MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/13-96

Total Repeats: 22984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_022119	TAAA	2	8	677450	677457	75 %	25 %	0 %	0 %	532424510
15002	NC_022119	ATG	2	6	677578	677583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424510
15003	NC_022119	AAC	2	6	677607	677612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424510
15004	NC_022119	TTG	2	6	677627	677632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424510
15005	NC_022119	TAG	2	6	677645	677650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424510
15006	NC_022119	TC	3	6	677684	677689	0 %	50 %	0 %	50 %	532424510
15007	NC_022119	CTTTT	2	10	677708	677717	0 %	80 %	0 %	20 %	532424510
15008	NC_022119	AGA	3	9	677783	677791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424511
15009	NC_022119	CTC	2	6	677809	677814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424511
15010	NC_022119	TTA	2	6	677866	677871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424511
15011	NC_022119	A	6	6	677922	677927	100 %	0 %	0 %	0 %	532424511
15012	NC_022119	ACCAT	2	10	677965	677974	40 %	20 %	0 %	40 %	532424511
15013	NC_022119	TC	3	6	677997	678002	0 %	50 %	0 %	50 %	532424511
15014	NC_022119	GCT	2	6	678059	678064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424511
15015	NC_022119	GAA	2	6	678120	678125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424511
15016	NC_022119	AACT	2	8	678159	678166	50 %	25 %	0 %	25 %	532424511
15017	NC_022119	ATC	2	6	678209	678214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424512
15018	NC_022119	GGA	2	6	678227	678232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424512
15019	NC_022119	A	7	7	678255	678261	100 %	0 %	0 %	0 %	532424512
15020	NC_022119	TC	3	6	678271	678276	0 %	50 %	0 %	50 %	532424512
15021	NC_022119	TCG	2	6	678294	678299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424512
15022	NC_022119	A	6	6	678370	678375	100 %	0 %	0 %	0 %	532424512
15023	NC_022119	A	6	6	678392	678397	100 %	0 %	0 %	0 %	532424512
15024	NC_022119	CAAA	2	8	678447	678454	75 %	0 %	0 %	25 %	532424512
15025	NC_022119	CGC	2	6	678465	678470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532424512
15026	NC_022119	A	6	6	678488	678493	100 %	0 %	0 %	0 %	532424512
15027	NC_022119	A	6	6	678506	678511	100 %	0 %	0 %	0 %	532424512
15028	NC_022119	CAG	2	6	678650	678655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424512
15029	NC_022119	TCT	2	6	678718	678723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424512
15030	NC_022119	CTA	2	6	678741	678746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424512
15031	NC_022119	ACA	2	6	678763	678768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424512
15032	NC_022119	TCTT	2	8	678803	678810	0 %	75 %	0 %	25 %	532424512
15033	NC_022119	TGA	2	6	678872	678877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424512
15034	NC_022119	TTCTC	2	10	678900	678909	0 %	60 %	0 %	40 %	532424513
15035	NC_022119	TCT	2	6	678921	678926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424513
15036	NC_022119	CT	3	6	678925	678930	0 %	50 %	0 %	50 %	532424513
15037	NC_022119	CT	3	6	678978	678983	0 %	50 %	0 %	50 %	532424513
15038	NC_022119	TCA	2	6	679009	679014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424513
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15040	NC_022119	CTG	2	6	679090	679095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424513
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15042	NC_022119	A	7	7	679167	679173	100 %	0 %	0 %	0 %	532424513
15043	NC_022119	A	6	6	679190	679195	100 %	0 %	0 %	0 %	532424513
15044	NC_022119	TC	3	6	679199	679204	0 %	50 %	0 %	50 %	532424513
15045	NC_022119	CT	3	6	679210	679215	0 %	50 %	0 %	50 %	532424513
15046	NC_022119	ATC	2	6	679232	679237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424513
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15050	NC_022119	ACA	2	6	679386	679391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424513
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15052	NC_022119	A	7	7	679534	679540	100 %	0 %	0 %	0 %	532424513
15053	NC_022119	TC	3	6	679577	679582	0 %	50 %	0 %	50 %	532424513
15054	NC_022119	CTC	2	6	679594	679599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424513
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15056	NC_022119	CCTT	2	8	679720	679727	0 %	50 %	0 %	50 %	532424513
15057	NC_022119	TC	3	6	679799	679804	0 %	50 %	0 %	50 %	532424513
15058	NC_022119	AAC	2	6	679808	679813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424513
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15061	NC_022119	A	7	7	679879	679885	100 %	0 %	0 %	0 %	532424513
15062	NC_022119	TG	3	6	679924	679929	0 %	50 %	50 %	0 %	532424513
15063	NC_022119	AAAG	2	8	679981	679988	75 %	0 %	25 %	0 %	532424513
15064	NC_022119	CTT	2	6	679991	679996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424513
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15067	NC_022119	A	7	7	680077	680083	100 %	0 %	0 %	0 %	532424513
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15069	NC_022119	TAT	2	6	680197	680202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424514
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15088	NC_022119	A	8	8	681068	681075	100 %	0 %	0 %	0 %	532424515
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15091	NC_022119	CGT	2	6	681240	681245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424515
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15093	NC_022119	TAA	2	6	681261	681266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424515
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15095	NC_022119	CTG	2	6	681353	681358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15096	NC_022119	AACT	2	8	681377	681384	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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15103	NC_022119	ATC	2	6	681650	681655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424516
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15106	NC_022119	CTT	2	6	681731	681736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424516
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15109	NC_022119	AGCG	2	8	682006	682013	25 %	0 %	50 %	25 %	532424517
15110	NC_022119	AAG	2	6	682056	682061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424517
15111	NC_022119	TCC	2	6	682096	682101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424517
15112	NC_022119	GTC	2	6	682144	682149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424517
15113	NC_022119	ATCT	2	8	682197	682204	25 %	50 %	0 %	25 %	532424517
15114	NC_022119	AC	3	6	682228	682233	50 %	0 %	0 %	50 %	532424517
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15117	NC_022119	TTTC	2	8	682299	682306	0 %	75 %	0 %	25 %	532424517
15118	NC_022119	TCT	2	6	682307	682312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424517
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15121	NC_022119	CTC	2	6	682376	682381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424517
15122	NC_022119	AGAA	2	8	682384	682391	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15123	NC_022119	AG	3	6	682402	682407	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15124	NC_022119	ACC	2	6	682422	682427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15125	NC_022119	GAA	2	6	682484	682489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15127	NC_022119	TTC	2	6	682583	682588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15165	NC_022119	AAC	2	6	684239	684244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15240	NC_022119	A	6	6	687718	687723	100 %	0 %	0 %	0 %	532424523
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15246	NC_022119	TGC	2	6	687970	687975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424523
15247	NC_022119	TA	3	6	688018	688023	50 %	50 %	0 %	0 %	532424523
15248	NC_022119	ATT	2	6	688071	688076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424523
15249	NC_022119	GTT	2	6	688088	688093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424523
15250	NC_022119	AGA	2	6	688099	688104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424523
15251	NC_022119	AAT	2	6	688157	688162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424523
15252	NC_022119	A	6	6	688176	688181	100 %	0 %	0 %	0 %	532424523
15253	NC_022119	AGA	2	6	688264	688269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424523
15254	NC_022119	CT	4	8	688302	688309	0 %	50 %	0 %	50 %	532424523
15255	NC_022119	CGAA	2	8	688328	688335	50 %	0 %	25 %	25 %	532424523
15256	NC_022119	CTT	2	6	688364	688369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424523
15257	NC_022119	TAA	2	6	688462	688467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424523
15258	NC_022119	A	6	6	688505	688510	100 %	0 %	0 %	0 %	532424523
15259	NC_022119	ACA	2	6	688559	688564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424523
15260	NC_022119	ACCT	2	8	688566	688573	25 %	25 %	0 %	50 %	532424523
15261	NC_022119	TTG	2	6	688585	688590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424523
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15263	NC_022119	A	6	6	688625	688630	100 %	0 %	0 %	0 %	532424523
15264	NC_022119	AGC	2	6	688677	688682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424523
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15268	NC_022119	ATT	2	6	688801	688806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424523
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15271	NC_022119	CTT	2	6	688988	688993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424523
15272	NC_022119	GAACG	2	10	689118	689127	40 %	0 %	40 %	20 %	532424523
15273	NC_022119	CAG	2	6	689140	689145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424523
15274	NC_022119	TTA	2	6	689148	689153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424523
15275	NC_022119	GCATCA	2	12	689197	689208	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	532424523
15276	NC_022119	TCC	2	6	689350	689355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424524
15277	NC_022119	CTT	2	6	689420	689425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424524
15278	NC_022119	CAA	2	6	689588	689593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424524
15279	NC_022119	CTA	2	6	689645	689650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424524
15280	NC_022119	AGG	2	6	689667	689672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424524
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15282	NC_022119	ACT	2	6	689723	689728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424524
15283	NC_022119	ATGC	2	8	689741	689748	25 %	25 %	25 %	25 %	532424524
15284	NC_022119	CAG	3	9	689808	689816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424524
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15291	NC_022119	GAA	2	6	690044	690049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424524
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15294	NC_022119	A	6	6	690104	690109	100 %	0 %	0 %	0 %	532424524
15295	NC_022119	CT	4	8	690155	690162	0 %	50 %	0 %	50 %	532424524
15296	NC_022119	ATA	2	6	690192	690197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424524
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15299	NC_022119	ACG	2	6	690385	690390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424524
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15302	NC_022119	GTT	2	6	690576	690581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15303	NC_022119	TAA	2	6	690611	690616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15304	NC_022119	TGA	2	6	690620	690625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424525
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15307	NC_022119	TCT	2	6	690752	690757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424525
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15309	NC_022119	TC	3	6	690852	690857	0 %	50 %	0 %	50 %	532424525
15310	NC_022119	AGC	2	6	690895	690900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424525
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15319	NC_022119	CAT	2	6	691300	691305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424525
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15321	NC_022119	A	6	6	691336	691341	100 %	0 %	0 %	0 %	532424526
15322	NC_022119	ACAA	2	8	691476	691483	75 %	0 %	0 %	25 %	532424526
15323	NC_022119	GAC	2	6	691535	691540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424526
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15326	NC_022119	AGT	2	6	691629	691634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424526
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15328	NC_022119	TCA	2	6	691762	691767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424526
15329	NC_022119	CTT	2	6	691793	691798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424526
15330	NC_022119	T	6	6	691797	691802	0 %	100 %	0 %	0 %	532424526
15331	NC_022119	AT	3	6	691809	691814	50 %	50 %	0 %	0 %	532424526
15332	NC_022119	ACAAA	2	10	691827	691836	80 %	0 %	0 %	20 %	532424526
15333	NC_022119	CTT	2	6	691847	691852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424526
15334	NC_022119	T	7	7	691851	691857	0 %	100 %	0 %	0 %	532424526
15335	NC_022119	GGC	2	6	691954	691959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532424526
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15340	NC_022119	A	6	6	692174	692179	100 %	0 %	0 %	0 %	532424527
15341	NC_022119	GCTCC	2	10	692190	692199	0 %	20 %	20 %	60 %	532424527
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15343	NC_022119	GAA	2	6	692249	692254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424527
15344	NC_022119	TGG	2	6	692269	692274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532424527
15345	NC_022119	ATG	2	6	692357	692362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424527
15346	NC_022119	GAT	2	6	692364	692369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424527
15347	NC_022119	A	7	7	692386	692392	100 %	0 %	0 %	0 %	532424527
15348	NC_022119	CTC	2	6	692442	692447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424527
15349	NC_022119	AGC	3	9	692502	692510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424527
15350	NC_022119	CTC	2	6	692561	692566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424528
15351	NC_022119	TCCA	2	8	692706	692713	25 %	25 %	0 %	50 %	532424528
15352	NC_022119	AAC	2	6	692766	692771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424528
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15355	NC_022119	CAT	2	6	692969	692974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424528
15356	NC_022119	TCG	2	6	693006	693011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424528
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15358	NC_022119	GATA	2	8	693036	693043	50 %	25 %	25 %	0 %	532424528
15359	NC_022119	TTG	2	6	693054	693059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424528
15360	NC_022119	AGC	2	6	693060	693065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424528
15361	NC_022119	C	6	6	693065	693070	0 %	0 %	0 %	100 %	532424528
15362	NC_022119	CCGCT	2	10	693072	693081	0 %	20 %	20 %	60 %	532424528
15363	NC_022119	TTGC	2	8	693155	693162	0 %	50 %	25 %	25 %	532424528
15364	NC_022119	AAT	2	6	693174	693179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424528
15365	NC_022119	TC	3	6	693201	693206	0 %	50 %	0 %	50 %	532424528
15366	NC_022119	TCC	3	9	693322	693330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424528
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15368	NC_022119	AAG	2	6	693377	693382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424528
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15490	NC_022119	CAG	2	6	698545	698550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424533
15491	NC_022119	AGT	2	6	698593	698598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424533
15492	NC_022119	TTC	2	6	698647	698652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424533
15493	NC_022119	CAA	2	6	698695	698700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424533
15494	NC_022119	GCA	2	6	699005	699010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424533
15495	NC_022119	TCT	2	6	699101	699106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424533
15496	NC_022119	TTCT	2	8	699134	699141	0 %	75 %	0 %	25 %	532424533
15497	NC_022119	TA	3	6	699188	699193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15498	NC_022119	T	8	8	699203	699210	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15499	NC_022119	GCT	2	6	699228	699233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424534
15500	NC_022119	TTG	2	6	699326	699331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424534

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