MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/13-96

Total Repeats: 22984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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22502	NC_022119	AGA	2	6	1021664	1021669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424774
22503	NC_022119	AGGA	2	8	1021735	1021742	50 %	0 %	50 %	0 %	532424774
22504	NC_022119	AG	3	6	1021758	1021763	50 %	0 %	50 %	0 %	532424774
22505	NC_022119	AGCT	2	8	1021774	1021781	25 %	25 %	25 %	25 %	532424774
22506	NC_022119	CT	3	6	1021780	1021785	0 %	50 %	0 %	50 %	532424774
22507	NC_022119	TGAA	2	8	1021843	1021850	50 %	25 %	25 %	0 %	532424774
22508	NC_022119	AAC	2	6	1021865	1021870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424774
22509	NC_022119	CTC	2	6	1022023	1022028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424774
22510	NC_022119	TGG	2	6	1022243	1022248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532424774
22511	NC_022119	AG	3	6	1022250	1022255	50 %	0 %	50 %	0 %	532424774
22512	NC_022119	TTC	2	6	1022275	1022280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424774
22513	NC_022119	GAA	2	6	1022373	1022378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424774
22514	NC_022119	GATG	2	8	1022413	1022420	25 %	25 %	50 %	0 %	532424774
22515	NC_022119	ATT	2	6	1022434	1022439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424774
22516	NC_022119	ATG	2	6	1022536	1022541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424774
22517	NC_022119	GTT	2	6	1022544	1022549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424774
22518	NC_022119	TAT	2	6	1022617	1022622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424774
22519	NC_022119	GAAA	2	8	1022647	1022654	75 %	0 %	25 %	0 %	532424774
22520	NC_022119	G	6	6	1022666	1022671	0 %	0 %	100 %	0 %	532424774
22521	NC_022119	GA	3	6	1022687	1022692	50 %	0 %	50 %	0 %	532424774
22522	NC_022119	ATT	2	6	1022723	1022728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424774
22523	NC_022119	ATC	2	6	1022740	1022745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424774
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22526	NC_022119	GCTTT	2	10	1022910	1022919	0 %	60 %	20 %	20 %	532424774
22527	NC_022119	CAT	2	6	1022925	1022930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424774
22528	NC_022119	TTAC	2	8	1022954	1022961	25 %	50 %	0 %	25 %	532424774
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22530	NC_022119	AG	5	10	1023080	1023089	50 %	0 %	50 %	0 %	532424774
22531	NC_022119	GAT	2	6	1023111	1023116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424774
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22533	NC_022119	CCT	2	6	1023156	1023161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424774
22534	NC_022119	T	6	6	1023175	1023180	0 %	100 %	0 %	0 %	532424774
22535	NC_022119	TC	3	6	1023292	1023297	0 %	50 %	0 %	50 %	532424775
22536	NC_022119	TTC	2	6	1023451	1023456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424775
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22538	NC_022119	GATA	2	8	1023486	1023493	50 %	25 %	25 %	0 %	532424775
22539	NC_022119	TGT	2	6	1023536	1023541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424775
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22541	NC_022119	CTT	2	6	1023675	1023680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424775
22542	NC_022119	CAG	2	6	1023687	1023692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424775
22543	NC_022119	GTC	2	6	1023741	1023746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424775
22544	NC_022119	GGA	2	6	1023770	1023775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424775
22545	NC_022119	CGTTGA	2	12	1023801	1023812	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	532424775
22546	NC_022119	TGTT	2	8	1023905	1023912	0 %	75 %	25 %	0 %	532424775
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22551	NC_022119	GGA	2	6	1024205	1024210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424775
22552	NC_022119	ATA	2	6	1024226	1024231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424775
22553	NC_022119	TTA	2	6	1024242	1024247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424775
22554	NC_022119	AAT	2	6	1024256	1024261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22555	NC_022119	AAAC	2	8	1024301	1024308	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
22556	NC_022119	TTA	2	6	1024324	1024329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22557	NC_022119	A	6	6	1024335	1024340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22558	NC_022119	CTG	2	6	1024349	1024354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22559	NC_022119	TC	3	6	1024401	1024406	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22560	NC_022119	TTAGA	2	10	1024432	1024441	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
22561	NC_022119	TC	3	6	1024579	1024584	0 %	50 %	0 %	50 %	532424776
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22563	NC_022119	TGC	2	6	1024656	1024661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424776
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22572	NC_022119	AG	3	6	1024987	1024992	50 %	0 %	50 %	0 %	532424776
22573	NC_022119	T	6	6	1025022	1025027	0 %	100 %	0 %	0 %	532424776
22574	NC_022119	TCT	2	6	1025029	1025034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424776
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22577	NC_022119	AAT	2	6	1025142	1025147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424776
22578	NC_022119	GTC	2	6	1025186	1025191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424776
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22583	NC_022119	AGG	2	6	1025409	1025414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424776
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22585	NC_022119	TAG	2	6	1025456	1025461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424776
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22587	NC_022119	AATC	2	8	1025523	1025530	50 %	25 %	0 %	25 %	532424776
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22589	NC_022119	AAG	2	6	1025547	1025552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424776
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22591	NC_022119	GAG	2	6	1025636	1025641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424776
22592	NC_022119	AGTTG	2	10	1025661	1025670	20 %	40 %	40 %	0 %	532424776
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22594	NC_022119	TTAA	2	8	1025697	1025704	50 %	50 %	0 %	0 %	532424776
22595	NC_022119	AAAG	2	8	1025711	1025718	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22596	NC_022119	AT	3	6	1025720	1025725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22597	NC_022119	T	6	6	1025742	1025747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22598	NC_022119	ACCAA	2	10	1026018	1026027	60 %	0 %	0 %	40 %	532424777
22599	NC_022119	AATA	2	8	1026242	1026249	75 %	25 %	0 %	0 %	532424777
22600	NC_022119	A	6	6	1026315	1026320	100 %	0 %	0 %	0 %	532424777
22601	NC_022119	CTT	2	6	1026449	1026454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424777
22602	NC_022119	AGA	2	6	1026495	1026500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424777
22603	NC_022119	GTT	2	6	1026504	1026509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424777
22604	NC_022119	T	6	6	1026508	1026513	0 %	100 %	0 %	0 %	532424777
22605	NC_022119	CTGA	2	8	1026543	1026550	25 %	25 %	25 %	25 %	532424777
22606	NC_022119	GT	4	8	1026565	1026572	0 %	50 %	50 %	0 %	532424777
22607	NC_022119	ATC	2	6	1026583	1026588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424777
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22609	NC_022119	CAT	2	6	1026654	1026659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424777
22610	NC_022119	TCC	3	9	1026666	1026674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424777
22611	NC_022119	T	6	6	1026721	1026726	0 %	100 %	0 %	0 %	532424777
22612	NC_022119	AGC	2	6	1026742	1026747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424777
22613	NC_022119	TAG	2	6	1026825	1026830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424777
22614	NC_022119	TTG	2	6	1026872	1026877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424777
22615	NC_022119	CCAT	2	8	1026936	1026943	25 %	25 %	0 %	50 %	532424777
22616	NC_022119	ATAG	2	8	1027012	1027019	50 %	25 %	25 %	0 %	532424777
22617	NC_022119	TGA	2	6	1027029	1027034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424777
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22975	NC_022119	GTA	2	6	1042274	1042279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22976	NC_022119	AGT	2	6	1042305	1042310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22977	NC_022119	GA	3	6	1042349	1042354	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22978	NC_022119	GT	3	6	1042437	1042442	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22979	NC_022119	CAA	2	6	1042472	1042477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22980	NC_022119	AGT	2	6	1042498	1042503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22981	NC_022119	GTG	2	6	1042514	1042519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22982	NC_022119	CAG	2	6	1042550	1042555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22983	NC_022119	AGTG	2	8	1042681	1042688	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
22984	NC_022119	TGGC	2	8	1042713	1042720	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding

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