MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/13-96

Total Repeats: 22984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_022119	TCT	2	6	519615	519620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424368
11502	NC_022119	CAT	2	6	519627	519632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424368
11503	NC_022119	TCT	2	6	519674	519679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424368
11504	NC_022119	AAT	2	6	519694	519699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424368
11505	NC_022119	TCA	2	6	519732	519737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424368
11506	NC_022119	TTGC	2	8	519747	519754	0 %	50 %	25 %	25 %	532424368
11507	NC_022119	AATC	2	8	519756	519763	50 %	25 %	0 %	25 %	532424368
11508	NC_022119	AGCAC	2	10	519797	519806	40 %	0 %	20 %	40 %	532424368
11509	NC_022119	TAA	2	6	519814	519819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424368
11510	NC_022119	AAT	2	6	519908	519913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424368
11511	NC_022119	AGT	2	6	520000	520005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424368
11512	NC_022119	GAA	2	6	520032	520037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424368
11513	NC_022119	GAT	2	6	520047	520052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424368
11514	NC_022119	TTCTG	2	10	520064	520073	0 %	60 %	20 %	20 %	532424368
11515	NC_022119	AT	3	6	520123	520128	50 %	50 %	0 %	0 %	532424368
11516	NC_022119	TTG	2	6	520189	520194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424368
11517	NC_022119	CA	4	8	520239	520246	50 %	0 %	0 %	50 %	532424368
11518	NC_022119	ATCC	2	8	520282	520289	25 %	25 %	0 %	50 %	532424368
11519	NC_022119	ACT	2	6	520343	520348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424368
11520	NC_022119	AAG	2	6	520382	520387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424368
11521	NC_022119	TCA	2	6	520413	520418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424368
11522	NC_022119	TC	4	8	520431	520438	0 %	50 %	0 %	50 %	532424368
11523	NC_022119	GAT	2	6	520510	520515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424368
11524	NC_022119	CAG	2	6	520558	520563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424368
11525	NC_022119	TAG	2	6	520581	520586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424368
11526	NC_022119	ATA	2	6	520730	520735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424368
11527	NC_022119	CAG	2	6	520804	520809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424368
11528	NC_022119	GTA	2	6	520843	520848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424368
11529	NC_022119	CAACA	2	10	520882	520891	60 %	0 %	0 %	40 %	532424368
11530	NC_022119	GA	3	6	520892	520897	50 %	0 %	50 %	0 %	532424368
11531	NC_022119	CTT	2	6	520941	520946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424368
11532	NC_022119	ACA	2	6	521099	521104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424368
11533	NC_022119	CTCC	2	8	521120	521127	0 %	25 %	0 %	75 %	532424368
11534	NC_022119	T	6	6	521141	521146	0 %	100 %	0 %	0 %	532424368
11535	NC_022119	CTT	2	6	521160	521165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424368
11536	NC_022119	TTG	2	6	521194	521199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424368
11537	NC_022119	CT	3	6	521356	521361	0 %	50 %	0 %	50 %	532424368
11538	NC_022119	AAG	2	6	521403	521408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424368
11539	NC_022119	GAG	2	6	521541	521546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424368
11540	NC_022119	CTT	2	6	521618	521623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424368
11541	NC_022119	AGA	2	6	521683	521688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424368
11542	NC_022119	CTG	2	6	521694	521699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424368
11543	NC_022119	TCA	2	6	521786	521791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424368
11544	NC_022119	TAA	2	6	521821	521826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424368
11545	NC_022119	CCT	2	6	521867	521872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424368
11546	NC_022119	TCT	2	6	522054	522059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424368
11547	NC_022119	TAC	2	6	522070	522075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424368
11548	NC_022119	TGT	2	6	522260	522265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424368
11549	NC_022119	AGC	2	6	522271	522276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424368
11550	NC_022119	TTC	2	6	522277	522282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424368
11551	NC_022119	GCC	2	6	522554	522559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532424368
11552	NC_022119	AACT	2	8	522679	522686	50 %	25 %	0 %	25 %	532424368
11553	NC_022119	AGC	2	6	522697	522702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424368
11554	NC_022119	AAC	2	6	522725	522730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424368
11555	NC_022119	GA	3	6	522768	522773	50 %	0 %	50 %	0 %	532424368
11556	NC_022119	CAA	2	6	522786	522791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424368
11557	NC_022119	AAG	2	6	522852	522857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424368
11558	NC_022119	CTC	2	6	522868	522873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424368
11559	NC_022119	TTC	2	6	522881	522886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424368
11560	NC_022119	TGT	2	6	522896	522901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424368
11561	NC_022119	ATAA	2	8	523100	523107	75 %	25 %	0 %	0 %	532424368
11562	NC_022119	TTG	2	6	523110	523115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424368
11563	NC_022119	AAAG	2	8	523169	523176	75 %	0 %	25 %	0 %	532424368
11564	NC_022119	AAG	2	6	523191	523196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424368
11565	NC_022119	AAC	2	6	523219	523224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424368
11566	NC_022119	TC	3	6	523227	523232	0 %	50 %	0 %	50 %	532424368
11567	NC_022119	ACA	2	6	523253	523258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424368
11568	NC_022119	AATA	2	8	523312	523319	75 %	25 %	0 %	0 %	532424368
11569	NC_022119	TCT	2	6	523328	523333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424368
11570	NC_022119	TGC	2	6	523376	523381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424368
11571	NC_022119	GTAG	2	8	523541	523548	25 %	25 %	50 %	0 %	532424368
11572	NC_022119	CAAAGC	2	12	523558	523569	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	532424368
11573	NC_022119	AAT	3	9	523579	523587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424368
11574	NC_022119	AGC	2	6	523676	523681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11575	NC_022119	GAAG	2	8	523684	523691	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11576	NC_022119	AT	3	6	523710	523715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11577	NC_022119	AAAG	2	8	523723	523730	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11578	NC_022119	T	6	6	523771	523776	0 %	100 %	0 %	0 %	532424829
11579	NC_022119	TTGGA	2	10	523794	523803	20 %	40 %	40 %	0 %	532424829
11580	NC_022119	T	6	6	523817	523822	0 %	100 %	0 %	0 %	532424829
11581	NC_022119	ACA	2	6	523825	523830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424829
11582	NC_022119	A	7	7	523928	523934	100 %	0 %	0 %	0 %	532424829
11583	NC_022119	T	6	6	523950	523955	0 %	100 %	0 %	0 %	532424829
11584	NC_022119	A	7	7	524001	524007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11585	NC_022119	AGA	2	6	524054	524059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424369
11586	NC_022119	AAAG	2	8	524067	524074	75 %	0 %	25 %	0 %	532424369
11587	NC_022119	CAA	2	6	524123	524128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424369
11588	NC_022119	GAACT	2	10	524280	524289	40 %	20 %	20 %	20 %	532424369
11589	NC_022119	TTG	2	6	524311	524316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424369
11590	NC_022119	TCA	2	6	524384	524389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11591	NC_022119	A	7	7	524394	524400	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11592	NC_022119	CTAA	2	8	524415	524422	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11593	NC_022119	AAT	2	6	524439	524444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11594	NC_022119	ACTT	2	8	524449	524456	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11595	NC_022119	GCT	2	6	524550	524555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11596	NC_022119	CAAAA	2	10	524569	524578	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
11597	NC_022119	AGA	2	6	524627	524632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11598	NC_022119	ATA	2	6	524661	524666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11599	NC_022119	CTA	2	6	524735	524740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11600	NC_022119	TCCC	2	8	524898	524905	0 %	25 %	0 %	75 %	532424370
11601	NC_022119	CAT	3	9	524918	524926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424370
11602	NC_022119	TCG	2	6	524936	524941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424370
11603	NC_022119	TTG	2	6	525022	525027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424370
11604	NC_022119	ATT	2	6	525116	525121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424370
11605	NC_022119	GCA	2	6	525145	525150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424370
11606	NC_022119	CT	3	6	525153	525158	0 %	50 %	0 %	50 %	532424370
11607	NC_022119	ACA	2	6	525229	525234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424370
11608	NC_022119	CCT	2	6	525244	525249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424370
11609	NC_022119	ATTA	2	8	525291	525298	50 %	50 %	0 %	0 %	532424370
11610	NC_022119	A	7	7	525357	525363	100 %	0 %	0 %	0 %	532424370
11611	NC_022119	CAA	2	6	525573	525578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424370
11612	NC_022119	TAAA	2	8	525596	525603	75 %	25 %	0 %	0 %	532424370
11613	NC_022119	GTC	2	6	525662	525667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424371
11614	NC_022119	TTC	2	6	525675	525680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424371
11615	NC_022119	TTC	2	6	525696	525701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424371
11616	NC_022119	CTT	2	6	525743	525748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424371
11617	NC_022119	TCC	2	6	525749	525754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424371
11618	NC_022119	TTTC	2	8	525813	525820	0 %	75 %	0 %	25 %	532424371
11619	NC_022119	TTCT	2	8	525923	525930	0 %	75 %	0 %	25 %	532424371
11620	NC_022119	CTT	2	6	525931	525936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424371
11621	NC_022119	GTT	2	6	526006	526011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424371
11622	NC_022119	TCC	2	6	526047	526052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424371
11623	NC_022119	TGG	2	6	526100	526105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532424371
11624	NC_022119	ACA	2	6	526124	526129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424371
11625	NC_022119	CTT	2	6	526153	526158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424371
11626	NC_022119	A	6	6	526175	526180	100 %	0 %	0 %	0 %	532424371
11627	NC_022119	AGT	2	6	526213	526218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424371
11628	NC_022119	ATCT	2	8	526243	526250	25 %	50 %	0 %	25 %	532424371
11629	NC_022119	CTT	2	6	526259	526264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424371
11630	NC_022119	CAG	2	6	526408	526413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424371
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11632	NC_022119	CTT	2	6	526460	526465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424371
11633	NC_022119	TCC	2	6	526488	526493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424371
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11646	NC_022119	AGA	2	6	527223	527228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424373
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11651	NC_022119	ATTC	2	8	527374	527381	25 %	50 %	0 %	25 %	532424373
11652	NC_022119	TGC	2	6	527438	527443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424373
11653	NC_022119	GCT	2	6	527454	527459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424373
11654	NC_022119	GGAG	2	8	527478	527485	25 %	0 %	75 %	0 %	532424373
11655	NC_022119	TCA	2	6	527488	527493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424373
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11660	NC_022119	ACA	2	6	527837	527842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11661	NC_022119	CTT	2	6	527843	527848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424374
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11728	NC_022119	A	6	6	531046	531051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11729	NC_022119	TGT	2	6	531086	531091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11730	NC_022119	TTTA	2	8	531093	531100	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11731	NC_022119	CAT	2	6	531157	531162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424830
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11862	NC_022119	TTTTC	2	10	536372	536381	0 %	80 %	0 %	20 %	532424378
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11989	NC_022119	CTTCCT	2	12	542113	542124	0 %	50 %	0 %	50 %	532424385
11990	NC_022119	GCA	2	6	542181	542186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424385
11991	NC_022119	AGA	2	6	542275	542280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424385
11992	NC_022119	CT	3	6	542282	542287	0 %	50 %	0 %	50 %	532424385
11993	NC_022119	CCA	2	6	542296	542301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532424385
11994	NC_022119	TCA	2	6	542316	542321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424385
11995	NC_022119	TCT	2	6	542354	542359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424385
11996	NC_022119	TTTCT	2	10	542416	542425	0 %	80 %	0 %	20 %	532424385
11997	NC_022119	TC	3	6	542426	542431	0 %	50 %	0 %	50 %	532424385
11998	NC_022119	CT	3	6	542441	542446	0 %	50 %	0 %	50 %	532424385
11999	NC_022119	CTT	2	6	542457	542462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424385
12000	NC_022119	AGA	2	6	542471	542476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424385

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