MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/6-94

Total Repeats: 22962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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22002	NC_022118	TAT	2	6	1000541	1000546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422640
22003	NC_022118	AGA	3	9	1000577	1000585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422640
22004	NC_022118	AGA	2	6	1000598	1000603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422640
22005	NC_022118	TGG	2	6	1000664	1000669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532422640
22006	NC_022118	CTT	2	6	1000713	1000718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422641
22007	NC_022118	CAA	2	6	1000842	1000847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422641
22008	NC_022118	CAA	2	6	1000854	1000859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422641
22009	NC_022118	AGGTT	2	10	1000919	1000928	20 %	40 %	40 %	0 %	532422641
22010	NC_022118	AGC	2	6	1000942	1000947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422641
22011	NC_022118	CTTTT	2	10	1000977	1000986	0 %	80 %	0 %	20 %	532422641
22012	NC_022118	ATC	2	6	1001006	1001011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422641
22013	NC_022118	TTCA	2	8	1001122	1001129	25 %	50 %	0 %	25 %	532422641
22014	NC_022118	GA	4	8	1001214	1001221	50 %	0 %	50 %	0 %	532422641
22015	NC_022118	AGC	2	6	1001254	1001259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422641
22016	NC_022118	T	6	6	1001422	1001427	0 %	100 %	0 %	0 %	532422641
22017	NC_022118	AGA	2	6	1001512	1001517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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22020	NC_022118	AG	3	6	1001684	1001689	50 %	0 %	50 %	0 %	532422642
22021	NC_022118	CAAG	2	8	1001696	1001703	50 %	0 %	25 %	25 %	532422642
22022	NC_022118	TCC	2	6	1001744	1001749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422642
22023	NC_022118	GAA	2	6	1001809	1001814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422642
22024	NC_022118	TC	4	8	1001831	1001838	0 %	50 %	0 %	50 %	532422642
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22032	NC_022118	A	6	6	1002099	1002104	100 %	0 %	0 %	0 %	532422642
22033	NC_022118	TGT	2	6	1002166	1002171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422642
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22046	NC_022118	A	8	8	1002733	1002740	100 %	0 %	0 %	0 %	532422643
22047	NC_022118	TGG	2	6	1002772	1002777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532422643
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22049	NC_022118	CA	3	6	1002837	1002842	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22050	NC_022118	TAA	2	6	1002876	1002881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22051	NC_022118	T	8	8	1002901	1002908	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22052	NC_022118	GAA	2	6	1002951	1002956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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22055	NC_022118	AGAA	2	8	1003328	1003335	75 %	0 %	25 %	0 %	532422644
22056	NC_022118	AAC	2	6	1003336	1003341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422644
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22070	NC_022118	A	8	8	1003989	1003996	100 %	0 %	0 %	0 %	532422644
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22102	NC_022118	TTTC	2	8	1005686	1005693	0 %	75 %	0 %	25 %	532422749
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22113	NC_022118	CT	3	6	1006257	1006262	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22114	NC_022118	TAA	2	6	1006267	1006272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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22119	NC_022118	GGC	2	6	1006500	1006505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532422645
22120	NC_022118	TAA	2	6	1006520	1006525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422645
22121	NC_022118	GGT	2	6	1006590	1006595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532422645
22122	NC_022118	GTT	2	6	1006630	1006635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422645
22123	NC_022118	TCA	2	6	1006641	1006646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422645
22124	NC_022118	AGAT	2	8	1006673	1006680	50 %	25 %	25 %	0 %	532422645
22125	NC_022118	CAT	2	6	1006715	1006720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422645
22126	NC_022118	ACA	2	6	1006782	1006787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422645
22127	NC_022118	T	6	6	1006793	1006798	0 %	100 %	0 %	0 %	532422645
22128	NC_022118	ATGA	2	8	1006814	1006821	50 %	25 %	25 %	0 %	532422645
22129	NC_022118	AATTAA	2	12	1006850	1006861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422645
22130	NC_022118	GCT	2	6	1006866	1006871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422645
22131	NC_022118	AGT	2	6	1006911	1006916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422645
22132	NC_022118	ATT	2	6	1006944	1006949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422645
22133	NC_022118	GTT	2	6	1006989	1006994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422645
22134	NC_022118	AATT	2	8	1007063	1007070	50 %	50 %	0 %	0 %	532422645
22135	NC_022118	GCT	2	6	1007118	1007123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422645
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22137	NC_022118	TG	3	6	1007200	1007205	0 %	50 %	50 %	0 %	532422645
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22139	NC_022118	TAAA	2	8	1007371	1007378	75 %	25 %	0 %	0 %	532422645
22140	NC_022118	GAA	2	6	1007499	1007504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422645
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22142	NC_022118	TGA	2	6	1007509	1007514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422645
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22152	NC_022118	CTG	2	6	1007950	1007955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422645
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22154	NC_022118	CT	3	6	1008023	1008028	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22155	NC_022118	AGT	2	6	1008089	1008094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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22157	NC_022118	GAG	2	6	1008179	1008184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22158	NC_022118	G	7	7	1008184	1008190	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
22159	NC_022118	CAA	2	6	1008224	1008229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22160	NC_022118	AG	3	6	1008312	1008317	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22161	NC_022118	T	6	6	1008338	1008343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22162	NC_022118	AAG	2	6	1008344	1008349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22163	NC_022118	TATTT	2	10	1008361	1008370	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22164	NC_022118	GTG	2	6	1008388	1008393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22165	NC_022118	T	6	6	1008406	1008411	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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22168	NC_022118	CTGT	2	8	1008576	1008583	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
22169	NC_022118	TA	3	6	1008593	1008598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22170	NC_022118	ATT	2	6	1008623	1008628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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22172	NC_022118	GTTT	2	8	1008821	1008828	0 %	75 %	25 %	0 %	532422646
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22189	NC_022118	A	7	7	1009297	1009303	100 %	0 %	0 %	0 %	532422646
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22201	NC_022118	TAA	2	6	1010008	1010013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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22204	NC_022118	TTA	2	6	1010200	1010205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422647
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22210	NC_022118	CCTT	2	8	1010406	1010413	0 %	50 %	0 %	50 %	532422647
22211	NC_022118	A	6	6	1010423	1010428	100 %	0 %	0 %	0 %	532422647
22212	NC_022118	TTC	2	6	1010469	1010474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422647
22213	NC_022118	GCT	2	6	1010584	1010589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422647
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22217	NC_022118	GA	3	6	1010682	1010687	50 %	0 %	50 %	0 %	532422647
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22219	NC_022118	TTC	2	6	1010991	1010996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422647
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22222	NC_022118	ATT	2	6	1011118	1011123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422647
22223	NC_022118	TCT	2	6	1011133	1011138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422647
22224	NC_022118	AAC	2	6	1011169	1011174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422647
22225	NC_022118	GGT	2	6	1011178	1011183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532422647
22226	NC_022118	CTTTAT	2	12	1011190	1011201	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	532422647
22227	NC_022118	ACA	2	6	1011350	1011355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422647
22228	NC_022118	TTG	2	6	1011423	1011428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422647
22229	NC_022118	CTT	2	6	1011561	1011566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422647
22230	NC_022118	TTG	2	6	1011602	1011607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422647
22231	NC_022118	AGCTGG	2	12	1011618	1011629	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	532422647
22232	NC_022118	AG	3	6	1011706	1011711	50 %	0 %	50 %	0 %	532422647
22233	NC_022118	A	6	6	1011817	1011822	100 %	0 %	0 %	0 %	532422647
22234	NC_022118	ACG	2	6	1011845	1011850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422647
22235	NC_022118	ATT	2	6	1011856	1011861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422647
22236	NC_022118	TTG	2	6	1011942	1011947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22237	NC_022118	TAA	2	6	1011959	1011964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22238	NC_022118	ATGC	2	8	1011976	1011983	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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22475	NC_022118	GAT	2	6	1021625	1021630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422654
22476	NC_022118	AGA	2	6	1021660	1021665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422654
22477	NC_022118	AGGA	2	8	1021731	1021738	50 %	0 %	50 %	0 %	532422654
22478	NC_022118	AG	3	6	1021754	1021759	50 %	0 %	50 %	0 %	532422654
22479	NC_022118	AGCT	2	8	1021770	1021777	25 %	25 %	25 %	25 %	532422654
22480	NC_022118	CT	3	6	1021776	1021781	0 %	50 %	0 %	50 %	532422654
22481	NC_022118	TGAA	2	8	1021839	1021846	50 %	25 %	25 %	0 %	532422654
22482	NC_022118	AAC	2	6	1021861	1021866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422654
22483	NC_022118	CTC	2	6	1022019	1022024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422654
22484	NC_022118	TGG	2	6	1022239	1022244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532422654
22485	NC_022118	AG	3	6	1022246	1022251	50 %	0 %	50 %	0 %	532422654
22486	NC_022118	TTC	2	6	1022271	1022276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422654
22487	NC_022118	GAA	2	6	1022369	1022374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422654
22488	NC_022118	GATG	2	8	1022409	1022416	25 %	25 %	50 %	0 %	532422654
22489	NC_022118	ATT	2	6	1022430	1022435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422654
22490	NC_022118	ATG	2	6	1022532	1022537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422654
22491	NC_022118	GTT	2	6	1022540	1022545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422654
22492	NC_022118	TAT	2	6	1022613	1022618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422654
22493	NC_022118	GAAA	2	8	1022643	1022650	75 %	0 %	25 %	0 %	532422654
22494	NC_022118	G	6	6	1022662	1022667	0 %	0 %	100 %	0 %	532422654
22495	NC_022118	GA	3	6	1022683	1022688	50 %	0 %	50 %	0 %	532422654
22496	NC_022118	ATT	2	6	1022719	1022724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422654
22497	NC_022118	ATC	2	6	1022736	1022741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422654
22498	NC_022118	CTC	2	6	1022821	1022826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422654
22499	NC_022118	GTT	2	6	1022864	1022869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422654
22500	NC_022118	GCTTT	2	10	1022906	1022915	0 %	60 %	20 %	20 %	532422654

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