MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/13-96

Total Repeats: 22984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_022119	TCT	2	6	654756	654761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424497
14502	NC_022119	AT	3	6	654804	654809	50 %	50 %	0 %	0 %	532424497
14503	NC_022119	TCA	2	6	654851	654856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424497
14504	NC_022119	AGA	2	6	654860	654865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424497
14505	NC_022119	A	7	7	654869	654875	100 %	0 %	0 %	0 %	532424497
14506	NC_022119	TC	3	6	654913	654918	0 %	50 %	0 %	50 %	532424497
14507	NC_022119	CTG	2	6	654931	654936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424497
14508	NC_022119	T	6	6	654944	654949	0 %	100 %	0 %	0 %	532424497
14509	NC_022119	GTT	2	6	654966	654971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424497
14510	NC_022119	ACT	2	6	654988	654993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424497
14511	NC_022119	TCA	2	6	655004	655009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424497
14512	NC_022119	AG	3	6	655053	655058	50 %	0 %	50 %	0 %	532424497
14513	NC_022119	GAA	2	6	655122	655127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424497
14514	NC_022119	GAT	2	6	655443	655448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424497
14515	NC_022119	GA	3	6	655657	655662	50 %	0 %	50 %	0 %	532424497
14516	NC_022119	TAT	2	6	655673	655678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424497
14517	NC_022119	TTTG	2	8	655691	655698	0 %	75 %	25 %	0 %	532424497
14518	NC_022119	ATT	2	6	655782	655787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424497
14519	NC_022119	GT	3	6	655993	655998	0 %	50 %	50 %	0 %	532424497
14520	NC_022119	TC	3	6	656023	656028	0 %	50 %	0 %	50 %	532424497
14521	NC_022119	TCCT	2	8	656066	656073	0 %	50 %	0 %	50 %	532424497
14522	NC_022119	ATT	2	6	656116	656121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14523	NC_022119	CA	3	6	656128	656133	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14524	NC_022119	A	6	6	656206	656211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14525	NC_022119	CAGG	2	8	656230	656237	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14526	NC_022119	TTC	2	6	656278	656283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14527	NC_022119	AAT	2	6	656371	656376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14528	NC_022119	TCC	2	6	656495	656500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14529	NC_022119	GGC	2	6	656559	656564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532424498
14530	NC_022119	GTT	2	6	656709	656714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424498
14531	NC_022119	A	7	7	656725	656731	100 %	0 %	0 %	0 %	532424498
14532	NC_022119	AGA	2	6	656735	656740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424498
14533	NC_022119	TTGG	2	8	656792	656799	0 %	50 %	50 %	0 %	532424498
14534	NC_022119	GCT	2	6	656826	656831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424498
14535	NC_022119	ATT	2	6	656859	656864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424498
14536	NC_022119	AC	3	6	656905	656910	50 %	0 %	0 %	50 %	532424498
14537	NC_022119	CTT	2	6	656914	656919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424498
14538	NC_022119	GCT	2	6	656949	656954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424498
14539	NC_022119	A	6	6	657127	657132	100 %	0 %	0 %	0 %	532424498
14540	NC_022119	CTT	2	6	657147	657152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424498
14541	NC_022119	GAA	2	6	657264	657269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424498
14542	NC_022119	CT	3	6	657430	657435	0 %	50 %	0 %	50 %	532424499
14543	NC_022119	AGA	2	6	657468	657473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424499
14544	NC_022119	CAA	2	6	657511	657516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424499
14545	NC_022119	TCA	3	9	657549	657557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424499
14546	NC_022119	A	6	6	657586	657591	100 %	0 %	0 %	0 %	532424499
14547	NC_022119	ATT	2	6	657600	657605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424499
14548	NC_022119	TTA	2	6	657687	657692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424499
14549	NC_022119	A	6	6	657793	657798	100 %	0 %	0 %	0 %	532424499
14550	NC_022119	ATC	2	6	657894	657899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424499
14551	NC_022119	CAA	2	6	657907	657912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424499
14552	NC_022119	CTTTT	2	10	657915	657924	0 %	80 %	0 %	20 %	532424499
14553	NC_022119	T	7	7	657921	657927	0 %	100 %	0 %	0 %	532424499
14554	NC_022119	ATT	2	6	657942	657947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424499
14555	NC_022119	AAG	2	6	657971	657976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424499
14556	NC_022119	CTC	2	6	657979	657984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424499
14557	NC_022119	CTT	2	6	658030	658035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424499
14558	NC_022119	GAC	2	6	658060	658065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424499
14559	NC_022119	AAC	2	6	658091	658096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424499
14560	NC_022119	ACA	2	6	658201	658206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424500
14561	NC_022119	T	6	6	658219	658224	0 %	100 %	0 %	0 %	532424500
14562	NC_022119	GTT	2	6	658249	658254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424500
14563	NC_022119	ATG	2	6	658310	658315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424500
14564	NC_022119	TCA	2	6	658356	658361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424500
14565	NC_022119	CT	3	6	658418	658423	0 %	50 %	0 %	50 %	532424500
14566	NC_022119	A	7	7	658515	658521	100 %	0 %	0 %	0 %	532424500
14567	NC_022119	A	7	7	658533	658539	100 %	0 %	0 %	0 %	532424500
14568	NC_022119	AAG	2	6	658554	658559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424500
14569	NC_022119	GAA	2	6	658586	658591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424500
14570	NC_022119	ATC	2	6	658628	658633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14571	NC_022119	GAT	2	6	658642	658647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14572	NC_022119	T	6	6	658770	658775	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14573	NC_022119	A	9	9	658810	658818	100 %	0 %	0 %	0 %	532424501
14574	NC_022119	GTC	2	6	658886	658891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424501
14575	NC_022119	TTC	2	6	658924	658929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424501
14576	NC_022119	ACT	2	6	658954	658959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424501
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14578	NC_022119	T	6	6	659102	659107	0 %	100 %	0 %	0 %	532424501
14579	NC_022119	GAA	2	6	659182	659187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424501
14580	NC_022119	A	6	6	659468	659473	100 %	0 %	0 %	0 %	532424501
14581	NC_022119	TTTA	2	8	659541	659548	25 %	75 %	0 %	0 %	532424501
14582	NC_022119	GAA	2	6	659578	659583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424501
14583	NC_022119	AGA	2	6	659586	659591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424501
14584	NC_022119	AGA	2	6	659652	659657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424501
14585	NC_022119	AATC	2	8	659658	659665	50 %	25 %	0 %	25 %	532424501
14586	NC_022119	CAA	2	6	659737	659742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424501
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14588	NC_022119	TAAA	2	8	659841	659848	75 %	25 %	0 %	0 %	532424501
14589	NC_022119	A	6	6	659846	659851	100 %	0 %	0 %	0 %	532424501
14590	NC_022119	AAC	2	6	659856	659861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424501
14591	NC_022119	TG	3	6	659869	659874	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14592	NC_022119	GGA	3	9	659875	659883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424502
14593	NC_022119	TCC	2	6	659918	659923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424502
14594	NC_022119	ATA	2	6	660080	660085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424502
14595	NC_022119	CTT	2	6	660123	660128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424502
14596	NC_022119	CTA	2	6	660159	660164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424502
14597	NC_022119	TAC	2	6	660169	660174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424502
14598	NC_022119	A	6	6	660215	660220	100 %	0 %	0 %	0 %	532424502
14599	NC_022119	CTT	2	6	660223	660228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424502
14600	NC_022119	ATG	2	6	660233	660238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424502
14601	NC_022119	ACT	2	6	660344	660349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424502
14602	NC_022119	CT	3	6	660400	660405	0 %	50 %	0 %	50 %	532424502
14603	NC_022119	CCT	2	6	660434	660439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424502
14604	NC_022119	TCT	2	6	660488	660493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424502
14605	NC_022119	ACC	2	6	660592	660597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532424502
14606	NC_022119	CT	3	6	660608	660613	0 %	50 %	0 %	50 %	532424502
14607	NC_022119	GAA	2	6	660676	660681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424502
14608	NC_022119	T	8	8	660698	660705	0 %	100 %	0 %	0 %	532424502
14609	NC_022119	GAA	2	6	660706	660711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424502
14610	NC_022119	ATT	2	6	660800	660805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424502
14611	NC_022119	GCC	2	6	660837	660842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532424502
14612	NC_022119	CCT	2	6	660849	660854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424502
14613	NC_022119	GAT	2	6	660868	660873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424502
14614	NC_022119	GAG	2	6	660932	660937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424502
14615	NC_022119	TAG	2	6	660959	660964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424502
14616	NC_022119	GAA	2	6	661015	661020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424502
14617	NC_022119	TCG	2	6	661023	661028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424502
14618	NC_022119	ATC	2	6	661099	661104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424502
14619	NC_022119	GAT	2	6	661174	661179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424502
14620	NC_022119	AGA	2	6	661185	661190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424502
14621	NC_022119	A	6	6	661220	661225	100 %	0 %	0 %	0 %	532424502
14622	NC_022119	A	7	7	661245	661251	100 %	0 %	0 %	0 %	532424502
14623	NC_022119	TGC	3	9	661293	661301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424502
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14871	NC_022119	GAC	2	6	671984	671989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14872	NC_022119	TCT	2	6	672079	672084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14873	NC_022119	TC	3	6	672107	672112	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14874	NC_022119	AAT	2	6	672141	672146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14875	NC_022119	TCC	2	6	672180	672185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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14878	NC_022119	ACC	2	6	672360	672365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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14880	NC_022119	GAC	2	6	672426	672431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14882	NC_022119	AATC	2	8	672462	672469	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14883	NC_022119	ACG	3	9	672516	672524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14913	NC_022119	AC	3	6	673730	673735	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14914	NC_022119	GAAT	2	8	673747	673754	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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14990	NC_022119	GTT	2	6	676957	676962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14991	NC_022119	AC	3	6	676982	676987	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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14995	NC_022119	TCA	2	6	677175	677180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424510
14996	NC_022119	TAA	2	6	677237	677242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424510
14997	NC_022119	A	6	6	677241	677246	100 %	0 %	0 %	0 %	532424510
14998	NC_022119	CT	4	8	677258	677265	0 %	50 %	0 %	50 %	532424510
14999	NC_022119	GAAC	2	8	677365	677372	50 %	0 %	25 %	25 %	532424510
15000	NC_022119	CT	3	6	677444	677449	0 %	50 %	0 %	50 %	532424510

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