MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/13-96

Total Repeats: 22984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_022119	AGG	2	6	318503	318508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424210
7002	NC_022119	TTAATT	2	12	318636	318647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424210
7003	NC_022119	GTC	2	6	318652	318657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424210
7004	NC_022119	GAA	2	6	318658	318663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424210
7005	NC_022119	A	6	6	318662	318667	100 %	0 %	0 %	0 %	532424210
7006	NC_022119	A	6	6	318768	318773	100 %	0 %	0 %	0 %	532424210
7007	NC_022119	GAA	2	6	318834	318839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424210
7008	NC_022119	GATG	2	8	318854	318861	25 %	25 %	50 %	0 %	532424210
7009	NC_022119	TTAT	2	8	318888	318895	25 %	75 %	0 %	0 %	532424210
7010	NC_022119	TGA	2	6	318896	318901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424210
7011	NC_022119	TTG	2	6	318913	318918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424210
7012	NC_022119	GCT	2	6	318927	318932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424210
7013	NC_022119	GAG	2	6	318979	318984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424210
7014	NC_022119	A	6	6	319066	319071	100 %	0 %	0 %	0 %	532424210
7015	NC_022119	GTT	2	6	319074	319079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424210
7016	NC_022119	CCT	2	6	319083	319088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424210
7017	NC_022119	A	6	6	319128	319133	100 %	0 %	0 %	0 %	532424210
7018	NC_022119	TCA	2	6	319156	319161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424210
7019	NC_022119	TGA	2	6	319163	319168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424210
7020	NC_022119	TGC	2	6	319178	319183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424210
7021	NC_022119	CT	3	6	319191	319196	0 %	50 %	0 %	50 %	532424210
7022	NC_022119	TTC	2	6	319219	319224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424210
7023	NC_022119	A	6	6	319324	319329	100 %	0 %	0 %	0 %	532424210
7024	NC_022119	GCT	2	6	319377	319382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424210
7025	NC_022119	TGA	2	6	319391	319396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424210
7026	NC_022119	AGA	2	6	319399	319404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424210
7027	NC_022119	ACA	2	6	319433	319438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424210
7028	NC_022119	GAA	2	6	319455	319460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424210
7029	NC_022119	TGA	2	6	319475	319480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424210
7030	NC_022119	AGT	2	6	319496	319501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424210
7031	NC_022119	AAAG	2	8	319583	319590	75 %	0 %	25 %	0 %	532424210
7032	NC_022119	CGT	2	6	319635	319640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424210
7033	NC_022119	TCCT	2	8	319680	319687	0 %	50 %	0 %	50 %	532424210
7034	NC_022119	GCA	2	6	319727	319732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424210
7035	NC_022119	GGA	2	6	319752	319757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424210
7036	NC_022119	GAT	2	6	319817	319822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424210
7037	NC_022119	TCC	2	6	319829	319834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424210
7038	NC_022119	AT	3	6	319838	319843	50 %	50 %	0 %	0 %	532424210
7039	NC_022119	CGC	2	6	319884	319889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532424210
7040	NC_022119	TGTGT	2	10	319896	319905	0 %	60 %	40 %	0 %	532424210
7041	NC_022119	TGA	2	6	319910	319915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424210
7042	NC_022119	CAT	3	9	320018	320026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424210
7043	NC_022119	GTG	2	6	320065	320070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532424210
7044	NC_022119	TGC	2	6	320129	320134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424210
7045	NC_022119	AAG	2	6	320139	320144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424210
7046	NC_022119	AAG	2	6	320206	320211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424210
7047	NC_022119	TAA	2	6	320240	320245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424210
7048	NC_022119	GGA	2	6	320378	320383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424210
7049	NC_022119	AAG	2	6	320422	320427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424210
7050	NC_022119	CG	4	8	320439	320446	0 %	0 %	50 %	50 %	532424210
7051	NC_022119	AGA	2	6	320453	320458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424210
7052	NC_022119	GTT	2	6	320463	320468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424210
7053	NC_022119	AGA	3	9	320477	320485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424210
7054	NC_022119	TGA	2	6	320537	320542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424210
7055	NC_022119	CTC	3	9	320562	320570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424211
7056	NC_022119	TAAAG	2	10	320783	320792	60 %	20 %	20 %	0 %	532424211
7057	NC_022119	GAT	2	6	320793	320798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424211
7058	NC_022119	TCC	2	6	320869	320874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424211
7059	NC_022119	TAA	2	6	320906	320911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424211
7060	NC_022119	TGT	2	6	320939	320944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424211
7061	NC_022119	AAT	2	6	320956	320961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424211
7062	NC_022119	T	7	7	321043	321049	0 %	100 %	0 %	0 %	532424211
7063	NC_022119	CTT	2	6	321069	321074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424211
7064	NC_022119	CTC	2	6	321219	321224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424211
7065	NC_022119	AAT	2	6	321228	321233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424211
7066	NC_022119	A	6	6	321245	321250	100 %	0 %	0 %	0 %	532424211
7067	NC_022119	CTT	2	6	321271	321276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424211
7068	NC_022119	TAA	2	6	321280	321285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424211
7069	NC_022119	ATGGA	2	10	321408	321417	40 %	20 %	40 %	0 %	532424211
7070	NC_022119	CAA	2	6	321513	321518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424211
7071	NC_022119	CTT	2	6	321535	321540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424211
7072	NC_022119	CAA	2	6	321552	321557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424211
7073	NC_022119	CTC	2	6	321570	321575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424211
7074	NC_022119	CAA	2	6	321585	321590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424211
7075	NC_022119	CAT	2	6	321659	321664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7076	NC_022119	A	7	7	321671	321677	100 %	0 %	0 %	0 %	532424812
7077	NC_022119	A	7	7	321685	321691	100 %	0 %	0 %	0 %	532424812
7078	NC_022119	GCC	2	6	321704	321709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532424812
7079	NC_022119	AAAAAT	2	12	321729	321740	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	532424812
7080	NC_022119	CAATT	2	10	321741	321750	40 %	40 %	0 %	20 %	532424812
7081	NC_022119	A	7	7	321755	321761	100 %	0 %	0 %	0 %	532424812
7082	NC_022119	TAT	2	6	321796	321801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7083	NC_022119	ATA	2	6	321805	321810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7084	NC_022119	TCA	2	6	321854	321859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424212
7085	NC_022119	GAG	2	6	322015	322020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424212
7086	NC_022119	TGG	2	6	322043	322048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532424212
7087	NC_022119	TGC	2	6	322052	322057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424212
7088	NC_022119	CCA	2	6	322081	322086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532424212
7089	NC_022119	A	6	6	322100	322105	100 %	0 %	0 %	0 %	532424212
7090	NC_022119	AAAACA	2	12	322121	322132	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	532424212
7091	NC_022119	AGA	2	6	322136	322141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424212
7092	NC_022119	A	8	8	322276	322283	100 %	0 %	0 %	0 %	532424212
7093	NC_022119	AAG	2	6	322291	322296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424212
7094	NC_022119	CT	4	8	322365	322372	0 %	50 %	0 %	50 %	532424212
7095	NC_022119	GAG	2	6	322399	322404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532424212
7096	NC_022119	CTC	2	6	322432	322437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424212
7097	NC_022119	GGT	2	6	322503	322508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532424212
7098	NC_022119	T	6	6	322510	322515	0 %	100 %	0 %	0 %	532424212
7099	NC_022119	TA	3	6	322555	322560	50 %	50 %	0 %	0 %	532424212
7100	NC_022119	GCT	2	6	322605	322610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424212
7101	NC_022119	ATC	2	6	322614	322619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424212
7102	NC_022119	TTC	2	6	322621	322626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424212
7103	NC_022119	GCCT	2	8	322633	322640	0 %	25 %	25 %	50 %	532424212
7104	NC_022119	A	6	6	322765	322770	100 %	0 %	0 %	0 %	532424212
7105	NC_022119	GAGC	2	8	322871	322878	25 %	0 %	50 %	25 %	532424212
7106	NC_022119	CTT	2	6	322880	322885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424212
7107	NC_022119	AT	3	6	322939	322944	50 %	50 %	0 %	0 %	532424212
7108	NC_022119	TAA	2	6	322958	322963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424212
7109	NC_022119	ACA	2	6	322970	322975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424212
7110	NC_022119	CTTA	2	8	323011	323018	25 %	50 %	0 %	25 %	532424212
7111	NC_022119	TAA	2	6	323030	323035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424212
7112	NC_022119	CGA	2	6	323036	323041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424212
7113	NC_022119	TAAA	2	8	323113	323120	75 %	25 %	0 %	0 %	532424212
7114	NC_022119	ACG	2	6	323141	323146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424212
7115	NC_022119	AGA	2	6	323234	323239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424212
7116	NC_022119	CAA	2	6	323274	323279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424212
7117	NC_022119	CTC	2	6	323283	323288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424212
7118	NC_022119	AGA	2	6	323291	323296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424212
7119	NC_022119	GGC	2	6	323360	323365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532424212
7120	NC_022119	ATG	2	6	323430	323435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424212
7121	NC_022119	AC	3	6	323460	323465	50 %	0 %	0 %	50 %	532424212
7122	NC_022119	CT	3	6	323481	323486	0 %	50 %	0 %	50 %	532424212
7123	NC_022119	ACA	2	6	323492	323497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424212
7124	NC_022119	TTC	2	6	323532	323537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424212
7125	NC_022119	AAAAAG	2	12	323547	323558	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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7145	NC_022119	T	6	6	324383	324388	0 %	100 %	0 %	0 %	532424213
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7152	NC_022119	T	6	6	324566	324571	0 %	100 %	0 %	0 %	532424213
7153	NC_022119	TAG	2	6	324634	324639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424213
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7156	NC_022119	T	7	7	324820	324826	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7157	NC_022119	AAGA	2	8	324902	324909	75 %	0 %	25 %	0 %	532424214
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7166	NC_022119	CCCCT	2	10	325264	325273	0 %	20 %	0 %	80 %	532424214
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7232	NC_022119	A	6	6	328226	328231	100 %	0 %	0 %	0 %	532424219
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7241	NC_022119	AAAT	2	8	328790	328797	75 %	25 %	0 %	0 %	532424219
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7243	NC_022119	TA	3	6	328836	328841	50 %	50 %	0 %	0 %	532424219
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7249	NC_022119	ATC	2	6	329091	329096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424219
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7353	NC_022119	CTC	2	6	333694	333699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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7355	NC_022119	GAA	2	6	333743	333748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7356	NC_022119	CTTGT	2	10	333768	333777	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
7357	NC_022119	C	6	6	333815	333820	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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7359	NC_022119	TCA	2	6	333887	333892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7363	NC_022119	A	6	6	333944	333949	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7364	NC_022119	TGG	2	6	333951	333956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7365	NC_022119	TTGT	2	8	333970	333977	0 %	75 %	25 %	0 %	532424813
7366	NC_022119	CTG	2	6	333985	333990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424813
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7373	NC_022119	T	7	7	334263	334269	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7374	NC_022119	A	7	7	334274	334280	100 %	0 %	0 %	0 %	532424224
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7481	NC_022119	TGT	2	6	339921	339926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7482	NC_022119	CAAG	2	8	340018	340025	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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7495	NC_022119	ACTG	2	8	340658	340665	25 %	25 %	25 %	25 %	532424814
7496	NC_022119	CAT	2	6	340690	340695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424814
7497	NC_022119	CAG	2	6	340697	340702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424814
7498	NC_022119	TGA	2	6	340733	340738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424814
7499	NC_022119	CAGA	2	8	340747	340754	50 %	0 %	25 %	25 %	532424814
7500	NC_022119	AAT	2	6	340757	340762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424814

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