MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/13-96

Total Repeats: 22984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_022119	TCC	2	6	699395	699400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424534
15502	NC_022119	TGC	2	6	699428	699433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424534
15503	NC_022119	TCTT	2	8	699513	699520	0 %	75 %	0 %	25 %	532424534
15504	NC_022119	CTT	2	6	699540	699545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424534
15505	NC_022119	AG	3	6	699549	699554	50 %	0 %	50 %	0 %	532424534
15506	NC_022119	ATA	2	6	699579	699584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424534
15507	NC_022119	TGCG	2	8	699612	699619	0 %	25 %	50 %	25 %	532424534
15508	NC_022119	CTAG	2	8	699675	699682	25 %	25 %	25 %	25 %	532424534
15509	NC_022119	AAC	2	6	699712	699717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424534
15510	NC_022119	AT	3	6	699735	699740	50 %	50 %	0 %	0 %	532424534
15511	NC_022119	TCCT	2	8	699800	699807	0 %	50 %	0 %	50 %	532424534
15512	NC_022119	GAA	2	6	699825	699830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424534
15513	NC_022119	GTA	2	6	699836	699841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424534
15514	NC_022119	TTA	2	6	699861	699866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424534
15515	NC_022119	AGG	2	6	699876	699881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424534
15516	NC_022119	AGC	2	6	699896	699901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424534
15517	NC_022119	TTG	2	6	699906	699911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424534
15518	NC_022119	CTT	2	6	699919	699924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424534
15519	NC_022119	AAG	2	6	700042	700047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424534
15520	NC_022119	AAG	2	6	700072	700077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424534
15521	NC_022119	TTG	2	6	700127	700132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424534
15522	NC_022119	CAG	3	9	700198	700206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424534
15523	NC_022119	T	6	6	700216	700221	0 %	100 %	0 %	0 %	532424534
15524	NC_022119	TTG	2	6	700269	700274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424534
15525	NC_022119	TAGT	2	8	700287	700294	25 %	50 %	25 %	0 %	532424534
15526	NC_022119	ATC	2	6	700307	700312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424534
15527	NC_022119	A	6	6	700331	700336	100 %	0 %	0 %	0 %	532424534
15528	NC_022119	T	6	6	700343	700348	0 %	100 %	0 %	0 %	532424534
15529	NC_022119	GTTC	2	8	700351	700358	0 %	50 %	25 %	25 %	532424534
15530	NC_022119	CT	3	6	700665	700670	0 %	50 %	0 %	50 %	532424534
15531	NC_022119	TGCTTG	2	12	700676	700687	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	532424534
15532	NC_022119	AAG	2	6	700689	700694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424534
15533	NC_022119	ACC	2	6	700785	700790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532424534
15534	NC_022119	TG	3	6	700863	700868	0 %	50 %	50 %	0 %	532424534
15535	NC_022119	TAC	2	6	700873	700878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424534
15536	NC_022119	TCC	2	6	700884	700889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424534
15537	NC_022119	CTT	2	6	700948	700953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424534
15538	NC_022119	ATT	2	6	700988	700993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424534
15539	NC_022119	TCCA	2	8	701001	701008	25 %	25 %	0 %	50 %	532424534
15540	NC_022119	TGCT	2	8	701125	701132	0 %	50 %	25 %	25 %	532424534
15541	NC_022119	TG	3	6	701160	701165	0 %	50 %	50 %	0 %	532424534
15542	NC_022119	TCA	2	6	701175	701180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424534
15543	NC_022119	ATA	2	6	701183	701188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424534
15544	NC_022119	AGCTG	2	10	701247	701256	20 %	20 %	40 %	20 %	532424534
15545	NC_022119	CTT	2	6	701272	701277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424534
15546	NC_022119	TTCT	2	8	701294	701301	0 %	75 %	0 %	25 %	532424534
15547	NC_022119	CTG	2	6	701387	701392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424534
15548	NC_022119	TGC	2	6	701414	701419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424534
15549	NC_022119	TCT	2	6	701460	701465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424534
15550	NC_022119	TAC	2	6	701539	701544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424534
15551	NC_022119	CTG	2	6	701557	701562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424534
15552	NC_022119	TGC	2	6	701569	701574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424534
15553	NC_022119	CTT	2	6	701586	701591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424534
15554	NC_022119	C	6	6	701593	701598	0 %	0 %	0 %	100 %	532424534
15555	NC_022119	TCC	2	6	701603	701608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424534
15556	NC_022119	CTC	2	6	701711	701716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424534
15557	NC_022119	TGGC	2	8	701725	701732	0 %	25 %	50 %	25 %	532424534
15558	NC_022119	TAAA	2	8	701779	701786	75 %	25 %	0 %	0 %	532424534
15559	NC_022119	AGT	2	6	701801	701806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424534
15560	NC_022119	AAG	2	6	701827	701832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424534
15561	NC_022119	AAAAC	2	10	701838	701847	80 %	0 %	0 %	20 %	532424534
15562	NC_022119	A	6	6	701879	701884	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15563	NC_022119	T	7	7	701886	701892	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15564	NC_022119	TGTT	2	8	701896	701903	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15565	NC_022119	TAA	2	6	701972	701977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424535
15566	NC_022119	AGA	2	6	702011	702016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424535
15567	NC_022119	ATT	2	6	702017	702022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424535
15568	NC_022119	A	6	6	702076	702081	100 %	0 %	0 %	0 %	532424535
15569	NC_022119	ATG	2	6	702136	702141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424535
15570	NC_022119	AGTT	2	8	702160	702167	25 %	50 %	25 %	0 %	532424535
15571	NC_022119	TCT	2	6	702177	702182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424535
15572	NC_022119	TTGG	2	8	702297	702304	0 %	50 %	50 %	0 %	532424535
15573	NC_022119	TC	3	6	702308	702313	0 %	50 %	0 %	50 %	532424535
15574	NC_022119	CAA	2	6	702357	702362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424535
15575	NC_022119	TCC	2	6	702365	702370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424535
15576	NC_022119	TTTG	2	8	702398	702405	0 %	75 %	25 %	0 %	532424535
15577	NC_022119	ACT	2	6	702414	702419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424535
15578	NC_022119	TAG	2	6	702421	702426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424535
15579	NC_022119	TCCT	2	8	702478	702485	0 %	50 %	0 %	50 %	532424535
15580	NC_022119	CAAT	2	8	702548	702555	50 %	25 %	0 %	25 %	532424535
15581	NC_022119	GAT	2	6	702692	702697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424535
15582	NC_022119	ATCT	2	8	702772	702779	25 %	50 %	0 %	25 %	532424535
15583	NC_022119	ATC	2	6	702786	702791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424535
15584	NC_022119	TTC	2	6	702794	702799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424535
15585	NC_022119	TC	4	8	702798	702805	0 %	50 %	0 %	50 %	532424535
15586	NC_022119	TATC	2	8	702865	702872	25 %	50 %	0 %	25 %	532424535
15587	NC_022119	TA	3	6	702906	702911	50 %	50 %	0 %	0 %	532424535
15588	NC_022119	CT	3	6	702926	702931	0 %	50 %	0 %	50 %	532424535
15589	NC_022119	TCA	2	6	702961	702966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424535
15590	NC_022119	ACT	2	6	702999	703004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424535
15591	NC_022119	AACG	2	8	703013	703020	50 %	0 %	25 %	25 %	532424535
15592	NC_022119	GC	3	6	703049	703054	0 %	0 %	50 %	50 %	532424535
15593	NC_022119	AACT	2	8	703075	703082	50 %	25 %	0 %	25 %	532424535
15594	NC_022119	TGA	2	6	703124	703129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424535
15595	NC_022119	AGG	2	6	703136	703141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424535
15596	NC_022119	GAC	2	6	703208	703213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424535
15597	NC_022119	TAA	2	6	703298	703303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424535
15598	NC_022119	AG	3	6	703349	703354	50 %	0 %	50 %	0 %	532424535
15599	NC_022119	CTT	2	6	703422	703427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424535
15600	NC_022119	T	6	6	703503	703508	0 %	100 %	0 %	0 %	532424535
15601	NC_022119	CTT	2	6	703574	703579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424535
15602	NC_022119	AGA	2	6	703582	703587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424535
15603	NC_022119	T	6	6	703609	703614	0 %	100 %	0 %	0 %	532424535
15604	NC_022119	CT	3	6	703649	703654	0 %	50 %	0 %	50 %	532424535
15605	NC_022119	CTTC	2	8	703659	703666	0 %	50 %	0 %	50 %	532424535
15606	NC_022119	GATT	2	8	703709	703716	25 %	50 %	25 %	0 %	532424535
15607	NC_022119	CTAC	2	8	703813	703820	25 %	25 %	0 %	50 %	532424535
15608	NC_022119	ACA	2	6	703844	703849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424535
15609	NC_022119	ACA	2	6	703925	703930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424535
15610	NC_022119	ATG	2	6	704137	704142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424535
15611	NC_022119	GGA	2	6	704199	704204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424535
15612	NC_022119	AGA	2	6	704237	704242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424535
15613	NC_022119	CTTC	2	8	704259	704266	0 %	50 %	0 %	50 %	532424535
15614	NC_022119	ATC	2	6	704271	704276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424535
15615	NC_022119	GGA	2	6	704280	704285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424535
15616	NC_022119	CAAG	2	8	704298	704305	50 %	0 %	25 %	25 %	532424535
15617	NC_022119	CAA	2	6	704319	704324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424535
15618	NC_022119	AAATGC	2	12	704359	704370	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532424535
15619	NC_022119	GCA	2	6	704384	704389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424535
15620	NC_022119	GTA	2	6	704400	704405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424535
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15622	NC_022119	CTAG	2	8	704457	704464	25 %	25 %	25 %	25 %	532424535
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15991	NC_022119	TTC	2	6	721098	721103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424548
15992	NC_022119	AAG	2	6	721157	721162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424548
15993	NC_022119	GAA	3	9	721186	721194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424548
15994	NC_022119	TGA	2	6	721208	721213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424548
15995	NC_022119	GA	3	6	721254	721259	50 %	0 %	50 %	0 %	532424548
15996	NC_022119	GGT	2	6	721275	721280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532424548
15997	NC_022119	GCT	2	6	721318	721323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424548
15998	NC_022119	GGT	2	6	721334	721339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532424548
15999	NC_022119	AAAG	2	8	721345	721352	75 %	0 %	25 %	0 %	532424548
16000	NC_022119	TAA	2	6	721355	721360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424548

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