MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/13-96

Total Repeats: 22984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_022119	A	7	7	497451	497457	100 %	0 %	0 %	0 %	532424347
11002	NC_022119	T	6	6	497490	497495	0 %	100 %	0 %	0 %	532424347
11003	NC_022119	CTC	2	6	497506	497511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424347
11004	NC_022119	CTA	2	6	497521	497526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424347
11005	NC_022119	AG	3	6	497528	497533	50 %	0 %	50 %	0 %	532424347
11006	NC_022119	TCTT	2	8	497534	497541	0 %	75 %	0 %	25 %	532424347
11007	NC_022119	TGC	2	6	497548	497553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424347
11008	NC_022119	ATG	2	6	497644	497649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424347
11009	NC_022119	TAT	2	6	497653	497658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424347
11010	NC_022119	AGC	2	6	497717	497722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424347
11011	NC_022119	TTC	2	6	497777	497782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424347
11012	NC_022119	ATTTC	2	10	497787	497796	20 %	60 %	0 %	20 %	532424347
11013	NC_022119	ATT	2	6	497827	497832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424347
11014	NC_022119	AGA	2	6	497846	497851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424347
11015	NC_022119	AGC	2	6	497864	497869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424347
11016	NC_022119	ATACT	2	10	497906	497915	40 %	40 %	0 %	20 %	532424347
11017	NC_022119	TAT	2	6	497973	497978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424347
11018	NC_022119	CCTA	2	8	498031	498038	25 %	25 %	0 %	50 %	532424347
11019	NC_022119	TC	3	6	498100	498105	0 %	50 %	0 %	50 %	532424826
11020	NC_022119	TTG	2	6	498200	498205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424826
11021	NC_022119	CAA	2	6	498212	498217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424826
11022	NC_022119	AC	3	6	498283	498288	50 %	0 %	0 %	50 %	532424826
11023	NC_022119	ATA	2	6	498302	498307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424826
11024	NC_022119	CGTTT	2	10	498308	498317	0 %	60 %	20 %	20 %	532424826
11025	NC_022119	TATCC	2	10	498347	498356	20 %	40 %	0 %	40 %	532424826
11026	NC_022119	GGA	2	6	498397	498402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424826
11027	NC_022119	TTG	2	6	498479	498484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424826
11028	NC_022119	GAAA	2	8	498537	498544	75 %	0 %	25 %	0 %	532424826
11029	NC_022119	ACT	2	6	498624	498629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424826
11030	NC_022119	CTT	2	6	498704	498709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424348
11031	NC_022119	TTC	2	6	498729	498734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424348
11032	NC_022119	CTT	2	6	498748	498753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424348
11033	NC_022119	CGT	3	9	498754	498762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424348
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11035	NC_022119	GAA	2	6	498773	498778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424348
11036	NC_022119	TC	3	6	498787	498792	0 %	50 %	0 %	50 %	532424348
11037	NC_022119	CTC	3	9	498886	498894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424348
11038	NC_022119	TTC	3	9	498911	498919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424348
11039	NC_022119	GAA	2	6	498948	498953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424348
11040	NC_022119	CGT	2	6	498984	498989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424348
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11045	NC_022119	GTT	2	6	499192	499197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424348
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11047	NC_022119	AAACTG	2	12	499238	499249	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532424348
11048	NC_022119	ATT	2	6	499250	499255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424348
11049	NC_022119	ATG	2	6	499269	499274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424348
11050	NC_022119	T	6	6	499417	499422	0 %	100 %	0 %	0 %	532424348
11051	NC_022119	TCT	2	6	499444	499449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424348
11052	NC_022119	TTC	2	6	499499	499504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424348
11053	NC_022119	TC	4	8	499593	499600	0 %	50 %	0 %	50 %	532424348
11054	NC_022119	TCA	2	6	499602	499607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424348
11055	NC_022119	TAA	2	6	499643	499648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424348
11056	NC_022119	GTC	2	6	499674	499679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424348
11057	NC_022119	CT	4	8	499718	499725	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11058	NC_022119	ACC	2	6	499771	499776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532424349
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11060	NC_022119	CTA	2	6	499860	499865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424349
11061	NC_022119	AC	3	6	499871	499876	50 %	0 %	0 %	50 %	532424349
11062	NC_022119	AGC	2	6	499995	500000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424349
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11064	NC_022119	CTT	2	6	500009	500014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424349
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11066	NC_022119	CTTA	2	8	500099	500106	25 %	50 %	0 %	25 %	532424349
11067	NC_022119	A	6	6	500150	500155	100 %	0 %	0 %	0 %	532424349
11068	NC_022119	T	6	6	500204	500209	0 %	100 %	0 %	0 %	532424349
11069	NC_022119	AGA	2	6	500414	500419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424349
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11071	NC_022119	TCGA	2	8	500616	500623	25 %	25 %	25 %	25 %	532424350
11072	NC_022119	AAT	2	6	500676	500681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424350
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11075	NC_022119	CA	3	6	500816	500821	50 %	0 %	0 %	50 %	532424350
11076	NC_022119	TGC	2	6	500844	500849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424350
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11085	NC_022119	ATA	2	6	501297	501302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424351
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11088	NC_022119	AAT	2	6	501491	501496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424351
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11093	NC_022119	CAT	2	6	501671	501676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424351
11094	NC_022119	T	6	6	501713	501718	0 %	100 %	0 %	0 %	532424351
11095	NC_022119	CGT	3	9	501761	501769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424351
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11103	NC_022119	ACA	2	6	502344	502349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424351
11104	NC_022119	GTAA	2	8	502393	502400	50 %	25 %	25 %	0 %	532424351
11105	NC_022119	AGA	2	6	502428	502433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424351
11106	NC_022119	GAT	2	6	502526	502531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424351
11107	NC_022119	ATG	2	6	502535	502540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424351
11108	NC_022119	CT	4	8	502683	502690	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11109	NC_022119	AATCT	2	10	502704	502713	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11110	NC_022119	TGA	2	6	502716	502721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11111	NC_022119	ATTT	2	8	502751	502758	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11112	NC_022119	TAACTA	2	12	502759	502770	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11113	NC_022119	AAGAAA	2	12	502772	502783	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11114	NC_022119	AAG	2	6	502892	502897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424827
11115	NC_022119	CTA	2	6	502902	502907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424827
11116	NC_022119	A	6	6	502910	502915	100 %	0 %	0 %	0 %	532424827
11117	NC_022119	CTTCT	2	10	502917	502926	0 %	60 %	0 %	40 %	532424827
11118	NC_022119	A	8	8	502931	502938	100 %	0 %	0 %	0 %	532424827
11119	NC_022119	ATCC	2	8	503005	503012	25 %	25 %	0 %	50 %	532424352
11120	NC_022119	CTG	2	6	503029	503034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424352
11121	NC_022119	TAT	2	6	503045	503050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424352
11122	NC_022119	T	8	8	503156	503163	0 %	100 %	0 %	0 %	532424352
11123	NC_022119	CTT	2	6	503233	503238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424352
11124	NC_022119	TTC	2	6	503305	503310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424352
11125	NC_022119	CTTC	2	8	503325	503332	0 %	50 %	0 %	50 %	532424352
11126	NC_022119	CTC	2	6	503336	503341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424352
11127	NC_022119	CTCG	2	8	503364	503371	0 %	25 %	25 %	50 %	532424352
11128	NC_022119	CT	3	6	503384	503389	0 %	50 %	0 %	50 %	532424352
11129	NC_022119	TCC	2	6	503409	503414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424352
11130	NC_022119	TTC	2	6	503467	503472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424352
11131	NC_022119	TAT	2	6	503483	503488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424352
11132	NC_022119	TCGT	2	8	503506	503513	0 %	50 %	25 %	25 %	532424352
11133	NC_022119	GA	3	6	503566	503571	50 %	0 %	50 %	0 %	532424352
11134	NC_022119	GCA	2	6	503577	503582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424352
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11137	NC_022119	TATT	2	8	503667	503674	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11138	NC_022119	AAG	2	6	503692	503697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11173	NC_022119	CTT	2	6	505687	505692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11213	NC_022119	CTT	2	6	507991	507996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424357
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11221	NC_022119	T	6	6	508379	508384	0 %	100 %	0 %	0 %	532424358
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11229	NC_022119	CT	3	6	508724	508729	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11230	NC_022119	AGAATA	2	12	508747	508758	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11231	NC_022119	TTTG	2	8	508761	508768	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11232	NC_022119	A	6	6	508825	508830	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11233	NC_022119	TCC	2	6	508835	508840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11234	NC_022119	TAAT	2	8	508875	508882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11235	NC_022119	A	7	7	508883	508889	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11236	NC_022119	TTC	2	6	508917	508922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11237	NC_022119	GTT	2	6	508970	508975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424359
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11239	NC_022119	TAT	2	6	509107	509112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424359
11240	NC_022119	T	6	6	509153	509158	0 %	100 %	0 %	0 %	532424359
11241	NC_022119	TCTT	2	8	509196	509203	0 %	75 %	0 %	25 %	532424359
11242	NC_022119	GAA	2	6	509224	509229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424359
11243	NC_022119	CCTTT	2	10	509313	509322	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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11245	NC_022119	T	8	8	509338	509345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11378	NC_022119	AATA	2	8	514476	514483	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11381	NC_022119	AACA	2	8	514516	514523	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11382	NC_022119	ACTA	2	8	514525	514532	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11383	NC_022119	TA	3	6	514531	514536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11493	NC_022119	AGG	2	6	519347	519352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424828
11494	NC_022119	ATC	2	6	519367	519372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424828
11495	NC_022119	TCA	2	6	519408	519413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424828
11496	NC_022119	TTC	2	6	519433	519438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424368
11497	NC_022119	GGA	2	6	519464	519469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424368
11498	NC_022119	TA	3	6	519472	519477	50 %	50 %	0 %	0 %	532424368
11499	NC_022119	AATG	2	8	519517	519524	50 %	25 %	25 %	0 %	532424368
11500	NC_022119	GTT	2	6	519581	519586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424368

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