MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/13-96

Total Repeats: 22984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_022119	T	6	6	564874	564879	0 %	100 %	0 %	0 %	532424405
12502	NC_022119	CCCA	2	8	564888	564895	25 %	0 %	0 %	75 %	532424405
12503	NC_022119	CTTG	2	8	564981	564988	0 %	50 %	25 %	25 %	532424405
12504	NC_022119	AGA	2	6	564991	564996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12505	NC_022119	GAAAA	2	10	565043	565052	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
12506	NC_022119	CT	3	6	565058	565063	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12507	NC_022119	GAT	2	6	565104	565109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424406
12508	NC_022119	AAC	2	6	565122	565127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424406
12509	NC_022119	CAG	2	6	565198	565203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424406
12510	NC_022119	TCA	2	6	565207	565212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424406
12511	NC_022119	CAT	2	6	565287	565292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424406
12512	NC_022119	CA	3	6	565385	565390	50 %	0 %	0 %	50 %	532424406
12513	NC_022119	AAT	2	6	565419	565424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424406
12514	NC_022119	GAT	2	6	565436	565441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424406
12515	NC_022119	C	6	6	565461	565466	0 %	0 %	0 %	100 %	532424406
12516	NC_022119	TCA	2	6	565468	565473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424406
12517	NC_022119	TGT	2	6	565493	565498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424406
12518	NC_022119	TAA	2	6	565534	565539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424406
12519	NC_022119	CGT	2	6	565571	565576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424406
12520	NC_022119	ATC	2	6	565635	565640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424406
12521	NC_022119	TCT	2	6	565648	565653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424406
12522	NC_022119	T	6	6	565740	565745	0 %	100 %	0 %	0 %	532424406
12523	NC_022119	ATCA	2	8	565809	565816	50 %	25 %	0 %	25 %	532424406
12524	NC_022119	CTA	2	6	565922	565927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424406
12525	NC_022119	A	6	6	565972	565977	100 %	0 %	0 %	0 %	532424406
12526	NC_022119	AGA	2	6	566005	566010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424406
12527	NC_022119	AGGTA	2	10	566147	566156	40 %	20 %	40 %	0 %	532424406
12528	NC_022119	CAA	2	6	566263	566268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424406
12529	NC_022119	CTC	2	6	566294	566299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424406
12530	NC_022119	CTT	2	6	566363	566368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424406
12531	NC_022119	CGTC	2	8	566370	566377	0 %	25 %	25 %	50 %	532424406
12532	NC_022119	CCA	2	6	566397	566402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532424406
12533	NC_022119	A	6	6	566404	566409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12534	NC_022119	ATT	2	6	566425	566430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12535	NC_022119	A	6	6	566431	566436	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12536	NC_022119	ACAA	2	8	566442	566449	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12537	NC_022119	ATT	2	6	566457	566462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12538	NC_022119	A	6	6	566471	566476	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12539	NC_022119	ATTTT	2	10	566480	566489	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12540	NC_022119	AAAAAT	2	12	566500	566511	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12541	NC_022119	A	6	6	566526	566531	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12542	NC_022119	TTG	2	6	566595	566600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424407
12543	NC_022119	CCT	2	6	566636	566641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424407
12544	NC_022119	AAAG	2	8	566696	566703	75 %	0 %	25 %	0 %	532424407
12545	NC_022119	CTA	2	6	566744	566749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424407
12546	NC_022119	ATC	2	6	566801	566806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424407
12547	NC_022119	AAC	2	6	566949	566954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424408
12548	NC_022119	ACA	2	6	566983	566988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424408
12549	NC_022119	TTC	2	6	566990	566995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424408
12550	NC_022119	ATCA	2	8	567131	567138	50 %	25 %	0 %	25 %	532424408
12551	NC_022119	TCC	2	6	567164	567169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424408
12552	NC_022119	GAA	2	6	567194	567199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424408
12553	NC_022119	GTT	2	6	567391	567396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424408
12554	NC_022119	CGA	2	6	567412	567417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424408
12555	NC_022119	TCA	2	6	567465	567470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424408
12556	NC_022119	ATT	2	6	567500	567505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424408
12557	NC_022119	GAG	2	6	567556	567561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424408
12558	NC_022119	T	6	6	567809	567814	0 %	100 %	0 %	0 %	532424408
12559	NC_022119	ACG	2	6	567824	567829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424408
12560	NC_022119	TCT	2	6	567855	567860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424408
12561	NC_022119	GGAA	2	8	567863	567870	50 %	0 %	50 %	0 %	532424408
12562	NC_022119	TCA	2	6	567948	567953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424408
12563	NC_022119	TTTC	2	8	568111	568118	0 %	75 %	0 %	25 %	532424408
12564	NC_022119	TCT	2	6	568119	568124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424408
12565	NC_022119	CAA	2	6	568129	568134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424408
12566	NC_022119	CTT	2	6	568150	568155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424408
12567	NC_022119	CT	3	6	568221	568226	0 %	50 %	0 %	50 %	532424408
12568	NC_022119	CGA	2	6	568274	568279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424409
12569	NC_022119	TTC	2	6	568282	568287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424409
12570	NC_022119	ATT	2	6	568297	568302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424409
12571	NC_022119	T	6	6	568329	568334	0 %	100 %	0 %	0 %	532424409
12572	NC_022119	AGA	2	6	568342	568347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424409
12573	NC_022119	T	7	7	568392	568398	0 %	100 %	0 %	0 %	532424409
12574	NC_022119	ACA	2	6	568479	568484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424409
12575	NC_022119	CAA	2	6	568548	568553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424409
12576	NC_022119	AC	3	6	568558	568563	50 %	0 %	0 %	50 %	532424409
12577	NC_022119	TCT	2	6	568580	568585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424409
12578	NC_022119	CTA	2	6	568637	568642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424409
12579	NC_022119	T	6	6	568849	568854	0 %	100 %	0 %	0 %	532424409
12580	NC_022119	ACAG	2	8	568882	568889	50 %	0 %	25 %	25 %	532424410
12581	NC_022119	TTC	2	6	568941	568946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424410
12582	NC_022119	ATA	2	6	568961	568966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424410
12583	NC_022119	TAA	3	9	568983	568991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424410
12584	NC_022119	TTAA	2	8	569047	569054	50 %	50 %	0 %	0 %	532424410
12585	NC_022119	GCA	2	6	569059	569064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424410
12586	NC_022119	CT	3	6	569148	569153	0 %	50 %	0 %	50 %	532424410
12587	NC_022119	TAA	2	6	569207	569212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424410
12588	NC_022119	CTG	2	6	569216	569221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424410
12589	NC_022119	CTG	2	6	569307	569312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424410
12590	NC_022119	GCT	3	9	569354	569362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424410
12591	NC_022119	CT	3	6	569438	569443	0 %	50 %	0 %	50 %	532424410
12592	NC_022119	AAT	2	6	569495	569500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424410
12593	NC_022119	CAG	2	6	569501	569506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424410
12594	NC_022119	A	6	6	569509	569514	100 %	0 %	0 %	0 %	532424410
12595	NC_022119	T	6	6	569526	569531	0 %	100 %	0 %	0 %	532424410
12596	NC_022119	ACA	2	6	569705	569710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424410
12597	NC_022119	AAT	2	6	569745	569750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424410
12598	NC_022119	TCT	2	6	569761	569766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424410
12599	NC_022119	TTC	2	6	569910	569915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424410
12600	NC_022119	TCT	2	6	570049	570054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424410
12601	NC_022119	AAAT	2	8	570063	570070	75 %	25 %	0 %	0 %	532424410
12602	NC_022119	C	6	6	570158	570163	0 %	0 %	0 %	100 %	532424410
12603	NC_022119	A	7	7	570173	570179	100 %	0 %	0 %	0 %	532424410
12604	NC_022119	CTT	2	6	570185	570190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424410
12605	NC_022119	GAAA	2	8	570222	570229	75 %	0 %	25 %	0 %	532424410
12606	NC_022119	CACT	2	8	570242	570249	25 %	25 %	0 %	50 %	532424410
12607	NC_022119	CTG	2	6	570272	570277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424410
12608	NC_022119	A	6	6	570339	570344	100 %	0 %	0 %	0 %	532424410
12609	NC_022119	A	6	6	570363	570368	100 %	0 %	0 %	0 %	532424410
12610	NC_022119	AAGCA	2	10	570375	570384	60 %	0 %	20 %	20 %	532424410
12611	NC_022119	TA	3	6	570408	570413	50 %	50 %	0 %	0 %	532424410
12612	NC_022119	AAG	2	6	570458	570463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424410
12613	NC_022119	C	6	6	570505	570510	0 %	0 %	0 %	100 %	532424410
12614	NC_022119	TGC	2	6	570616	570621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424410
12615	NC_022119	CTC	2	6	570675	570680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424410
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12617	NC_022119	TCT	2	6	570754	570759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424410
12618	NC_022119	AACT	2	8	570801	570808	50 %	25 %	0 %	25 %	532424410
12619	NC_022119	GAA	2	6	570886	570891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424410
12620	NC_022119	GCT	2	6	571005	571010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424410
12621	NC_022119	AC	3	6	571047	571052	50 %	0 %	0 %	50 %	532424410
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12623	NC_022119	CAT	2	6	571097	571102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424410
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