MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/13-96

Total Repeats: 22984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_022119	GTC	2	6	765956	765961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424585
17002	NC_022119	TGC	2	6	765977	765982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424585
17003	NC_022119	TGA	2	6	766039	766044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424585
17004	NC_022119	CCT	2	6	766104	766109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424585
17005	NC_022119	GAT	2	6	766224	766229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424585
17006	NC_022119	TTCT	2	8	766282	766289	0 %	75 %	0 %	25 %	532424585
17007	NC_022119	AAC	2	6	766375	766380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424585
17008	NC_022119	ATT	2	6	766386	766391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424585
17009	NC_022119	AG	3	6	766401	766406	50 %	0 %	50 %	0 %	532424585
17010	NC_022119	TCG	2	6	766457	766462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424585
17011	NC_022119	GGATC	2	10	766464	766473	20 %	20 %	40 %	20 %	532424585
17012	NC_022119	TAAAT	2	10	766505	766514	60 %	40 %	0 %	0 %	532424585
17013	NC_022119	A	6	6	766540	766545	100 %	0 %	0 %	0 %	532424585
17014	NC_022119	GCT	2	6	766560	766565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424585
17015	NC_022119	TAG	2	6	766603	766608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17016	NC_022119	TG	3	6	766612	766617	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17017	NC_022119	AAG	2	6	766651	766656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424586
17018	NC_022119	CAGAG	2	10	766668	766677	40 %	0 %	40 %	20 %	532424586
17019	NC_022119	GTT	2	6	766681	766686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424586
17020	NC_022119	AAC	2	6	766812	766817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424586
17021	NC_022119	GCGAT	2	10	766820	766829	20 %	20 %	40 %	20 %	532424586
17022	NC_022119	AGT	2	6	766854	766859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424586
17023	NC_022119	GAA	4	12	766876	766887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424586
17024	NC_022119	AGAA	2	8	766901	766908	75 %	0 %	25 %	0 %	532424586
17025	NC_022119	GCA	3	9	766918	766926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424586
17026	NC_022119	ACG	2	6	766962	766967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424586
17027	NC_022119	AGA	3	9	766971	766979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424586
17028	NC_022119	A	6	6	766979	766984	100 %	0 %	0 %	0 %	532424586
17029	NC_022119	AGA	2	6	766998	767003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424586
17030	NC_022119	AAG	2	6	767012	767017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424586
17031	NC_022119	AGA	2	6	767025	767030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424586
17032	NC_022119	GAA	2	6	767041	767046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424586
17033	NC_022119	AGATG	2	10	767055	767064	40 %	20 %	40 %	0 %	532424586
17034	NC_022119	TCA	2	6	767076	767081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424586
17035	NC_022119	AAC	2	6	767096	767101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424586
17036	NC_022119	TAAA	2	8	767132	767139	75 %	25 %	0 %	0 %	532424587
17037	NC_022119	ATC	2	6	767177	767182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424587
17038	NC_022119	GAAG	2	8	767239	767246	50 %	0 %	50 %	0 %	532424587
17039	NC_022119	GAA	2	6	767285	767290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424587
17040	NC_022119	CGTCA	2	10	767294	767303	20 %	20 %	20 %	40 %	532424587
17041	NC_022119	TCT	2	6	767308	767313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424587
17042	NC_022119	CAG	2	6	767348	767353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424587
17043	NC_022119	TCT	2	6	767359	767364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424587
17044	NC_022119	AGA	4	12	767367	767378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424587
17045	NC_022119	TTC	2	6	767395	767400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424587
17046	NC_022119	TGG	2	6	767403	767408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532424587
17047	NC_022119	ATG	2	6	767467	767472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424587
17048	NC_022119	TAG	2	6	767579	767584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424587
17049	NC_022119	ATA	2	6	767597	767602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424587
17050	NC_022119	GAA	2	6	767659	767664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424587
17051	NC_022119	CAG	2	6	767728	767733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424587
17052	NC_022119	AGC	2	6	767741	767746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424587
17053	NC_022119	TGG	2	6	767756	767761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532424587
17054	NC_022119	TCA	2	6	767775	767780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424587
17055	NC_022119	GTTG	2	8	767796	767803	0 %	50 %	50 %	0 %	532424587
17056	NC_022119	A	6	6	767837	767842	100 %	0 %	0 %	0 %	532424587
17057	NC_022119	TGC	2	6	767865	767870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424587
17058	NC_022119	CAT	2	6	767881	767886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424587
17059	NC_022119	AAG	2	6	767891	767896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424587
17060	NC_022119	AAG	2	6	767903	767908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424587
17061	NC_022119	GTC	2	6	767915	767920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424587
17062	NC_022119	AGA	2	6	767948	767953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424587
17063	NC_022119	AGA	2	6	767958	767963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424587
17064	NC_022119	AT	3	6	767969	767974	50 %	50 %	0 %	0 %	532424587
17065	NC_022119	GCA	2	6	767995	768000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424588
17066	NC_022119	TAG	2	6	768006	768011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424588
17067	NC_022119	GAAG	2	8	768060	768067	50 %	0 %	50 %	0 %	532424588
17068	NC_022119	TTTTC	2	10	768073	768082	0 %	80 %	0 %	20 %	532424588
17069	NC_022119	GAA	2	6	768136	768141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424588
17070	NC_022119	TCTG	2	8	768171	768178	0 %	50 %	25 %	25 %	532424588
17071	NC_022119	GCT	2	6	768184	768189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424588
17072	NC_022119	GAA	2	6	768274	768279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424588
17073	NC_022119	CTT	2	6	768326	768331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424588
17074	NC_022119	TTA	2	6	768352	768357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424588
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17077	NC_022119	GCT	2	6	768393	768398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424588
17078	NC_022119	GGAG	2	8	768471	768478	25 %	0 %	75 %	0 %	532424588
17079	NC_022119	AGA	2	6	768579	768584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424588
17080	NC_022119	AGA	3	9	768669	768677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424588
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17083	NC_022119	AGA	2	6	768852	768857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424588
17084	NC_022119	GAA	2	6	768865	768870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424588
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17086	NC_022119	CAA	2	6	768908	768913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424588
17087	NC_022119	ATT	2	6	769024	769029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424588
17088	NC_022119	CAT	2	6	769059	769064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424588
17089	NC_022119	TTGC	2	8	769154	769161	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17090	NC_022119	TCC	2	6	769266	769271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424589
17091	NC_022119	TGT	2	6	769361	769366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424589
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17094	NC_022119	GGA	2	6	769475	769480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424589
17095	NC_022119	AT	3	6	769751	769756	50 %	50 %	0 %	0 %	532424589
17096	NC_022119	GAGCA	2	10	769764	769773	40 %	0 %	40 %	20 %	532424589
17097	NC_022119	TTG	2	6	769818	769823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424589
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17099	NC_022119	AAGA	2	8	770010	770017	75 %	0 %	25 %	0 %	532424589
17100	NC_022119	TGT	2	6	770021	770026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424589
17101	NC_022119	AG	3	6	770053	770058	50 %	0 %	50 %	0 %	532424589
17102	NC_022119	ATA	2	6	770140	770145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424589
17103	NC_022119	ATG	2	6	770229	770234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424589
17104	NC_022119	GAG	2	6	770256	770261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424589
17105	NC_022119	GAA	2	6	770334	770339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424589
17106	NC_022119	TTG	2	6	770348	770353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424589
17107	NC_022119	AGA	2	6	770372	770377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424589
17108	NC_022119	A	6	6	770417	770422	100 %	0 %	0 %	0 %	532424589
17109	NC_022119	G	7	7	770430	770436	0 %	0 %	100 %	0 %	532424589
17110	NC_022119	GGA	2	6	770471	770476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424589
17111	NC_022119	AC	3	6	770537	770542	50 %	0 %	0 %	50 %	532424589
17112	NC_022119	TATATT	2	12	770563	770574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424589
17113	NC_022119	CTT	2	6	770578	770583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424589
17114	NC_022119	AT	3	6	770614	770619	50 %	50 %	0 %	0 %	532424589
17115	NC_022119	GTT	2	6	770795	770800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424590
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17117	NC_022119	CTT	2	6	770862	770867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424590
17118	NC_022119	CAG	2	6	770891	770896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424590
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17120	NC_022119	TC	3	6	771072	771077	0 %	50 %	0 %	50 %	532424590
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17488	NC_022119	AGGGA	2	10	788222	788231	40 %	0 %	60 %	0 %	532424601
17489	NC_022119	AGAA	2	8	788360	788367	75 %	0 %	25 %	0 %	532424601
17490	NC_022119	TCA	2	6	788378	788383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424601
17491	NC_022119	G	6	6	788401	788406	0 %	0 %	100 %	0 %	532424601
17492	NC_022119	GCT	2	6	788481	788486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424601
17493	NC_022119	CAT	2	6	788547	788552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424601
17494	NC_022119	ACT	2	6	788565	788570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424601
17495	NC_022119	G	6	6	788621	788626	0 %	0 %	100 %	0 %	532424601
17496	NC_022119	TTA	2	6	788685	788690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424601
17497	NC_022119	A	6	6	788929	788934	100 %	0 %	0 %	0 %	532424601
17498	NC_022119	GT	3	6	789009	789014	0 %	50 %	50 %	0 %	532424602
17499	NC_022119	TTC	2	6	789042	789047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424602
17500	NC_022119	A	7	7	789318	789324	100 %	0 %	0 %	0 %	532424602

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