MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/13-96

Total Repeats: 22984

< Previous12...34353637383940414243444546Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19502	NC_022119	CTTTT	2	10	885452	885461	0 %	80 %	0 %	20 %	532424667
19503	NC_022119	T	6	6	885458	885463	0 %	100 %	0 %	0 %	532424667
19504	NC_022119	T	7	7	885498	885504	0 %	100 %	0 %	0 %	532424667
19505	NC_022119	T	8	8	885537	885544	0 %	100 %	0 %	0 %	532424667
19506	NC_022119	TTC	2	6	885616	885621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424668
19507	NC_022119	TGC	2	6	885667	885672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424668
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19510	NC_022119	GAT	2	6	885774	885779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424668
19511	NC_022119	TCA	2	6	885834	885839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424668
19512	NC_022119	TTG	2	6	885885	885890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424668
19513	NC_022119	GAAGA	2	10	885939	885948	60 %	0 %	40 %	0 %	532424668
19514	NC_022119	ACCA	2	8	886005	886012	50 %	0 %	0 %	50 %	532424668
19515	NC_022119	GAA	2	6	886032	886037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424668
19516	NC_022119	ACC	2	6	886041	886046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532424668
19517	NC_022119	GAGT	2	8	886053	886060	25 %	25 %	50 %	0 %	532424668
19518	NC_022119	T	6	6	886060	886065	0 %	100 %	0 %	0 %	532424668
19519	NC_022119	TTA	2	6	886094	886099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424668
19520	NC_022119	GTTT	2	8	886118	886125	0 %	75 %	25 %	0 %	532424668
19521	NC_022119	T	6	6	886123	886128	0 %	100 %	0 %	0 %	532424668
19522	NC_022119	CAT	2	6	886149	886154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424668
19523	NC_022119	TA	3	6	886168	886173	50 %	50 %	0 %	0 %	532424668
19524	NC_022119	GAAA	2	8	886199	886206	75 %	0 %	25 %	0 %	532424668
19525	NC_022119	CA	3	6	886261	886266	50 %	0 %	0 %	50 %	532424668
19526	NC_022119	GCT	2	6	886284	886289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424668
19527	NC_022119	GA	3	6	886311	886316	50 %	0 %	50 %	0 %	532424668
19528	NC_022119	CCT	2	6	886340	886345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424668
19529	NC_022119	TTA	2	6	886501	886506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19530	NC_022119	TAGT	2	8	886538	886545	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19531	NC_022119	T	7	7	886556	886562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19532	NC_022119	AAG	2	6	886595	886600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424669
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19535	NC_022119	TCT	2	6	886690	886695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424669
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19539	NC_022119	CAA	2	6	886757	886762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424669
19540	NC_022119	TCCA	2	8	886767	886774	25 %	25 %	0 %	50 %	532424669
19541	NC_022119	GTT	2	6	886793	886798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424669
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19543	NC_022119	CAG	2	6	886835	886840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424669
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19546	NC_022119	AGA	2	6	886894	886899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424669
19547	NC_022119	T	7	7	887030	887036	0 %	100 %	0 %	0 %	532424669
19548	NC_022119	TCT	2	6	887059	887064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424669
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19557	NC_022119	TTC	2	6	887388	887393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424669
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19559	NC_022119	CTT	2	6	887569	887574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424669
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19564	NC_022119	GAG	2	6	887980	887985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424669
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19569	NC_022119	T	8	8	888304	888311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19607	NC_022119	TGCC	2	8	889468	889475	0 %	25 %	25 %	50 %	532424670
19608	NC_022119	ATG	2	6	889519	889524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424670
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