MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/13-96

Total Repeats: 22984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_022119	GCA	2	6	475175	475180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424332
10502	NC_022119	CTG	2	6	475221	475226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424332
10503	NC_022119	CTAT	2	8	475281	475288	25 %	50 %	0 %	25 %	532424332
10504	NC_022119	AATA	2	8	475336	475343	75 %	25 %	0 %	0 %	532424332
10505	NC_022119	CTA	2	6	475347	475352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424332
10506	NC_022119	GGA	2	6	475358	475363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424332
10507	NC_022119	TTTC	2	8	475386	475393	0 %	75 %	0 %	25 %	532424332
10508	NC_022119	CAT	2	6	475404	475409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424332
10509	NC_022119	GAA	2	6	475433	475438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424332
10510	NC_022119	GAG	2	6	475443	475448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424332
10511	NC_022119	CTAT	2	8	475449	475456	25 %	50 %	0 %	25 %	532424332
10512	NC_022119	TCAAT	2	10	475472	475481	40 %	40 %	0 %	20 %	532424332
10513	NC_022119	G	7	7	475526	475532	0 %	0 %	100 %	0 %	532424332
10514	NC_022119	AGG	2	6	475546	475551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424332
10515	NC_022119	GAA	2	6	475571	475576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424332
10516	NC_022119	A	8	8	475615	475622	100 %	0 %	0 %	0 %	532424332
10517	NC_022119	CTT	2	6	475632	475637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424332
10518	NC_022119	TCCTC	2	10	475682	475691	0 %	40 %	0 %	60 %	532424332
10519	NC_022119	GGT	2	6	475877	475882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532424332
10520	NC_022119	GGA	2	6	475961	475966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424332
10521	NC_022119	ACA	2	6	475980	475985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424332
10522	NC_022119	AGA	2	6	476038	476043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424332
10523	NC_022119	TAAT	2	8	476112	476119	50 %	50 %	0 %	0 %	532424332
10524	NC_022119	TGG	3	9	476137	476145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532424332
10525	NC_022119	TC	3	6	476166	476171	0 %	50 %	0 %	50 %	532424332
10526	NC_022119	AGG	2	6	476254	476259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424332
10527	NC_022119	TGG	2	6	476263	476268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532424332
10528	NC_022119	GT	3	6	476273	476278	0 %	50 %	50 %	0 %	532424332
10529	NC_022119	GCA	2	6	476333	476338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424332
10530	NC_022119	TGG	3	9	476344	476352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532424332
10531	NC_022119	CA	3	6	476357	476362	50 %	0 %	0 %	50 %	532424332
10532	NC_022119	CGG	2	6	476382	476387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532424332
10533	NC_022119	GCA	2	6	476405	476410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424332
10534	NC_022119	TCT	2	6	476474	476479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424332
10535	NC_022119	AGC	2	6	476503	476508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424332
10536	NC_022119	TAA	2	6	476536	476541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424332
10537	NC_022119	A	6	6	476645	476650	100 %	0 %	0 %	0 %	532424332
10538	NC_022119	CTG	2	6	476719	476724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424332
10539	NC_022119	TTG	2	6	476778	476783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424332
10540	NC_022119	AAG	2	6	476787	476792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424332
10541	NC_022119	AAC	2	6	476855	476860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424332
10542	NC_022119	CTC	2	6	476869	476874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424332
10543	NC_022119	CAA	2	6	476889	476894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424332
10544	NC_022119	CTG	2	6	476907	476912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424332
10545	NC_022119	GCT	3	9	476915	476923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424332
10546	NC_022119	AGC	2	6	476932	476937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424332
10547	NC_022119	GCA	2	6	476939	476944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424332
10548	NC_022119	CAT	2	6	476952	476957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424332
10549	NC_022119	GTA	2	6	476984	476989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424332
10550	NC_022119	GGA	2	6	476990	476995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424332
10551	NC_022119	CTAT	2	8	476997	477004	25 %	50 %	0 %	25 %	532424332
10552	NC_022119	TC	3	6	477021	477026	0 %	50 %	0 %	50 %	532424332
10553	NC_022119	TCCC	2	8	477076	477083	0 %	25 %	0 %	75 %	532424332
10554	NC_022119	ATC	2	6	477085	477090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424332
10555	NC_022119	AGG	2	6	477103	477108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424332
10556	NC_022119	CCT	2	6	477159	477164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424332
10557	NC_022119	ACA	2	6	477206	477211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424332
10558	NC_022119	GAG	2	6	477225	477230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424332
10559	NC_022119	CTT	2	6	477309	477314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424332
10560	NC_022119	GGA	2	6	477356	477361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424332
10561	NC_022119	TC	3	6	477396	477401	0 %	50 %	0 %	50 %	532424332
10562	NC_022119	A	6	6	477501	477506	100 %	0 %	0 %	0 %	532424332
10563	NC_022119	GAAA	2	8	477536	477543	75 %	0 %	25 %	0 %	532424332
10564	NC_022119	TAA	2	6	477550	477555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424332
10565	NC_022119	AAT	2	6	477596	477601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424332
10566	NC_022119	TCAA	2	8	477609	477616	50 %	25 %	0 %	25 %	532424332
10567	NC_022119	ATG	2	6	477630	477635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424332
10568	NC_022119	AAATAC	2	12	477745	477756	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	532424332
10569	NC_022119	CTT	2	6	477830	477835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424332
10570	NC_022119	CTT	2	6	477837	477842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424332
10571	NC_022119	CAA	2	6	477862	477867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424332
10572	NC_022119	GTA	2	6	477912	477917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424332
10573	NC_022119	CT	4	8	477935	477942	0 %	50 %	0 %	50 %	532424332
10574	NC_022119	TG	3	6	477980	477985	0 %	50 %	50 %	0 %	532424332
10575	NC_022119	A	7	7	477998	478004	100 %	0 %	0 %	0 %	532424332
10576	NC_022119	TAA	2	6	478042	478047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424332
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10579	NC_022119	AGAA	2	8	478197	478204	75 %	0 %	25 %	0 %	532424332
10580	NC_022119	ATTA	2	8	478213	478220	50 %	50 %	0 %	0 %	532424332
10581	NC_022119	CTC	2	6	478311	478316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424332
10582	NC_022119	TCT	2	6	478329	478334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424332
10583	NC_022119	CTC	2	6	478335	478340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424332
10584	NC_022119	GGA	2	6	478379	478384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424332
10585	NC_022119	CAG	2	6	478393	478398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424332
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10587	NC_022119	GCA	2	6	478430	478435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424332
10588	NC_022119	ACT	2	6	478457	478462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424332
10589	NC_022119	TCG	2	6	478726	478731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424332
10590	NC_022119	TTG	2	6	478800	478805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424332
10591	NC_022119	CAA	2	6	478822	478827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424332
10592	NC_022119	AAT	2	6	478835	478840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424332
10593	NC_022119	GAT	2	6	478850	478855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424332
10594	NC_022119	CAA	2	6	478904	478909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424332
10595	NC_022119	CTC	2	6	478914	478919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424332
10596	NC_022119	GAA	2	6	478925	478930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424332
10597	NC_022119	TAC	2	6	478937	478942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424332
10598	NC_022119	A	7	7	479039	479045	100 %	0 %	0 %	0 %	532424332
10599	NC_022119	TTCCT	2	10	479148	479157	0 %	60 %	0 %	40 %	532424332
10600	NC_022119	ACA	3	9	479198	479206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424332
10601	NC_022119	GAAA	2	8	479225	479232	75 %	0 %	25 %	0 %	532424332
10602	NC_022119	TTC	2	6	479308	479313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424332
10603	NC_022119	GAT	2	6	479402	479407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424332
10604	NC_022119	TAA	2	6	479485	479490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424332
10605	NC_022119	TCTA	2	8	479513	479520	25 %	50 %	0 %	25 %	532424332
10606	NC_022119	CTGT	2	8	479532	479539	0 %	50 %	25 %	25 %	532424332
10607	NC_022119	CT	3	6	479652	479657	0 %	50 %	0 %	50 %	532424332
10608	NC_022119	ACTAT	2	10	479664	479673	40 %	40 %	0 %	20 %	532424332
10609	NC_022119	TCT	2	6	479727	479732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424332
10610	NC_022119	T	9	9	479844	479852	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10611	NC_022119	CAT	2	6	479875	479880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10612	NC_022119	GTT	2	6	479886	479891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10613	NC_022119	CTG	2	6	479930	479935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424333
10614	NC_022119	TGC	2	6	479940	479945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424333
10615	NC_022119	CTC	2	6	479952	479957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424333
10616	NC_022119	ATG	2	6	480052	480057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424333
10617	NC_022119	GCT	2	6	480082	480087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424333
10618	NC_022119	TAG	4	12	480144	480155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424333
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10620	NC_022119	TGA	2	6	480249	480254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424333
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10623	NC_022119	ACTA	2	8	480306	480313	50 %	25 %	0 %	25 %	532424333
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10651	NC_022119	A	6	6	481549	481554	100 %	0 %	0 %	0 %	532424333
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