MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/6-94

Total Repeats: 22962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_022118	GCT	2	6	136185	136190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421933
3002	NC_022118	GGAT	2	8	136200	136207	25 %	25 %	50 %	0 %	532421933
3003	NC_022118	CTG	2	6	136321	136326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421934
3004	NC_022118	CAAT	2	8	136349	136356	50 %	25 %	0 %	25 %	532421934
3005	NC_022118	AAGC	2	8	136403	136410	50 %	0 %	25 %	25 %	532421934
3006	NC_022118	TTTG	2	8	136429	136436	0 %	75 %	25 %	0 %	532421934
3007	NC_022118	GCG	2	6	136472	136477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532421934
3008	NC_022118	TGC	2	6	136495	136500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421934
3009	NC_022118	TTC	2	6	136503	136508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421934
3010	NC_022118	CTG	2	6	136514	136519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421934
3011	NC_022118	CAG	2	6	136527	136532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532421934
3012	NC_022118	TTTG	2	8	136544	136551	0 %	75 %	25 %	0 %	532421934
3013	NC_022118	CAG	2	6	136581	136586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532421934
3014	NC_022118	GAA	2	6	136616	136621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421934
3015	NC_022118	GCT	2	6	136631	136636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421934
3016	NC_022118	CAG	2	6	136649	136654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532421934
3017	NC_022118	AGG	2	6	136660	136665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532421934
3018	NC_022118	GAG	2	6	136676	136681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532421934
3019	NC_022118	CAC	2	6	136689	136694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532421934
3020	NC_022118	GAT	2	6	136772	136777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421934
3021	NC_022118	ATAA	2	8	136778	136785	75 %	25 %	0 %	0 %	532421934
3022	NC_022118	ACA	2	6	136788	136793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532421934
3023	NC_022118	AGG	2	6	136849	136854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_022118	CCT	2	6	136859	136864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3025	NC_022118	T	9	9	136866	136874	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_022118	TTGCA	2	10	136962	136971	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3027	NC_022118	GAG	2	6	137026	137031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532421935
3028	NC_022118	TC	3	6	137036	137041	0 %	50 %	0 %	50 %	532421935
3029	NC_022118	CT	3	6	137065	137070	0 %	50 %	0 %	50 %	532421935
3030	NC_022118	TTC	2	6	137163	137168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421935
3031	NC_022118	CTT	2	6	137213	137218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421935
3032	NC_022118	CT	3	6	137247	137252	0 %	50 %	0 %	50 %	532421935
3033	NC_022118	A	6	6	137297	137302	100 %	0 %	0 %	0 %	532421935
3034	NC_022118	TCT	2	6	137314	137319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421935
3035	NC_022118	CAG	2	6	137408	137413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532421935
3036	NC_022118	AG	3	6	137412	137417	50 %	0 %	50 %	0 %	532421935
3037	NC_022118	GAA	2	6	137453	137458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421935
3038	NC_022118	T	6	6	137460	137465	0 %	100 %	0 %	0 %	532421935
3039	NC_022118	AATT	2	8	137486	137493	50 %	50 %	0 %	0 %	532421935
3040	NC_022118	AAG	2	6	137598	137603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421935
3041	NC_022118	CAA	2	6	137636	137641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532421935
3042	NC_022118	TGT	2	6	137667	137672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421935
3043	NC_022118	GCT	2	6	137698	137703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421935
3044	NC_022118	AAG	2	6	137726	137731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421935
3045	NC_022118	GGA	2	6	137776	137781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532421935
3046	NC_022118	TTG	2	6	137916	137921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422677
3047	NC_022118	ATGT	2	8	138066	138073	25 %	50 %	25 %	0 %	532422677
3048	NC_022118	AGG	2	6	138083	138088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422677
3049	NC_022118	AAT	2	6	138116	138121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422677
3050	NC_022118	CTT	2	6	138139	138144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_022118	AG	3	6	138150	138155	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_022118	GA	3	6	138213	138218	50 %	0 %	50 %	0 %	532421936
3053	NC_022118	A	6	6	138229	138234	100 %	0 %	0 %	0 %	532421936
3054	NC_022118	TAT	2	6	138258	138263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532421936
3055	NC_022118	AGA	2	6	138306	138311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421936
3056	NC_022118	ATGG	2	8	138343	138350	25 %	25 %	50 %	0 %	532421936
3057	NC_022118	GTT	2	6	138385	138390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421936
3058	NC_022118	TC	3	6	138578	138583	0 %	50 %	0 %	50 %	532421936
3059	NC_022118	AGAA	2	8	138693	138700	75 %	0 %	25 %	0 %	532421936
3060	NC_022118	GAAG	2	8	138739	138746	50 %	0 %	50 %	0 %	532421936
3061	NC_022118	TTGA	2	8	138751	138758	25 %	50 %	25 %	0 %	532421936
3062	NC_022118	GGT	2	6	138766	138771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532421936
3063	NC_022118	CCT	2	6	138830	138835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532421936
3064	NC_022118	T	7	7	138837	138843	0 %	100 %	0 %	0 %	532421936
3065	NC_022118	GAAA	2	8	138864	138871	75 %	0 %	25 %	0 %	532421936
3066	NC_022118	GAA	2	6	138892	138897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421936
3067	NC_022118	AGT	2	6	138961	138966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421937
3068	NC_022118	TTA	2	6	139005	139010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532421937
3069	NC_022118	GA	3	6	139049	139054	50 %	0 %	50 %	0 %	532421937
3070	NC_022118	AAG	2	6	139080	139085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421937
3071	NC_022118	T	6	6	139257	139262	0 %	100 %	0 %	0 %	532421937
3072	NC_022118	AGG	2	6	139336	139341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532421937
3073	NC_022118	A	6	6	139346	139351	100 %	0 %	0 %	0 %	532421937
3074	NC_022118	TTA	2	6	139410	139415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532421937
3075	NC_022118	TAA	2	6	139513	139518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532421938
3076	NC_022118	GAGTTA	2	12	139553	139564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421938
3077	NC_022118	AAGA	2	8	139635	139642	75 %	0 %	25 %	0 %	532421938
3078	NC_022118	AG	3	6	139684	139689	50 %	0 %	50 %	0 %	532421938
3079	NC_022118	GAA	2	6	139696	139701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421938
3080	NC_022118	TTA	2	6	139791	139796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532421938
3081	NC_022118	GTT	2	6	139826	139831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421938
3082	NC_022118	AGA	2	6	139891	139896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421938
3083	NC_022118	TCCAG	2	10	139918	139927	20 %	20 %	20 %	40 %	532421938
3084	NC_022118	GAA	2	6	139969	139974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421938
3085	NC_022118	ATTG	2	8	139978	139985	25 %	50 %	25 %	0 %	532421939
3086	NC_022118	ATT	2	6	140012	140017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532421939
3087	NC_022118	AAG	2	6	140073	140078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421939
3088	NC_022118	CTT	2	6	140090	140095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421939
3089	NC_022118	GCA	2	6	140129	140134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532421939
3090	NC_022118	CCTA	2	8	140139	140146	25 %	25 %	0 %	50 %	532421939
3091	NC_022118	GCT	2	6	140165	140170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421939
3092	NC_022118	TCA	2	6	140430	140435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532421939
3093	NC_022118	TAA	2	6	140539	140544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532421939
3094	NC_022118	GTACA	2	10	140649	140658	40 %	20 %	20 %	20 %	532421939
3095	NC_022118	AGA	2	6	140680	140685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421939
3096	NC_022118	GAA	2	6	140864	140869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421939
3097	NC_022118	TAA	2	6	140998	141003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532421939
3098	NC_022118	TAGAT	2	10	141022	141031	40 %	40 %	20 %	0 %	532421939
3099	NC_022118	TAT	2	6	141032	141037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532421939
3100	NC_022118	CTCC	2	8	141038	141045	0 %	25 %	0 %	75 %	532421939
3101	NC_022118	CTG	2	6	141054	141059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421939
3102	NC_022118	CCT	2	6	141098	141103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532421939
3103	NC_022118	TAT	2	6	141104	141109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532421939
3104	NC_022118	TGG	2	6	141199	141204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532421939
3105	NC_022118	TCA	2	6	141226	141231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532421939
3106	NC_022118	TCT	2	6	141256	141261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421939
3107	NC_022118	ATTA	2	8	141275	141282	50 %	50 %	0 %	0 %	532421939
3108	NC_022118	T	8	8	141344	141351	0 %	100 %	0 %	0 %	532421939
3109	NC_022118	T	6	6	141389	141394	0 %	100 %	0 %	0 %	532422678
3110	NC_022118	AAG	2	6	141398	141403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422678
3111	NC_022118	AAAAG	2	10	141424	141433	80 %	0 %	20 %	0 %	532422678
3112	NC_022118	T	6	6	141448	141453	0 %	100 %	0 %	0 %	532422678
3113	NC_022118	GCT	2	6	141484	141489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422678
3114	NC_022118	A	6	6	141500	141505	100 %	0 %	0 %	0 %	532422678
3115	NC_022118	ATC	2	6	141508	141513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422678
3116	NC_022118	A	6	6	141557	141562	100 %	0 %	0 %	0 %	532421940
3117	NC_022118	CTC	2	6	141707	141712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532421940
3118	NC_022118	AAAAC	2	10	141904	141913	80 %	0 %	0 %	20 %	532421940
3119	NC_022118	AGA	2	6	142058	142063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421941
3120	NC_022118	GGA	2	6	142232	142237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532421941
3121	NC_022118	AGAA	2	8	142296	142303	75 %	0 %	25 %	0 %	532421941
3122	NC_022118	CTT	2	6	142333	142338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421941
3123	NC_022118	AAGA	2	8	142355	142362	75 %	0 %	25 %	0 %	532421941
3124	NC_022118	A	6	6	142367	142372	100 %	0 %	0 %	0 %	532421941
3125	NC_022118	AT	3	6	142435	142440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_022118	CTT	2	6	142462	142467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3127	NC_022118	AAG	2	6	142472	142477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421942
3128	NC_022118	AAAG	2	8	142552	142559	75 %	0 %	25 %	0 %	532421942
3129	NC_022118	T	6	6	142596	142601	0 %	100 %	0 %	0 %	532421942
3130	NC_022118	GCA	2	6	142604	142609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532421942
3131	NC_022118	TGAA	2	8	142610	142617	50 %	25 %	25 %	0 %	532421942
3132	NC_022118	TCA	2	6	142635	142640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532421942
3133	NC_022118	TGCT	2	8	142662	142669	0 %	50 %	25 %	25 %	532421942
3134	NC_022118	TCC	2	6	142687	142692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532421942
3135	NC_022118	TTC	2	6	142764	142769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421942
3136	NC_022118	AGT	2	6	142784	142789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421942
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3138	NC_022118	GAAA	2	8	142885	142892	75 %	0 %	25 %	0 %	532421942
3139	NC_022118	AG	3	6	142904	142909	50 %	0 %	50 %	0 %	532421942
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3146	NC_022118	A	6	6	143078	143083	100 %	0 %	0 %	0 %	532421942
3147	NC_022118	CTT	2	6	143085	143090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421942
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3151	NC_022118	AGA	2	6	143179	143184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421942
3152	NC_022118	ATGGTT	2	12	143215	143226	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	532421942
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3154	NC_022118	TCA	2	6	143422	143427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532421943
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3156	NC_022118	TTG	2	6	143505	143510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421943
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3159	NC_022118	TCTA	2	8	143601	143608	25 %	50 %	0 %	25 %	532421943
3160	NC_022118	GAA	2	6	143668	143673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421943
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3164	NC_022118	GTC	2	6	143888	143893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421943
3165	NC_022118	TAA	2	6	143895	143900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532421943
3166	NC_022118	AGG	2	6	144058	144063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532421943
3167	NC_022118	ATA	3	9	144121	144129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532421943
3168	NC_022118	ATC	2	6	144153	144158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532421943
3169	NC_022118	TAA	2	6	144160	144165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3170	NC_022118	T	7	7	144224	144230	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3171	NC_022118	T	6	6	144252	144257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3172	NC_022118	T	7	7	144285	144291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3173	NC_022118	CTT	2	6	144388	144393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421944
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3201	NC_022118	TGA	2	6	145439	145444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421945
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3235	NC_022118	AG	3	6	147510	147515	50 %	0 %	50 %	0 %	532421946
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3238	NC_022118	GAA	2	6	147892	147897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421946
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3240	NC_022118	AG	3	6	147971	147976	50 %	0 %	50 %	0 %	532421946
3241	NC_022118	AGGA	2	8	147991	147998	50 %	0 %	50 %	0 %	532421946
3242	NC_022118	CTC	2	6	148003	148008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532421946
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3244	NC_022118	GAT	2	6	148045	148050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421946
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3246	NC_022118	CTT	2	6	148213	148218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421946
3247	NC_022118	GA	3	6	148243	148248	50 %	0 %	50 %	0 %	532421946
3248	NC_022118	AG	3	6	148253	148258	50 %	0 %	50 %	0 %	532421946
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3251	NC_022118	CGTA	2	8	148332	148339	25 %	25 %	25 %	25 %	532421946
3252	NC_022118	TGA	2	6	148407	148412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421946
3253	NC_022118	TGA	2	6	148429	148434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421946
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3281	NC_022118	GA	3	6	149691	149696	50 %	0 %	50 %	0 %	532421947
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3367	NC_022118	A	6	6	153292	153297	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3368	NC_022118	GCG	2	6	153314	153319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3369	NC_022118	AT	3	6	153368	153373	50 %	50 %	0 %	0 %	532421951
3370	NC_022118	T	7	7	153383	153389	0 %	100 %	0 %	0 %	532421951
3371	NC_022118	T	6	6	153454	153459	0 %	100 %	0 %	0 %	532421951
3372	NC_022118	ATC	2	6	153484	153489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532421951
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