MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/13-96

Total Repeats: 22984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_022119	TTA	2	6	409502	409507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424820
9002	NC_022119	T	6	6	409524	409529	0 %	100 %	0 %	0 %	532424820
9003	NC_022119	GGA	2	6	409548	409553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424820
9004	NC_022119	CTT	2	6	409559	409564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424820
9005	NC_022119	CT	3	6	409572	409577	0 %	50 %	0 %	50 %	532424820
9006	NC_022119	T	6	6	409596	409601	0 %	100 %	0 %	0 %	532424820
9007	NC_022119	TAG	2	6	409609	409614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424820
9008	NC_022119	GTA	2	6	409627	409632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424820
9009	NC_022119	ACC	2	6	409700	409705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532424820
9010	NC_022119	TCT	2	6	409752	409757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424821
9011	NC_022119	ATT	2	6	409768	409773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424821
9012	NC_022119	CTTG	2	8	409785	409792	0 %	50 %	25 %	25 %	532424821
9013	NC_022119	TAG	2	6	409820	409825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424821
9014	NC_022119	TCA	2	6	409882	409887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424821
9015	NC_022119	ACT	2	6	409899	409904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424821
9016	NC_022119	ACA	2	6	409933	409938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424821
9017	NC_022119	ACA	2	6	409944	409949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424821
9018	NC_022119	CTT	2	6	410003	410008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424280
9019	NC_022119	TCA	2	6	410014	410019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424280
9020	NC_022119	TCT	2	6	410023	410028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424280
9021	NC_022119	ACA	2	6	410077	410082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424280
9022	NC_022119	TAT	2	6	410150	410155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424280
9023	NC_022119	TCTCT	2	10	410239	410248	0 %	60 %	0 %	40 %	532424280
9024	NC_022119	AGA	2	6	410348	410353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424280
9025	NC_022119	AGA	2	6	410402	410407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424280
9026	NC_022119	TC	3	6	410425	410430	0 %	50 %	0 %	50 %	532424280
9027	NC_022119	CAC	2	6	410431	410436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532424280
9028	NC_022119	TC	3	6	410437	410442	0 %	50 %	0 %	50 %	532424280
9029	NC_022119	TA	3	6	410457	410462	50 %	50 %	0 %	0 %	532424280
9030	NC_022119	ATC	2	6	410464	410469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424280
9031	NC_022119	CT	3	6	410557	410562	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9032	NC_022119	ATAA	2	8	410583	410590	75 %	25 %	0 %	0 %	532424281
9033	NC_022119	AG	3	6	410688	410693	50 %	0 %	50 %	0 %	532424281
9034	NC_022119	CAAG	2	8	410721	410728	50 %	0 %	25 %	25 %	532424281
9035	NC_022119	ATC	2	6	410775	410780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424281
9036	NC_022119	CAG	2	6	410872	410877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424281
9037	NC_022119	CA	3	6	410902	410907	50 %	0 %	0 %	50 %	532424281
9038	NC_022119	GAA	2	6	410927	410932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424281
9039	NC_022119	ACT	2	6	410955	410960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424281
9040	NC_022119	A	6	6	411275	411280	100 %	0 %	0 %	0 %	532424822
9041	NC_022119	CAC	2	6	411288	411293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532424822
9042	NC_022119	CT	3	6	411354	411359	0 %	50 %	0 %	50 %	532424822
9043	NC_022119	T	6	6	411378	411383	0 %	100 %	0 %	0 %	532424822
9044	NC_022119	ATGC	2	8	411385	411392	25 %	25 %	25 %	25 %	532424822
9045	NC_022119	TTC	2	6	411401	411406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424822
9046	NC_022119	CT	4	8	411422	411429	0 %	50 %	0 %	50 %	532424822
9047	NC_022119	AT	3	6	411444	411449	50 %	50 %	0 %	0 %	532424822
9048	NC_022119	TTCT	2	8	411470	411477	0 %	75 %	0 %	25 %	532424822
9049	NC_022119	TTC	2	6	411506	411511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424282
9050	NC_022119	CT	3	6	411524	411529	0 %	50 %	0 %	50 %	532424282
9051	NC_022119	TC	3	6	411551	411556	0 %	50 %	0 %	50 %	532424282
9052	NC_022119	A	6	6	411558	411563	100 %	0 %	0 %	0 %	532424282
9053	NC_022119	CTT	3	9	411571	411579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424282
9054	NC_022119	CACT	2	8	411636	411643	25 %	25 %	0 %	50 %	532424282
9055	NC_022119	CT	3	6	411654	411659	0 %	50 %	0 %	50 %	532424282
9056	NC_022119	A	6	6	411738	411743	100 %	0 %	0 %	0 %	532424282
9057	NC_022119	CAA	2	6	411760	411765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424282
9058	NC_022119	T	8	8	411769	411776	0 %	100 %	0 %	0 %	532424282
9059	NC_022119	AAT	2	6	411777	411782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424282
9060	NC_022119	TTCT	3	12	411878	411889	0 %	75 %	0 %	25 %	532424282
9061	NC_022119	CT	3	6	411888	411893	0 %	50 %	0 %	50 %	532424282
9062	NC_022119	CTG	2	6	411922	411927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424282
9063	NC_022119	AATG	2	8	411929	411936	50 %	25 %	25 %	0 %	532424282
9064	NC_022119	AGCA	2	8	411993	412000	50 %	0 %	25 %	25 %	532424282
9065	NC_022119	TTA	2	6	412084	412089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9066	NC_022119	TAA	2	6	412106	412111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9067	NC_022119	AGA	2	6	412134	412139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9068	NC_022119	TTA	2	6	412173	412178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9069	NC_022119	TGA	2	6	412184	412189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9070	NC_022119	AAG	2	6	412219	412224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424283
9071	NC_022119	TCTCT	2	10	412271	412280	0 %	60 %	0 %	40 %	532424283
9072	NC_022119	TTC	2	6	412397	412402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424283
9073	NC_022119	GAC	2	6	412416	412421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424283
9074	NC_022119	GTC	2	6	412519	412524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424283
9075	NC_022119	AATC	2	8	412803	412810	50 %	25 %	0 %	25 %	532424283
9076	NC_022119	AAAC	2	8	412881	412888	75 %	0 %	0 %	25 %	532424283
9077	NC_022119	TAC	2	6	412938	412943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424283
9078	NC_022119	AAATA	2	10	412945	412954	80 %	20 %	0 %	0 %	532424283
9079	NC_022119	CGAA	2	8	412978	412985	50 %	0 %	25 %	25 %	532424283
9080	NC_022119	CT	3	6	412991	412996	0 %	50 %	0 %	50 %	532424283
9081	NC_022119	AGC	2	6	412999	413004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424283
9082	NC_022119	CAA	2	6	413092	413097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424284
9083	NC_022119	TTA	2	6	413123	413128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424284
9084	NC_022119	AATTA	2	10	413131	413140	60 %	40 %	0 %	0 %	532424284
9085	NC_022119	AGCT	2	8	413218	413225	25 %	25 %	25 %	25 %	532424284
9086	NC_022119	CTT	2	6	413529	413534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424284
9087	NC_022119	CT	3	6	413737	413742	0 %	50 %	0 %	50 %	532424284
9088	NC_022119	AG	3	6	413765	413770	50 %	0 %	50 %	0 %	532424284
9089	NC_022119	C	6	6	413785	413790	0 %	0 %	0 %	100 %	532424284
9090	NC_022119	TCT	2	6	413858	413863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424284
9091	NC_022119	CCGC	2	8	413913	413920	0 %	0 %	25 %	75 %	532424284
9092	NC_022119	CAG	2	6	413987	413992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424284
9093	NC_022119	AGAA	2	8	414055	414062	75 %	0 %	25 %	0 %	532424284
9094	NC_022119	CT	3	6	414180	414185	0 %	50 %	0 %	50 %	532424284
9095	NC_022119	AAC	3	9	414244	414252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424284
9096	NC_022119	TCTT	2	8	414262	414269	0 %	75 %	0 %	25 %	532424284
9097	NC_022119	TCG	2	6	414289	414294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424284
9098	NC_022119	AC	3	6	414334	414339	50 %	0 %	0 %	50 %	532424284
9099	NC_022119	CT	3	6	414375	414380	0 %	50 %	0 %	50 %	532424285
9100	NC_022119	TGA	2	6	414381	414386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424285
9101	NC_022119	TCC	2	6	414392	414397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424285
9102	NC_022119	CTC	2	6	414442	414447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424285
9103	NC_022119	CCG	2	6	414495	414500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532424285
9104	NC_022119	ATC	2	6	414530	414535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424285
9105	NC_022119	AAG	2	6	414613	414618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424285
9106	NC_022119	TCT	2	6	414624	414629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424285
9107	NC_022119	TC	3	6	414757	414762	0 %	50 %	0 %	50 %	532424285
9108	NC_022119	TCT	2	6	414769	414774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424285
9109	NC_022119	ACATGC	2	12	414870	414881	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	532424285
9110	NC_022119	ACA	2	6	414892	414897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424285
9111	NC_022119	ACA	2	6	414932	414937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424285
9112	NC_022119	TAA	2	6	414949	414954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424285
9113	NC_022119	A	6	6	414963	414968	100 %	0 %	0 %	0 %	532424285
9114	NC_022119	TTC	2	6	414974	414979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424285
9115	NC_022119	AGT	2	6	415088	415093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424285
9116	NC_022119	CTG	2	6	415096	415101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424285
9117	NC_022119	GAAG	2	8	415116	415123	50 %	0 %	50 %	0 %	532424285
9118	NC_022119	ACA	2	6	415131	415136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424285
9119	NC_022119	AACGC	2	10	415234	415243	40 %	0 %	20 %	40 %	532424285
9120	NC_022119	AGA	2	6	415253	415258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424285
9121	NC_022119	CAA	2	6	415321	415326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424285
9122	NC_022119	AAAC	2	8	415394	415401	75 %	0 %	0 %	25 %	532424286
9123	NC_022119	TCT	2	6	415456	415461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424286
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9125	NC_022119	A	6	6	415486	415491	100 %	0 %	0 %	0 %	532424286
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9242	NC_022119	T	6	6	419993	419998	0 %	100 %	0 %	0 %	532424823
9243	NC_022119	AG	3	6	420008	420013	50 %	0 %	50 %	0 %	532424823
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9247	NC_022119	AGA	2	6	420129	420134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424289
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9359	NC_022119	A	6	6	424656	424661	100 %	0 %	0 %	0 %	532424293
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9495	NC_022119	AG	3	6	430655	430660	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9496	NC_022119	TAAAA	2	10	430687	430696	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9497	NC_022119	CAAA	2	8	430703	430710	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9498	NC_022119	A	7	7	430708	430714	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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