MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/13-96

Total Repeats: 22984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17502	NC_022119	TTC	2	6	789434	789439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424602
17503	NC_022119	A	6	6	789610	789615	100 %	0 %	0 %	0 %	532424602
17504	NC_022119	TCC	2	6	789633	789638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424602
17505	NC_022119	AGG	3	9	789645	789653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424602
17506	NC_022119	ATTAGG	2	12	789744	789755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424602
17507	NC_022119	GCG	2	6	789757	789762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532424602
17508	NC_022119	ATT	2	6	789767	789772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424602
17509	NC_022119	AGC	2	6	789833	789838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424602
17510	NC_022119	GTA	2	6	789902	789907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424602
17511	NC_022119	T	6	6	789942	789947	0 %	100 %	0 %	0 %	532424602
17512	NC_022119	CAGC	2	8	789994	790001	25 %	0 %	25 %	50 %	532424602
17513	NC_022119	TTC	2	6	790070	790075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424602
17514	NC_022119	TCGT	2	8	790113	790120	0 %	50 %	25 %	25 %	532424602
17515	NC_022119	AG	3	6	790139	790144	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17516	NC_022119	CTGT	2	8	790212	790219	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17517	NC_022119	TTCT	2	8	790370	790377	0 %	75 %	0 %	25 %	532424603
17518	NC_022119	TCC	2	6	790401	790406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424603
17519	NC_022119	TAT	2	6	790444	790449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424603
17520	NC_022119	GC	3	6	790476	790481	0 %	0 %	50 %	50 %	532424603
17521	NC_022119	TGT	2	6	790512	790517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424603
17522	NC_022119	TGA	2	6	790536	790541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424603
17523	NC_022119	GCA	2	6	790546	790551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424603
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17525	NC_022119	TTG	2	6	790628	790633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424603
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17527	NC_022119	GAA	2	6	790674	790679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424603
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17529	NC_022119	A	6	6	790736	790741	100 %	0 %	0 %	0 %	532424603
17530	NC_022119	GA	3	6	790751	790756	50 %	0 %	50 %	0 %	532424603
17531	NC_022119	CTT	2	6	790898	790903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424603
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17534	NC_022119	CTT	2	6	790928	790933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424603
17535	NC_022119	CAA	2	6	790964	790969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424603
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17537	NC_022119	TCT	3	9	791077	791085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424603
17538	NC_022119	CTTAA	2	10	791094	791103	40 %	40 %	0 %	20 %	532424603
17539	NC_022119	CGG	2	6	791120	791125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532424604
17540	NC_022119	AGC	2	6	791156	791161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424604
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17542	NC_022119	TGC	2	6	791177	791182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424604
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17546	NC_022119	TTG	2	6	791311	791316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424604
17547	NC_022119	ATAG	2	8	791354	791361	50 %	25 %	25 %	0 %	532424604
17548	NC_022119	TCA	2	6	791381	791386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424604
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17550	NC_022119	CCA	2	6	791496	791501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532424604
17551	NC_022119	TTC	2	6	791533	791538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424604
17552	NC_022119	GAT	2	6	791553	791558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424604
17553	NC_022119	CCTT	2	8	791659	791666	0 %	50 %	0 %	50 %	532424604
17554	NC_022119	T	6	6	791665	791670	0 %	100 %	0 %	0 %	532424604
17555	NC_022119	AAT	2	6	791788	791793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424604
17556	NC_022119	T	6	6	791845	791850	0 %	100 %	0 %	0 %	532424604
17557	NC_022119	TAA	2	6	791876	791881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424604
17558	NC_022119	GCTT	2	8	791896	791903	0 %	50 %	25 %	25 %	532424604
17559	NC_022119	ATT	2	6	791917	791922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424604
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17581	NC_022119	A	6	6	793031	793036	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17609	NC_022119	TA	3	6	794214	794219	50 %	50 %	0 %	0 %	532424607
17610	NC_022119	ATT	2	6	794273	794278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424607
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17612	NC_022119	T	6	6	794377	794382	0 %	100 %	0 %	0 %	532424607
17613	NC_022119	CTT	2	6	794404	794409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424607
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17618	NC_022119	CTTA	2	8	794520	794527	25 %	50 %	0 %	25 %	532424607
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17988	NC_022119	GAT	2	6	811725	811730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424620
17989	NC_022119	TTC	2	6	811756	811761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424620
17990	NC_022119	GTT	2	6	811775	811780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424620
17991	NC_022119	CTC	2	6	811824	811829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424620
17992	NC_022119	TCC	2	6	811891	811896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424620
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