MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/13-96

Total Repeats: 22984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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8002	NC_022119	ACA	2	6	364605	364610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424246
8003	NC_022119	TTAT	2	8	364673	364680	25 %	75 %	0 %	0 %	532424246
8004	NC_022119	CTC	2	6	364685	364690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424246
8005	NC_022119	TAT	2	6	364704	364709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424246
8006	NC_022119	T	6	6	364716	364721	0 %	100 %	0 %	0 %	532424246
8007	NC_022119	AT	3	6	364779	364784	50 %	50 %	0 %	0 %	532424246
8008	NC_022119	CAT	2	6	364833	364838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424246
8009	NC_022119	CGC	2	6	364876	364881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532424246
8010	NC_022119	AT	3	6	364886	364891	50 %	50 %	0 %	0 %	532424246
8011	NC_022119	GAA	2	6	364969	364974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424246
8012	NC_022119	AGT	2	6	365007	365012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424246
8013	NC_022119	GCTCA	2	10	365038	365047	20 %	20 %	20 %	40 %	532424246
8014	NC_022119	CTCTT	2	10	365158	365167	0 %	60 %	0 %	40 %	532424247
8015	NC_022119	ACAA	2	8	365197	365204	75 %	0 %	0 %	25 %	532424247
8016	NC_022119	T	8	8	365325	365332	0 %	100 %	0 %	0 %	532424247
8017	NC_022119	T	6	6	365433	365438	0 %	100 %	0 %	0 %	532424247
8018	NC_022119	GGA	2	6	365478	365483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424247
8019	NC_022119	TCC	2	6	365574	365579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8020	NC_022119	ACT	2	6	365590	365595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8021	NC_022119	CGA	2	6	365605	365610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424816
8022	NC_022119	GC	3	6	365694	365699	0 %	0 %	50 %	50 %	532424816
8023	NC_022119	TGT	2	6	365706	365711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424816
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8025	NC_022119	TAT	2	6	365789	365794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424816
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8029	NC_022119	TGT	2	6	365977	365982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424816
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8031	NC_022119	ATC	2	6	366006	366011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424816
8032	NC_022119	TCT	2	6	366061	366066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424816
8033	NC_022119	TA	3	6	366068	366073	50 %	50 %	0 %	0 %	532424816
8034	NC_022119	CAA	2	6	366104	366109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424816
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8036	NC_022119	TCCA	2	8	366178	366185	25 %	25 %	0 %	50 %	532424816
8037	NC_022119	A	7	7	366185	366191	100 %	0 %	0 %	0 %	532424816
8038	NC_022119	AGC	2	6	366229	366234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424817
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8040	NC_022119	CTT	2	6	366318	366323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424817
8041	NC_022119	CTC	2	6	366361	366366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424817
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8043	NC_022119	AGT	2	6	366473	366478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424817
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8045	NC_022119	AGGGA	2	10	366509	366518	40 %	0 %	60 %	0 %	532424817
8046	NC_022119	GCT	2	6	366522	366527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424817
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8052	NC_022119	TGAG	2	8	366752	366759	25 %	25 %	50 %	0 %	532424817
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8054	NC_022119	A	6	6	366881	366886	100 %	0 %	0 %	0 %	532424817
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8062	NC_022119	CA	3	6	367194	367199	50 %	0 %	0 %	50 %	532424817
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8072	NC_022119	GT	3	6	367512	367517	0 %	50 %	50 %	0 %	532424818
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8077	NC_022119	A	8	8	367658	367665	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8091	NC_022119	AAG	2	6	368082	368087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8093	NC_022119	GAA	2	6	368118	368123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8094	NC_022119	GCTT	2	8	368167	368174	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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8096	NC_022119	TGA	2	6	368311	368316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8100	NC_022119	AAAAC	2	10	368430	368439	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
8101	NC_022119	TAAA	2	8	368445	368452	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8102	NC_022119	A	7	7	368690	368696	100 %	0 %	0 %	0 %	532424249
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8112	NC_022119	GTC	2	6	369041	369046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424249
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8114	NC_022119	TCAC	2	8	369149	369156	25 %	25 %	0 %	50 %	532424249
8115	NC_022119	CAT	2	6	369225	369230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424249
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8117	NC_022119	AAG	2	6	369320	369325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8118	NC_022119	AAAT	2	8	369363	369370	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8119	NC_022119	CCTT	2	8	369385	369392	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8120	NC_022119	ATCT	2	8	369418	369425	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8121	NC_022119	ACAA	2	8	369427	369434	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8122	NC_022119	TCC	2	6	369656	369661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424250
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8124	NC_022119	CAA	2	6	369684	369689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424250
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8126	NC_022119	GCT	2	6	369870	369875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424250
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8131	NC_022119	GGA	2	6	370227	370232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424250
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8201	NC_022119	AGCTGA	2	12	373182	373193	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	532424254
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8228	NC_022119	CTT	2	6	374290	374295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8229	NC_022119	AGA	2	6	374312	374317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8380	NC_022119	TAT	2	6	381782	381787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424257
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8383	NC_022119	CTA	2	6	381828	381833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424257
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8499	NC_022119	TTA	2	6	386841	386846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424262
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