MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/13-96

Total Repeats: 22984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_022119	TTA	2	6	721369	721374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424548
16002	NC_022119	AG	3	6	721382	721387	50 %	0 %	50 %	0 %	532424548
16003	NC_022119	GCTA	2	8	721437	721444	25 %	25 %	25 %	25 %	532424548
16004	NC_022119	GA	3	6	721462	721467	50 %	0 %	50 %	0 %	532424548
16005	NC_022119	GAA	2	6	721478	721483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424548
16006	NC_022119	GCA	2	6	721490	721495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16007	NC_022119	GAG	2	6	721509	721514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16008	NC_022119	GCGTA	2	10	721533	721542	20 %	20 %	40 %	20 %	532424549
16009	NC_022119	TCT	2	6	721611	721616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424549
16010	NC_022119	CTT	2	6	721648	721653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424549
16011	NC_022119	TAA	3	9	721678	721686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424549
16012	NC_022119	AAT	2	6	721736	721741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424549
16013	NC_022119	CATG	2	8	721756	721763	25 %	25 %	25 %	25 %	532424549
16014	NC_022119	TATCCA	2	12	721768	721779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424549
16015	NC_022119	A	6	6	721800	721805	100 %	0 %	0 %	0 %	532424549
16016	NC_022119	AGAT	2	8	721808	721815	50 %	25 %	25 %	0 %	532424549
16017	NC_022119	GAA	2	6	721888	721893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424549
16018	NC_022119	TATGG	2	10	721898	721907	20 %	40 %	40 %	0 %	532424549
16019	NC_022119	TC	3	6	721908	721913	0 %	50 %	0 %	50 %	532424549
16020	NC_022119	TCT	2	6	721932	721937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424549
16021	NC_022119	T	6	6	721937	721942	0 %	100 %	0 %	0 %	532424549
16022	NC_022119	GAA	2	6	722011	722016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424549
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16024	NC_022119	TGT	2	6	722100	722105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424549
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16026	NC_022119	TTTCG	2	10	722182	722191	0 %	60 %	20 %	20 %	532424549
16027	NC_022119	TGA	2	6	722205	722210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424549
16028	NC_022119	TG	3	6	722252	722257	0 %	50 %	50 %	0 %	532424549
16029	NC_022119	GTCT	2	8	722299	722306	0 %	50 %	25 %	25 %	532424549
16030	NC_022119	CAA	2	6	722362	722367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424549
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16032	NC_022119	TCT	2	6	722382	722387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424549
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16034	NC_022119	A	6	6	722395	722400	100 %	0 %	0 %	0 %	532424549
16035	NC_022119	TAA	2	6	722452	722457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424549
16036	NC_022119	GAG	2	6	722467	722472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424549
16037	NC_022119	TTTG	2	8	722506	722513	0 %	75 %	25 %	0 %	532424549
16038	NC_022119	CCTT	2	8	722529	722536	0 %	50 %	0 %	50 %	532424549
16039	NC_022119	CTT	3	9	722612	722620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424549
16040	NC_022119	GTTT	2	8	722644	722651	0 %	75 %	25 %	0 %	532424549
16041	NC_022119	TAA	2	6	722692	722697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424549
16042	NC_022119	A	6	6	722707	722712	100 %	0 %	0 %	0 %	532424549
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16045	NC_022119	AAC	2	6	722888	722893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424549
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16047	NC_022119	T	7	7	722953	722959	0 %	100 %	0 %	0 %	532424550
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16052	NC_022119	ATT	2	6	723125	723130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424550
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16054	NC_022119	T	6	6	723220	723225	0 %	100 %	0 %	0 %	532424550
16055	NC_022119	GTC	2	6	723254	723259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424550
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16057	NC_022119	AG	3	6	723305	723310	50 %	0 %	50 %	0 %	532424550
16058	NC_022119	T	6	6	723334	723339	0 %	100 %	0 %	0 %	532424550
16059	NC_022119	ATT	2	6	723347	723352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424550
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16061	NC_022119	T	6	6	723402	723407	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16062	NC_022119	T	6	6	723425	723430	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16063	NC_022119	ATC	2	6	723509	723514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424551
16064	NC_022119	T	7	7	723522	723528	0 %	100 %	0 %	0 %	532424551
16065	NC_022119	ATG	2	6	723554	723559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424551
16066	NC_022119	A	6	6	723593	723598	100 %	0 %	0 %	0 %	532424551
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16072	NC_022119	TGCTT	2	10	723858	723867	0 %	60 %	20 %	20 %	532424551
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16099	NC_022119	A	6	6	724954	724959	100 %	0 %	0 %	0 %	532424551
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16110	NC_022119	AG	3	6	725310	725315	50 %	0 %	50 %	0 %	532424551
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16122	NC_022119	CCTT	2	8	725828	725835	0 %	50 %	0 %	50 %	532424552
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16129	NC_022119	T	6	6	726207	726212	0 %	100 %	0 %	0 %	532424552
16130	NC_022119	TCA	2	6	726214	726219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424552
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16142	NC_022119	TTCG	2	8	726762	726769	0 %	50 %	25 %	25 %	532424552
16143	NC_022119	T	6	6	726836	726841	0 %	100 %	0 %	0 %	532424552
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16232	NC_022119	GCTT	2	8	730881	730888	0 %	50 %	25 %	25 %	532424554
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16236	NC_022119	TTG	2	6	731098	731103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424554
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16239	NC_022119	AG	3	6	731152	731157	50 %	0 %	50 %	0 %	532424555
16240	NC_022119	TCT	2	6	731171	731176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424555
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16243	NC_022119	TCT	2	6	731219	731224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424555
16244	NC_022119	T	7	7	731239	731245	0 %	100 %	0 %	0 %	532424555
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16493	NC_022119	AAG	2	6	742067	742072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424561
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16495	NC_022119	CTT	2	6	742136	742141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424561
16496	NC_022119	AAG	2	6	742154	742159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424561
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