MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/13-96

Total Repeats: 22984

< Previous12...34353637383940414243444546Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_022119	AGG	2	6	860408	860413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424654
19003	NC_022119	CTG	2	6	860452	860457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424654
19004	NC_022119	AAG	2	6	860461	860466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424654
19005	NC_022119	AGAT	2	8	860504	860511	50 %	25 %	25 %	0 %	532424654
19006	NC_022119	AGG	2	6	860606	860611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424654
19007	NC_022119	AGAA	2	8	860669	860676	75 %	0 %	25 %	0 %	532424654
19008	NC_022119	ACA	2	6	860715	860720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424654
19009	NC_022119	AAG	3	9	860731	860739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424654
19010	NC_022119	CTTCTA	2	12	860755	860766	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	532424654
19011	NC_022119	TGC	2	6	860823	860828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424654
19012	NC_022119	TCA	2	6	860862	860867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424654
19013	NC_022119	AGC	2	6	860903	860908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424654
19014	NC_022119	TAA	2	6	860948	860953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424654
19015	NC_022119	ATC	2	6	860999	861004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424654
19016	NC_022119	ATT	2	6	861005	861010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424654
19017	NC_022119	TAA	2	6	861037	861042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424654
19018	NC_022119	TGC	2	6	861098	861103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424654
19019	NC_022119	A	6	6	861206	861211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19020	NC_022119	T	6	6	861221	861226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19021	NC_022119	TTA	2	6	861233	861238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19022	NC_022119	AGC	2	6	861318	861323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424655
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19024	NC_022119	CTTTTT	2	12	861439	861450	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	532424655
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19028	NC_022119	TTA	2	6	861644	861649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19029	NC_022119	T	7	7	861889	861895	0 %	100 %	0 %	0 %	532424656
19030	NC_022119	GAG	2	6	861946	861951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424656
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19032	NC_022119	AAT	2	6	862100	862105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424656
19033	NC_022119	T	8	8	862105	862112	0 %	100 %	0 %	0 %	532424656
19034	NC_022119	AG	3	6	862165	862170	50 %	0 %	50 %	0 %	532424656
19035	NC_022119	TCT	2	6	862173	862178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424656
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19053	NC_022119	TGGGA	2	10	862791	862800	20 %	20 %	60 %	0 %	532424656
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19055	NC_022119	GAG	2	6	862867	862872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424656
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19057	NC_022119	TCC	2	6	862957	862962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19058	NC_022119	AGG	2	6	862965	862970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19059	NC_022119	A	8	8	863028	863035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19061	NC_022119	ATT	2	6	863114	863119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19062	NC_022119	T	7	7	863118	863124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19063	NC_022119	T	7	7	863135	863141	0 %	100 %	0 %	0 %	532424657
19064	NC_022119	T	7	7	863172	863178	0 %	100 %	0 %	0 %	532424657
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19070	NC_022119	AGC	2	6	863286	863291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424657
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19082	NC_022119	GTTT	2	8	863552	863559	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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19092	NC_022119	T	6	6	863878	863883	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19105	NC_022119	A	7	7	864643	864649	100 %	0 %	0 %	0 %	532424658
19106	NC_022119	AAG	2	6	864677	864682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424658
19107	NC_022119	A	6	6	864835	864840	100 %	0 %	0 %	0 %	532424658
19108	NC_022119	TTA	2	6	864865	864870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424658
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19114	NC_022119	GA	3	6	865122	865127	50 %	0 %	50 %	0 %	532424658
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19123	NC_022119	AG	3	6	865375	865380	50 %	0 %	50 %	0 %	532424658
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19125	NC_022119	GA	3	6	865430	865435	50 %	0 %	50 %	0 %	532424658
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19220	NC_022119	CTG	2	6	870101	870106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424662
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19231	NC_022119	GCAT	2	8	870816	870823	25 %	25 %	25 %	25 %	532424662
19232	NC_022119	TGC	2	6	870953	870958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424662
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19235	NC_022119	GA	3	6	871031	871036	50 %	0 %	50 %	0 %	532424662
19236	NC_022119	AG	3	6	871058	871063	50 %	0 %	50 %	0 %	532424662
19237	NC_022119	GTT	2	6	871159	871164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424662
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19239	NC_022119	ATA	2	6	871173	871178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424662
19240	NC_022119	T	7	7	871273	871279	0 %	100 %	0 %	0 %	532424662
19241	NC_022119	CAGCC	2	10	871328	871337	20 %	0 %	20 %	60 %	532424662
19242	NC_022119	GTA	2	6	871380	871385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424662
19243	NC_022119	CTTG	2	8	871402	871409	0 %	50 %	25 %	25 %	532424662
19244	NC_022119	CA	4	8	871417	871424	50 %	0 %	0 %	50 %	532424662
19245	NC_022119	CAT	2	6	871508	871513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424662
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19247	NC_022119	GATA	2	8	871609	871616	50 %	25 %	25 %	0 %	532424662
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19372	NC_022119	TGA	2	6	877890	877895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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