MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/13-96

Total Repeats: 22984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_022119	GTT	2	6	296026	296031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424188
6502	NC_022119	CAA	2	6	296045	296050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424188
6503	NC_022119	CTA	2	6	296051	296056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424188
6504	NC_022119	AG	3	6	296100	296105	50 %	0 %	50 %	0 %	532424188
6505	NC_022119	CCT	2	6	296140	296145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424188
6506	NC_022119	CAA	2	6	296201	296206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424188
6507	NC_022119	TAT	2	6	296207	296212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424188
6508	NC_022119	AAG	2	6	296223	296228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424188
6509	NC_022119	CTCC	2	8	296267	296274	0 %	25 %	0 %	75 %	532424188
6510	NC_022119	AGA	2	6	296287	296292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424188
6511	NC_022119	A	6	6	296330	296335	100 %	0 %	0 %	0 %	532424188
6512	NC_022119	CTT	2	6	296403	296408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424188
6513	NC_022119	AGA	2	6	296428	296433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424188
6514	NC_022119	TGA	2	6	296567	296572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424189
6515	NC_022119	GCA	3	9	296651	296659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424189
6516	NC_022119	AAT	2	6	296721	296726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424189
6517	NC_022119	ACA	2	6	296747	296752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424189
6518	NC_022119	CCT	2	6	296777	296782	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424189
6519	NC_022119	TTC	2	6	296875	296880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424189
6520	NC_022119	ATGC	2	8	297010	297017	25 %	25 %	25 %	25 %	532424189
6521	NC_022119	ATC	2	6	297103	297108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424189
6522	NC_022119	T	6	6	297237	297242	0 %	100 %	0 %	0 %	532424189
6523	NC_022119	ATCT	2	8	297249	297256	25 %	50 %	0 %	25 %	532424189
6524	NC_022119	GAA	3	9	297284	297292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424189
6525	NC_022119	T	7	7	297311	297317	0 %	100 %	0 %	0 %	532424189
6526	NC_022119	T	6	6	297336	297341	0 %	100 %	0 %	0 %	532424189
6527	NC_022119	AGT	2	6	297371	297376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424189
6528	NC_022119	CTT	2	6	297395	297400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6529	NC_022119	A	6	6	297403	297408	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6530	NC_022119	ACAA	2	8	297422	297429	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6531	NC_022119	AAC	2	6	297438	297443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6532	NC_022119	TG	3	6	297548	297553	0 %	50 %	50 %	0 %	532424190
6533	NC_022119	A	6	6	297569	297574	100 %	0 %	0 %	0 %	532424190
6534	NC_022119	A	6	6	297609	297614	100 %	0 %	0 %	0 %	532424190
6535	NC_022119	AGA	2	6	297631	297636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424190
6536	NC_022119	A	6	6	297769	297774	100 %	0 %	0 %	0 %	532424190
6537	NC_022119	AGA	2	6	297799	297804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424190
6538	NC_022119	GAA	2	6	297899	297904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424190
6539	NC_022119	CTT	2	6	297939	297944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424190
6540	NC_022119	A	6	6	298058	298063	100 %	0 %	0 %	0 %	532424190
6541	NC_022119	ACCACT	2	12	298084	298095	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	532424190
6542	NC_022119	AAG	2	6	298110	298115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424190
6543	NC_022119	TCT	2	6	298166	298171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424190
6544	NC_022119	CTT	2	6	298179	298184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424190
6545	NC_022119	T	6	6	298215	298220	0 %	100 %	0 %	0 %	532424190
6546	NC_022119	CTT	2	6	298239	298244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424190
6547	NC_022119	TC	3	6	298270	298275	0 %	50 %	0 %	50 %	532424190
6548	NC_022119	AAT	2	6	298283	298288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424190
6549	NC_022119	T	6	6	298308	298313	0 %	100 %	0 %	0 %	532424190
6550	NC_022119	ACA	2	6	298356	298361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424190
6551	NC_022119	AAGG	2	8	298392	298399	50 %	0 %	50 %	0 %	532424190
6552	NC_022119	A	6	6	298409	298414	100 %	0 %	0 %	0 %	532424190
6553	NC_022119	CGA	2	6	298421	298426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424190
6554	NC_022119	AAT	2	6	298427	298432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424190
6555	NC_022119	CTT	2	6	298491	298496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424190
6556	NC_022119	GAT	2	6	298551	298556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424190
6557	NC_022119	TTC	2	6	298578	298583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424190
6558	NC_022119	CTT	2	6	298588	298593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424190
6559	NC_022119	CTA	2	6	298686	298691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424190
6560	NC_022119	TAA	2	6	298699	298704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424190
6561	NC_022119	A	6	6	298721	298726	100 %	0 %	0 %	0 %	532424190
6562	NC_022119	GCTT	2	8	298752	298759	0 %	50 %	25 %	25 %	532424190
6563	NC_022119	AAAGC	2	10	298785	298794	60 %	0 %	20 %	20 %	532424190
6564	NC_022119	GAA	2	6	298805	298810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6565	NC_022119	AAG	2	6	298815	298820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424191
6566	NC_022119	TTG	2	6	298824	298829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424191
6567	NC_022119	TCAA	2	8	298835	298842	50 %	25 %	0 %	25 %	532424191
6568	NC_022119	CTG	2	6	298905	298910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424191
6569	NC_022119	TC	3	6	298942	298947	0 %	50 %	0 %	50 %	532424191
6570	NC_022119	A	6	6	299021	299026	100 %	0 %	0 %	0 %	532424191
6571	NC_022119	TCT	2	6	299094	299099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424191
6572	NC_022119	TTG	2	6	299122	299127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424191
6573	NC_022119	CCT	2	6	299128	299133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532424191
6574	NC_022119	T	7	7	299212	299218	0 %	100 %	0 %	0 %	532424191
6575	NC_022119	CCCT	2	8	299319	299326	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6576	NC_022119	ATT	2	6	299334	299339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6577	NC_022119	T	7	7	299347	299353	0 %	100 %	0 %	0 %	532424192
6578	NC_022119	GCGA	2	8	299439	299446	25 %	0 %	50 %	25 %	532424192
6579	NC_022119	GCTC	2	8	299468	299475	0 %	25 %	25 %	50 %	532424192
6580	NC_022119	GAAA	2	8	299486	299493	75 %	0 %	25 %	0 %	532424192
6581	NC_022119	GTT	2	6	299522	299527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424192
6582	NC_022119	CTT	2	6	299550	299555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424192
6583	NC_022119	T	7	7	299582	299588	0 %	100 %	0 %	0 %	532424192
6584	NC_022119	CT	3	6	299618	299623	0 %	50 %	0 %	50 %	532424192
6585	NC_022119	AAAT	2	8	299660	299667	75 %	25 %	0 %	0 %	532424192
6586	NC_022119	CTTA	2	8	299758	299765	25 %	50 %	0 %	25 %	532424192
6587	NC_022119	GCA	2	6	299966	299971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532424192
6588	NC_022119	AACT	2	8	299982	299989	50 %	25 %	0 %	25 %	532424192
6589	NC_022119	ACT	2	6	299992	299997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424192
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6591	NC_022119	AAT	2	6	300017	300022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424192
6592	NC_022119	CA	4	8	300052	300059	50 %	0 %	0 %	50 %	532424192
6593	NC_022119	ATC	2	6	300068	300073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532424193
6594	NC_022119	CAA	2	6	300196	300201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424193
6595	NC_022119	AT	3	6	300229	300234	50 %	50 %	0 %	0 %	532424193
6596	NC_022119	AAT	2	6	300239	300244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424193
6597	NC_022119	TCT	2	6	300255	300260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424193
6598	NC_022119	CCA	2	6	300348	300353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532424193
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6600	NC_022119	AGGA	2	8	300386	300393	50 %	0 %	50 %	0 %	532424193
6601	NC_022119	TAA	2	6	300398	300403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532424193
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6603	NC_022119	TA	3	6	300586	300591	50 %	50 %	0 %	0 %	532424193
6604	NC_022119	AAG	2	6	300655	300660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424193
6605	NC_022119	TGA	2	6	300665	300670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532424193
6606	NC_022119	ATCT	2	8	300682	300689	25 %	50 %	0 %	25 %	532424193
6607	NC_022119	CTT	2	6	300703	300708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424193
6608	NC_022119	ACA	2	6	300783	300788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424193
6609	NC_022119	AT	3	6	300837	300842	50 %	50 %	0 %	0 %	532424193
6610	NC_022119	GTTA	2	8	300884	300891	25 %	50 %	25 %	0 %	532424193
6611	NC_022119	AGA	2	6	300944	300949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424193
6612	NC_022119	CAA	2	6	301039	301044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424193
6613	NC_022119	TTC	3	9	301090	301098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424193
6614	NC_022119	TGT	2	6	301136	301141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532424193
6615	NC_022119	ATT	2	6	301190	301195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424193
6616	NC_022119	TGC	2	6	301205	301210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532424193
6617	NC_022119	TCT	2	6	301236	301241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532424193
6618	NC_022119	AAC	2	6	301253	301258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532424193
6619	NC_022119	A	6	6	301263	301268	100 %	0 %	0 %	0 %	532424193
6620	NC_022119	AGAGA	2	10	301278	301287	60 %	0 %	40 %	0 %	532424193
6621	NC_022119	GAA	2	6	301320	301325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424193
6622	NC_022119	CATTGC	2	12	301330	301341	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	532424193
6623	NC_022119	GAA	2	6	301459	301464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424193
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