MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/13-96

Total Repeats: 22984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21002	NC_022119	AGA	2	6	953640	953645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424721
21003	NC_022119	CTG	2	6	953654	953659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424721
21004	NC_022119	AAAGT	2	10	953726	953735	60 %	20 %	20 %	0 %	532424721
21005	NC_022119	ACA	2	6	953754	953759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424721
21006	NC_022119	TCT	2	6	953926	953931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424721
21007	NC_022119	GAA	2	6	953964	953969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424721
21008	NC_022119	ACA	2	6	953977	953982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424721
21009	NC_022119	CCT	2	6	954023	954028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424721
21010	NC_022119	TCT	2	6	954031	954036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424721
21011	NC_022119	AGG	2	6	954044	954049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424721
21012	NC_022119	CTC	2	6	954062	954067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424721
21013	NC_022119	GGA	2	6	954082	954087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424721
21014	NC_022119	AGTT	2	8	954119	954126	25 %	50 %	25 %	0 %	532424721
21015	NC_022119	ACA	2	6	954130	954135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424721
21016	NC_022119	GAA	2	6	954165	954170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424721
21017	NC_022119	TGA	2	6	954210	954215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424721
21018	NC_022119	GTA	2	6	954265	954270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424721
21019	NC_022119	GAA	2	6	954283	954288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424721
21020	NC_022119	GAA	2	6	954421	954426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424721
21021	NC_022119	TGTCT	2	10	954432	954441	0 %	60 %	20 %	20 %	532424721
21022	NC_022119	ATT	2	6	954497	954502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424721
21023	NC_022119	TG	3	6	954510	954515	0 %	50 %	50 %	0 %	532424721
21024	NC_022119	TGG	2	6	954528	954533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532424721
21025	NC_022119	CTG	2	6	954602	954607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424721
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21028	NC_022119	TA	3	6	954728	954733	50 %	50 %	0 %	0 %	532424721
21029	NC_022119	TTC	2	6	954757	954762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424721
21030	NC_022119	CTT	2	6	954836	954841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424721
21031	NC_022119	GAG	2	6	954851	954856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424721
21032	NC_022119	AGG	2	6	955140	955145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424721
21033	NC_022119	GGGA	2	8	955178	955185	25 %	0 %	75 %	0 %	532424721
21034	NC_022119	ATA	2	6	955232	955237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424721
21035	NC_022119	GGA	2	6	955288	955293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424721
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21037	NC_022119	T	8	8	955459	955466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21038	NC_022119	GAG	2	6	955486	955491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424865
21039	NC_022119	T	8	8	955509	955516	0 %	100 %	0 %	0 %	532424865
21040	NC_022119	CAA	2	6	955524	955529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424865
21041	NC_022119	T	6	6	955558	955563	0 %	100 %	0 %	0 %	532424865
21042	NC_022119	ACT	2	6	955603	955608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424865
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21054	NC_022119	A	6	6	956135	956140	100 %	0 %	0 %	0 %	532424722
21055	NC_022119	A	6	6	956158	956163	100 %	0 %	0 %	0 %	532424722
21056	NC_022119	AAC	2	6	956202	956207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424722
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21064	NC_022119	GTT	2	6	956416	956421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21065	NC_022119	T	7	7	956420	956426	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21066	NC_022119	GTA	2	6	956443	956448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21067	NC_022119	T	7	7	956463	956469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21068	NC_022119	CGA	2	6	956484	956489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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21072	NC_022119	TTC	2	6	956613	956618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424723
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21074	NC_022119	GGA	2	6	956674	956679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424723
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21077	NC_022119	T	8	8	956748	956755	0 %	100 %	0 %	0 %	532424723
21078	NC_022119	T	7	7	956803	956809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21083	NC_022119	CAAT	2	8	956979	956986	50 %	25 %	0 %	25 %	532424724
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21086	NC_022119	A	8	8	957166	957173	100 %	0 %	0 %	0 %	532424724
21087	NC_022119	ATT	2	6	957195	957200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21088	NC_022119	CTT	2	6	957207	957212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21089	NC_022119	TTTG	2	8	957241	957248	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
21090	NC_022119	AAG	2	6	957301	957306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21091	NC_022119	AGTT	2	8	957365	957372	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21092	NC_022119	TTA	2	6	957519	957524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424725
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21096	NC_022119	TTA	2	6	957673	957678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424725
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21103	NC_022119	TGA	2	6	958276	958281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424725
21104	NC_022119	GCA	2	6	958361	958366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424725
21105	NC_022119	GGA	2	6	958392	958397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424725
21106	NC_022119	TACAA	2	10	958428	958437	60 %	20 %	0 %	20 %	532424725
21107	NC_022119	GGGAT	2	10	958441	958450	20 %	20 %	60 %	0 %	532424725
21108	NC_022119	TAT	2	6	958475	958480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424725
21109	NC_022119	AAG	2	6	958609	958614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424725
21110	NC_022119	TTG	2	6	958735	958740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424725
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21112	NC_022119	TG	3	6	958793	958798	0 %	50 %	50 %	0 %	532424725
21113	NC_022119	TTGT	2	8	958915	958922	0 %	75 %	25 %	0 %	532424726
21114	NC_022119	CTG	2	6	958958	958963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424726
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21116	NC_022119	AC	3	6	959014	959019	50 %	0 %	0 %	50 %	532424726
21117	NC_022119	ATT	2	6	959092	959097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424726
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21122	NC_022119	TAT	2	6	959300	959305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424726
21123	NC_022119	TGC	2	6	959307	959312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424726
21124	NC_022119	TCT	2	6	959362	959367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424726
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21135	NC_022119	CAGCT	2	10	960005	960014	20 %	20 %	20 %	40 %	532424726
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21143	NC_022119	GCT	2	6	960448	960453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424726
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21150	NC_022119	TGA	2	6	960634	960639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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21152	NC_022119	A	6	6	960700	960705	100 %	0 %	0 %	0 %	532424727
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21221	NC_022119	T	6	6	964108	964113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21230	NC_022119	CTG	2	6	964517	964522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424730
21231	NC_022119	GCA	3	9	964546	964554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424730
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21234	NC_022119	CGGAA	2	10	964628	964637	40 %	0 %	40 %	20 %	532424730
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21243	NC_022119	T	8	8	964952	964959	0 %	100 %	0 %	0 %	532424730
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