MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/13-96

Total Repeats: 22984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_022119	GTT	2	6	834982	834987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18502	NC_022119	GA	3	6	834991	834996	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18503	NC_022119	TTA	2	6	835016	835021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18504	NC_022119	TGGCA	2	10	835062	835071	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
18505	NC_022119	CAG	2	6	835100	835105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424637
18506	NC_022119	GAA	2	6	835118	835123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424637
18507	NC_022119	TGA	2	6	835128	835133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424637
18508	NC_022119	TGA	2	6	835197	835202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424637
18509	NC_022119	A	6	6	835249	835254	100 %	0 %	0 %	0 %	532424637
18510	NC_022119	TGT	2	6	835337	835342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424637
18511	NC_022119	GTT	2	6	835359	835364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424637
18512	NC_022119	ATG	2	6	835415	835420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424637
18513	NC_022119	TATT	2	8	835471	835478	25 %	75 %	0 %	0 %	532424637
18514	NC_022119	TGAT	2	8	835535	835542	25 %	50 %	25 %	0 %	532424637
18515	NC_022119	CCG	2	6	835578	835583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532424637
18516	NC_022119	ATT	2	6	835597	835602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424637
18517	NC_022119	TGAA	2	8	835604	835611	50 %	25 %	25 %	0 %	532424637
18518	NC_022119	A	6	6	835615	835620	100 %	0 %	0 %	0 %	532424637
18519	NC_022119	TCG	2	6	835781	835786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424637
18520	NC_022119	TTAGA	2	10	835788	835797	40 %	40 %	20 %	0 %	532424637
18521	NC_022119	T	8	8	835845	835852	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18522	NC_022119	T	6	6	835914	835919	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18523	NC_022119	AGG	2	6	835942	835947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424638
18524	NC_022119	A	8	8	836029	836036	100 %	0 %	0 %	0 %	532424638
18525	NC_022119	AGA	2	6	836089	836094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424638
18526	NC_022119	T	6	6	836192	836197	0 %	100 %	0 %	0 %	532424638
18527	NC_022119	GAA	2	6	836270	836275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424638
18528	NC_022119	GAAA	2	8	836463	836470	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18529	NC_022119	TAT	2	6	836473	836478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424639
18530	NC_022119	CTTT	2	8	836524	836531	0 %	75 %	0 %	25 %	532424639
18531	NC_022119	CGG	2	6	836576	836581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532424639
18532	NC_022119	AAT	2	6	836659	836664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424639
18533	NC_022119	AAG	2	6	836735	836740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424639
18534	NC_022119	ACG	2	6	836759	836764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424639
18535	NC_022119	A	6	6	836779	836784	100 %	0 %	0 %	0 %	532424639
18536	NC_022119	TG	3	6	836798	836803	0 %	50 %	50 %	0 %	532424639
18537	NC_022119	GT	3	6	836829	836834	0 %	50 %	50 %	0 %	532424639
18538	NC_022119	ATT	2	6	836836	836841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424639
18539	NC_022119	TGA	2	6	836871	836876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424639
18540	NC_022119	TC	3	6	836905	836910	0 %	50 %	0 %	50 %	532424639
18541	NC_022119	GAA	2	6	836941	836946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424639
18542	NC_022119	GAAA	2	8	836964	836971	75 %	0 %	25 %	0 %	532424639
18543	NC_022119	TAGT	2	8	837019	837026	25 %	50 %	25 %	0 %	532424639
18544	NC_022119	AAG	2	6	837069	837074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424640
18545	NC_022119	TAG	2	6	837078	837083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424640
18546	NC_022119	AGA	2	6	837091	837096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424640
18547	NC_022119	TCA	2	6	837150	837155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424640
18548	NC_022119	CTC	2	6	837198	837203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424640
18549	NC_022119	ATC	2	6	837223	837228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424640
18550	NC_022119	ATA	2	6	837282	837287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424640
18551	NC_022119	TTC	2	6	837313	837318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424640
18552	NC_022119	AGCC	2	8	837359	837366	25 %	0 %	25 %	50 %	532424640
18553	NC_022119	CCT	2	6	837410	837415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424640
18554	NC_022119	AG	3	6	837431	837436	50 %	0 %	50 %	0 %	532424640
18555	NC_022119	AGA	2	6	837537	837542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424640
18556	NC_022119	TAG	2	6	837544	837549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424640
18557	NC_022119	AG	3	6	837548	837553	50 %	0 %	50 %	0 %	532424640
18558	NC_022119	GGA	2	6	837599	837604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424640
18559	NC_022119	A	6	6	837621	837626	100 %	0 %	0 %	0 %	532424640
18560	NC_022119	AAT	2	6	837706	837711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424640
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18562	NC_022119	TAA	2	6	837828	837833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424640
18563	NC_022119	TACA	2	8	837952	837959	50 %	25 %	0 %	25 %	532424640
18564	NC_022119	T	6	6	838006	838011	0 %	100 %	0 %	0 %	532424640
18565	NC_022119	AGA	2	6	838054	838059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424640
18566	NC_022119	ATCACA	2	12	838076	838087	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	532424640
18567	NC_022119	ATG	2	6	838106	838111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424640
18568	NC_022119	T	7	7	838152	838158	0 %	100 %	0 %	0 %	532424640
18569	NC_022119	GAAG	2	8	838195	838202	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18570	NC_022119	T	6	6	838260	838265	0 %	100 %	0 %	0 %	532424641
18571	NC_022119	AAAT	2	8	838363	838370	75 %	25 %	0 %	0 %	532424641
18572	NC_022119	AAT	2	6	838373	838378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424641
18573	NC_022119	CGA	2	6	838413	838418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424641
18574	NC_022119	GA	3	6	838448	838453	50 %	0 %	50 %	0 %	532424641
18575	NC_022119	CAC	2	6	838475	838480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532424641
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18577	NC_022119	CATA	2	8	838715	838722	50 %	25 %	0 %	25 %	532424641
18578	NC_022119	GCA	2	6	838761	838766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424641
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18580	NC_022119	AAGC	2	8	838815	838822	50 %	0 %	25 %	25 %	532424641
18581	NC_022119	CGC	2	6	838837	838842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532424641
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18584	NC_022119	GAC	2	6	839058	839063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424641
18585	NC_022119	GTA	2	6	839145	839150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424641
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18588	NC_022119	CCT	2	6	839376	839381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424641
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18592	NC_022119	TGA	2	6	839491	839496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424641
18593	NC_022119	GGA	2	6	839527	839532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424641
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18596	NC_022119	AAC	2	6	839675	839680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424641
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18598	NC_022119	GA	3	6	840027	840032	50 %	0 %	50 %	0 %	532424641
18599	NC_022119	AAG	2	6	840056	840061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424641
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18602	NC_022119	GA	3	6	840136	840141	50 %	0 %	50 %	0 %	532424641
18603	NC_022119	A	7	7	840176	840182	100 %	0 %	0 %	0 %	532424641
18604	NC_022119	A	6	6	840214	840219	100 %	0 %	0 %	0 %	532424641
18605	NC_022119	CTA	2	6	840240	840245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424641
18606	NC_022119	AAT	2	6	840260	840265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18607	NC_022119	AGC	2	6	840276	840281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424642
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18609	NC_022119	T	6	6	840341	840346	0 %	100 %	0 %	0 %	532424642
18610	NC_022119	GAAG	2	8	840385	840392	50 %	0 %	50 %	0 %	532424642
18611	NC_022119	CTTG	2	8	840483	840490	0 %	50 %	25 %	25 %	532424642
18612	NC_022119	TCT	2	6	840506	840511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424642
18613	NC_022119	AAGAG	2	10	840548	840557	60 %	0 %	40 %	0 %	532424642
18614	NC_022119	AC	3	6	840568	840573	50 %	0 %	0 %	50 %	532424642
18615	NC_022119	TCTT	2	8	840671	840678	0 %	75 %	0 %	25 %	532424642
18616	NC_022119	TGC	2	6	840721	840726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424642
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18619	NC_022119	A	6	6	840838	840843	100 %	0 %	0 %	0 %	532424642
18620	NC_022119	CAAT	2	8	840857	840864	50 %	25 %	0 %	25 %	532424642
18621	NC_022119	T	7	7	840895	840901	0 %	100 %	0 %	0 %	532424642
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18623	NC_022119	CTT	2	6	840945	840950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424642
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18746	NC_022119	TAC	2	6	847069	847074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18998	NC_022119	CCT	2	6	860253	860258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424654
18999	NC_022119	AG	3	6	860343	860348	50 %	0 %	50 %	0 %	532424654
19000	NC_022119	AT	3	6	860350	860355	50 %	50 %	0 %	0 %	532424654

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