %	50 %	0 %	0 %	532431455
7536	NC_022121	AGA	2	6	341947	341952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431455
7537	NC_022121	TAC	2	6	341995	342000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431455
7538	NC_022121	AAC	2	6	342052	342057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431455
7539	NC_022121	TA	3	6	342063	342068	50 %	50 %	0 %	0 %	532431455
7540	NC_022121	CTA	2	6	342080	342085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431455
7541	NC_022121	AGA	2	6	342098	342103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431455
7542	NC_022121	TCT	2	6	342120	342125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431455
7543	NC_022121	ATA	2	6	342184	342189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431455
7544	NC_022121	TTC	2	6	342197	342202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431455
7545	NC_022121	A	6	6	342265	342270	100 %	0 %	0 %	0 %	532431455
7546	NC_022121	TGT	2	6	342274	342279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431455
7547	NC_022121	CTC	2	6	342282	342287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431455
7548	NC_022121	AC	4	8	342292	342299	50 %	0 %	0 %	50 %	532431455
7549	NC_022121	A	7	7	342401	342407	100 %	0 %	0 %	0 %	532431455
7550	NC_022121	TAA	2	6	342429	342434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431455
7551	NC_022121	A	7	7	342443	342449	100 %	0 %	0 %	0 %	532431455
7552	NC_022121	A	6	6	342452	342457	100 %	0 %	0 %	0 %	532431455
7553	NC_022121	CTTCA	2	10	342631	342640	20 %	40 %	0 %	40 %	532431455
7554	NC_022121	ATC	2	6	342685	342690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431455
7555	NC_022121	TCT	2	6	342698	342703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431455
7556	NC_022121	CATTG	2	10	342735	342744	20 %	40 %	20 %	20 %	532431455
7557	NC_022121	CTT	2	6	342802	342807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431455
7558	NC_022121	CTC	3	9	342835	342843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431455
7559	NC_022121	TCT	2	6	342965	342970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431455
7560	NC_022121	TTC	2	6	343054	343059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431455
7561	NC_022121	TTG	2	6	343197	343202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431455
7562	NC_022121	CTG	2	6	343212	343217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431455
7563	NC_022121	TTAG	2	8	343229	343236	25 %	50 %	25 %	0 %	532431455
7564	NC_022121	TC	3	6	343326	343331	0 %	50 %	0 %	50 %	532431455
7565	NC_022121	AATA	2	8	343366	343373	75 %	25 %	0 %	0 %	532431455
7566	NC_022121	ACT	2	6	343403	343408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431456
7567	NC_022121	TGC	2	6	343414	343419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431456
7568	NC_022121	T	7	7	343424	343430	0 %	100 %	0 %	0 %	532431456
7569	NC_022121	T	6	6	343524	343529	0 %	100 %	0 %	0 %	532431456
7570	NC_022121	TTC	3	9	343566	343574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431456
7571	NC_022121	AGC	2	6	343579	343584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431456
7572	NC_022121	AAG	2	6	343644	343649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431456
7573	NC_022121	AG	3	6	343648	343653	50 %	0 %	50 %	0 %	532431456
7574	NC_022121	AAGT	2	8	343694	343701	50 %	25 %	25 %	0 %	532431456
7575	NC_022121	AG	3	6	343799	343804	50 %	0 %	50 %	0 %	532431456
7576	NC_022121	CTTT	2	8	343916	343923	0 %	75 %	0 %	25 %	532431456
7577	NC_022121	CTT	2	6	344059	344064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431457
7578	NC_022121	CTT	2	6	344110	344115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431457
7579	NC_022121	AAT	2	6	344157	344162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431457
7580	NC_022121	TAA	2	6	344174	344179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431457
7581	NC_022121	AG	3	6	344195	344200	50 %	0 %	50 %	0 %	532431457
7582	NC_022121	TCT	2	6	344293	344298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431457
7583	NC_022121	TAA	2	6	344380	344385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431457
7584	NC_022121	TG	3	6	344409	344414	0 %	50 %	50 %	0 %	532431457
7585	NC_022121	ATC	2	6	344417	344422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431457
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7587	NC_022121	ATGA	2	8	344708	344715	50 %	25 %	25 %	0 %	532431457
7588	NC_022121	GAA	2	6	344762	344767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431457
7589	NC_022121	CAA	2	6	344776	344781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431457
7590	NC_022121	ATCCC	2	10	344788	344797	20 %	20 %	0 %	60 %	532431457
7591	NC_022121	AAT	2	6	344801	344806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431457
7592	NC_022121	AGA	3	9	344867	344875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431457
7593	NC_022121	T	6	6	344887	344892	0 %	100 %	0 %	0 %	532431457
7594	NC_022121	ATCA	2	8	344918	344925	50 %	25 %	0 %	25 %	532431457
7595	NC_022121	GTTC	2	8	344933	344940	0 %	50 %	25 %	25 %	532431457
7596	NC_022121	ACC	2	6	345143	345148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532431457
7597	NC_022121	TA	3	6	345301	345306	50 %	50 %	0 %	0 %	532431457
7598	NC_022121	TACC	2	8	345316	345323	25 %	25 %	0 %	50 %	532431457
7599	NC_022121	TTC	2	6	345381	345386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431458
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7601	NC_022121	TGC	2	6	345565	345570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431458
7602	NC_022121	CTT	2	6	345632	345637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431458
7603	NC_022121	TCC	2	6	345676	345681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431458
7604	NC_022121	AAG	2	6	345682	345687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431458
7605	NC_022121	T	6	6	345726	345731	0 %	100 %	0 %	0 %	532431458
7606	NC_022121	TCT	2	6	345798	345803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431458
7607	NC_022121	CCT	2	6	345886	345891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431458
7608	NC_022121	TCT	2	6	346024	346029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431458
7609	NC_022121	TC	3	6	346043	346048	0 %	50 %	0 %	50 %	532431458
7610	NC_022121	AAAT	2	8	346138	346145	75 %	25 %	0 %	0 %	532431458
7611	NC_022121	AGA	2	6	346146	346151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431458
7612	NC_022121	AGC	2	6	346158	346163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431458
7613	NC_022121	ATA	2	6	346189	346194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431458
7614	NC_022121	CA	3	6	346292	346297	50 %	0 %	0 %	50 %	532431458
7615	NC_022121	CAG	2	6	346313	346318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431458
7616	NC_022121	TGC	2	6	346336	346341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431458
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7618	NC_022121	A	6	6	346471	346476	100 %	0 %	0 %	0 %	532431458
7619	NC_022121	GCTT	2	8	346477	346484	0 %	50 %	25 %	25 %	532431458
7620	NC_022121	CAA	2	6	346547	346552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431458
7621	NC_022121	AGA	2	6	346575	346580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431458
7622	NC_022121	CTT	2	6	346649	346654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431458
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7624	NC_022121	AAT	2	6	346947	346952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431458
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7866	NC_022121	ATTTA	2	10	357960	357969	40 %	60 %	0 %	0 %	532431465
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7994	NC_022121	AGC	2	6	363603	363608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431472
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7997	NC_022121	ATT	2	6	363981	363986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7998	NC_022121	TTTA	2	8	364016	364023	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7999	NC_022121	AAC	2	6	364036	364041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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