MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/13-96

Total Repeats: 22984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_022119	TAA	2	6	812221	812226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424620
18002	NC_022119	T	7	7	812313	812319	0 %	100 %	0 %	0 %	532424620
18003	NC_022119	CG	3	6	812320	812325	0 %	0 %	50 %	50 %	532424620
18004	NC_022119	TTG	2	6	812391	812396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424620
18005	NC_022119	T	9	9	812564	812572	0 %	100 %	0 %	0 %	532424620
18006	NC_022119	AGA	2	6	812623	812628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424621
18007	NC_022119	CTT	2	6	812661	812666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424621
18008	NC_022119	TC	4	8	812684	812691	0 %	50 %	0 %	50 %	532424621
18009	NC_022119	T	6	6	812706	812711	0 %	100 %	0 %	0 %	532424621
18010	NC_022119	T	6	6	812755	812760	0 %	100 %	0 %	0 %	532424621
18011	NC_022119	CAG	2	6	812775	812780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424621
18012	NC_022119	CCT	2	6	812816	812821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424621
18013	NC_022119	ATC	2	6	812834	812839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424621
18014	NC_022119	ATA	2	6	812886	812891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424621
18015	NC_022119	CTG	2	6	812979	812984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424621
18016	NC_022119	AT	3	6	812987	812992	50 %	50 %	0 %	0 %	532424621
18017	NC_022119	TGA	2	6	813006	813011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424621
18018	NC_022119	TAG	2	6	813027	813032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424621
18019	NC_022119	AATA	2	8	813135	813142	75 %	25 %	0 %	0 %	532424621
18020	NC_022119	CGC	2	6	813156	813161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532424621
18021	NC_022119	CAA	2	6	813174	813179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424621
18022	NC_022119	TG	3	6	813200	813205	0 %	50 %	50 %	0 %	532424621
18023	NC_022119	AGAAA	2	10	813263	813272	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
18024	NC_022119	ATG	2	6	813309	813314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18025	NC_022119	AAG	2	6	813367	813372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18026	NC_022119	AAC	2	6	813374	813379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424622
18027	NC_022119	T	6	6	813389	813394	0 %	100 %	0 %	0 %	532424622
18028	NC_022119	CAA	2	6	813445	813450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424622
18029	NC_022119	AACT	2	8	813452	813459	50 %	25 %	0 %	25 %	532424622
18030	NC_022119	ATC	2	6	813465	813470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424622
18031	NC_022119	TCA	2	6	813526	813531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424622
18032	NC_022119	TTC	2	6	813542	813547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424622
18033	NC_022119	CCTT	2	8	813610	813617	0 %	50 %	0 %	50 %	532424622
18034	NC_022119	CTT	2	6	813631	813636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424622
18035	NC_022119	AG	3	6	813716	813721	50 %	0 %	50 %	0 %	532424622
18036	NC_022119	TTC	2	6	813725	813730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424622
18037	NC_022119	CT	3	6	813747	813752	0 %	50 %	0 %	50 %	532424622
18038	NC_022119	CTT	2	6	813820	813825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424622
18039	NC_022119	TTC	2	6	813858	813863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424622
18040	NC_022119	AAG	2	6	813956	813961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424622
18041	NC_022119	AGGA	2	8	813972	813979	50 %	0 %	50 %	0 %	532424622
18042	NC_022119	ATTT	2	8	814087	814094	25 %	75 %	0 %	0 %	532424622
18043	NC_022119	TCA	2	6	814122	814127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424622
18044	NC_022119	A	6	6	814205	814210	100 %	0 %	0 %	0 %	532424622
18045	NC_022119	T	6	6	814221	814226	0 %	100 %	0 %	0 %	532424622
18046	NC_022119	TCT	2	6	814242	814247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424622
18047	NC_022119	GAAA	2	8	814334	814341	75 %	0 %	25 %	0 %	532424622
18048	NC_022119	GAG	2	6	814380	814385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424622
18049	NC_022119	CA	3	6	814417	814422	50 %	0 %	0 %	50 %	532424622
18050	NC_022119	CAA	2	6	814501	814506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424622
18051	NC_022119	TAT	2	6	814507	814512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424622
18052	NC_022119	ACA	2	6	814545	814550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424622
18053	NC_022119	T	8	8	814551	814558	0 %	100 %	0 %	0 %	532424622
18054	NC_022119	CTT	2	6	814573	814578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424622
18055	NC_022119	TG	3	6	814590	814595	0 %	50 %	50 %	0 %	532424622
18056	NC_022119	ACACA	2	10	814624	814633	60 %	0 %	0 %	40 %	532424622
18057	NC_022119	TCT	2	6	814644	814649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424622
18058	NC_022119	TGA	2	6	814734	814739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18059	NC_022119	GAA	2	6	814802	814807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18060	NC_022119	A	8	8	814863	814870	100 %	0 %	0 %	0 %	532424850
18061	NC_022119	T	6	6	814884	814889	0 %	100 %	0 %	0 %	532424850
18062	NC_022119	GGT	2	6	814903	814908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532424850
18063	NC_022119	A	7	7	814909	814915	100 %	0 %	0 %	0 %	532424850
18064	NC_022119	GAA	2	6	814960	814965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424850
18065	NC_022119	AAG	2	6	815071	815076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424623
18066	NC_022119	GT	3	6	815171	815176	0 %	50 %	50 %	0 %	532424623
18067	NC_022119	TCTT	2	8	815371	815378	0 %	75 %	0 %	25 %	532424623
18068	NC_022119	GAG	2	6	815384	815389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424623
18069	NC_022119	GAG	2	6	815435	815440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424623
18070	NC_022119	TGC	2	6	815491	815496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424623
18071	NC_022119	CTT	3	9	815518	815526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424623
18072	NC_022119	TGTTT	2	10	815566	815575	0 %	80 %	20 %	0 %	532424623
18073	NC_022119	A	7	7	815583	815589	100 %	0 %	0 %	0 %	532424623
18074	NC_022119	TCT	2	6	815601	815606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424623
18075	NC_022119	GAA	2	6	815733	815738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424623
18076	NC_022119	ATT	2	6	815839	815844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424623
18077	NC_022119	GAT	2	6	815878	815883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424623
18078	NC_022119	GA	5	10	815937	815946	50 %	0 %	50 %	0 %	532424623
18079	NC_022119	AGA	2	6	815977	815982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424623
18080	NC_022119	CTTTG	2	10	815985	815994	0 %	60 %	20 %	20 %	532424623
18081	NC_022119	TTA	2	6	816056	816061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424623
18082	NC_022119	TTG	2	6	816075	816080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424623
18083	NC_022119	AGCA	2	8	816105	816112	50 %	0 %	25 %	25 %	532424623
18084	NC_022119	TTC	2	6	816114	816119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424623
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18086	NC_022119	TGGA	2	8	816375	816382	25 %	25 %	50 %	0 %	532424623
18087	NC_022119	ACG	2	6	816411	816416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424623
18088	NC_022119	CTT	2	6	816435	816440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424623
18089	NC_022119	AAG	2	6	816456	816461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424623
18090	NC_022119	AG	3	6	816511	816516	50 %	0 %	50 %	0 %	532424623
18091	NC_022119	AGA	2	6	816526	816531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424623
18092	NC_022119	GAA	2	6	816589	816594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424623
18093	NC_022119	TAA	2	6	816625	816630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424623
18094	NC_022119	GCATC	2	10	816634	816643	20 %	20 %	20 %	40 %	532424623
18095	NC_022119	TTTA	2	8	816677	816684	25 %	75 %	0 %	0 %	532424623
18096	NC_022119	TGA	2	6	816685	816690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424623
18097	NC_022119	ACT	2	6	816732	816737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424623
18098	NC_022119	ACTT	2	8	816786	816793	25 %	50 %	0 %	25 %	532424623
18099	NC_022119	GAA	2	6	816811	816816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424623
18100	NC_022119	CTT	2	6	816820	816825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424623
18101	NC_022119	A	6	6	816854	816859	100 %	0 %	0 %	0 %	532424623
18102	NC_022119	GCG	2	6	816862	816867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532424623
18103	NC_022119	A	6	6	816918	816923	100 %	0 %	0 %	0 %	532424623
18104	NC_022119	GAT	2	6	816971	816976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424623
18105	NC_022119	TTG	2	6	816978	816983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424623
18106	NC_022119	AGA	2	6	817060	817065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424623
18107	NC_022119	AGAA	2	8	817158	817165	75 %	0 %	25 %	0 %	532424623
18108	NC_022119	ATT	2	6	817253	817258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424623
18109	NC_022119	GGC	2	6	817286	817291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532424623
18110	NC_022119	AGA	2	6	817339	817344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424623
18111	NC_022119	AGA	2	6	817426	817431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424623
18112	NC_022119	ATG	2	6	817434	817439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424623
18113	NC_022119	CTT	2	6	817449	817454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424623
18114	NC_022119	GTT	2	6	817508	817513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424623
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18117	NC_022119	TTC	2	6	817776	817781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424623
18118	NC_022119	AGA	2	6	817804	817809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424623
18119	NC_022119	CCT	2	6	817814	817819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424623
18120	NC_022119	AAG	2	6	817923	817928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424623
18121	NC_022119	GA	3	6	817934	817939	50 %	0 %	50 %	0 %	532424623
18122	NC_022119	TGT	2	6	817985	817990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424623
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18128	NC_022119	TGG	2	6	818318	818323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532424623
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18162	NC_022119	GA	3	6	819934	819939	50 %	0 %	50 %	0 %	532424625
18163	NC_022119	TGCA	2	8	819963	819970	25 %	25 %	25 %	25 %	532424625
18164	NC_022119	TGT	2	6	820081	820086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424625
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18232	NC_022119	A	6	6	823361	823366	100 %	0 %	0 %	0 %	532424626
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18235	NC_022119	AAGC	2	8	823543	823550	50 %	0 %	25 %	25 %	532424626
18236	NC_022119	TGA	2	6	823552	823557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424626
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18241	NC_022119	AGC	2	6	823710	823715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424626
18242	NC_022119	CGT	2	6	823725	823730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424626
18243	NC_022119	CAA	2	6	823778	823783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424626
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18246	NC_022119	CAA	2	6	823928	823933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424627
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18252	NC_022119	AG	3	6	824151	824156	50 %	0 %	50 %	0 %	532424627
18253	NC_022119	AG	5	10	824174	824183	50 %	0 %	50 %	0 %	532424627
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18272	NC_022119	AAGAG	2	10	825102	825111	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
18273	NC_022119	G	6	6	825117	825122	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18274	NC_022119	TCC	2	6	825135	825140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424628
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18352	NC_022119	A	7	7	828495	828501	100 %	0 %	0 %	0 %	532424630
18353	NC_022119	TTG	2	6	828543	828548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424630
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18355	NC_022119	AGC	2	6	828598	828603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424630
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18357	NC_022119	GTT	2	6	828727	828732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424631
18358	NC_022119	TA	3	6	828787	828792	50 %	50 %	0 %	0 %	532424631
18359	NC_022119	CT	3	6	828803	828808	0 %	50 %	0 %	50 %	532424631
18360	NC_022119	TTGT	2	8	828863	828870	0 %	75 %	25 %	0 %	532424631
18361	NC_022119	TGT	2	6	828909	828914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424631
18362	NC_022119	T	7	7	828941	828947	0 %	100 %	0 %	0 %	532424631
18363	NC_022119	T	6	6	829013	829018	0 %	100 %	0 %	0 %	532424631
18364	NC_022119	GTT	2	6	829043	829048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424632
18365	NC_022119	GAT	2	6	829173	829178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424632
18366	NC_022119	GA	3	6	829210	829215	50 %	0 %	50 %	0 %	532424632
18367	NC_022119	GCA	2	6	829228	829233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424632
18368	NC_022119	ATG	2	6	829236	829241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424632
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18372	NC_022119	GA	3	6	829324	829329	50 %	0 %	50 %	0 %	532424632
18373	NC_022119	AGA	2	6	829345	829350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424632
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18397	NC_022119	TC	3	6	830361	830366	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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18483	NC_022119	T	6	6	834415	834420	0 %	100 %	0 %	0 %	532424852
18484	NC_022119	ATC	2	6	834475	834480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424852
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18489	NC_022119	AAG	2	6	834759	834764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424852
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18491	NC_022119	GAT	2	6	834788	834793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424852
18492	NC_022119	T	6	6	834840	834845	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18493	NC_022119	AGGG	2	8	834854	834861	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
18494	NC_022119	G	6	6	834859	834864	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18495	NC_022119	GAG	2	6	834891	834896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18496	NC_022119	CTT	2	6	834899	834904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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